Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468435
- Subject:
- XM_017028596.2
- Aligned Length:
- 1366
- Identities:
- 1008
- Gaps:
- 248
Alignment
Query 1 ATGAAGCCTCACTTCAGAAACACAGTGGAGCGAATGTATCGAGACACATTCTCCTACAACTTTTATAATAGACC 74
|||||.||.||..|||||||..|..|||||||.|||||||||||||||||||.|.||||||||.|.||...|||
Sbjct 1 ATGAATCCACAGATCAGAAATCCGATGGAGCGGATGTATCGAGACACATTCTACGACAACTTTGAAAACGAACC 74
Query 75 CATCCTTTCTCGTCGGA-ATACCGTCTGGCTGTGCTACGAAGTGAAAACAAA---GGGTCCCTCAAGGCCCCGT 144
||||||.|.|.|||||| .|||..| |||||||||||.||||||||||.||| |||.|.|||||..|.||.|
Sbjct 75 CATCCTCTATGGTCGGAGCTACACT-TGGCTGTGCTATGAAGTGAAAATAAAGAGGGGCCGCTCAAATCTCCTT 147
Query 145 TTGGACGCAAAGATCTTTCGAGGCC------------------------------------AGGTGTATTCCCA 182
|.||||.||..|.|||||||||||| |||||||||.||.
Sbjct 148 TGGGACACAGGGGTCTTTCGAGGCCCGGTACTACCCAAACGTCAGTCGAATCACAGGCAGGAGGTGTATTTCCG 221
Query 183 GCCTGAGCACCACGCAGAAATGTGCTTCCTCTCTTGGTTCTGTGGCAACCAGCTGCCTGCTTACAAGTGTTTCC 256
|..||||.||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||..|||||||||.|||.|.|.||||
Sbjct 222 GTTTGAGAACCACGCAGAAATGTGCTTCTTATCTTGGTTCTGTGGCAACCGACTGCCTGCTAACAGGCGCTTCC 295
Query 257 AGATCACCTGGTTTGTATCCTGGACCCCCTGCCCGGACTGTGTGGCGAAGCTGGCCGAATTCCTGTCTGAGCAC 330
|||||||||||||||||||.||||.||||||||.|..||||||||.||||.||.||.|||||.||.||||||||
Sbjct 296 AGATCACCTGGTTTGTATCATGGAACCCCTGCCTGCCCTGTGTGGTGAAGGTGACCAAATTCTTGGCTGAGCAC 369
Query 331 CCCAATGTCACCCTGACCATCTCCGCCGCCCGCCTCTACTACTACTGGGAAAGAGATTACCGAAGGGCGCTCTG 404
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||..||..|||.||||..
Sbjct 370 CCCAATGTCACCCTGACCATCTCTGCCGCCCGCCTCTACTACTACCGGGATAGAGATTGGCGGTGGGTGCTCCT 443
Query 405 CAGGCTGAGTCAGGCAGGGGCCCGTGTGAAGATTATGGACGATGA----------------------------- 449
|||||||..|.||||||||||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct 444 CAGGCTGCATAAGGCAGGGGCCCGTGTGAAGATCATGGACTATGAAGGTGAGAGGTGCAGGGGTCAGGGGAGCA 517
Query 450 -------------------------------------------------------------------------- 449
Sbjct 518 TGACGGGGAGGAACAGCCTCAGAGATGGATGGATCTGCAATGCCATGGCTGGGGGTGTTCCAGGGCAGCCTGCA 591
Query 450 -------------------------------------------------------------------------- 449
Sbjct 592 GGGGTGGGGCTGGCACTGATTGCAACTGACAGCCAGGAGACCAGGCCTGGGAGGGCAGGCCCAGGGTCAGGGGA 665
Query 450 ------------------------------AGAATTTGCATACTGCTGGGAAAACTTTGTGTACAGTGAAGGTC 493
|||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 666 GAGCCTGAGTGCTTCCCACCTCTTCATCTCAGACTTTGCATACTGCTGGGAAAACTTTGTGTGCAATGAAGGTC 739
Query 494 AGCCATTCATGCCTTGGTACAAATTCGATGACAATTATGCATTCCTGCACCGCACGCTAAAGGAGATTCTCAGA 567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 AGCCATTCATGCCTTGGTACAAATTCGATGACAATTATGCATCCCTGCACCGCACGCTAAAGGAGATTCTCAGA 813
Query 568 AACCCGATGGAGGCAATGTATCCACACATATTCTACTTCCACTTTAAAAACCTACGCAAAGCCTATGGTCGGAA 641
||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.|||||||||
Sbjct 814 AACCCGATGGAGGCAATGTACCCACACATATTCTACTTCCACTTTAAAAACCTACTGAAAGCCTGTGGTCGGAA 887
Query 642 CGAAAGCTGGCTGTGCTTCACCATGGAAGTTGTAAAGCACCACTCACCTATCTCCTGGAAGAGGGGCGTCTTCC 715
|||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.||.|||.|.||||||||||||||||||
Sbjct 888 CGAAAGCTGGCTGTGCTTCACCATGGAAGTTACAAAGCACCACTCAGCTGTCTTCCGGAAGAGGGGCGTCTTCC 961
Query 716 GAAACCAGGTGGATCCTGAGACCCATTGTCATGCAGAAAGGTGCTTCCTCTCTTGGTTCTGTGACGACATACTG 789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 GAAACCAGGTGGATCCTGAGACCCATTGTCATGCAGAAAGGTGCTTCCTCTCTTGGTTCTGTGACGACATACTG 1035
Query 790 TCTCCTAACACAAACTACGAGGTCACCTGGTACACATCTTGGAGCCCTTGCCCAGAGTGTGCAGGGGAGGTGGC 863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 TCTCCTAACACAAACTACGAGGTCACCTGGTACACATCTTGGAGCCCTTGCCCAGAGTGTGCAGGGGAGGTGGC 1109
Query 864 CGAGTTCCTGGCCAGGCACAGCAACGTGAATCTCACCATCTTCACCGCCCGCCTCTACTACTTCTGGGATACAG 937
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1110 CGAGTTCCTGGCCAGGCACAGCAACGTGAATCTCACCATCTTCACCGCCCGCCTCTGCTACTTCTGGGATACAG 1183
Query 938 ATTACCAGGAGGGGCTCCGCAGCCTGAGTCAGGAAGGGGCCTCCGTGGAGATCATGGGCTACAAAGATTTTAAA 1011
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|
Sbjct 1184 ATTACCAGGAGGGGCTCTGCAGCCTGAGTCAGGAAGGGGCCTCCGTGAAGATCATGGGCTACAAAGATTTTGTA 1257
Query 1012 TATTGTTGGGAAAACTTTGTGTACAATGATGATGAGCCATTCAAGCCTTGGAAAGGACTAAAATACAACTTTCT 1085
|.|||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||.||..||||||||.
Sbjct 1258 TCTTGTTGGAAAAACTTTGTGTACAGTGATGATGAGCCATTCAAGCCTTGGAAGGGACTACAAACCAACTTTCG 1331
Query 1086 ATTCCTGGACAGCAAGCTGCAGGAGATTCTCGAG 1119
|.|.|||.|.||.|.|||.|.||||||||||.||
Sbjct 1332 ACTTCTGAAAAGAAGGCTACGGGAGATTCTCCAG 1365