Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468616
• Subject: NM_001172828.2
• Aligned Length: 1737
• Identities: 1587
• Gaps: 150

Alignment

Query    1  ATGTCGGCCAGCAGCCTCTTGGAGCAGAGACCAAAAGGTCAAGGAAACAAAGTACAAAATGGATCTGTACATCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AAAGGATGGATTAAACGATGATGATTTTGAACCTTACTTGAGTCCACAGGCAAGGCCCAATAATGCATATACTG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCATGTCAGATTCCTACTTACCCAGTTACTACAGTCCCTCCATTGGCTTCTCCTATTCTTTGGGTGAAGCTGCT  222
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --ATGTCAGATTCCTACTTACCCAGTTACTACAGTCCCTCCATTGGCTTCTCCTATTCTTTGGGTGAAGCTGCT  72

Query  223  TGGTCTACGGGGGGTGACACAGCCATGCCCTACTTAACTTCTTATGGACAGCTGAGCAACGGAGAGCCCCACTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   73  TGGTCTACGGGGGGTGACACAGCCATGCCCTACTTAACTTCTTATGGACAGCTGAGCAACGGAGAGCCCCACTT  146

Query  297  CCTACCAGATGCAATGTTTGGGCAACCAGGAGCCCTAGGTAGCACTCCATTTCTTGGTCAGCATGGTTTTAATT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  147  CCTACCAGATGCAATGTTTGGGCAACCAGGAGCCCTAGGTAGCACTCCATTTCTTGGTCAGCATGGTTTTAATT  220

Query  371  TCTTTCCCAGTGGGATTGACTTCTCAGCATGGGGAAATAACAGTTCTCAGGGACAGTCTACTCAGAGCTCTGGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  221  TCTTTCCCAGTGGGATTGACTTCTCAGCATGGGGAAATAACAGTTCTCAGGGACAGTCTACTCAGAGCTCTGGA  294

Query  445  TATAGTAGCAATTATGCTTATGCACCTAGCTCCTTAGGTGGAGCCATGATTGATGGACAGTCAGCTTTTGCCAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  TATAGTAGCAATTATGCTTATGCACCTAGCTCCTTAGGTGGAGCCATGATTGATGGACAGTCAGCTTTTGCCAA  368

Query  519  TGAGACCCTCAATAAGGCTCCTGGCATGAATACTATAGACCAAGGGATGGCAGCACTGAAGTTGGGTAGCACAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  369  TGAGACCCTCAATAAGGCTCCTGGCATGAATACTATAGACCAAGGGATGGCAGCACTGAAGTTGGGTAGCACAG  442

Query  593  AAGTTGCAAGCAATGTTCCAAAAGTTGTAGGTTCTGCTGTTGGTAGCGGGTCCATTACTAGTAACATCGTGGCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  AAGTTGCAAGCAATGTTCCAAAAGTTGTAGGTTCTGCTGTTGGTAGCGGGTCCATTACTAGTAACATCGTGGCT  516

Query  667  TCCAATAGTTTGCCTCCAGCCACCATTGCTCCTCCAAAACCAGCATCTTGGGCTGATATTGCTAGCAAGCCTGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  TCCAATAGTTTGCCTCCAGCCACCATTGCTCCTCCAAAACCAGCATCTTGGGCTGATATTGCTAGCAAGCCTGC  590

Query  741  AAAACAGCAACCTAAACTGAAGACCAAGAATGGCATTGCAGGGTCAAGTCTTCCGCCACCCCCGATAAAGCATA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  AAAACAGCAACCTAAACTGAAGACCAAGAATGGCATTGCAGGGTCAAGTCTTCCGCCACCCCCGATAAAGCATA  664

Query  815  ACATGGATATTGGAACTTGGGATAACAAGGGTCCCGTTGCAAAAGCCCCCTCACAGGCTTTGGTTCAGAATATA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  ACATGGATATTGGAACTTGGGATAACAAGGGTCCCGTTGCAAAAGCCCCCTCACAGGCTTTGGTTCAGAATATA  738

Query  889  GGTCAGCCAACCCAGGGGTCTCCTCAGCCTGTAGGTCAGCAGGCTAACAATAGCCCACCAGTGGCTCAGGCATC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  GGTCAGCCAACCCAGGGGTCTCCTCAGCCTGTAGGTCAGCAGGCTAACAATAGCCCACCAGTGGCTCAGGCATC  812

Query  963  AGTAGGGCAACAGACACAGCCATTGCCTCCACCTCCACCACAGCCTGCCCAGCTTTCAGTCCAGCAACAGGCAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  AGTAGGGCAACAGACACAGCCATTGCCTCCACCTCCACCACAGCCTGCCCAGCTTTCAGTCCAGCAACAGGCAG  886

Query 1037  CTCAGCCAACCCGCTGGGTAGCACCTCGGAACCGTGGCAGTGGGTTCGGTCATAATGGGGTGGATGGTAATGGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  CTCAGCCAACCCGCTGGGTAGCACCTCGGAACCGTGGCAGTGGGTTCGGTCATAATGGGGTGGATGGTAATGGA  960

Query 1111  GTAGGACAGTCTCAGGCTGGTTCTGGATCTACTCCTTCAGAACCCCACCCAGTGTTGGAGAAGCTTCGGTCCAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  GTAGGACAGTCTCAGGCTGGTTCTGGATCTACTCCTTCAGAACCCCACCCAGTGTTGGAGAAGCTTCGGTCCAT  1034

Query 1185  TAATAACTATAACCCCAAAGATTTTGACTGGAATCTGAAACATGGCCGGGTTTTCATCATTAAGAGCTACTCTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  TAATAACTATAACCCCAAAGATTTTGACTGGAATCTGAAACATGGCCGGGTTTTCATCATTAAGAGCTACTCTG  1108

Query 1259  AGGACGATATTCACCGTTCCATTAAGTATAATATTTGGTGCAGCACAGAGCATGGTAACAAGAGACTGGATGCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  AGGACGATATTCACCGTTCCATTAAGTATAATATTTGGTGCAGCACAGAGCATGGTAACAAGAGACTGGATGCT  1182

Query 1333  GCTTATCGTTCCATGAACGGGAAAGGCCCCGTTTACTTACTTTTCAGTGTCAACGGCAGTGGACACTTCTGTGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  GCTTATCGTTCCATGAACGGGAAAGGCCCCGTTTACTTACTTTTCAGTGTCAACGGCAGTGGACACTTCTGTGG  1256

Query 1407  CGTGGCAGAAATGAAATCTGCTGTGGACTACAACACATGTGCAGGTGTGTGGTCCCAGGACAAATGGAAGGGTC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257  CGTGGCAGAAATGAAATCTGCTGTGGACTACAACACATGTGCAGGTGTGTGGTCCCAGGACAAATGGAAGGGTC  1330

Query 1481  GTTTTGATGTCAGGTGGATTTTTGTGAAGGACGTTCCCAATAGCCAACTGCGACACATTCGCCTAGAGAACAAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331  GTTTTGATGTCAGGTGGATTTTTGTGAAGGACGTTCCCAATAGCCAACTGCGACACATTCGCCTAGAGAACAAC  1404

Query 1555  GAGAATAAACCAGTGACCAACTCTAGGGACACTCAGGAAGTGCCTCTGGAAAAGGCTAAGCAGGTGTTGAAAAT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405  GAGAATAAACCAGTGACCAACTCTAGGGACACTCAGGAAGTGCCTCTGGAAAAGGCTAAGCAGGTGTTGAAAAT  1478

Query 1629  TATAGCCAGCTACAAGCACACCACTTCCATTTTTGATGACTTCTCACACTATGAGAAACGCCAAGAGGAAGAAG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1479  TATAGCCAGCTACAAGCACACCACTTCCATTTTTGATGACTTCTCACACTATGAGAAACGCCAAGAGGAAGAAG  1552

Query 1703  AAAGTGTTAAAAAGGAACGTCAAGGTCGTGGGAAA  1737
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553  AAAGTGTTAAAAAGGAACGTCAAGGTCGTGGGAAA  1587