Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000468652
Subject:
NM_001114096.1
Aligned Length:
3390
Identities:
3068
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGCGGTGCGGAAGAAGGACGGCGGCCCCAACGTGAAGTACTACGAGGCCGCGGACACCGTGACCCAGTTCGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGTGCGGAAGAAGGACGGCGGCCCCAACGTGAAGTACTACGAGGCCGCGGACACCGTGACCCAGTTCGA  74

Query   75  CAACGTGCGGCTGTGGCTCGGCAAGAACTACAAGAAGTATATACAAGCTGAACCACCCACCAACAAGTCCCTGT  148
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct   75  CAACGTGCGGCTCTGGCTCGGCAAGAACTACAAGAAGTACATACAAGCAGAACCGCCAACCAACAAGTCTCTGT  148

Query  149  CTAGCCTGGTTGTACAGTTGCTACAATTTCAGGAAGAAGTTTTTGGCAAACATGTCAGCAATGCACCGCTCACT  222
            |.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  149  CCAGCCTGGTGGTGCAGTTGCTCCAGTTTCAGGAAGAGGTTTTTGGCAAACATGTCAGCAACGCACCGCTTACT  222

Query  223  AAACTGCCGATCAAATGTTTCCTAGATTTCAAAGCGGGAGGCTCCTTGTGCCACATTCTTGCAGCTGCCTACAA  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||.|.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAACTGCCGATCAAATGTTTCCTAGATTTCAAAGCAGGAGGATCCCTCTGCCATATTCTTGCAGCTGCCTACAA  296

Query  297  ATTCAAGAGTGACCAGGGATGGCGGCGTTACGATTTCCAGAATCCATCACGCATGGACCGCAATGTGGAAATGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATTCAAGAGTGACCAGGGATGGCGGCGTTACGATTTCCAGAATCCATCACGCATGGACCGCAATGTGGAAATGT  370

Query  371  TTATGACCATTGAGAAGTCCTTGGTGCAGAATAATTGCCTGTCTCGACCTAACATTTTTCTGTGCCCAGAAATT  444
            |.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  371  TCATGACCATTGAGAAGTCCTTGGTACAGAATAATTGCCTGTCACGACCTAACATTTTCCTCTGCCCAGAAATT  444

Query  445  GAGCCCAAACTACTAGGGAAATTAAAGGACATTATCAAGAGACACCAGGGAACAGTCACTGAGGATAAGAACAA  518
            |||||||||||.||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||..||.||||||||||||.|||
Sbjct  445  GAGCCCAAACTGCTAGGGAAATTAAAAGACATTGTTAAGAGACACCAGGGAACCATCTCTGAGGATAAGAGCAA  518

Query  519  TGCCTCCCATGTTGTGTATCCTGTCCCGGGGAATCTAGAAGAAGAGGAATGGGTACGACCAGTCATGAAGAGGG  592
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCCTCCCATGTTGTGTATCCTGTCCCAGGGAACCTAGAAGAAGAGGAATGGGTACGGCCAGTCATGAAGAGGG  592

Query  593  ATAAGCAGGTTCTTCTGCACTGGGGCTACTATCCTGACAGTTACGACACGTGGATCCCAGCGAGTGAAATTGAG  666
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  593  ATAAACAGGTTCTTCTGCACTGGGGCTACTATCCTGACAGCTACGACACGTGGATCCCAGCGAGTGAAATTGAA  666

Query  667  GCATCTGTGGAAGATGCTCCAACTCCTGAGAAACCTAGGAAGGTTCATGCAAAGTGGATCCTGGACACCGACAC  740
            |||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  GCATCTGTGGAGGACGCTCCCACTCCTGAGAAACCGAGGAAGGTCCATGCGAAGTGGATCCTCGACACCGACAC  740

Query  741  CTTCAATGAATGGATGAATGAGGAAGACTATGAAGTAAATGATGACAAAAACCCTGTCTCCCGCCGAAAGAAGA  814
            .|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|.|||.|||||||.|||.|||||||||.|.|||||||
Sbjct  741  ATTCAACGAGTGGATGAATGAGGAAGACTACGAAGTCAGTGACGACAAAAGCCCAGTCTCCCGCAGGAAGAAGA  814

Query  815  TTTCAGCCAAGACACTGACAGATGAGGTGAACAGCCCAGATTCAGATCGACGGGACAAGAAGGGGGGAAACTAT  888
            |.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||..||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  815  TCTCAGCCAAGACGCTGACAGACGAGGTAAACAGCCCAGATTCAGACAGACGAGACAAGAAGGGGGGCAACTAT  888

Query  889  AAGAAGAGGAAGCGCTCCCCCTCTCCTTCACCAACCCCAGAAGCAAAGAAGAAAAATGCTAAGAAAGGTCCCTC  962
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  889  AAGAAGAGGAAGCGCTCTCCCTCTCCTTCACCCACCCCAGAGGCTAAGAAGAAAAACGCTAAGAAAGGACCCTC  962

Query  963  AACACCTTACACTAAGTCAAAGCGTGGCCACAGAGAAGAGGAGCAAGAAGACCTGACAAAGGACATGGACGAGC  1036
            |||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  963  AACACCTTATACCAAGTCAAAGCGAGGCCACAGAGAAGAGGAACAAGAAGACCTGACAAAAGACATGGATGAGC  1036

Query 1037  CCTCACCAGTCCCCAATGTAGAAGAGGTGACACTTCCCAAAACAGTCAACACAAAGAAAGACTCAGAGTCGGCC  1110
            ||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||
Sbjct 1037  CCTCTCCAGTCCCAAACGTGGAAGAGGTGACACTCCCCAAAACAGTCAACACTAAAAAGGACTCTGAGTCAGCC  1110

Query 1111  CCAGTCAAAGGCGGCACCATGACCGACCTGGATGAACAGGAAGATGAAAGCATGGAGACGACGGGCAAGGATGA  1184
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1111  CCAGTCAAAGGCGGCACCATGACTGACCTGGATGAACAGGACGATGAAAGCATGGAGACCACCGGCAAGGACGA  1184

Query 1185  GGATGAGAACAGTACGGGGAACAAGGGAGAGCAGACCAAGAATCCAGACCTGCATGAGGACAATGTGACTGAAC  1258
            ||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1185  GGATGAGAACAGCACGGGCAACAAAGGCGAGCAGACGAAGAACCCGGACCTGCATGAGGACAATGTGACCGAGC  1258

Query 1259  AGACCCACCACATCATCATTCCCAGCTACGCTGCCTGGTTTGACTACAATAGTGTTCATGCCATTGAGCGGAGG  1332
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1259  AGACCCACCACATCATCATCCCCAGCTACGCCGCCTGGTTTGACTACAACAGCGTCCATGCCATTGAACGGAGG  1332

Query 1333  GCTCTCCCCGAGTTCTTCAACGGCAAGAACAAGTCCAAGACTCCAGAGATCTACCTGGCCTATCGAAACTTTAT  1406
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 1333  GCTCTTCCTGAGTTCTTCAACGGCAAGAACAAGTCTAAGACTCCAGAGATCTACCTGGCGTATCGGAACTTCAT  1406

Query 1407  GATTGACACTTACCGACTGAACCCCCAAGAGTATCTTACCTCTACCGCCTGCCGCCGAAACCTAGCGGGTGATG  1480
            |||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||..|.||||||||||
Sbjct 1407  GATTGACACTTACCGACTGAATCCCCAGGAGTATCTAACATCTACTGCCTGTCGGCGGAATTTGGCGGGTGATG  1480

Query 1481  TCTGTGCCATCATGAGGGTCCATGCCTTCCTAGAACAGTGGGGTCTTATTAACTACCAGGTGGATGCTGAGAGT  1554
            ||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1481  TCTGCGCTATCATGAGGGTCCATGCCTTCCTGGAACAGTGGGGTCTTATTAACTACCAGGTAGATGCTGAGAGC  1554

Query 1555  CGACCAACCCCAATGGGGCCTCCGCCTACCTCTCACTTCCATGTCTTGGCTGACACACCATCAGGGCTGGTGCC  1628
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1555  CGACCAACCCCAATGGGGCCTCCACCCACCTCTCACTTCCATGTCTTGGCGGACACACCATCAGGGCTGGTTCC  1628

Query 1629  TCTGCAGCCCAAGACACCTCAGGGCCGCCAGGTTGATGCTGATACCAAGGCTGGGCGAAAGGGCAAAGAGCTGG  1702
            |||.|||||.|||.|.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1629  TCTTCAGCCGAAGCCTCCACAGGGCCGCCAGGTTGATGCTGACACCAAGGCTGGGCGGAAGGGCAAAGAGCTGG  1702

Query 1703  ATGACCTGGTGCCAGAGACGGCTAAGGGCAAGCCAGAGCTGCAGACCTCTGCTTCCCAACAAATGCTCAACTTT  1776
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1703  ATGACCTGGTGCCAGAGACGGCTAAGGGCAAGCCAGAGCTGCAGAGCTCTGCTTCCCAGCAAATGCTGAACTTC  1776

Query 1777  CCTGACAAAGGCAAAGAGAAACCAACAGACATGCAAAACTTTGGGCTGCGCACAGACATGTACACAAAAAAGAA  1850
            |||||.||.|||||.|||||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1777  CCTGAGAAGGGCAAGGAGAAACCAGCAGACATGCAGAATTTTGGGCTGCGCACAGACATGTACACAAAGAAGAA  1850

Query 1851  TGTTCCCTCCAAGAGCAAGGCTGCAGCCAGTGCCACTCGTGAGTGGACAGAACAGGAAACCCTGCTTCTCCTGG  1924
            .||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 1851  CGTCCCCTCCAAGAGCAAAGCTGCAGCAAGTGCCACTCGGGAATGGACGGAGCAGGAGACTCTGCTGCTCCTGG  1924

Query 1925  AGGCACTGGAAATGTACAAAGATGACTGGAACAAAGTGTCCGAGCATGTGGGAAGCCGCACACAGGACGAGTGC  1998
            ||||..|||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1925  AGGCTTTGGAAATGTACAAGGACGACTGGAACAAAGTATCTGAGCACGTGGGAAGCCGCACGCAGGACGAGTGC  1998

Query 1999  ATCTTGCATTTTCTTCGTCTTCCCATTGAAGACCCATACCTGGAGGACTCAGAGGCCTCCCTAGGCCCCCTGGC  2072
            ||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 1999  ATCTTGCATTTTCTCCGCCTTCCCATTGAAGACCCATACCTGGAGGACTCGGAGGCTTCTCTAGGCCCTCTGGC  2072

Query 2073  CTACCAACCCATCCCCTTCAGTCAGTCGGGCAACCCTGTTATGAGCACTGTTGCCTTCCTGGCCTCTGTCGTCG  2146
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CTACCAACCCATCCCCTTCAGTCAGTCAGGCAACCCTGTTATGAGCACCGTTGCCTTCCTGGCCTCTGTCGTCG  2146

Query 2147  ATCCCCGAGTCGCCTCTGCTGCTGCAAAGTCAGCCCTAGAGGAGTTCTCCAAAATGAAGGAAGAGGTACCCACG  2220
            ||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 2147  ATCCCCGAGTTGCCTCTGCTGCTGCGAAGTCAGCCCTAGAAGAGTTCTCAAAAATGAAGGAAGAGGTGCCCACA  2220

Query 2221  GCCTTGGTGGAGGCCCATGTTCGAAAAGTGGAAGAAGCAGCCAAAGTAACAGGCAAGGCGGACCCTGCCTTCGG  2294
            ||.||||||||.|||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 2221  GCTTTGGTGGAAGCCCACGTGCGTAAGGTCGAAGAAGCGGCCAAAGTCACAGGCAAGGCCGACCCAGCCTTTGG  2294

Query 2295  TCTGGAAAGCAGTGGCATTGCAGGAACCACCTCTGATGAGCCTGAGCGGATTGAGGAGAGCGGGAATGACGAGG  2368
            ||||||.||.||.|||||.|||||.||..|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||.|||.||||
Sbjct 2295  TCTGGAGAGTAGCGGCATCGCAGGGACTGCCTCTGATGAGCCTGAGCGCATTGAGGAAAGCGGGACTGAGGAGG  2368

Query 2369  CTCGGGTGGAAGGCCAGGCCACAGATGAGAAGAAGGAGCCCAAGGAACCCCGAGAAGGAGGGGGTGCTATAGAG  2442
            |.|||...||.||||||||..|||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||.|.|||
Sbjct 2369  CACGGCCAGAGGGCCAGGCAGCAGATGAGAAGAAGGAGCCTAAGGAACCACGGGAAGGAGGGGGCGCTGTGGAG  2442

Query 2443  GAGGAAGCAAAAGAGAAAACCAGCGAGGCTCCCAAGAAGGATGAGGAGAAAGGGAAAGAAGGCGACAGTGAGAA  2516
            ||.||||||||.|||.|||..||.||||..||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2443  GAAGAAGCAAAGGAGGAAATAAGTGAGGTCCCCAAGAAAGATGAAGAGAAAGGGAAAGAAGGTGACAGTGAGAA  2516

Query 2517  GGAGTCCGAGAAGAGTGATGGAGACCCAATAGTCGATCCTGAGAAGGAGAAGGAGCCAAAGGAAGGGCAGGAGG  2590
            ||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||..|||||||||||||
Sbjct 2517  GGAGTCTGAGAAGAGTGACGGGGACCCGATAGTTGATCCTGAGAAAGACAAGGAACCAACAGAAGGGCAGGAGG  2590

Query 2591  AAGTGCTGAAGGAAGTGGTGGAGTCTGAGGGGGAAAGGAAGACAAAGGTGGAGCGGGACATTGGCGAGGGCAAC  2664
            |||||||.||||||||||..|||.|.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||
Sbjct 2591  AAGTGCTAAAGGAAGTGGCAGAGCCAGAGGGGGAGAGGAAAACCAAGGTGGAGCGTGACATTGGTGAAGGCAAC  2664

Query 2665  CTCTCCACCGCTGCTGCCGCCGCCCTGGCCGCCGCCGCAGTGAAAGCTAAGCACTTTGCTGCTGTTGAGGAAAG  2738
            ||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 2665  CTGTCCACAGCTGCAGCCGCAGCCCTGGCCGCTGCTGCAGTCAAGGCCAAGCACTTGGCTGCAGTTGAGGAGAG  2738

Query 2739  GAAGATCAAATCTTTGGTGGCCCTGCTGGTGGAGACCCAGATGAAAAAGTTGGAGATCAAACTTCGGCACTTTG  2812
            .||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||..|.|||||||||||.||.||.||||
Sbjct 2739  AAAGATCAAGTCTTTGGTGGCTCTGCTGGTAGAGACCCAAATGAAGAAACTAGAGATCAAACTCCGACATTTTG  2812

Query 2813  AGGAGCTGGAGACTATCATGGACCGGGAGCGAGAAGCACTGGAGTATCAGAGGCAGCAGCTCCTGGCCGACAGA  2886
            |||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||.|.
Sbjct 2813  AGGAGCTGGAGACAATAATGGACCGGGAGCGAGAGGCGCTGGAATACCAGAGGCAGCAGCTCCTGGCCGACCGG  2886

Query 2887  CAAGCCTTCCACATGGAGCAGCTGAAGTATGCGGAGATGAGGGCTCGGCAGCAGCACTTCCAACAGATGCACCA  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2887  CAAGCCTTCCACATGGAGCAGCTGAAGTATGCAGAGATGAGGGCCCGGCAGCAGCACTTCCAGCAGATGCACCA  2960

Query 2961  ACAGCAGCAGCAGCCACCACCAGCCCTGCCCCCAGGCTCCCAGCCTATCCCCCCAACAGGGGCTGCTGGGCCAC  3034
            .|||||||||||||..||||||.||.|||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 2961  GCAGCAGCAGCAGCAGCCACCAACCTTGCCCCCAGGCTCCCAGCCCATACCTCCCACCGGGGCTGCTGGACCAC  3034

Query 3035  CCGCAGTCCATGGCTTGGCTGTGGCTCCAGCCTCTGTAGTCCCTGCTCCTGCTGGCAGTGGGGCCCCTCCAGGA  3108
            |..||||||||||..|.||||||.||||||||.||||.|.|.||||.|||.|||||||||||||||||||.|||
Sbjct 3035  CTACAGTCCATGGTCTAGCTGTGCCTCCAGCCGCTGTGGCCTCTGCCCCTCCTGGCAGTGGGGCCCCTCCTGGA  3108

Query 3109  AGTTTGGGCCCTTCTGAACAGATTGGGCAGGCAGGGTCAACTGCAGGGCCACAGCAGCAGCAACCAGCTGGAGC  3182
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||..||||.|||||||||
Sbjct 3109  AGCTTGGGCCCTTCTGAACAGATTGGGCAGGCAGGGACAACTGCAGGGCCACAGCAGCCACAACAAGCTGGAGC  3182

Query 3183  CCCCCAGCCTGGGGCAGTCCCACCAGGGGTTCCCCCCCCTGGACCCCATGGCCCCTCACCGTTCCCCAACCAAC  3256
            |||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  CCCTCAGCCTGGGGCAGTCCCACCAGGGGTACCCCCCCCTGGACCCCATGGCCCCTCACCGTTCCCCAACCAAC  3256

Query 3257  AAACTCCTCCCTCAATGATGCCAGGGGCAGTGCCAGGCAGCGGGCACCCAGGCGTGGCGGACCCAGGCACCCCC  3330
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 3257  CAACTCCTCCCTCAATGATGCCAGGGGCAGTGCCAGGCAGCGGGCACCCAGGCGTGGCGGACCCAGGCACCCCG  3330

Query 3331  CTGCCTCCAGACCCCACAGCCCCGAGCCCAGGCACGGTCACCCCTGTGCCACCTCCACAG  3390
            ||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  CTGCCTCCAGACCCCACAGCTCCAAGCCCAGGCACAGTCACCCCTGTGCCACCTCCACAG  3390