Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468230
- Subject:
- NM_017460.6
- Aligned Length:
- 1514
- Identities:
- 1352
- Gaps:
- 13
Alignment
Query 1 ATGGACCTCATCCCAAATTTGGCGGTGGAAACCTGGCTTCTCCTGGCTGTCAGCCTGGTGCTCCTCTATCTATA 74
||||..|||||||||.|.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTCTCATCCCAGACTTGGCCATGGAAACCTGGCTTCTCCTGGCTGTCAGCCTGGTGCTCCTCTATCTATA 74
Query 75 TGGGACCCGTACACATGGACTTTTTAAGAGACTGGGAATTCCAGGGCCCACACCTCTGCCTTTGTTGGGAAATG 148
|||.||||.|.||||||||||||||||||..||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct 75 TGGAACCCATTCACATGGACTTTTTAAGAAGCTTGGAATTCCAGGGCCCACACCTCTGCCTTTTTTGGGAAATA 148
Query 149 TTTTGTCCTATCGTCAGGGTCTCTGGAAATTTGACACAGAGTGCTATAAAAAGTATGGAAAAATGTGGGGAACG 222
||||||||||.|.|.||||..|.||.|..|||||||..||.||..|||||||||||||||||.|||||||....
Sbjct 149 TTTTGTCCTACCATAAGGGCTTTTGTATGTTTGACATGGAATGTCATAAAAAGTATGGAAAAGTGTGGGGCTTT 222
Query 223 TATGAAGGTCAACTCCCTGTGCTGGCCATCACAGATCCCGACGTGATCAGAACAGTGCTAGTGAAAGAATGTTA 296
|||||.|||||||..|||||||||||.|||||||||||.|||.||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TATGATGGTCAACAGCCTGTGCTGGCTATCACAGATCCTGACATGATCAAAACAGTGCTAGTGAAAGAATGTTA 296
Query 297 TTCTGTCTTCACAAATCGAAGGTCTTTAGGCCCAGTGGGATTTATGAAAAGTGCCATCTCTTTAGCTGAGGATG 370
|||||||||||||||.||.|||.||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 297 TTCTGTCTTCACAAACCGGAGGCCTTTTGGTCCAGTGGGATTTATGAAAAGTGCCATCTCTATAGCTGAGGATG 370
Query 371 AAGAATGGAAGAGAATACGGTCATTGCTGTCTCCAACCTTCACCAGCGGAAAACTCAAGGAGATGTTCCCCATC 444
||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct 371 AAGAATGGAAGAGATTACGATCATTGCTGTCTCCAACCTTCACCAGTGGAAAACTCAAGGAGATGGTCCCTATC 444
Query 445 ATTGCCCAGTATGGAGATGTATTGGTGAGAAACTTGAGGCGGGAAGCAGAGAAAGGCAAGCCTGTCACCTTGAA 518
||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATTGCCCAGTATGGAGATGTGTTGGTGAGAAATCTGAGGCGGGAAGCAGAGACAGGCAAGCCTGTCACCTTGAA 518
Query 519 AGACATCTTTGGGGCCTACAGCATGGATGTGATTACTGGCACATCATTTGGAGTGAACATCGACTCTCTCAACA 592
||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGACGTCTTTGGGGCCTACAGCATGGATGTGATCACTAGCACATCATTTGGAGTGAACATCGACTCTCTCAACA 592
Query 593 ATCCACAAGACCCCTTTGTGGAGAGCACTAAGAAGTTCCTAAAATTTGGTTTCTTAGATCCATTATTTCTCTCA 666
||||||||||||||||||||||.|.|||.||||||.|..|||.|||||.|||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 593 ATCCACAAGACCCCTTTGTGGAAAACACCAAGAAGCTTTTAAGATTTGATTTTTTGGATCCATTCTTTCTCTCA 666
Query 667 ATAATACTCTTTCCATTCCTTACCCCAGTTTTTGAAGCATTAAATGTCTCTCTGTTTCCAA---AAGATACCAT 737
||||.|.|||||||||||||.|.||||.||.||||||.|||||||.|||.|.||||||||| |||.|||
Sbjct 667 ATAACAGTCTTTCCATTCCTCATCCCAATTCTTGAAGTATTAAATATCTGTGTGTTTCCAAGAGAAGTTAC--- 737
Query 738 AAATTTTTTAAGTAAATCTGTAAACAGAATGAAGAAAAGTCGCCTCAACGACAAACAAAAGCACCGACTAGATT 811
||||||||||||.|||||||||||.||.|||||..|||||||||||.|.||.|.|||||||||||||.|.||||
Sbjct 738 AAATTTTTTAAGAAAATCTGTAAAAAGGATGAAAGAAAGTCGCCTCGAAGATACACAAAAGCACCGAGTGGATT 811
Query 812 TCCTTCAGCTGATGATTGACTCCCAGAATTCGAAAGAAACTGAGTCCCACAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGCTC 885
||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 812 TCCTTCAGCTGATGATTGACTCTCAGAATTCAAAAGAAACTGAGTCCCACAAAGCTCTGTCCGATCTGGAGCTC 885
Query 886 GCAGCCCAGTCAATAATCTTCATTTTTGCTGGCTATGAAACCACCAGCAGTGTTCTTTCCTTCACTTTATATGA 959
|..|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||.|.|.|||||
Sbjct 886 GTGGCCCAATCAATTATCTTTATTTTTGCTGGCTATGAAACCACGAGCAGTGTTCTCTCCTTCATTATGTATGA 959
Query 960 ACTGGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAAAAGGAGATTGATGCAGTTTTGCCCAATAAGGCACCAC 1033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 960 ACTGGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAGGAGGAAATTGATGCAGTTTTACCCAATAAGGCACCAC 1033
Query 1034 CTACCTATGATGCCGTGGTACAGATGGAGTACCTTGACATGGTGGTGAATGAAACACTCAGATTATTCCCAGTT 1107
|.|||||||||.|.|||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||
Sbjct 1034 CCACCTATGATACTGTGCTACAGATGGAGTATCTTGACATGGTGGTGAATGAAACGCTCAGATTATTCCCAATT 1107
Query 1108 GCTATTAGACTTGAGAGGACTTGCAAGAAAGATGTTGAAATCAATGGGGTATTCATTCCCAAAGGGTCAATGGT 1181
|||||.||||||||||||...|||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||||||....||||
Sbjct 1108 GCTATGAGACTTGAGAGGGTCTGCAAAAAAGATGTTGAGATCAATGGGATGTTCATTCCCAAAGGGGTGGTGGT 1181
Query 1182 GGTGATTCCAACTTATGCTCTTCACCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGGAGTTCCGCCCTGAAAGGT 1255
|.|||||||||..|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||.|
Sbjct 1182 GATGATTCCAAGCTATGCTCTTCACCGTGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCCTCCCTGAAAGAT 1255
Query 1256 TCAGTAAGAAG---AAGGACAGCATAGATCCTTACATATACACACCCTTTGGAACTGGACCCAGAAACTGCATT 1326
||||.|||||| |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1256 TCAGCAAGAAGAACAAGGACAACATAGATCCTTACATATACACACCCTTTGGAAGTGGACCCAGAAACTGCATT 1329
Query 1327 GGCATGAGGTTTGCTCTCATGAACATGAAACTTGCTCTAATCAGAGTCCTTCAGAACTTCTCCTTCAAACCTTG 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330 GGCATGAGGTTTGCTCTCATGAACATGAAACTTGCTCTAATCAGAGTCCTTCAGAACTTCTCCTTCAAACCTTG 1403
Query 1401 TAAAGAAACACAGATCCCCTTGAAATTAGAC--ACGCAAGGACTTCTTCAACCAGAAAAACCCATTGTTCTAAA 1472
|||||||||||||||||||.||||||||..| |.| |||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1404 TAAAGAAACACAGATCCCCCTGAAATTAAGCTTAGG--AGGACTTCTTCAACCAGAAAAACCCGTTGTTCTAAA 1475
Query 1473 GGTGGATTCAAGAGATGGAACCCTAAGTGGAGAA 1506
|||.||.|||||.|||||.|||.|||||||||..
Sbjct 1476 GGTTGAGTCAAGGGATGGCACCGTAAGTGGAGCC 1509