Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468238
- Subject:
- NM_008959.3
- Aligned Length:
- 1419
- Identities:
- 1287
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGCGTCCTGCGTGGGGAGCCGGACCCTAAGCAAGGATGATGTGAACTACAAAATGCATTTCCGGATGATCAA 74
|||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||||||||||||||||..|||||||||||.||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCCTGCGTGGGGAGCAGGACTCTGAGCAAGGATGATGTGAACTACAGGATGCATTTCCGCATGATCAA 74
Query 75 CGAGCAGCAAGTGGAGGACATCACCATTGACTTCTTCTACCGGCCGCATACCATCACCCTGCTCAGCTTCACCA 148
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGAGCAGCAAGTGGAGGACATCACCATAGACTTCTTCTACCGGCCGCACACCATCACCCTGCTCAGCTTCACCA 148
Query 149 TCGTCAGCCTCATGTACTTCGCCTTTACCAGGGATGACTCTGTTCCAGAAGACAACATCTGGAGAGGCATCCTC 222
||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 149 TCATCAGCCTCATGTACTTCGCCTTCACCAGGGATGACTCTGTTCCGGAAGACAACATCTGGAGAGGCATCCTG 222
Query 223 TCTGTTATTTTCTTCTTTCTTATCATCAGTGTGTTAGCTTTCCCCAATGGTCCGTTCACTCGACCTCATCCAGC 296
||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 223 TCTGTTATCTTCTTCTTTCTCATCATCAGCGTGTTAGCATTCCCCAATGGTCCATTTACTCGACCTCATCCAGC 296
Query 297 CTTATGGCGAATGGTTTTTGGACTCAGTGTGCTCTACTTCCTGTTCCTGGTATTCCTACTCTTCCTGAATTTCG 370
|||||||||||||||||||||.|||||||||.|.||.|||||.|||.||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 297 CTTATGGCGAATGGTTTTTGGTCTCAGTGTGTTGTATTTCCTCTTCTTGGTATTCCTCCTTTTCCTGAACTTCG 370
Query 371 AGCAGGTTAAATCTCTAATGTATTGGCTAGATCCAAATCTTCGATACGCCACAAGGGAAGCAGATGTCATGGAG 444
|||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||.|.|||||.||..||||||||
Sbjct 371 AGCAGGTTAAATCCCTGATGTATTGGCTGGATCCCAATCTTCGATATGCTACACGAGAAGCGGACATCATGGAG 444
Query 445 TATGCTGTGAACTGCCATGTGATCACCTGGGAGAGGATTATCAGCCACTTTGATATTTTTGCATTTGGACATTT 518
||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||..|.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 445 TATGCTGTGAACTGTCATGTGATAACCTGGGAGAGAATCGTTAGTCACTTTGATATATTTGCATTTGGCCATTT 518
Query 519 CTGGGGCTGGGCCATGAAGGCCTTGCTGATCCGTAGTTACGGTCTCTGCTGGACAATCAGTATTACCTGGGAGC 592
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 519 CTGGGGCTGGGCCATGAAGGCCTTGTTGATCCGTAGTTATGGGCTTTGCTGGACAATCAGTATCACCTGGGAGC 592
Query 593 TGACTGAGCTCTTCTTCATGCATCTCCTCCCCAATTTTGCCGAGTGCTGGTGGGATCAAGTCATTCTGGACATC 666
||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGACAGAGCTTTTCTTCATGCATCTCCTGCCCAATTTTGCTGAGTGCTGGTGGGACCAAGTCATTCTGGACATC 666
Query 667 CTGTTGTGCAATGGCGGTGGCATTTGGCTGGGCATGGTCGTTTGCCGGTTTTTAGAGATGAGGACTTACCACTG 740
||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 CTGTTGTGCAATGGTGGTGGAATCTGGCTGGGCATGGTCGTTTGCCGGTTTCTGGAGATGAGAACTTACCACTG 740
Query 741 GGCAAGCTTCAAGGACATTCATACCACCACCGGGAAGATCAAGAGAGCTGTTCTGCAGTTCACTCCTGCTAGCT 814
||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 741 GGCAAGCTTCAAGGACATCCACACCACCACAGGGAAGATCAAGCGAGCTGTGCTGCAGTTCACCCCTGCTAGCT 814
Query 815 GGACCTATGTTCGATGGTTTGACCCCAAATCTTCTTTTCAGAGAGTAGCTGGAGTGTACCTTTTCATGATCATC 888
||||.||.||..|.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||..|.|||||.|||||||||||.
Sbjct 815 GGACTTACGTCAGGTGGTTTGATCCCAAGTCTTCCTTTCAGAGAGTGGCTGGTATATACCTCTTCATGATCATA 888
Query 889 TGGCAGCTGACTGAGTTGAATACCTTCTTCTTGAAGCATATCTTTGTGTTCCAAGCCAGTCATCCATTAAGTTG 962
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 889 TGGCAGTTGACTGAGTTGAATACCTTCTTCTTGAAGCACATCTTTGTGTTCCAAGCCAGCCATCCCTTAAGCTG 962
Query 963 GGGTAGAATTCTCTTTATTGGTGGCATCACAGCTCCCACAGTGAGACAGTACTACGCTTACCTCACCGACACAC 1036
|||||||||.|||||.||.||..||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 963 GGGTAGAATCCTCTTCATCGGCTGCATTACGGCTCCCACAGTGAGACAGTACTATGCCTACCTCACGGACACAC 1036
Query 1037 AGTGCAAGCGCGTAGGAACACAATGCTGGGTGTTTGGGGTCATTGGTTTCCTGGAGGCCATTGTTTGCATAAAA 1110
||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1037 AGTGCAAGCGTGTAGGGACACAGTGCTGGGTGTTTGGGGTCATTGGTTTCCTGGAAGCTATTGTTTGCATAAAA 1110
Query 1111 TTTGGACAAGATCTCTTCTCTAAGACCCAAATACTCTATGTTGTGCTTTGGCTTCTTTGCGTGGCTTTCACCAC 1184
|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1111 TTTGGACAAGATCTCTTTTCTAAGACCCAGATACTCTATGTGATGCTTTGGCTTCTTTGTGTGGCCTTCACCAC 1184
Query 1185 TTTCCTCTGTCTGTACGGCATGATTTGGTATGCAGAACACTATGGTCACCGAGAAAAGACCTACTCGGAGTGTG 1258
.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1185 GTTCCTGTGTCTGTACGGCATGGTTTGGTATGCAGAGCACTATGGTCACCGGGAAAAGACCTATTCAGAGTGTG 1258
Query 1259 AAGATGGCACCTACAGTCCAGAGATCTCCTGGCATCACAGGAAAGGGACAAAAGGTTCTGAAGACAGCCCACCC 1332
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||..|||||||..|.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1259 AAGATGGCACTTACAGTCCAGAGATCTCCTGGCATCATGGGAAAGGCTCCAAAGGTTCTGAAGACAGCCCACCG 1332
Query 1333 AAGCATGCAGGCAACAACGAAAGCCATTCTTCCAGGAGAAGGAATCGGCATTCCAAGTCAAAAGTCACCAATGG 1406
||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1333 AAGCATTCAAGCAACCACGAAAGCCATTCTTCCAGAAGAAGGAACCGGCATTCTAAGTCCAAAGTCACTAATGG 1406
Query 1407 CGTTGGAAAGAAA 1419
.||||||||||||
Sbjct 1407 AGTTGGAAAGAAA 1419