Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468585
- Subject:
- NM_001322043.1
- Aligned Length:
- 1824
- Identities:
- 1542
- Gaps:
- 279
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGGCCCCCATCCTGAAAGTGGCCTATGTTGAAGTGTGGTCATCCAATGGAACAGAAAATTATTCAAAGAC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 ATTTACAACACAGCTTGTGGATATGGGGGCAAAGGTTTCAAAAACTTTTAACAAACAAGTAACTCACGTTATCT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TCAAAGATGGCTACCAGAGCACTTGGGACAAAGCTCAGAAGAGAGGCGTAAAGCTCGTTTCGGTGCTCTGGGTG 222
Query 1 ---------------------------------------------------------ATGAATGAACACTTATC 17
|||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAAAATGCAGGACAGCTGGAGCACACATTGATGAATCATTGTTCCCTGCAGCTAATATGAATGAACACTTATC 296
Query 18 AAGCCTAATTAAAAAAAAACGTAAATGTATGCAGCCCAAGGATTTTAATTTTAAAACACCAGAAAATGATAAGA 91
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAGCCTAATTAAAAAAAAACGTAAATGTATGCAGCCCAAAGATTTTAATTTTAAAACACCAGAAAATGATAAGA 370
Query 92 GATTTCAGAAGAAATTTGAGAAAATGGCTAAAGAGCTACAAAGGCAAAAAACAAATCTAGATGATGATGTACCT 165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GATTTCAGAAGAAATTTGAGAAAATGGCTAAAGAGCTACAAAGGCAAAAAACAAATCTAGATGATGATGTACCT 444
Query 166 ATTCTCTTATTTGAATCTAATGGTTCATTAATATATACTCCCACAATTGAAATTAATAGTAGTCACCACAGCGC 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATTCTCTTATTTGAATCTAATGGTTCATTAATATATACTCCCACAATTGAAATTAATAGTAGTCACCACAGCGC 518
Query 240 AATGGAGAAGAGATTACAAGAGATGAAGGAGAAAAGGGAAAATCTTTCCCCCACCTCTTCCCAAATGATTCAGC 313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AATGGAGAAGAGATTACAAGAGATGAAGGAGAAAAGGGAAAATCTTTCCCCCACCTCTTCCCAAATGATTCAGC 592
Query 314 AGTCTCATGATAATCCAAGTAACTCTCTGTGTGAAGCACCTTTGAACATTTCACGTGATACTTTGTGTTCAGAT 387
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGTCTCATGATAATCCAAGTAACTCTCTGTGTGAAGCACCTTTGAACATTTCACGTGATACTTTGTGTTCAGAT 666
Query 388 GAATACTTTGCTGGTGGCTTACACTCATCTTTTGATGATCTTTGTGGAAACTCAGGATGTGGAAATCAGGAAAG 461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAATACTTTGCTGGTGGCTTACACTCATCTTTTGATGATCTTTGTGGAAACTCAGGATGTGGAAATCAGGAAAG 740
Query 462 GAAGTTGGAAGGATCCATTAATGACATTAAAAGTGATGTGTGTATTTCTTCACTTGTATTGAAAGCAAATAATA 535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAAGTTGGAAGGATCCATTAATGACATTAAAAGTGATGTGTGTATTTCTTCACTTGTATTGAAAGCAAATAATA 814
Query 536 TTCATTCATCACCATCTTTCACTCACCTCGATAAATCAAGTCCTCAGAAATTTCTGAGTAATCTTTCAAAGGAA 609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTCATTCATCACCATCTTTCACTCACCTCGATAAATCAAGTCCTCAGAAATTTCTGAGTAATCTTTCAAAGGAA 888
Query 610 GAAATAAACTTGCAAAGAAATATTGCAGGTAAAGTAGTCACCCCTCACCAAAAGCAGGCTGCAGGTATGTCTCA 683
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAAATAAACTTGCAAAGAAATATTGCAGGTAAAGTAGTCACCCCTGACCAAAAGCAGGCTGCAGGTATGTCTCA 962
Query 684 GGAGACGTTTGAAGAGAAGTATCGTTTGTCTCCTACCTTATCTTCAACAAAAGGCCACCTTTTGATACATTCAA 757
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGAGACGTTTGAAGAGAAGTATCGTTTGTCTCCTACCTTATCTTCAACAAAAGGCCACCTTTTGATACATTCAA 1036
Query 758 GACCCAGGAGTTCCTCAGTAAAGAGAAAAAGAGTATCACATGGCTCCCATTCACCTCCGAAGGAAAAATGCAAG 831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GACCCAGGAGTTCCTCAGTAAAGAGAAAAAGAGTATCACATGGCTCCCATTCACCTCCGAAGGAAAAATGCAAG 1110
Query 832 AGAAAGAGGAGCACCAGGAGATCTATCATGCCGAGGCTGCAGCTGTGCAGGTCGGAAGGCAGGCTGCAGCACGT 905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1111 AGAAAGAGGAGCACCAGGAGATCTATCATGCCGAGGCTGCAGCTGTGCAGGTCGGAAGACAGGCTGCAGCACGT 1184
Query 906 GGCGGGACCTGCCCTGGAGGCTCTTAGCTGTGGGGAGTCTTCATATGATGACTATTTTTCACCTGATAATCTTA 979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGCGGGACCTGCCCTGGAGGCTCTTAGCTGTGGGGAGTCTTCATATGATGACTATTTTTCACCTGATAATCTTA 1258
Query 980 AGGAAAGGTATTCAGAGAATCTTCCTCCTGAATCTCAGCTGCCATCAAGCCCTGCTCAGTTGAGCTGCAGAAGT 1053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGGAAAGGTATTCAGAGAATCTTCCTCCTGAATCTCAGCTGCCATCAAGCCCTGCTCAGTTGAGCTGCAGAAGT 1332
Query 1054 CTTTCTAAGAAGGAGAGAACAAGCATATTTGAAATGTCTGATTTTTCCTGCGTTGGCAAAAAAACCAGAACAGT 1127
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTTTCTAAGAAGGAGAGAACAAGCATATTTGAAATGTCTGATTTTTCCTGCGTTGGCAAAAAAACCAGAACAGT 1406
Query 1128 TGACATTACCAATTTCACAGCAAAAACCATCTCCAGTCCTCGGAAAACTGGAAATGGTGAAGGCCGTGCAACTT 1201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGACATTACCAATTTCACAGCAAAAACCATCTCCAGTCCTCGGAAAACTGGAAATGGTGAAGGCCGTGCAACTT 1480
Query 1202 CGAGTTGCGTGACTTCTGCCCCTGAAGAAGCCCTAAGGTGTTGTAGACAGGCTGGGAAAGAAGACGCATGCCCA 1275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CGAGTTGCGTGACTTCTGCCCCTGAAGAAGCCCTAAGGTGTTGTAGACAGGCTGGGAAAGAAGACGCATGCCCA 1554
Query 1276 GAGGGAAATGGCTTTTCTTACACCATTGAGGACCCTGCTCTTCCAAAAGGACATGATGATGATTTAACTCCTTT 1349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GAGGGAAATGGCTTTTCTTACACCATTGAGGACCCTGCTCTTCCAAAAGGACATGATGATGATTTAACTCCTTT 1628
Query 1350 GGAAGGAAGCCTTGAAGAAATGAAAGAAGCGGTTGGTCTGAAAAGCACACAGAACAAAGGTACCACTTCCAAAA 1423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GGAAGGAAGCCTTGAAGAAATGAAAGAAGCGGTTGGTCTGAAAAGCACACAGAACAAAGGTACCACTTCCAAAA 1702
Query 1424 TATCAAACTCCTCTGAAGGCGAAGCCCAGAGTGAACATGAGCCATGTTTTATAGTTGACTGTAACATGGAGACG 1497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TATCAAACTCCTCTGAAGGCGAAGCCCAGAGTGAACATGAGCCATGTTTTATAGTTGACTGTAACATGGAGACG 1776
Query 1498 TCTACAGAAGAGAAGGAAAACTTACCCGGAGGATACAGTGGAAGTATG 1545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TCTACAGAAGAGAAGGAAAACTTACCCGGAGGATACAGTGGAAGTATG 1824