Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000468435
Subject:
XM_024452178.1
Aligned Length:
1326
Identities:
1116
Gaps:
207

Alignment

Query    1  ATGAAGCCTCACTTCAGAAACACAGTGGAGCGAATGTATCGAGACACATTCTCCTACAACTTTTATAATAGACC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGCCTCACTTCAGAAACACAGTGGAGCGAATGTATCGAGACACATTCTCCTACAACTTTTATAATAGACC  74

Query   75  CATCCTTTCTCGTCGGAATACCGTCTGGCTGTGCTACGAAGTGAAAACAAAGGGTCCCTCAAGGCCCCGTTTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATCCTTTCTCGTCGGAATACCGTCTGGCTGTGCTACGAAGTGAAAACAAAGGGTCCCTCAAGGCCCCGTTTGG  148

Query  149  ACGCAAAGATCTTTCGAGGCCAGGTGTATTCCCAGCCTGAGCACCACGCAGAAATGTGCTTCCTCTCTTGGTTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACGCAAAGATCTTTCGAGGCCAGGTGTATTCCCAGCCTGAGCACCACGCAGAAATGTGCTTCCTCTCTTGGTTC  222

Query  223  TGTGGCAACCAGCTGCCTGCTTACAAGTGTTTCCAGATCACCTGGTTTGTATCCTGGACCCCCTGCCCGGACTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGTGGCAACCAGCTGCCTGCTTACAAGTGTTTCCAGATCACCTGGTTTGTATCCTGGACCCCCTGCCCGGACTG  296

Query  297  TGTGGCGAAGCTGGCCGAATTCCTGTCTGAGCACCCCAATGTCACCCTGACCATCTCCGCCGCCCGCCTCTACT  370
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTGGCGAAGCTGGCCGAATTCCTGGCTGAGCACCCCAATGTCACCCTGACCATCTCCGCCGCCCGCCTCTACT  370

Query  371  ACTACTGGGAAAGAGATTACCGAAGGGCGCTCTGCAGGCTGAGTCAGGCAGGGGCCCGTGTGAAGATTATGGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  ACTACTGGGAAAGAGATTACCGAAGGGCGCTCTGCAGGCTGAGTCAGGCAGGGGCCCGCGTGAAGATTATGGAC  444

Query  445  GATGA---------------------------------------------------------------------  449
            |||||                                                                     
Sbjct  445  GATGAAGGTGAGAGGTGGAGGGGTCAGGGGAGCGTGAGCGGGAGGAACAGCATGAAAGATGGATGGATCTGCAA  518

Query  450  --------------------------------------------------------------------------  449
                                                                                      
Sbjct  519  TGCCATGGCTGGGGGTGTCCCAGGGCAGCCTGCAGGGGCGGGGCCAGCACTGACAGCAACTGACAGCCAGGAGA  592

Query  450  ----------------------------------------------------------------AGAATTTGCA  459
                                                                            ||||||||||
Sbjct  593  CCAGGCCTGGGAGCGCGGGCCCAGGGTCAGGGCAGAGCCTGACTGCTTCCTGCCTCTTCGTCTCAGAATTTGCA  666

Query  460  TACTGCTGGGAAAACTTTGTGTACAGTGAAGGTCAGCCATTCATGCCTTGGTACAAATTCGATGACAATTATGC  533
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TACTGCTGGGAAAACTTTGTGTACAGTGAAGGTCAGCCATTCATGCCTTGGTACAAATTCGATGACAATTATGC  740

Query  534  ATTCCTGCACCGCACGCTAAAGGAGATTCTCAGAAACCCGATGGAGGCAATGTATCCACACATATTCTACTTCC  607
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATTCCTGCACCGCACGCTAAAGGAGATTCTCAGAAACCCGATGGAGGCAATGTATCCACACATATTCTACTTCC  814

Query  608  ACTTTAAAAACCTACGCAAAGCCTATGGTCGGAACGAAAGCTGGCTGTGCTTCACCATGGAAGTTGTAAAGCAC  681
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACTTTAAAAACCTACGCAAAGCCTATGGTCGGAACGAAAGCTGGCTGTGCTTCACCATGGAAGTTGTAAAGCAC  888

Query  682  CACTCACCTATCTCCTGGAAGAGGGGCGTCTTCCGAAACCAGGTGGATCCTGAGACCCATTGTCATGCAGAAAG  755
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CACTCACCTGTCTCCTGGAAGAGGGGCGTCTTCCGAAACCAGGTGGATCCTGAGACCCATTGTCATGCAGAAAG  962

Query  756  GTGCTTCCTCTCTTGGTTCTGTGACGACATACTGTCTCCTAACACAAACTACGAGGTCACCTGGTACACATCTT  829
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTGCTTCCTCTCTTGGTTCTGTGACGACATACTGTCTCCTAACACAAACTACGAGGTCACCTGGTACACATCTT  1036

Query  830  GGAGCCCTTGCCCAGAGTGTGCAGGGGAGGTGGCCGAGTTCCTGGCCAGGCACAGCAACGTGAATCTCACCATC  903
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGAGCCCTTGCCCAGAGTGTGCAGGGGAGGTGGCCGAGTTCCTGGCCAGGCACAGCAACGTGAATCTCACCATC  1110

Query  904  TTCACCGCCCGCCTCTACTACTTCTGGGATACAGATTACCAGGAGGGGCTCCGCAGCCTGAGTCAGGAAGGGGC  977
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTCACCGCCCGCCTCTACTACTTCTGGGATACAGATTACCAGGAGGGGCTCCGCAGCCTGAGTCAGGAAGGGGC  1184

Query  978  CTCCGTGGAGATCATGGGCTACAAAGATTTTAAATATTGTTGGGAAAACTTTGTGTACAATGATGATGAGCCAT  1051
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTCCGTGGAGATCATGGGCTACAAAGATTTTAAATATTGTTGGGAAAACTTTGTGTACAATGATGATGAGCCAT  1258

Query 1052  TCAAGCCTTGGAAAGGACTAAAATACAACTTTCTATTCCTGGACAGCAAGCTGCAGGAGATTCTCGAG  1119
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCAAGCCTTGGAAAGGACTAAAATACAACTTTCTATTCCTGGACAGCAAGCTGCAGGAGATTCTCGAG  1326