Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468244
• Subject: XM_011534331.2
• Aligned Length: 1749
• Identities: 1559
• Gaps: 177

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTTAGTGTGGCTACTGCCTCTGTGCTACTTGAGGCTCTCCTACGGCTTTTCGATGCCTTCGATGAACCTCT  74

Query    1  -----------------------------------------------------------------ATGTCCGAG  9
                                                                             |..||| ||
Sbjct   75  ACCTAAGCACTTCTTCCCTTTCACCGCGAACTCCTACCTTCTCGGGTTTCTAGCTTGCTCACTTTACATCC-AG  147

Query   10  ---GACTCGA----GCGCCCTG--------CCCTGGT---------CCATCAACAGGGACGATTA-CGAGCTGC  58
               .|||.||    |||.||.|        ||..|||         |||.| .|||.|||| |.| ||.|||||
Sbjct  148  CCACACTGGAGATGGCGGCCGGAGGCGGGCCCGAGGTGGGGCGTGACCAGC-GCAGTGACG-TCAGCGCGCTGC  219

Query   59  AGGAGGTGATC----GGGAGTGGAGCAACTGCTGTAGTCCAAGCAGCTTATTGTGCCCCTAAAAAGGAGAAAGT  128
                 ||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  220  -----GTG-TCGGCAGGGAGTGGAGCAACTGCTGTAGTCCAAGCAGCTTATTGTGCCCCTAAAAAGGAGAAAGT  287

Query  129  GGCAATCAAACGGATAAACCTTGAGAAATGTCAAACTAGCATGGATGAACTCCTGAAAGAAATTCAAGCCATGA  202
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  288  GGCAATCAAACGGATAAACCTTGAGAAATGTCAAACTAGCATGGATGAACTCCTGAAAGAAATTCAAGCCATGA  361

Query  203  GTCAATGCCATCATCCTAATATTGTATCTTACTACACATCTTTTGTGGTAAAAGATGAGCTGTGGCTTGTCATG  276
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  362  GTCAATGCCATCATCCTAATATTGTATCTTACTACACATCTTTTGTGGTAAAAGATGAGCTGTGGCTTGTCATG  435

Query  277  AAGCTGCTAAGTGGAGGTTCTGTTCTGGATATTATTAAGCACATTGTGGCAAAAGGGGAACACAAAAGTGGAGT  350
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  436  AAGCTGCTAAGTGGAGGTTCTGTTCTGGATATTATTAAGCACATTGTGGCAAAAGGGGAACACAAAAGTGGAGT  509

Query  351  CCTAGATGAATCTACCATTGCTACGATACTCCGAGAAGTACTGGAAGGGCTGGAATATCTGCATAAAAATGGAC  424
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  510  CCTAGATGAATCTACCATTGCTACGATACTCCGAGAAGTACTGGAAGGGCTGGAATATCTGCATAAAAATGGAC  583

Query  425  AGATCCACAGAGATGTGAAAGCTGGAAACATTCTTCTTGGAGAAGATGGCTCAGTACAGATTGCAGACTTTGGG  498
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  584  AGATCCACAGAGATGTGAAAGCTGGAAACATTCTTCTTGGAGAAGATGGCTCAGTACAGATTGCAGACTTTGGG  657

Query  499  GTTAGTGCTTTTTTAGCAACTGGTGGTGATATTACCCGAAATAAAGTGAGAAAGACCTTTGTTGGCACCCCTTG  572
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  658  GTTAGTGCTTTTTTAGCAACTGGTGGTGATATTACCCGAAATAAAGTGAGAAAGACCTTTGTTGGCACCCCTTG  731

Query  573  TTGGATGGCACCTGAAGTTATGGAACAGGTCCGTGGTTATGATTTCAAAGCTGATATTTGGAGTTTTGGAATTA  646
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  732  TTGGATGGCACCTGAAGTTATGGAACAGGTCCGTGGTTATGATTTCAAAGCTGATATTTGGAGTTTTGGAATTA  805

Query  647  CAGCAATTGAATTGGCTACAGGGGCGGCTCCTTATCATAAATATCCACCAATGAAGGTTTTAATGCTGACACTG  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  806  CAGCAATTGAATTGGCTACAGGGGCGGCTCCTTATCATAAATATCCACCAATGAAGGTTTTAATGCTGACACTG  879

Query  721  CAGAACGATCCTCCTTCTTTGGAAACTGGTGTTCAAGATAAAGAAATGCTGAAAAAATATGGAAAATCATTTAG  794
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  880  CAGAACGATCCTCCTTCTTTGGAAACTGGTGTTCAAGATAAAGAAATGCTGAAAAAATATGGAAAATCATTTAG  953

Query  795  AAAAATGATTTCATTGTGCCTTCAAAAAGATCCAGAAAAAAGACCAACAGCAGCAGAACTATTAAGGCACAAAT  868
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  954  AAAAATGATTTCATTGTGCCTTCAAAAAGATCCAGAAAAAAGACCAACAGCAGCAGAACTATTAAGGCACAAAT  1027

Query  869  TTTTCCAGAAAGCAAAGAATAAAGAATTTCTTCAAGAAAAAACATTGCAGAGAGCACCAACCATTTCTGAAAGA  942
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028  TTTTCCAGAAAGCAAAGAATAAAGAATTTCTTCAAGAAAAAACATTGCAGAGAGCACCAACCATTTCTGAAAGA  1101

Query  943  GCAAAAAAGGTTCGGAGAGTACCAGGTTCCAGTGGGCGTCTTCATAAGACAGAGGATGGAGGCTGGGAGTGGAG  1016
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102  GCAAAAAAGGTTCGGAGAGTACCAGGTTCCAGTGGGCGTCTTCATAAGACAGAGGATGGAGGCTGGGAGTGGAG  1175

Query 1017  TGATGATGAATTTGATGAAGAAAGTGAGGAAGGGAAAGCAGCAATTTCACAACTCAGGTCTCCCCGAGTGAAAG  1090
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176  TGATGATGAATTTGATGAAGAAAGTGAGGAAGGGAAAGCAGCAATTTCACAACTCAGGTCTCCCCGAGTGAAAG  1249

Query 1091  AATCAATATCAAATTCTGAGCTCTTTCCAACAACTGATCCTGTGGGTACTTTGCTCCAAGTTCCAGAACAGATC  1164
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250  AATCAATATCAAATTCTGAGCTCTTTCCAACAACTGATCCTGTGGGTACTTTGCTCCAAGTTCCAGAACAGATC  1323

Query 1165  TCTGCTCATCTACCTCAGCCAGCTGGGCAGATTGCTACACAGCCAACTCAAGTCTCTCTCCCACCCACCGCAGA  1238
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324  TCTGCTCATCTACCTCAGCCAGCTGGGCAGATTGCTACACAGCCAACTCAAGTCTCTCTCCCACCCACCGCAGA  1397

Query 1239  GCCAGCAAAAACAGCTCAGGCTTTGTCTTCAGGATCAGGTTCACAAGAAACCAAGATCCCAATCAGTCTAGTAC  1312
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398  GCCAGCAAAAACAGCTCAGGCTTTGTCTTCAGGATCAGGTTCACAAGAAACCAAGATCCCAATCAGTCTAGTAC  1471

Query 1313  TAAGATTAAGGAATTCCAAAAAAGAACTAAATGATATTCGATTTGAATTTACTCCTGGGAGAGATACAGCAGAG  1386
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472  TAAGATTAAGGAATTCCAAAAAAGAACTAAATGATATTCGATTTGAATTTACTCCTGGGAGAGATACAGCAGAG  1545

Query 1387  GGTGTCTCTCAGGAACTCATTTCTGCTGGCCTGGTCGACGGAAGGGATTTAGTAATAGTGGCAGCTAATTTGCA  1460
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546  GGTGTCTCTCAGGAACTCATTTCTGCTGGCCTGGTCGACGGAAGGGATTTAGTAATAGTGGCAGCTAATTTGCA  1619

Query 1461  GAAAATTGTGGAAGAACCTCAGTCAAATCGATCTGTCACTTTCAAACTGGCATCTGGTGTCGAAGGCTCAGATA  1534
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620  GAAAATTGTGGAAGAACCTCAGTCAAATCGATCTGTCACTTTCAAACTGGCATCTGGTGTCGAAGGCTCAGATA  1693

Query 1535  TTCCTGATGATGGTAAACTGATAGGATTTGCCCAGCTCAGCATCAGC  1581
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694  TTCCTGATGATGGTAAACTGATAGGATTTGCCCAGCTCAGCATCAGC  1740