Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468604
- Subject:
- XM_017314494.1
- Aligned Length:
- 1864
- Identities:
- 1586
- Gaps:
- 80
Alignment
Query 1 ATGTCTGTGGCCCACATGAGCTTGCAAGCTGCCGCTGCCCTCCTCAAGGGGCGCTCGGTGCTGGATGCCACCGG 74
||||.||.||
Sbjct 1 ----------------------------------------------------------------ATGCGACTGG 10
Query 75 ACAGCGGTGCCGGGTGGTCAAGCGCAGCTTTGCCTTCCCGAGCTTCCTGGAGGAGGATGTGGTCGATGGGGCAG 148
.||||||||||||...|||||.||||||||.||.|.|||.|||||||||||||||||||..||||||||.||.|
Sbjct 11 GCAGCGGTGCCGGCATGTCAAACGCAGCTTCGCTTACCCCAGCTTCCTGGAGGAGGATGCTGTCGATGGAGCTG 84
Query 149 ACACGTTTGACTCCTCCTTTTTTAGTAAGGAAGAAATGAGCTCCATGCCTGATGATGTCTTTGAGTCCCCCCCA 222
||||.||.|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 85 ACACCTTCGACTCCTCCTTTTTTA-----GAAGAAATGAGCTCCATGCCTGACGATGTCTTTGAGTCCCCCCCA 153
Query 223 CTCTCTGCCAGCTACTTCCGAGGGATCCCACACTCAGCCTCCCCTGTCTCCCCCGATGGGGTGCAAATCCCTCT 296
|||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct 154 CTCTCTGCCAGCTACTTCCGAGGTGTCCCACACTCTGCCTCCCCGGTCTCCCCGGATGGAGTGCACATCCCGCT 227
Query 297 GAAGGAGTA------TGGCCGAGCCCCAGTCCCCGGGCCCCGGCGCGGCAAGCGCATCGCCTCCAAGGTGAAGC 364
.||.||.|| |||||||||||..|..||||||.|||.|||.|||||.|||||.||||||||.||.||||
Sbjct 228 AAAAGAATACAGCGGTGGCCGAGCCCTGGGTCCCGGGACCCAGCGTGGCAAACGCATTGCCTCCAAAGTAAAGC 301
Query 365 ACTTTGCCTTTGATCGGAAGAAGCGGCACTACGGCCTCGGCGTGGTGGGCAACTGGCTGAACCGCAGCTACCGC 438
|||||||.|||||.|||||||||.|||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.
Sbjct 302 ACTTTGCATTTGACCGGAAGAAGAGGCACTACGGCCTGGGCGTCGTGGGTAACTGGCTCAACCGAAGCTATCGA 375
Query 439 CGCAGCATCAGCAGCACTGTGCAGCGGCAGCTGGAGAGCTTCGACAGCCACCGGCCCTACTTCACCTACTGGCT 512
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 376 CGCAGCATCAGCAGCACCGTGCAGCGGCAGCTGGAGAGCTTCGATAGCCACCGGCCCTACTTCACCTACTGGCT 449
Query 513 GACCTTCGTCCATGTCATCATCACGCTGCTGGTGATTTGCACGTATGGCATCGCACCCGTGGGCTTTGCCCAGC 586
|||.|||||.||..||||||||||..||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 450 GACGTTCGTTCACATCATCATCACCTTGCTGGTGATCTGCACCTATGGCATCGCACCTGTGGGCTTTGCCCAGC 523
Query 587 ACGTCACCACCCAGCTGGTGCTGCGGAACAAAGGTGTGTACGAGAGCGTGAAGTACATCCAGCAGGAGAACTTC 660
||||.||||||||||||||||||..|||||.|||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 524 ACGTTACCACCCAGCTGGTGCTGAAGAACAGAGGCGTGTATGAGAGCGTGAAGTACATCCAGCAGGAGAACTTC 597
Query 661 TGGGTTGGCCCCAGCTCGATTGACCTGATCCACCTGGGGGCCAAGTTCTCACCCTGCATCCGGAAGGACGGGCA 734
|||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||..|||
Sbjct 598 TGGATTGGCCCCAGCTCGATTGACCTCATTCACCTGGGAGCAAAGTTCTCGCCCTGCATCCGGAAGGACCAGCA 671
Query 735 GATCGAGCAGCTGGTGCTGCGCGAGCGAGACCTGGAGCGGGACTCAGGCTGCTGTGTCCAGAATGACCACTCCG 808
.||.|||||||||||.|.|.|.|||||.|||.|.|||||...|||.||||||||||||||||||||||.|||.|
Sbjct 672 AATTGAGCAGCTGGTACGGAGGGAGCGCGACATTGAGCGCACCTCTGGCTGCTGTGTCCAGAATGACCGCTCGG 745
Query 809 GATGCATCCAGACCCAGCGGAAGGACTGCTCGGAGACTTTGGCCACTTTTGTCAAGTGGCAGGATGACACTGGG 882
|.|||||||||||||.|..|||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||.||||.||||||
Sbjct 746 GCTGCATCCAGACCCTGAAGAAGGACTGCTCGGAGACTTTAGCCACGTTCGTAAAGTGGCAGAATGATACTGGG 819
Query 883 CCCCCCATGGACAAGTCTGATCTGGGCCAGAAGCGGACTTCGGGGGCTGTCTGCCACCAGGACCCCAGGACCTG 956
|||.| .|||||||||||.|||.|||||||||.|.|.||||.||.|||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 820 CCCTC---AGACAAGTCTGACCTGAGCCAGAAGCAGCCATCGGCGGTTGTGTGCCACCAAGACCCCAGGACCTG 890
Query 957 CGAGGAGCCAGCCTCCAGCGGTGCCCACATCTGGCCCGATGACATCACTAAGTGGCCGATCTGCACAGAGCAGG 1030
.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 891 TGAAGAGCCTGCCTCCAGTGGGGCCCACATCTGGCCTGATGACATTACCAAGTGGCCGATCTGCACAGAGCAGG 964
Query 1031 C-CAGGAGCAACCACACAGGCTTCCTGCACATGGACTGCGAGATCAAGGGCCGCCCCTGCTGCATCGGCACCAA 1103
| || ||||||||||||.|||||..|||||||.|||||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 965 CTCA-GAGCAACCACACGGGCTTGTTGCACATAGACTGTAAGATCAAAGGCCGCCCCTGCTGCATCGGCACCAA 1037
Query 1104 GGGCAGCTGTGAGATCACCACCCGGGAATACTGTGAGTTCATGCACGGCTATTTCCATGAGGAAGCAACACTCT 1177
|||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.|
Sbjct 1038 GGGCAGCTGCGAGATCACCACTCGGGAGTACTGTGAGTTCATGCATGGCTATTTCCATGAAGACGCGACGCTGT 1111
Query 1178 GCTCCCAGGTGCACTGCTTGGACAAGGTGTGTGGGCTGCTGCCCTTCCTCAACCCTGAGGTCCCAGATCAGTTC 1251
|.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1112 GTTCCCAGGTGCACTGTTTAGACAAGGTGTGTGGGCTCCTGCCTTTCCTCAACCCTGAGGTCCCTGACCAGTTC 1185
Query 1252 TACAGGCTCTGGCTGTCTCTCTTCCTACATGCTGGCGTGGTGCACTGCCTCGTGTCTGTGGTCTTTCAAATGAC 1325
|||.||.|||||||||||.|.|||||.|||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1186 TACCGGATCTGGCTGTCTTTATTCCTGCATGCTGGCATAGTGCACTGCCTTGTGTCTGTGGTCTTCCAAATGAC 1259
Query 1326 CATCCTGAGGGACCTGGAGAAGCTGGCCGGCTGGCACCGTATCGCCATCATCTTCATCCTCAGTGGCATCACAG 1399
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1260 CATCCTGAGGGACCTAGAGAAGCTGGCCGGCTGGCACCGCATCTCCATCATCTTCATCCTTAGTGGCATTACAG 1333
Query 1400 GCAACCTCGCCAGTGCCATCTTTCTCCCATACCGGGCAGAGGTGGGCCCGGCCGGCTCACAGTTCGGCCTCCTC 1473
|||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1334 GCAACCTGGCCAGCGCCATCTTCCTCCCCTACCGGGCAGAGGTGGGCCCAGCCGGGTCGCAGTTCGGCCTCCTC 1407
Query 1474 GCCTGCCTCTTCGTGGAGCTCTTCCAGAGCTGGCCGCTGCTGGAGAGGCCCTGGAAGGCCTTCCTCAACCTCTC 1547
||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||.|||||.||||.||||||||||||.|||||||.||
Sbjct 1408 GCCTGCCTCTTCGTGGAGCTGTTCCAGAGCTGGCAGCTGTTGGAGCGGCCGTGGAAGGCCTTCTTCAACCTGTC 1481
Query 1548 GGCCATCGTGCTCTTCCTGTTCATCTGTGGCCTCCTGCCCTGGATCGACAACATCGCCCACATCTTCGGCTTCC 1621
||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1482 GGCCATTGTGCTTTTCCTCTTCATCTGTGGCCTCCTGCCCTGGATAGACAACATCGCCCACATCTTCGGGTTCC 1555
Query 1622 TCAGTGGCCTGCTGCTGGCCTTCGCCTTCCTGCCCTACATCACCTTCGGCACCAGCGACAAGTACCGCAAGCGG 1695
||||.|||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1556 TCAGCGGCATGCTTCTGGCCTTCGCCTTCCTGCCTTACATTACCTTCGGCACCAGCGACAAGTACCGCAAGCGA 1629
Query 1696 GCACTCATCCTGGTGTCACTGCTGGCCTTTGCCGGCCTCTTCGCCGCCCTCGTGCTGTGGCTGTACATCTACCC 1769
||.||||||||.|||||.|||||||.||||||.||.|||||.||..||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1630 GCCCTCATCCTCGTGTCGCTGCTGGTCTTTGCTGGGCTCTTTGCTTCCCTGGTGCTGTGGCTGTACATCTACCC 1703
Query 1770 CATTAACTGGCCCTGGATCGAGCACCTCACCTGCTTCCCCTTCACCAGCCGCTTCTGCGAGAAGTATGAGCTGG 1843
|||.||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 1704 CATCAACTGGCCCTGGATCGAGTACCTCACCTGCTTTCCCTTCACCAGCCGCTTCTGTGAGAAGTACGAGCTAG 1777
Query 1844 ACCAGGTGCTGCAC 1857
||||||||||.|||
Sbjct 1778 ACCAGGTGCTACAC 1791