Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468604
- Subject:
- NM_024599.5
- Aligned Length:
- 2568
- Identities:
- 1857
- Gaps:
- 711
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCCTCTGCTGACAAGAATGGCGGGAGCGTGTCCTCTGTGTCCAGCAGCCGCCTGCAGAGCCGGAAGCCACC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CAACCTCTCCATCACCATCCCGCCACCCGAGAAAGAGACCCAGGCCCCTGGCGAGCAGGACAGCATGCTGCCTG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AGGGTTTTCAGAATAGGAGGCTAAAGAAAAGCCAGCCCAGGACCTGGGCTGCACACACCACCGCCTGCCCTCCC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TCCTTCCTCCCCAAGAGGAAGAACCCAGCCTACTTGAAGAGCGTCAGCCTCCAGGAGCCACGCAGCCGATGGCA 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 GGAGAGTTCAGAGAAGCGCCCTGGCTTCCGCCGCCAGGCCTCACTGTCCCAGAGCATCCGCAAGGGCGCAGCCC 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 AGTGGTTTGGAGTCAGCGGCGACTGGGAGGGGCAGCGGCAGCAGTGGCAGCGCCGCAGCCTGCACCACTGCAGC 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 ATGCGCTACGGCCGCCTGAAGGCCTCGTGCCAGCGTGACCTGGAGCTCCCCAGCCAGGAGGCACCGTCCTTCCA 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 GGGCACTGAGTCCCCAAAGCCCTGCAAGATGCCCAAGATTGTGGATCCGCTGGCCCGGGGCCGGGCCTTCCGCC 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 ACCCGGAGGAGATGGACAGGCCCCACGCCCCGCACCCACCGCTGACCCCCGGAGTCCTGTCCCTCACCTCCTTC 666
Query 1 ---------------------------------------------ATGTCTGTGGCCCACATGAGCTTGCAAGC 29
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACCAGTGTCCGTTCTGGCTACTCCCACCTGCCACGCCGCAAGAGAATGTCTGTGGCCCACATGAGCTTGCAAGC 740
Query 30 TGCCGCTGCCCTCCTCAAGGGGCGCTCGGTGCTGGATGCCACCGGACAGCGGTGCCGGGTGGTCAAGCGCAGCT 103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGCCGCTGCCCTCCTCAAGGGGCGCTCGGTGCTGGATGCCACCGGACAGCGGTGCCGGGTGGTCAAGCGCAGCT 814
Query 104 TTGCCTTCCCGAGCTTCCTGGAGGAGGATGTGGTCGATGGGGCAGACACGTTTGACTCCTCCTTTTTTAGTAAG 177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTGCCTTCCCGAGCTTCCTGGAGGAGGATGTGGTCGATGGGGCAGACACGTTTGACTCCTCCTTTTTTAGTAAG 888
Query 178 GAAGAAATGAGCTCCATGCCTGATGATGTCTTTGAGTCCCCCCCACTCTCTGCCAGCTACTTCCGAGGGATCCC 251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAAGAAATGAGCTCCATGCCTGATGATGTCTTTGAGTCCCCCCCACTCTCTGCCAGCTACTTCCGAGGGATCCC 962
Query 252 ACACTCAGCCTCCCCTGTCTCCCCCGATGGGGTGCAAATCCCTCTGAAGGAGTATGGCCGAGCCCCAGTCCCCG 325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACACTCAGCCTCCCCTGTCTCCCCCGATGGGGTGCAAATCCCTCTGAAGGAGTATGGCCGAGCCCCAGTCCCCG 1036
Query 326 GGCCCCGGCGCGGCAAGCGCATCGCCTCCAAGGTGAAGCACTTTGCCTTTGATCGGAAGAAGCGGCACTACGGC 399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GGCCCCGGCGCGGCAAGCGCATCGCCTCCAAGGTGAAGCACTTTGCCTTTGATCGGAAGAAGCGGCACTACGGC 1110
Query 400 CTCGGCGTGGTGGGCAACTGGCTGAACCGCAGCTACCGCCGCAGCATCAGCAGCACTGTGCAGCGGCAGCTGGA 473
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTCGGCGTGGTGGGCAACTGGCTGAACCGCAGCTACCGCCGCAGCATCAGCAGCACTGTGCAGCGGCAGCTGGA 1184
Query 474 GAGCTTCGACAGCCACCGGCCCTACTTCACCTACTGGCTGACCTTCGTCCATGTCATCATCACGCTGCTGGTGA 547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GAGCTTCGACAGCCACCGGCCCTACTTCACCTACTGGCTGACCTTCGTCCATGTCATCATCACGCTGCTGGTGA 1258
Query 548 TTTGCACGTATGGCATCGCACCCGTGGGCTTTGCCCAGCACGTCACCACCCAGCTGGTGCTGCGGAACAAAGGT 621
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TTTGCACGTATGGCATCGCACCCGTGGGCTTTGCCCAGCACGTCACCACCCAGCTGGTGCTGCGGAACAAAGGT 1332
Query 622 GTGTACGAGAGCGTGAAGTACATCCAGCAGGAGAACTTCTGGGTTGGCCCCAGCTCGATTGACCTGATCCACCT 695
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTGTACGAGAGCGTGAAGTACATCCAGCAGGAGAACTTCTGGGTTGGCCCCAGCTCGATTGACCTGATCCACCT 1406
Query 696 GGGGGCCAAGTTCTCACCCTGCATCCGGAAGGACGGGCAGATCGAGCAGCTGGTGCTGCGCGAGCGAGACCTGG 769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGGGGCCAAGTTCTCACCCTGCATCCGGAAGGACGGGCAGATCGAGCAGCTGGTGCTGCGCGAGCGAGACCTGG 1480
Query 770 AGCGGGACTCAGGCTGCTGTGTCCAGAATGACCACTCCGGATGCATCCAGACCCAGCGGAAGGACTGCTCGGAG 843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGCGGGACTCAGGCTGCTGTGTCCAGAATGACCACTCCGGATGCATCCAGACCCAGCGGAAGGACTGCTCGGAG 1554
Query 844 ACTTTGGCCACTTTTGTCAAGTGGCAGGATGACACTGGGCCCCCCATGGACAAGTCTGATCTGGGCCAGAAGCG 917
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ACTTTGGCCACTTTTGTCAAGTGGCAGGATGACACTGGGCCCCCCATGGACAAGTCTGATCTGGGCCAGAAGCG 1628
Query 918 GACTTCGGGGGCTGTCTGCCACCAGGACCCCAGGACCTGCGAGGAGCCAGCCTCCAGCGGTGCCCACATCTGGC 991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GACTTCGGGGGCTGTCTGCCACCAGGACCCCAGGACCTGCGAGGAGCCAGCCTCCAGCGGTGCCCACATCTGGC 1702
Query 992 CCGATGACATCACTAAGTGGCCGATCTGCACAGAGCAGGCCAGGAGCAACCACACAGGCTTCCTGCACATGGAC 1065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CCGATGACATCACTAAGTGGCCGATCTGCACAGAGCAGGCCAGGAGCAACCACACAGGCTTCCTGCACATGGAC 1776
Query 1066 TGCGAGATCAAGGGCCGCCCCTGCTGCATCGGCACCAAGGGCAGCTGTGAGATCACCACCCGGGAATACTGTGA 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TGCGAGATCAAGGGCCGCCCCTGCTGCATCGGCACCAAGGGCAGCTGTGAGATCACCACCCGGGAATACTGTGA 1850
Query 1140 GTTCATGCACGGCTATTTCCATGAGGAAGCAACACTCTGCTCCCAGGTGCACTGCTTGGACAAGGTGTGTGGGC 1213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GTTCATGCACGGCTATTTCCATGAGGAAGCAACACTCTGCTCCCAGGTGCACTGCTTGGACAAGGTGTGTGGGC 1924
Query 1214 TGCTGCCCTTCCTCAACCCTGAGGTCCCAGATCAGTTCTACAGGCTCTGGCTGTCTCTCTTCCTACATGCTGGC 1287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TGCTGCCCTTCCTCAACCCTGAGGTCCCAGATCAGTTCTACAGGCTCTGGCTGTCTCTCTTCCTACATGCTGGC 1998
Query 1288 GTGGTGCACTGCCTCGTGTCTGTGGTCTTTCAAATGACCATCCTGAGGGACCTGGAGAAGCTGGCCGGCTGGCA 1361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GTGGTGCACTGCCTCGTGTCTGTGGTCTTTCAAATGACCATCCTGAGGGACCTGGAGAAGCTGGCCGGCTGGCA 2072
Query 1362 CCGTATCGCCATCATCTTCATCCTCAGTGGCATCACAGGCAACCTCGCCAGTGCCATCTTTCTCCCATACCGGG 1435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CCGTATCGCCATCATCTTCATCCTCAGTGGCATCACAGGCAACCTCGCCAGTGCCATCTTTCTCCCATACCGGG 2146
Query 1436 CAGAGGTGGGCCCGGCCGGCTCACAGTTCGGCCTCCTCGCCTGCCTCTTCGTGGAGCTCTTCCAGAGCTGGCCG 1509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CAGAGGTGGGCCCGGCCGGCTCACAGTTCGGCCTCCTCGCCTGCCTCTTCGTGGAGCTCTTCCAGAGCTGGCCG 2220
Query 1510 CTGCTGGAGAGGCCCTGGAAGGCCTTCCTCAACCTCTCGGCCATCGTGCTCTTCCTGTTCATCTGTGGCCTCCT 1583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CTGCTGGAGAGGCCCTGGAAGGCCTTCCTCAACCTCTCGGCCATCGTGCTCTTCCTGTTCATCTGTGGCCTCCT 2294
Query 1584 GCCCTGGATCGACAACATCGCCCACATCTTCGGCTTCCTCAGTGGCCTGCTGCTGGCCTTCGCCTTCCTGCCCT 1657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GCCCTGGATCGACAACATCGCCCACATCTTCGGCTTCCTCAGTGGCCTGCTGCTGGCCTTCGCCTTCCTGCCCT 2368
Query 1658 ACATCACCTTCGGCACCAGCGACAAGTACCGCAAGCGGGCACTCATCCTGGTGTCACTGCTGGCCTTTGCCGGC 1731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 ACATCACCTTCGGCACCAGCGACAAGTACCGCAAGCGGGCACTCATCCTGGTGTCACTGCTGGCCTTTGCCGGC 2442
Query 1732 CTCTTCGCCGCCCTCGTGCTGTGGCTGTACATCTACCCCATTAACTGGCCCTGGATCGAGCACCTCACCTGCTT 1805
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CTCTTCGCCGCCCTCGTGCTGTGGCTGTACATCTACCCCATTAACTGGCCCTGGATCGAGCACCTCACCTGCTT 2516
Query 1806 CCCCTTCACCAGCCGCTTCTGCGAGAAGTATGAGCTGGACCAGGTGCTGCAC 1857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CCCCTTCACCAGCCGCTTCTGCGAGAAGTATGAGCTGGACCAGGTGCTGCAC 2568