Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468268
- Subject:
- NM_198089.3
- Aligned Length:
- 2118
- Identities:
- 1402
- Gaps:
- 504
Alignment
Query 1 ATGACCACGTTGAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGACGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAAGAGCTGAGGCTGCT 74
||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct 1 ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT 74
Query 75 GGACCTTGCCCAGAGGAAACTGTACCGAGAAGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC 148
|||||.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC 148
Query 149 AATCACTCCACAGAGATACTTTCCACTTCCTAAAGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGAGACAGCAACCCAAAGA 222
||.|..|||||..||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 149 AACCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAGA 222
Query 223 GAAGGGAATTTAGGAGGCAAGATCCAAATGGAGATGGAGACTGTTTCAGAATCAGGAACACATGAAGGCTTGTT 296
||||||||||.|||||||||||||||||..|||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||..|.||.
Sbjct 223 GAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTC 296
Query 297 CAGTCATCAAACCTGGGAACAAATTTCAAGTGACTTAACCAGGTTTCAAGACTCCATGGTAAACAGCTTTCAGT 370
|.|.||.||||.|||||||||||||.|||..|||||||||||||.|||.|||||.||..||||.|.||.|||||
Sbjct 297 CTGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCAGGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGT 370
Query 371 TCTCCAAACAAGATGATATGCCCTGCCAGGTTGATGCAGGACTATCTATAATTCACGTAAGACAGAAACCTTCT 444
|||...||.|.|.||||.|.||||.|||||||||.|||||||||.|.|.||||||...|.|||||||||||||.
Sbjct 371 TCTTTGAAAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGACTACCCACAATTCATACAGGACAGAAACCTTCC 444
Query 445 GAGGGTAGGACGTGTAAAAAGTCCTTTAGTGATGTCTCCGTCCTTGATCTTCATCAACAACTACAGTCAAGAGA 518
.|||||.|||.|||||||.|||||.|.||||||||..||.||.|||||||||.|||.||..||.|.|||..|||
Sbjct 445 CAGGGTGGGAAGTGTAAACAGTCCATCAGTGATGTTCCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGA 518
Query 519 GAAGTCTCATACATGTGATGAATGTGGAAAGAGTTTCTGTTATAGCTCAGCTCTTCGTATTCATCAGAGAGTTC 592
|||||||.|||||||||||||.||||||||.||..|||||||.|.|||||||||||.|.|||||||||||||.|
Sbjct 519 GAAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCTGTTACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTCC 592
Query 593 ACATGGGGGAGAAACTCTATAATTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTCAATCAGAGCTCACATCTGCAAATTCAT 666
||.||||.||||||||||.||..||||||||||||||.||||||||.|.|||.||||||||||||||||.||||
Sbjct 593 ACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAGGAATTTAGTCAAAGCTCACATCTGCAAACTCAT 666
Query 667 CAGAGAATCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAGGCTTTAGTCGTAGATCAGGACT 740
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||.|||
Sbjct 667 CAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACT 740
Query 741 TTATGTTCATCGTAAATTACACACAGGAGTGAAACCTCATATTTGTGAGAAATGTGGGAAGGCCTTCATTCATG 814
|.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.|||||||||..|||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TAATGTTCATCGTAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACATTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATG 814
Query 815 ATTCCCAGCTTCAGGAACATCAAAGAATCCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGATATATGTTGTAAGAGC 888
|||||||||||.||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||.|
Sbjct 815 ATTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGGGAGAAACCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACC 888
Query 889 TTCCGTAGTAGAGCAAATCTTAATAGGCATTCCATGGTTCACATGCGAGAGAAACCATTCAGATGTGATACATG 962
|||..|..|||..|||..|||||.||.||||||||||||||||...||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 889 TTCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAAACCATTTAGGTGTGATACATG 962
Query 963 TGGTAAGAGCTTTGGTCTGAAATCAGCACTTAATAGTCATCGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACGGTACAAAT 1036
||.||||||||||..||.||.|||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 963 TGATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAGAT 1036
Query 1037 GTGAGGAATGTGGAAAACGCTTCATTTATAGGCAAGATCTTTATAAGCATCAGATAGACCACACAGGGGAGAAG 1110
|||||.|.|||||||||.||||.|||..|||||.||||.||||||||||||||.|.|.|||||||||.||.||.
Sbjct 1037 GTGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTTTATAAGCATCAGGTGGTCCACACAGGAGAAAAA 1110
Query 1111 CCATATAATTGTAAAGAATGTGGAAAGAGCTTCAGATGGGCCTCAGGTCTTTCAAGACATGTGCGAGTCCACAG 1184
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||.|.||||..|..|||..||||||||||||
Sbjct 1111 CCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCACAG 1184
Query 1185 TGGAGAGACAACATTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACAACGTTATTCTCACCAGA 1258
||||||.|.||..||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|.|||.||.||||
Sbjct 1185 TGGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGAAAGGGATTTTATACAAATTCACAACTGTCTTCCCATCAGA 1258
Query 1259 GAGCGCACAGTGGAGAAAAGCCATATAGATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACAAAAGGAGGTTGGATCTTGAC 1332
||.|.||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1259 GATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTA-----------TG--------- 1312
Query 1333 TTTCATCAGAGGGTCCACAGAGGAGAGAAACCCTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTGGCTGGGCCTC 1406
Sbjct 1313 -------------------------------------------------------------------------- 1312
Query 1407 GTGTCTTTTGAATCATCAGAGAATCCACAGTGGAGAAAAACCATTTAAATGTGAAGAATGTGGGAAAAGATTTA 1480
|||
Sbjct 1313 -----------------------------------------------------------------------TTA 1315
Query 1481 CTCAGAATTCACAACTTTATACCCATCGTAGAGTCCACAGTGGAGAAAAACCATTCAAATGTGAAGAGTGTGGG 1554
|
Sbjct 1316 C------------------------------------------------------------------------- 1316
Query 1555 AAAAGATTTACTCAGAATTCACAACTTTATTCTCATCGCAGAGTCCACACTGGAGTAAAGCCATACAAATGTGA 1628
Sbjct 1317 -------------------------------------------------------------------------- 1316
Query 1629 AGAGTGTGGGAAGGGCTTCAACAGTAAGTTTAATCTTGACATGCACCAGAGGGTCCACACCGGAGAGAGACCTT 1702
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1317 ------------------------TAAGTTTAATCTTGACTTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTT 1366
Query 1703 ATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCATGGTGAT 1776
||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1367 ATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAACTTTAGCCGGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCC-------- 1432
Query 1777 GAAAAGCCATTCAAATGTGAAGAGTGTGGGAAGAGATTTACTGAGAATTCACAGCTTCATTCCCATCAGAGGGT 1850
|||| |||
Sbjct 1433 ---------------------------------------ACTG-------------------CCA--------- 1439
Query 1851 TCACACTGGGGAAAAGCCATACAAATGTGAGAAGTGTGGAAAGAGCTTCAGATGGGCCTCAACTCATCTAACCC 1924
|.||||.||||.||
Sbjct 1440 ---------GAAAAAACCATTCA--------------------------------------------------- 1453
Query 1925 ATCAGAGACTCCACAGTAGAGAAAAACTACTTCAATGTGAGGACTGTGGGAAGAGCATTGTGCACAGTTCATGC 1998
||||||||||||||||.|||||..||||.|||||..|||.|
Sbjct 1454 ---------------------------------AATGTGAGGACTGTGGAAAGAGGCTTGTACACAGGACATAC 1494
Query 1999 CTTAAAGACCAACAAAGAGACCAAAGTGGAGAGAAAACATCTAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAG 2072
|.|||||||||.|..||||||.|.|||||.||.||..||||.|||||||||||.|||||||..|||||||||||
Sbjct 1495 CGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGTGGGGAAAACCCATCCAAATGTGAGGATTGTGGGAGACGCTACAAGAG 1568
Query 2073 GCGCTTGAATCTTGATACGCTTTTGTCATTATTTTTAAATGACACA 2118
||||||||||||.||||..|||||.|||||||||.|||||||||||
Sbjct 1569 GCGCTTGAATCTGGATATACTTTTATCATTATTTCTAAATGACACA 1614