Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468390
• Subject: XM_011516416.1
• Aligned Length: 948
• Identities: 830
• Gaps: 117

Alignment

Query   1  ATGGCCACGTTTGTGGAGCTCAGTACCAAAGCCAAGATGCCCATTGTGGGCCTGGGCACTTGGAAGTCTCCTCT  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCCACGTTTGTGGAGCTCAGTACCAAAGCCAAGATGCCCATTGTGGGCCTGGGCACTTGGAAGTCTCCTCT  74

Query  75  TGGCAAAGTGAAAGAAGCAGTGAAGGTGGCCATTGATGCAGGATATCGGCACATTGACTGTGCCTATGTCTATC  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TGGCAAAGTGAAAGAAGCAGTGAAGGTGGCCATTGATGCAGGATATCGGCACATTGACTGTGCCTATGTCTATC  148

Query 149  AGAATGAACATGAAGTGGGGGAAGCCATCCAAGAGAAGATCCAAGAGAAGGCTGTGAAGCGGGAGGACCTGTTC  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  AGAATGAACATGAAGTGGGGGAAGCCATCCAAGAGAAGATCCAAGAGAAGGCTGTGAAGCGGGAGGACCTGTTC  222

Query 223  ATCGTCAGCAAGTTGTGGCCCACTTTCTTTGAGAGACCCCTTGTGAGGAAAGCCTTTGAGAAGACCCTCAAGGA  296
           ||||||||                                                                  
Sbjct 223  ATCGTCAG------------------------------------------------------------------  230

Query 297  CCTGAAGCTGAGCTATCTGGACGTCTATCTTATTCACTGGCCACAGGGATTCAAGTCTGGGGATGACCTTTTCC  370
                                                              |||||||||||||||||||||||
Sbjct 231  ---------------------------------------------------CAAGTCTGGGGATGACCTTTTCC  253

Query 371  CCAAAGATGATAAAGGTAATGCCATCGGTGGAAAAGCAACGTTCTTGGATGCCTGGGAGGCCATGGAGGAGCTG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 254  CCAAAGATGATAAAGGTAATGCCATCGGTGGAAAAGCAACGTTCTTGGATGCCTGGGAGGCCATGGAGGAGCTG  327

Query 445  GTGGATGAGGGGCTGGTGAAAGCCCTTGGGGTCTCCAATTTCAGCCACTTCCAGATCGAGAAGCTCTTGAACAA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 328  GTGGATGAGGGGCTGGTGAAAGCCCTTGGGGTCTCCAATTTCAGCCACTTCCAGATCGAGAAGCTCTTGAACAA  401

Query 519  ACCTGGACTGAAATATAAACCAGTGACTAACCAGGTTGAGTGTCACCCATACCTCACACAGGAGAAACTGATCC  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 402  ACCTGGACTGAAATATAAACCAGTGACTAACCAGGTTGAGTGTCACCCATACCTCACACAGGAGAAACTGATCC  475

Query 593  AGTACTGCCACTCCAAGGGCATCACCGTTACGGCCTACAGCCCCCTGGGCTCTCCGGATAGACCTTGGGCCAAG  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 476  AGTACTGCCACTCCAAGGGCATCACCGTTACGGCCTACAGCCCCCTGGGCTCTCCGGATAGACCTTGGGCCAAG  549

Query 667  CCAGAAGACCCTTCCCTGCTGGAGGATCCCAAGATTAAGGAGATTGCTGCAAAGCACAAAAAAACCGCAGCCCA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 550  CCAGAAGACCCTTCCCTGCTGGAGGATCCCAAGATTAAGGAGATTGCTGCAAAGCACAAAAAAACCGCAGCCCA  623

Query 741  GGTTCTGATCCGTTTCCATATCCAGAGGAATGTGATTGTCATCCCCAAGTCTGTGACACCAGCACGCATTGTTG  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 624  GGTTCTGATCCGTTTCCATATCCAGAGGAATGTGATTGTCATCCCCAAGTCTGTGACACCAGCACGCATTGTTG  697

Query 815  AGAACATTCAGGTCTTTGACTTTAAATTGAGTGATGAGGAGATGGCAACCATACTCAGCTTCAACAGAAACTGG  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 698  AGAACATTCAGGTCTTTGACTTTAAATTGAGTGATGAGGAGATGGCAACCATACTCAGCTTCAACAGAAACTGG  771

Query 889  AGGGCCTGTAACGTGTTGCAATCCTCTCATTTGGAAGACTATCCCTTCGATGCAGAATAT  948
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 772  AGGGCCTGTAACGTGTTGCAATCCTCTCATTTGGAAGACTATCCCTTCAATGCAGAATAT  831