Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468350
• Subject: XM_006497471.3
• Aligned Length: 1155
• Identities: 933
• Gaps: 132

Alignment

Query    1  ATGGCCCGGGAGAACGGCGAGAGCAGCTCCTCCTGGAAAAAGCAAGCTGAAGACATCAAGAAGATCTTCGAGTT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCCGGGAGAACGGCGAGAGCAGCTCCTCCTGGAAAAAGCAAGCAGAAGACATTAAGAAGATCTTCGAGTT  74

Query   75  CAAAGAGACCCTCGGAACCGGGGCCTTTTCCGAAGTGGTTTTAGCTGAAGAGAAGGCAACTGGCAAGCTCTTTG  148
            |||.||||||||||||||                                                        
Sbjct   75  CAAGGAGACCCTCGGAAC--------------------------------------------------------  92

Query  149  CTGTGAAGTGTATCCCTAAGAAGGCGCTGAAGGGCAAGGAAAGCAGCATAGAGAATGAGATAGCCGTCCTGAGA  222
                                                                                      
Sbjct   93  --------------------------------------------------------------------------  92

Query  223  AAGATTAAGCATGAAAATATTGTTGCCCTGGAAGACATTTATGAAAGCCCAAATCACCTGTACTTGGTCATGCA  296
              |||||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||
Sbjct   93  --GATTAAGCATGAAAACATTGTTGCCTTGGAAGATATTTATGAAAGCCCAAATCACCTCTACCTGGTCATGCA  164

Query  297  GCTGGTGTCCGGTGGAGAGCTGTTTGACCGGATAGTGGAGAAGGGGTTTTATACAGAGAAGGATGCCAGCACTC  370
            .||.|||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  165  ACTTGTGTCTGGTGGAGAACTCTTCGATCGGATAGTGGAGAAGGGGTTTTACACAGAGAAAGATGCCAGCACTC  238

Query  371  TGATCCGCCAAGTCTTGGACGCCGTGTACTATCTCCACAGAATGGGCATCGTCCACAGAGACCTCAAGCCCGAA  444
            |.||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct  239  TCATCCGCCAGGTCCTGGATGCCGTATACTATCTCCACAGAATGGGCATTGTCCACAGGGACCTCAAGCCGGAG  312

Query  445  AATCTCTTGTACTACAGTCAAGATGAGGAGTCCAAAATAATGATCAGTGACTTTGGATTGTCAAAAATGGAGGG  518
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  313  AATCTCTTATACTACAGTCAAGACGAGGAGTCCAAAATAATGATCAGTGACTTTGGCTTGTCGAAAATGGAGGG  386

Query  519  CAAAGGAGATGTGATGTCCACTGCCTGTGGAACTCCAGGCTATGTCGCTCCTGAAGTCCTCGCCCAGAAACCTT  592
            |||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|
Sbjct  387  CAAAGGAGATGTGATGTCCACGGCCTGCGGGACCCCAGGCTATGTTGCTCCGGAAGTTCTCGCCCAGAAACCGT  460

Query  593  ACAGCAAAGCCGTTGACTGCTGGTCCATCGGAGTGATTGCCTACATCTTGCTCTGCGGCTACCCTCCTTTTTAT  666
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  461  ACAGCAAAGCTGTGGACTGCTGGTCCATCGGGGTGATCGCCTATATCTTGCTCTGTGGTTACCCTCCTTTTTAT  534

Query  667  GATGAAAATGACTCCAAGCTCTTTGAGCAGATCCTCAAGGCGGAATATGAGTTTGACTCTCCCTACTGGGATGA  740
            ||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  535  GATGAAAATGACTCGAAGCTGTTTGAACAGATCCTCAAGGCAGAATATGAGTTTGATTCCCCCTACTGGGATGA  608

Query  741  CATCTCCGACTCTGCAAAAGACTTCATTCGGAACCTGATGGAGAAGGACCCGAATAAAAGATACACGTGTGAGC  814
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  609  CATCTCCGACTCTGCCAAAGACTTCATTCGGAATCTGATGGAGAAAGACCCAAATAAAAGATACACTTGTGAGC  682

Query  815  AGGCAGCTCGGCACCCATGGATCGCTGGTGACACAGCCCTCAACAAAAACATCCACGAGTCCGTCAGCGCCCAG  888
            ||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||.||.|||||.||||||
Sbjct  683  AGGCAGCTCGACACCCATGGATTGCTGGTGACACAGCCCTTAGCAAAAACATTCACGAATCTGTCAGTGCCCAG  756

Query  889  ATCCGGAAAAACTTTGCCAAGAGCAAATGGAGACAAGCATTTAATGCCACGGCCGTCGTGAGACATATGAGAAA  962
            ||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||.|.|.
Sbjct  757  ATCCGGAAGAATTTTGCAAAGAGCAAATGGAGACAAGCGTTTAACGCCACGGCAGTCGTGAGACATATGCGGAG  830

Query  963  ACTACACCTCGGCAGCAGCCTGGACAGTTCAAATGCAAGTGTTTCGAGCAGCCTCAGTTTGGCCAGCCAAAAAG  1036
            .||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  831  GCTCCAGCTTGGCAGCAGCCTGGACAGTTCAAATGCAAGTGTCTCAAGCAACCTCAGTTTGGCCAGCCAAAAAG  904

Query 1037  ACTGTCTGGCACCTTCCACGCTCTGTAGTTTCATTTCTTCTTCGTCGGGGGTCTCAGGAGTTGGAGCCGAGCGG  1110
            |.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||.|||||.|||.||
Sbjct  905  ATTGTCTGGCACCTTCCACGCTCTGTAGTTTCCTTTCTTCTTCGTCGGGGGTCGCAGGAGTCGGAGCTGAGAGG  978

Query 1111  AGACCCAGGCCCACCACTGTGACGGCAGTGCACTCTGGAAGCAAG  1155
            |||||||||||||||||||||||..|||.||||.|||||||||||
Sbjct  979  AGACCCAGGCCCACCACTGTGACAACAGGGCACACTGGAAGCAAG  1023