Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468268
• Subject: XM_024451486.1
• Aligned Length: 2122
• Identities: 1565
• Gaps: 347

Alignment

Query    1  ATGACCACGTTGAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGACGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAAGAGCTGAGGCTGCT  74
            |||||||.|||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||.|||||||
Sbjct    1  ATGACCATGTTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACCGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT  74

Query   75  GGACCTTGCCCAGAGGAAACTGTACCGAGAAGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC  148
            ||||.||.||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct   75  GGACGTTTCCCAGAGGAAGCTGTATCGAGATGTCATGCTGGAGAACTTCAGAAACCTGCTATCAGTGGGGCATC  148

Query  149  AATCACT---CCACAGAGATACTTTCCACTTCCTAAAG-GAAGAAAAGTTTTGGATGATGGAGACAGCAACCCA  218
            |   |||   ||||.||||||||||.||||||| |||| |||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  149  A---ACTTTCCCACCGAGATACTTTTCACTTCC-AAAGAGAAGAAAAGTTTTGGATCATGGAGACAGCAACCCA  218

Query  219  AAGAGAAGGGAATTTAGGAGGCAAGATCCAAATGGAGATGGAGACTGTTTCAGAATCAGGAACACATGAAGGCT  292
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||..|
Sbjct  219  AAGAGAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAACAGGACCACATGAAGAGT  292

Query  293  TGTTCAGTCATCAAACCTGGGAACAAATTTCAAGTGACTTAACCAGGTTTCAAGACTCCATGGTAAACAGCTTT  366
            .||...|.||.||||.|||||||||||.|.|||||||.|||||.||...|||||||||||   |||..||||.|
Sbjct  293  GGTCTTGCCAGCAAATCTGGGAACAAACTGCAAGTGAGTTAACTAGACCTCAAGACTCCA---TAAGTAGCTCT  363

Query  367  CAGTTCTCCAAACAAGATGATATGCCCTGCCAGGTTGATGCAGGACTATCTATAATTCACGTAAGACAGAAACC  440
            ||||||||||.|||||.||||.|.||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||.||.||.|||.|||
Sbjct  364  CAGTTCTCCACACAAGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGACGCAGGACTATCTATAATTCACATAGGAGAGACACC  437

Query  441  TTCTGAGGGTAGGACGTGTAAAAAGTCCTTTAGTGATGTCTCCGTCCTTGATCTTCATCAACAACTACAGTCAA  514
            |||||||..|.|||.|||||||||.|.|||.||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||.|||.
Sbjct  438  TTCTGAGCATGGGAAGTGTAAAAAATTCTTCAGTGATGTCTCCATCCTTGATCTTCATCAACAATTACACTCAG  511

Query  515  GAGAGAAGTCTCATACATGTGATGAATGTGGAAAGAGTTTCTGTTATAGCTCAGCTCTTCGTATTCATCAGAGA  588
            ||.|||..||.|||||||||.||||.|...|.|||||.|||||||||||||||||||||.||.|||||||||.|
Sbjct  512  GAAAGATATCCCATACATGTAATGAGTACAGGAAGAGATTCTGTTATAGCTCAGCTCTTTGTCTTCATCAGAAA  585

Query  589  GTTCACATGGGGGAGAAACTCTATAATTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTCAATCAGAGCTCACATCTGCAAAT  662
            |||||||||||.|||||||.||||||.||||||||||||.||||||.|||.|.|||||.||||||.|||||||.
Sbjct  586  GTTCACATGGGAGAGAAACGCTATAAGTGTGATGTGTGTAGTAAGGCATTTAGTCAGAACTCACAACTGCAAAC  659

Query  663  TCATCAGAGAATCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAGGCTTTAGTCGTAGATCAG  736
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||.||||||||||
Sbjct  660  TCATCAGAGAATCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAAGTTTCAGCCGTAGATCAG  733

Query  737  GACTTTATGTTCATCGTAAATTACACACAGGAGTGAAACCTCATATTTGTGAGAAATGTGGGAAGGCCTTCATT  810
            ||.|.|||||||||.|.||||||||||||||||..||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  734  GAATGTATGTTCATTGCAAATTACACACAGGAGAAAAACCTCATATTTGTGAGGAATGTGGGAAGGCCTTCATT  807

Query  811  CATGATTCCCAGCTTCAGGAACATCAAAGAATCCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGATATATGTTGTAA  884
            ||..||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  808  CACAATTCCCAGCTTCGGGAACATCAAAGAATCCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTTATATATGTGGTAA  881

Query  885  GAGCTTCCGTAGTAGAGCAAATCTTAATAGGCATTCCATGGTTCACATGCGAGAGAAACCATTCAGATGTGATA  958
            ||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||.||||.||||||||||
Sbjct  882  GAGCTTCCATAGTAGATCAAATCTTAATAGGCATTCCATGGTCCACATGCAAGAGAAATCATTTAGATGTGATA  955

Query  959  CATGTGGTAAGAGCTTTGGTCTGAAATCAGCACTTAATAGTCATCGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACGGTAC  1032
            |.|||.||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||.||||||.|||||||..||||||||..|||
Sbjct  956  CCTGTAGTAATAGCTTTGGTCAGAGATCAGCACTTAATAGTCATTGCATGGACCACACAAAAGAGAAACTATAC  1029

Query 1033  AAATGTGAGGAATGTGGAAAACGCTTCATTTATAGGCAAGATCTTTATAAGCATCAGATAGACCACACAGGGGA  1106
            ||||||||.||||||||||...||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 1030  AAATGTGAAGAATGTGGAAGGAGCTTCACTTGTAGGCAAGATCTTTGTAAGCATCAGATGGACCATACAGGAGA  1103

Query 1107  GAAGCCATATAATTGTAAAGAATGTGGAAAGAGCTTCAGATGGGCCTCAGGTCTTTCAAGACATGTGCGAGTCC  1180
            .||.||||||||||||||.|.||||||.|||.|||||||.|||.|||||.||||||||||||||..|||.||||
Sbjct 1104  CAAACCATATAATTGTAATGTATGTGGGAAGGGCTTCAGGTGGTCCTCATGTCTTTCAAGACATCAGCGGGTCC  1177

Query 1181  ACAGTGGAGAGACAACATTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACAACGTTATTCTCAC  1254
            |||.||||||.|||||||||||.||.||.|.||||||||||.|||||||||..||||||||..|..||||.||.
Sbjct 1178  ACAATGGAGAAACAACATTCAAGTGCGACGGATGTGGGAAGAGATTTTATATGAATTCACAGGGCCATTCACAT  1251

Query 1255  CAGAGAGCGCACAGTGGAGAAAAGCCATATAGATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACAAAAGGAGGTTGGATCT  1328
            |||||||                                                                   
Sbjct 1252  CAGAGAG-------------------------------------------------------------------  1258

Query 1329  TGACTTTCATCAGAGGGTCCACAGAGGAGAGAAACCCTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTGGCTGGG  1402
                                               |||||                                  
Sbjct 1259  -----------------------------------CCTAT----------------------------------  1263

Query 1403  CCTCGTGTCTTTTGAATCATCAGAGAATCCACAGTGGAGAAAAACCATTTAAATGTGAAGAATGTGGGAAAAGA  1476
                                 ||||||                             ||||              
Sbjct 1264  ---------------------AGAGAA-----------------------------GAAG--------------  1273

Query 1477  TTTACTCAGAATTCACAACTTTATACCCATCGTAGAGTCCACAGTGGAGAAAAACCATTCAAATGTGAAGAGTG  1550
                            ||||.|||                                    |||||         
Sbjct 1274  ----------------AACTGTAT------------------------------------AAATG---------  1286

Query 1551  TGGGAAAAGATTTACTCAGAATTCACAACTTTATTCTCATCGCAGAGTCCACACTGGAGTAAAGCCATACAAAT  1624
                           |||||                                                      
Sbjct 1287  ---------------TCAGA------------------------------------------------------  1291

Query 1625  GTGAAGAGTGTGGGAAGGGCTTCAACAGTAAGTTTAATCTTGACATGCACCAGAGGGTCCACACCGGAGAGAGA  1698
                  |||||||||||||||.||..||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1292  ------AGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTTTAATCTTGACTTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGA  1359

Query 1699  CCTTATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCATGG  1772
            ||||||||||||||.||||||||.||||||||.||..||||||||.|||||||||..|||||||||||||||..
Sbjct 1360  CCTTATAATTGTAAGGAATGTGGAAAGAGCTTCAGGTGGGCCTCAGGTATTTTGAGACATAAGAGACTCCATAC  1433

Query 1773  TGATGAAAAGCCATTCAAATGTGAAGAGTGTGGGAAGAGATTTACTGAGAATTCACAGCTTCATTCCCATCAGA  1846
            ||..|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||.||.||||||.|
Sbjct 1434  TGGAGAAAAACCATTCAAATGTGAAGAGTGTGGGAAGAGGTTTACTGAGAATTCAAAACTTCGTTTCCATCAAA  1507

Query 1847  GGGTTCACACTGGGGAAAAGCCATACAAATGTGAGAAGTGTGGAAAGAGCTTCAGATGGGCCTCAACTCATCTA  1920
            |..||||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1508  GAATTCACACTGGAGAAAAGCCTTACAAATGTGAGGAGTGTGGAAAGGGATTCAGATGGGCCTCAACTCATCTA  1581

Query 1921  ACCCATCAGAGACTCCACAGTAGAGAAAAACTACTTCAATGTGAGGACTGTGGGAAGAGCATTGTGCACAGTTC  1994
            ||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1582  ACCCATCAAAGACTCCACAGCAGAGAAAAACTATTCCAATGTGAGGATTGTGGGAAGAGCAGTGAGCACAGTTC  1655

Query 1995  ATGCCTTAAAGACCAACAAAGAGACCAAAGTGGAGAGAAAACATCTAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACA  2068
            |||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1656  ATGCCTTCAAGACCAACAAAGCGACCACAGTGGAGAAAAAACATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACG  1729

Query 2069  AGAGGCGCTTGAATCTTGATACGCTTTTGTCATTATTTTTAAATGACACA  2118
            ||||||||||||||||.||||.|.||||.|||||||||||||||||.|.|
Sbjct 1730  AGAGGCGCTTGAATCTAGATATGATTTTATCATTATTTTTAAATGATATA  1779