Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468272
- Subject:
- NR_135470.1
- Aligned Length:
- 2072
- Identities:
- 1337
- Gaps:
- 734
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GGGCGGGGCAGGACCGGCGACCCGGCCCGTGGAGCCGGCGCGGGCGGGCTGCTGAGGTGGCTGTCGCCGGCTCC 74
Query 1 -----------------------------ATGGAGGCCGAGGCCGCGGACGCTCCCCCGGGCGGGGTTGAGTCG 45
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAGCTGCGGCTTCCCGGGCCGAGCCCCCGATGGAGGCCGAGGCCGCGGACGCTCCCCCGGGCGGGGTTGAGTCG 148
Query 46 GCGCTCAGCTGCTTCTCTTTCAACCAGGACTGCACATCCCTAGCAATTGGAACTAAAGCCGGGTATAAGCTGTT 119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCGCTCAGCTGCTTCTCTTTCAACCAGGACTGCACATCCCTAGCAACTGGAACTAAAGCCGGGTATAAGCTGTT 222
Query 120 TTCTCTGAGTTCTGTGGAGCAGCTGGATCAAGTCCACGGAAGCAATGAAATCCCGGACGTCTACATCGTGGAGC 193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTCTCTGAGTTCTGTGGAGCAGCTGGATCAAGTCCACGGAAGCAATGAAATCCCGGACGTCTACATCGTGGAGC 296
Query 194 GCCTCTTCTCCAGCAGCCTGGTGGTGGTAGTCAGTCACACAAAACCACGGCAGATGAACGTGTATCACTTCAAG 267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCCTCTTCTCCAGCAGCCTGGTGGTGGTAGTCAGTCACACAAAACCACGGCAGATGAACGTGTATCACTTCAAG 370
Query 268 AAAGGCACAGAGATCTGTAATTACAGCTACTCCAGCAACATCTTGTCCATAAGGCTGAACCGGCAAAGGCTGCT 341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAAGGCACAGAGATCTGTAATTACAGCTACTCCAGCAACATCTTGTCCATAAGGCTGAACCGGCAAAGGCTGCT 444
Query 342 GGTTTGCCTAGAAGAGTCCATTTATATTCACAACATTAAAGACATGAAGCTGTTGAAGACCCTCCTGGATATTC 415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGTTTGCCTAGAAGAGTCCATTTATATTCACAACATTAAAGACATGAAGCTGTTGAAGACCCTCCTGGATATTC 518
Query 416 CTGCAAACCCAACAGGTCTATGTGCTCTCTCTATCAACCATTCCAATTCTTACCTGGCCTATCCTGGAAGCCTG 489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTGCAAACCCAACAGGTCTATGTGCTCTCTCTATCAACCATTCCAATTCTTACCTGGCCTATCCTGGAAGCCTG 592
Query 490 ACTTCAGGGGAGATTGTGCTTTATGATGGAAACTCCCTGAAAACAGTCTGCACTATTGCTGCCCATGAGGGAAC 563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACTTCAGGGGAGATTGTGCTTTATGATGGAAACTCCCTGAAAACAGTCTGCACTATTGCTGCCCATGAGGGAAC 666
Query 564 ACTAGCTGCCATCACCTTCAATGCCTCAGGCTCCAAACTAGCAAGTGCGTCTGAAAAAGGCACAGTCATCCGGG 637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACTAGCTGCCATCACCTTCAATGCCTCAGGCTCCAAACTAGCAAGTGCGTCTGAAAAAGGCACAGTCATCCGGG 740
Query 638 TGTTCTCTGTCCCTGATGGGCAAAAGCTCTATGAGTTCCGGAGAGGGATGAAA--------------------- 690
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGTTCTCTGTCCCTGATGGGCAAAAGCTCTATGAGTTCCGGAGAGGGATGAAAAGGTCTGTGTTCAATGTCAAA 814
Query 691 -------------------------------------------------------------------------- 690
Sbjct 815 CCCATTTTAAAGTCCCCGCAGAAGTCCCGCAGGGACCGCTGGCAGCTGTCTAGGGAGAGGACAGAGAGTGGCTC 888
Query 691 -----------------------------------------AGGTATGTGACAATCAGCTCTCTAGTGTTCAGT 723
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGTGCCCTCCACTCACCTGGAGGAAGTGTAACTACTCTCCCAGGTATGTGACAATCAGCTCTCTAGTGTTCAGT 962
Query 724 ATGGATTCACAATTCCTCTGCGCCTCCAGTAACACCGAGACGGTACACATCTTCAAGCTGGAACAGGTCACCAA 797
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ATGGATTCACAATTCCTCTGCGCCTCCAGTAACACCGAGACGGTACACATCTTCAAGCTGGAACAGGTCACCAA 1036
Query 798 CAGTCGACCAGAAGAGCCTTCGACCTGGAGTGGCTACATGGGAAAGATGTTTATGGCTGCTACCAACTACCTCC 871
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGTCGACCAGAAGAGCCTTCGACCTGGAGTGGCTACATGGGAAAGATGTTTATGGCTGCTACCAACTACCTCC 1110
Query 872 CTACCCAGGTGTCAGACATGATGCATCAGGACAGGGCTTTTGCCACTGCACGCTTGAACTTCTCCGGACAGAGG 945
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTACCCAGGTGTCAGACATGATGCATCAGGACAGGGCTTTTGCCACTGCACGCTTGAACTTCTCCGGACAGAGG 1184
Query 946 AACATCTGTACCCTCTCAACGATCCAGAAGTTGCCACGGCTGCTAGTTGCGTCATCCAGTGGACACCTTTATAT 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AACATCTGTACCCTCTCAACGATCCAGAAGTTGCCACGGCTGCTAGTTGCGTCATCCAGTGGACACCTTTATAT 1258
Query 1020 GTACAATTTGGATCCTCAGGATGGAGGAGAGTGTGTCTTAATCAAAACCCACAGCTTGCTTGGCTCAGGAACAA 1093
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GTACAATTTGGATCCTCAGGATGGAGGAGAGTGTGTCTTAATCAAAACCCACAGCTTGCTTGGCTCAGGAACAA 1332
Query 1094 CAGAAGAGAATAAAGAAAATGACCTCAGACCTTCCTTACCTCAGTCTTATGCAGCGACCGTAGCCAGACCAAGT 1167
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CAGAAGAGAATAAAGAAAATGACCTCAGACCTTCCTTACCTCAGTCTTATGCAGCGACCGTAGCCAGACCAAGT 1406
Query 1168 GCATCTTCAGCCTCCACGGTGCCAGGTTATTCTGAGGACGGCGGGGCGCTGCGAGGAGAAGTTATTCCTGAACA 1241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GCATCTTCAGCCTCCACGGTGCCAGGTTATTCTGAGGACGGCGGGGCGCTGCGAGGAGAAGTTATTCCTGAACA 1480
Query 1242 TGAGTTTGCGACGGGACCAGTGTGTCTTGATGATGAGAATGAGTTTCCTCCTATAATCTTGTGCCGTGGAAATC 1315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGAGTTTGCGACGGGACCAGTGTGTCTTGATGATGAGAATGAGTTTCCTCCTATAATCTTGTGCCGTGGAAATC 1554
Query 1316 AGAAGGGCAAAACGAAGCAGTCA--------------------------------------------------- 1338
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGAAGGGCAAAACGAAGCAGTCATGATGAGAAGCACACCTCAGAAATCAGGACATCCCCCCTATCAGGTGGTTT 1628
Query 1339 -------------------------------------------------------------------------- 1338
Sbjct 1629 TGGAGAAAACAAGGAAGGCGGAAGAATGGAGTGCAATTGTGTGAGCAGAAAGGGGGGCAGGAATCCCGGGTGCT 1702
Query 1339 -------------------------------------------------------------------------- 1338
Sbjct 1703 CCACTGCTTAAACCACAGGACCTGGTTAACTCCTCACCAAGCTTCCCACGACCCTGGTTGCCAATGGGCGCGGG 1776
Query 1339 -------------------------------------------------------------------------- 1338
Sbjct 1777 AGACATTGTATACACATCATGCTATTTAAAATACGTTCAAACTATAGTGTAAATGCTAATTAACCATATTGGTA 1850
Query 1339 -------------------------------------------------------------------------- 1338
Sbjct 1851 TATAACCGGAATTTTATATTAAAAGGGGCCTCCTTTTTAAATATATGCCGTGTAAAAAATGTACTTATAGGAAC 1924
Query 1339 -------------------------------------------------------------------------- 1338
Sbjct 1925 ATCTCTTTGAATTGTATTTCTTGTATATTACATACTTAGAGAGAGACTCTTTTAGCCAGGCAAAGTCTTTTTTG 1998
Query 1339 -------------------------------------------------------------------------- 1338
Sbjct 1999 GCTGTGGCTGGAATAAATCATTTATTACTTGGGAGTCCCATTTTGGACACTAATAATAAAATCATGGCAATGCA 2072