Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468585
• Subject: NM_001172575.1
• Aligned Length: 1830
• Identities: 1398
• Gaps: 429

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGGCCCCCATCCTGAAAGATGTAGTGGCCTATGTTGAAGTGTGGTCATCCAATGGAACAGAAAATTATTC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  AAAGACATTTACAACACAGCTTGTGGATATGGGGGCAAAGGTTTCAAAAACTTTTAACAAACAAGTAACTCACG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TTATCTTCAAAGATGGCTACCAGAGCACTTGGGACAAAGCTCAGAAGAGAGGCGTAAAGCTCGTTTCGGTGCTC  222

Query    1  ---------------------------------------------------------------ATGAATGAACA  11
                                                                           |||||||||||
Sbjct  223  TGGGTGGAAAAATGCAGGACAGCTGGAGCACACATTGATGAATCATTGTTCCCTGCAGCTAATATGAATGAACA  296

Query   12  CTTATCAAGCCTAATTAAAAAAAAACGTAAATGTATGCAGCCCAAGGATTTTAATTTTAAAACACCAGAAAATG  85
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTATCAAGCCTAATTAAAAAAAAACGTAAATGTATGCAGCCCAAAGATTTTAATTTTAAAACACCAGAAAATG  370

Query   86  ATAAGAGATTTCAGAAGAAATTTGAGAAAATGGCTAAAGAGCTACAAAGGCAAAAAACAAATCTAGATGATGAT  159
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct  371  ATAAGAGATTTCAGAAGAAATTTGAGAAAATGGCTAAAGAGCTACAAAGGCAAAAAACAAATCTAG--------  436

Query  160  GTACCTATTCTCTTATTTGAATCTAATGGTTCATTAATATATACTCCCACAATTGAAATTAATAGTAGTCACCA  233
                                                                                      
Sbjct  437  --------------------------------------------------------------------------  436

Query  234  CAGCGCAATGGAGAAGAGATTACAAGAGATGAAGGAGAAAAGGGAAAATCTTTCCCCCACCTCTTCCCAAATGA  307
                                                                          ||||||||||||
Sbjct  437  --------------------------------------------------------------CTTCCCAAATGA  448

Query  308  TTCAGCAGTCTCATGATAATCCAAGTAACTCTCTGTGTGAAGCACCTTTGAACATTTCACGTGATACTTTGTGT  381
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  449  TTCAGCAGTCTCATGATAATCCAAGTAACTCTCTGTGTGAAGCACCTTTGAACATTTCACGTGATACTTTGTGT  522

Query  382  TCAGATGAATACTTTGCTGGTGGCTTACACTCATCTTTTGATGATCTTTGTGGAAACTCAGGATGTGGAAATCA  455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  523  TCAGATGAATACTTTGCTGGTGGCTTACACTCATCTTTTGATGATCTTTGTGGAAACTCAGGATGTGGAAATCA  596

Query  456  GGAAAGGAAGTTGGAAGGATCCATTAATGACATTAAAAGTGATGTGTGTATTTCTTCACTTGTATTGAAAGCAA  529
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  597  GGAAAGGAAGTTGGAAGGATCCATTAATGACATTAAAAGTGATGTGTGTATTTCTTCACTTGTATTGAAAGCAA  670

Query  530  ATAATATTCATTCATCACCATCTTTCACTCACCTCGATAAATCAAGTCCTCAGAAATTTCTGAGTAATCTTTCA  603
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  671  ATAATATTCATTCATCACCATCTTTCACTCACCTCGATAAATCAAGTCCTCAGAAATTTCTGAGTAATCTTTCA  744

Query  604  AAGGAAGAAATAAACTTGCAAAGAAATATTGCAGGTAAAGTAGTCACCCCTCACCAAAAGCAGGCTGCAGGTAT  677
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  745  AAGGAAGAAATAAACTTGCAAAGAAATATTGCAGGTAAAGTAGTCACCCCTGACCAAAAGCAGGCTGCAGGTAT  818

Query  678  GTCTCAGGAGACGTTTGAAGAGAAGTATCGTTTGTCTCCTACCTTATCTTCAACAAAAGGCCACCTTTTGATAC  751
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  819  GTCTCAGGAGACGTTTGAAGAGAAGTATCGTTTGTCTCCTACCTTATCTTCAACAAAAGGCCACCTTTTGATAC  892

Query  752  ATTCAAGACCCAGGAGTTCCTCAGTAAAGAGAAAAAGAGTATCACATGGCTCCCATTCACCTCCGAAGGAAAAA  825
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  893  ATTCAAGACCCAGGAGTTCCTCAGTAAAGAGAAAAAGAGTATCACATGGCTCCCATTCACCTCCGAAGGAAAAA  966

Query  826  TGCAAGAGAAAGAGGAGCACCAGGAGATCTATCATGCCGAGGCTGCAGCTGTGCAGGTCGGAAGGCAGGCTGCA  899
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  967  TGCAAGAGAAAGAGGAGCACCAGGAGATCTATCATGCCGAGGCTGCAGCTGTGCAGGTCGGAAGACAGGCTGCA  1040

Query  900  GCACGTGGCGGGACCTGCCCTGGAGGCTCTTAGCTGTGGGGAGTCTTCATATGATGACTATTTTTCACCTGATA  973
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041  GCACGTGGCGGGACCTGCCCTGGAGGCTCTTAGCTGTGGGGAGTCTTCATATGATGACTATTTTTCACCTGATA  1114

Query  974  ATCTTAAGGAAAGGTATTCAGAGAATCTTCCTCCTGAATCTCAGCTGCCATCAAGCCCTGCTCAGTTGAGCTGC  1047
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115  ATCTTAAGGAAAGGTATTCAGAGAATCTTCCTCCTGAATCTCAGCTGCCATCAAGCCCTGCTCAGTTGAGCTGC  1188

Query 1048  AGAAGTCTTTCTAAGAAGGAGAGAACAAGCATATTTGAAATGTCTGATTTTTCCTGCGTTGGCAAAAAAACCAG  1121
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189  AGAAGTCTTTCTAAGAAGGAGAGAACAAGCATATTTGAAATGTCTGATTTTTCCTGCGTTGGCAAAAAAACCAG  1262

Query 1122  AACAGTTGACATTACCAATTTCACAGCAAAAACCATCTCCAGTCCTCGGAAAACTGGAAATGGTGAAGGCCGTG  1195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1263  AACAGTTGACATTACCAATTTCACAGCAAAAACCATCTCCAGTCCTCGGAAAACTGGAAATGGTGAAGGCCGTG  1336

Query 1196  CAACTTCGAGTTGCGTGACTTCTGCCCCTGAAGAAGCCCTAAGGTGTTGTAGACAGGCTGGGAAAGAAGACGCA  1269
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337  CAACTTCGAGTTGCGTGACTTCTGCCCCTGAAGAAGCCCTAAGGTGTTGTAGACAGGCTGGGAAAGAAGACGCA  1410

Query 1270  TGCCCAGAGGGAAATGGCTTTTCTTACACCATTGAGGACCCTGCTCTTCCAAAAGGACATGATGATGATTTAAC  1343
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1411  TGCCCAGAGGGAAATGGCTTTTCTTACACCATTGAGGACCCTGCTCTTCCAAAAGGACATGATGATGATTTAAC  1484

Query 1344  TCCTTTGGAAGGAAGCCTTGAAGAAATGAAAGAAGCGGTTGGTCTGAAAAGCACACAGAACAAAGGTACCACTT  1417
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1485  TCCTTTGGAAGGAAGCCTTGAAGAAATGAAAGAAGCGGTTGGTCTGAAAAGCACACAGAACAAAGGTACCACTT  1558

Query 1418  CCAAAATATCAAACTCCTCTGAAGGCGAAGCCCAGAGTGAACATGAGCCATGTTTTATAGTTGACTGTAACATG  1491
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559  CCAAAATATCAAACTCCTCTGAAGGCGAAGCCCAGAGTGAACATGAGCCATGTTTTATAGTTGACTGTAACATG  1632

Query 1492  GAGACGTCTACAGAAGAGAAGGAAAACTTACCCGGAGGATACAGTGGAAGTATG  1545
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1633  GAGACGTCTACAGAAGAGAAGGAAAACTTACCCGGAGGATACAGTGGAAGTATG  1686