Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468390
- Subject:
- NM_001080538.3
- Aligned Length:
- 1041
- Identities:
- 887
- Gaps:
- 102
Alignment
Query 1 ------------ATGG----CCACGTTTGTGGAGCTCA-----------GTACCAAAG---------CCAAGAT 38
|||| |||.|| ||.|||| ..|||||.| ||||
Sbjct 1 ATGGTCTTACAAATGGAACCCCAAGT-----GAACTCAACTAACAACTTCCACCAAGGACCCCTGGACCAA--- 66
Query 39 GCCCATTG------TG---GGCCT------------------GGGCACT-----TGGAAG-------------- 66
|||.||| || ||||| ||.|||| ||.|.|
Sbjct 67 -CCCGTTGGCCCTTTGACTGGCCTAAAGAGTTCCCTTCTGAAGGACACTACAAGTGCAGGGCCCCTTCTTCGCC 139
Query 67 -----------TCTCCTCTTGGCAAAGTGAAAGAAGCAGTGAAGGTGGCCATTGATGCAGGATATCGGCACATT 129
||||.|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||.||||||
Sbjct 140 CCTATCCAGCATCTCTTCTCGGCAAAGTGAAAGAAGCGGTGAAGGTGGCCATTGATGCAGAATATCGCCACATT 213
Query 130 GACTGTGCCTATGTCTATCAGAATGAACATGAAGTGGGGGAAGCCATCCAAGAGAAGATCCAAGAGAAGGCTGT 203
||||||||||||.|||||.|||||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 214 GACTGTGCCTATTTCTATGAGAATCAACATGAGGTGGGAGAAGCCATCCAAGAGAAGATCCAAGAGAAGGCTGT 287
Query 204 GAAGCGGGAGGACCTGTTCATCGTCAGCAAGTTGTGGCCCACTTTCTTTGAGAGACCCCTTGTGAGGAAAGCCT 277
||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 288 GATGCGGGAGGACCTGTTCATCGTCAGCAAGGTGTGGCCCACTTTCTTTGAGAGACCCCTTGTGAGGAAAGCCT 361
Query 278 TTGAGAAGACCCTCAAGGACCTGAAGCTGAGCTATCTGGACGTCTATCTTATTCACTGGCCACAGGGATTCAAG 351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 362 TTGAGAAGACCCTCAAGGACCTGAAGCTGAGCTATCTGGACGTCTATCTTATTCACTGGCCACAGGGATTCAAG 435
Query 352 TCTGGGGATGACCTTTTCCCCAAAGATGATAAAGGTAATGCCATCGGTGGAAAAGCAACGTTCTTGGATGCCTG 425
.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||...|||.|||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 436 ACTGGGGATGACTTTTTCCCCAAAGATGATAAAGGTAATATGATCAGTGGAAAAGGAACGTTCTTGGATGCCTG 509
Query 426 GGAGGCCATGGAGGAGCTGGTGGATGAGGGGCTGGTGAAAGCCCTTGGGGTCTCCAATTTCAGCCACTTCCAGA 499
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct 510 GGAGGCCATGGAGGAGCTGGTGGACGAGGGGCTGGTGAAAGCCCTTGGGGTCTCAAATTTCAACCACTTCCAGA 583
Query 500 TCGAGAAGCTCTTGAACAAACCTGGACTGAAATATAAACCAGTGACTAACCAGGTTGAGTGTCACCCATACCTC 573
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 584 TCGAGAGGCTCTTGAACAAACCTGGACTGAAATATAAACCAGTGACTAACCAGGTTGAGTGTCACCCATACCTC 657
Query 574 ACACAGGAGAAACTGATCCAGTACTGCCACTCCAAGGGCATCACCGTTACGGCCTACAGCCCCCTGGGCTCTCC 647
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 ACGCAGGAGAAACTGATCCAGTACTGCCACTCCAAGGGCATCACCGTTACGGCCTACAGCCCCCTGGGCTCTCC 731
Query 648 GGATAGACCTTGGGCCAAGCCAGAAGACCCTTCCCTGCTGGAGGATCCCAAGATTAAGGAGATTGCTGCAAAGC 721
||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 732 GGATAGACCTTGGGCCAAACCTGAGGACCCTTCCCTGCTGGAGGATCCCAAGATTAAGGAGATTGCTGCAAAGC 805
Query 722 ACAAAAAAACCGCAGCCCAGGTTCTGATCCGTTTCCATATCCAGAGGAATGTGATTGTCATCCCCAAGTCTGTG 795
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.||||||||||||.||
Sbjct 806 ACAAAAAAACCACAGCCCAGGTTCTGATCCGTTTCCATATCCAGAGGAATGTGACAGTGATCCCCAAGTCTATG 879
Query 796 ACACCAGCACGCATTGTTGAGAACATTCAGGTCTTTGACTTTAAATTGAGTGATGAGGAGATGGCAACCATACT 869
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 880 ACACCAGCACACATTGTTGAGAACATTCAGGTCTTTGACTTTAAATTGAGTGATGAGGAGATGGCAACCATACT 953
Query 870 CAGCTTCAACAGAAACTGGAGGGCCTGTAACGTGTTGCAATCCTCTCATTTGGAAGACTATCCCTTCGATGCAG 943
||||||||||||||||||||||||||.|.||.|...|.|||.||||||||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct 954 CAGCTTCAACAGAAACTGGAGGGCCTTTGACTTCAAGGAATTCTCTCATTTGGAGGACTTTCCCTTCGATGCAG 1027
Query 944 AATAT 948
|||||
Sbjct 1028 AATAT 1032