Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468576
• Subject: XM_011536231.1
• Aligned Length: 1560
• Identities: 1374
• Gaps: 183

Alignment

Query    1  ATGGTCACTTCCTCTTTTCCAATCTCTGTGGCAGTTTTTGCCCTAATAACCCTGCAGGTTGGTACTCAGGACAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTCACTTCCTCTTTTCCAATCTCTGTGGCAGTTTTTGCCCTAATAACCCTGCAGGTTGGTACTCAGGACAG  74

Query   75  TTTTATAGCTGCAGTGTATGAACATGCTGTCATTTTGCCAAATAAAACAGAAACACCAGTTTCTCAGGAGGATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTTTATAGCTGCAGTGTATGAACATGCTGTCATTTTGCCAAATAAAACAGAAACACCAGTTTCTCAGGAGGATG  148

Query  149  CCTTGAATCTCATGAACGAGAATATAGACATTCTGGAGACAGCGATCAAGCAGGCAGCTGAGCAGGGTGCTCGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTTGAATCTCATGAACGAGAATATAGACATTCTGGAGACAGCGATCAAGCAGGCAGCTGAGCAGGGTGCTCGA  222

Query  223  ATCATTGTGACTCCAGAAGATGCACTTTATGGATGGAAATTTACCAGGGAAACTGTTTTCCCTTATCTGGAGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATCATTGTGACTCCAGAAGATGCACTTTATGGATGGAAATTTACCAGGGAAACTGTTTTCCCTTATCTGGAGGA  296

Query  297  TATCCCAGACCCTCAGGTGAACTGGATTCCGTGTCAAGACCCCCACAGATTTGGTCACACACCAGTACAAGCAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TATCCCAGACCCTCAGGTGAACTGGATTCCGTGTCAAGACCCCCACAGATTTGGTCACACACCAGTACAAGCAA  370

Query  371  GACTCAGCTGCCTGGCCAAGGACAACTCTATCTATGTCTTGGCAAATTTGGGGGACAAAAAGCCATGTAATTCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GACTCAGCTGCCTGGCCAAGGACAACTCTATCTATGTCTTGGCAAATTTGGGGGACAAAAAGCCATGTAATTCC  444

Query  445  CGTGACTCCACATGTCCTCCTAATGGCTACTTTCAATACAATACCAATGTGGTGTATAATACAGAAGGAAAACT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGTGACTCCACATGTCCTCCTAATGGCTACTTTCAATACAATACCAATGTGGTGTATAATACAGAAGGAAAACT  518

Query  519  CGTGGCACGTTACCATAAGTACCACCTGTACTCTGAGCCTCAGTTTAATGTCCCTGAAAAGCCGGAGTTGGTGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGTGGCACGTTACCATAAGTACCACCTGTACTCTGAGCCTCAGTTTAATGTCCCTGAAAAGCCGGAGTTGGTGA  592

Query  593  CTTTCAACACCGCATTTGGAAGGTTTGGCATTTTCACGTGCTTTGATATATTCTTCTATGATCCTGGTGTTACC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTTTCAACACCGCATTTGGAAGGTTTGGCATTTTCACGTGCTTTGATATATTCTTCTATGATCCTGGTGTTACC  666

Query  667  CTGGTGAAAGATTTCCATGTGGACACCATACTGTTTCCCACAGCTTGGATGAACGTTTTGCCCCTTTTGACAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGGTGAAAGATTTCCATGTGGACACCATACTGTTTCCCACAGCTTGGATGAACGTTTTGCCCCTTTTGACAGC  740

Query  741  TATTGAATTCCATTCAGCTTGGGCAATGGGAATGGGAGTTAATCTTCTTGTGGCCAACACACATCATGTCAGCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TATTGAATTCCATTCAGCTTGGGCAATGGGAATGGGAGTTAATCTTCTTGTGGCCAACACACATCATGTCAGCC  814

Query  815  TAAATATGACAGGAAGTGGTATTTATGCACCAAATGGTCCCAAAGTGTATCATTATGACATGAAGACAGAGTTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TAAATATGACAGGAAGTGGTATTTATGCACCAAATGGTCCCAAAGTGTATCATTATGACATGAAGACAGAGTTG  888

Query  889  GGAAAACTTCTCCTTTCAGAGGTGGATTCACATCCCCTATCCTCGCTTGCCTACCCAACAGCTGTTAATTGGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGAAAACTTCTCCTTTCAGAGGTGGATTCACATCCCCTATCCTCGCTTGCCTACCCAACAGCTGTTAATTGGAA  962

Query  963  TGCCTACGCCACCACCATCAAACCATTTCCAGTACAGAAAAACACTTTCAGGGGATTTATTTCCAGGGATGGGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGCCTACGCCACCACCATCAAACCATTTCCAGTACAGAAAAACACTTTCAGGGGATTTATTTCCAGGGATGGGT  1036

Query 1037  TCAACTTCACAGAACTTTTTGAAAATGCAGGAAACCTTACAGTCTGTCAAAAGGAGCTTTGCTGTCATTTAAGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCAACTTCACAGAACTTTTTGAAAATGCAGGAAACCTTACAGTCTGTCAAAAGGAGCTTTGCTGTCATTTAAGC  1110

Query 1111  TACAGAATGTTACAAAAAGAAGAGAATGAAGTATACGTTCTAGGAGCTTTTACAGGATTACATGGCCGAAGGAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TACAGAATGTTACAAAAAGAAGAGAATGAAGTATACGTTCTAGGAGCTTTTACAGGATTACATGGCCGAAGGAG  1184

Query 1185  AAGAGAGTACTGGCAGGTCTGCACAATGCTGAAGTGCAAAACTACTAATTTGACAACTTGTGGACGGCCAGTAG  1258
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AAGAGAGTACTGGCAGGTCTGCACACTGCTGAAGTGCAAAACTACTAATTTGACAACTTGTGGACGGCCAGTAG  1258

Query 1259  AAACTGCTTCTACAAGATTTGAAATGTTCTCCCTCAGTGGCACATTTGGAACAGAGTATGTTTTTCCTGAAGTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAACTGCTTCTACAAGATTTGAAATGTTCTCCCTCAGTGGCACATTTGGAACAGAGTATGTTTTTCCTGAAGTG  1332

Query 1333  CTACTTACCGAAATTCATCTGTCACCTGGAAAATTTGAGGTGCTGAAAGATGGGCGTTTGGTAAACAAGAATGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      |.||||.       
Sbjct 1333  CTACTTACCGAAATTCATCTGTCACCTGGAAAATTTGA----------------------GCAAACC-------  1377

Query 1407  ATCATCTGGGCCTATACTAACAGTGTCACTCTTTGGGAGGTGGTACACAAAGGACTCACTTTACAGCTCATGTG  1480
                                                                                      
Sbjct 1378  --------------------------------------------------------------------------  1377

Query 1481  GGACCAGCAATTCAGCAATAACTTACCTGCTAATATTCATATTATTAATGATCATAGCTTTGCAAAATATTGTA  1554
                                                                                      
Sbjct 1378  --------------------------------------------------------------------------  1377

Query 1555  ATGTTA  1560
                  
Sbjct 1378  ------  1377