Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468663
- Subject:
- XM_006526985.3
- Aligned Length:
- 2349
- Identities:
- 1972
- Gaps:
- 33
Alignment
Query 1 ATGATGGTTCAGCGACTGGGACTCATTTCACCTCCAGCAAGCCAGGTCTCTACAGCATGCAACCAGATCAGTCC 74
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGATGGTTCAGCGACTGGGACCCATTTCACCTCCAGCAAGCCAGGTCTCCACAGCATGCAAGCAGATCAGTCC 74
Query 75 TAGCTTACAGAGGGCAATGAATGCAGCCAACCTGAATATACCTCCTTCAGATACCAGGTCCCTTATTTCGCGTG 148
||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||.||..|
Sbjct 75 TAGCTTACCGAGGGCAGTGAATGCAGCCAACCTGAATAGACCTCCTTCAGATACCAGGTCCGTTATTTTGCAAG 148
Query 149 AGTCTTTGGCGTCCACGACCTTGAGTCTGACGGAAAGTCAGTCGGCCTCAAGCATGAAGCAGGAGTGGTCCCAG 222
|||||.|||.|||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||||..||..|||||||.||||||||.|||
Sbjct 149 AGTCTCTGGTGTCCACGACTTTGAGTCTGACAGAGAGTCAATCAGCCTTGAGTGTGAAGCAAGAGTGGTCTCAG 222
Query 223 GGCTACAGGGCCCTCCCTTCGCT---CTCCAACCACGGCTCTCAGAATGGCCTTGATCTAGGGGATCTCCTTAG 293
.||||||||||..|||||||.|| .||||.||||.|.||.|||||||||...||.||||||||.||.|||||
Sbjct 223 AGCTACAGGGCTTTCCCTTCACTTTCATCCAGCCACAGTTCCCAGAATGGCACGGACCTAGGGGACCTTCTTAG 296
Query 294 CCTTCCTCCCGGGACATCCA-TGTCCAGCAATAGTGTCTCTAACTCATTACCATCCTACCTTTTTGGCACGGAA 366
|.|.|||||.||.|| .||| ||||..||||.||.|||||.|||||.||.|||.||||||||||.||||.||||
Sbjct 297 CTTGCCTCCAGGCAC-GCCAGTGTCTGGCAACAGCGTCTCCAACTCGTTGCCACCCTACCTTTTCGGCATGGAA 369
Query 367 AGTAGCCACTCTCCTTACCCTAGTCCTCGGCACTCATCCACCAGGTCCCACTCGGCCCGCTCCAAGAAGAGAGC 440
|.|||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||.|||||||..|||||||.|||||||||||
Sbjct 370 AATAGCCACTCTCCTTACCCTAGCCCTCGGCACTCAGCAACCAGGGCCCACTCCACCCGCTCTAAGAAGAGAGC 443
Query 441 GCTGTCCTTGTCCCCGCTGTCCGATGGCATCGGGATAGATTTCAATACCATCATCCGCACGTCGCCCACGTCCT 514
..||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||.||||
Sbjct 444 ATTGTCCTTGTCGCCACTGTCAGATGGCATCGGGATCGACTTCAACACTATCATCCGTACTTCACCCACATCCT 517
Query 515 TGGTGGCCTACATCAACGGGTCGAGGGCTTCGCCGGCCAACCTGTCCCCGCAGCCGGAGGTCTACGGGCATTTC 588
||||.||||||||||||||..|.||.||.||.||.||||||||||||||.|||.|.||||||||.|||||||||
Sbjct 518 TGGTCGCCTACATCAACGGACCAAGAGCCTCCCCAGCCAACCTGTCCCCACAGTCAGAGGTCTATGGGCATTTC 591
Query 589 CTGGGCGTGCGCGGCAGCTGCATTCCCCAGCCGCGCCCGGTGCCCGGCAGCCAGAAGGGCGTGCTGGTGGCCCC 662
|||||.||.||.|||||||||||.||||||.|..|..|.|||.||.||.|.|||||.|||.|..||||.|||..
Sbjct 592 CTGGGTGTTCGTGGCAGCTGCATCCCCCAGTCTTGTGCAGTGGCCAGCGGGCAGAAAGGCATATTGGTTGCCAG 665
Query 663 TGGAGGCCTGGCGCTGCCGGCCTACGGCGAGGACGGGGCCCTGGAGCACGAGCGCATGCAACAGCTGGAGCACG 736
||||||.|...|||||||||.|||.||.||||||||..|.||||||.|.||.||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 666 TGGAGGGCATACGCTGCCGGGCTATGGAGAGGACGGTACACTGGAGTATGAACGCATGCAGCAGCTTGAGCATG 739
Query 737 GCGGCCTGCAGCCAGG-CCTGGTCAACCACATGGTGGTGCAGCATGGCCTGCCGGGCCCCGACAGCCAGCCGGC 809
|.||||||||.||.|| ||| ||.|||.||||||||.||||||.||||||.|||||||..||..|||||.|.||
Sbjct 740 GTGGCCTGCAACCCGGACCT-GTAAACAACATGGTGTTGCAGCCTGGCCTACCGGGCCAGGATGGCCAGACAGC 812
Query 810 CGGCCTGTTCAAGACCGAACGCCTGGAGGAGTTCCCGGGCAGCACCGTAGACCTACCCCCCGCGCCTCCGCTCC 883
|..|.||.||||.||.||.|||||||||||||||||.|.|||..||.|.|||||.|||.|.||.|..||.|||
Sbjct 813 CAACATGCTCAAAACAGAGCGCCTGGAGGAGTTCCCCGCCAGTGCCTTGGACCTGCCCTCTGCTCTGCCTCTC- 885
Query 884 CTCCTCTGCCGCCGCCCCAAGGCCCCCCACCCCCTTACCATGCCCATGCGCACCTTCACCACCCGGAGCTCGGG 957
|||||.||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||.|.||||||||.|||||.||||||..|
Sbjct 886 --CCTCTTCCTCCGCCTCAGGGTCCCCCACCCCCATACCATGCCCATCCACACCTTCATCACCCAGAGCTCCTG 957
Query 958 CCCCACGCCCAGCAGCTGGCCTTGCCCCAGGCCACCCTGGACGACGACGGGGAGATGGACGGCATC-GGGGGCA 1030
||.|||.||||...||||.||.||.|||||.|...||||||.||.||.|||||||||||.|.| || |||||.|
Sbjct 958 CCTCACACCCAATCGCTGTCCCTGGCCCAGACTGGCCTGGAAGAGGATGGGGAGATGGAAGAC-TCAGGGGGGA 1030
Query 1031 AGCATTGCTACCGCTGGATCGACTGCAGCGCCCTGTACGACCAGCAGGAGGAGCTCGTGCGGCACATCGAGAAG 1104
||||.||||.|||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||
Sbjct 1031 AGCACTGCTGCCGTTGGATAGACTGCAGTGCCCTTTATGACCAGCAGGAGGAACTGGTGAGGCACATCGAGAAG 1104
Query 1105 GTCCACATCGACCAGCGCAAAGGGGAGGACTTCACTTGCTTCTGGGCCGGTTGCCCTCGAAGATACAAGCCCTT 1178
||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||.|.||.||||||.|||||||||||||.||
Sbjct 1105 GTCCACATAGACCAACGCAAGGGGGAAGACTTCACGTGCTTCTGGACTGGCTGCCCTAGAAGATACAAGCCTTT 1178
Query 1179 CAACGCCCGCTATAAACTGCTGATCCACATGAGAGTCCACTCTGGGGAGAAGCCCAACAAGTGTACGTTTGAAG 1252
||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1179 CAACGCACGGTATAAACTGCTGATCCACATGAGGGTCCACTCTGGGGAGAAGCCCAACAAGTGTACGTTCGAAG 1252
Query 1253 GTTGCGAGAAGGCCTTTTCAAGGCTTGAAAATCTCAAGATCCACTTGCGGAGCCACACAGGCGAGAAGCCGTAT 1326
|.|||.|||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||.
Sbjct 1253 GCTGCAAGAAGGCCTTTTCCAGGCTCGAGAACCTCAAGATTCACTTGCGGAGCCACACGGGTGAGAAGCCATAC 1326
Query 1327 TTGTGCCAGCATCCGGGTTGTCAGAAGGCCTTCAGTAACTCCAGTGACCGCGCCAAACACCAGCGGACGCATCT 1400
|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||.||||.|||||
Sbjct 1327 TTGTGCCAGCATCCGGGCTGCCAAAAGGCCTTCAGCAATTCCAGTGACCGTGCCAAGCACCAGAGGACACATCT 1400
Query 1401 GGACACCAAACCTTATGCTTGTCAAATTCCAGGATGTACCAAACGCTACACAGACCCAAGTTCCCTAAGAAAGC 1474
.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1401 TGACACTAAACCTTATGCTTGTCAAATTCCAGGATGTACAAAGCGCTACACAGACCCAAGCTCCCTCAGAAAGC 1474
Query 1475 ATGTGAAGGCACATTCTTCCAAAGAGCAACAAGCAAGGAAAAAGTTGCGGTCCAGCACAGAGCTCCATCCAGAC 1548
|.||||||||||||||||||..||||||.|||||||||||||||.|.|||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 1475 ACGTGAAGGCACATTCTTCCCGAGAGCAGCAAGCAAGGAAAAAGCTACGGTCTAGCACTGAGCTCCATCCAGAT 1548
Query 1549 CTGCTCACAGATTGCCTCACCGTGCAGTCCCTGCAGCCGGCCACTTCCCCTAGAGATGCTGCTGCTGAAGGGAC 1622
||.||||||||.||||||.|.||||||.||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||.|.| .||
Sbjct 1549 CTCCTCACAGACTGCCTCGCTGTGCAGCCCCTGCAGCCAGCCACGTCCCCTGGAGATGCTGCTGATCA---TAC 1619
Query 1623 CGTGGGACGCTCCCCTGGACCCGGGC------------------CTGACCTCTATTCAGCTCCCATTTTCTCCA 1678
||||||.|.||||||.||.||.|||| ||||.|||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1620 CGTGGGGCACTCCCCAGGGCCGGGGCCTGGGCCAGGGCCTGGGGCTGAACTCTATTCAGCTCCCATTTTCGCCA 1693
Query 1679 GCAATTATTCAAGCCGAAGTGGAACAGCTGCTGGGGCCGTACCACCCCCACATCCTGTCAGTCACCCTTCTCCA 1752
|||||.||||||..|||||||||||||||||||||||.|..|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694 GCAATCATTCAACTCGAAGTGGAACAGCTGCTGGGGCTGGGCCACCCCCACATCCTGTCAGTCACCCTTCTCCA 1767
Query 1753 GGACATAATGTACAGGGGAGCCCTCACAACCCCTCCTCCCAGTTACCTCCACTCACAGCTGTGGACGCAGGAGC 1826
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1768 GGACATAATGTACAGGGGAGCCCCCACAACCCCTCCTCCCAGTTACCTCCACTCACAGCTGTGGACGCAGGCGC 1841
Query 1827 TGAGAGGTTTGCACCTTCTGCTCCATCTCCTCACCACATCAGCCCCCGGAGAGTTCCAGCTCCTTCTTCAATAC 1900
||||||||||||||||.|..|||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||||||.|.|||.|.|
Sbjct 1842 TGAGAGGTTTGCACCTCCGACTCCATCTCCTCACCACATCAGCCCGGGAAGAGTTCCAGCTCCTCCGTCACTGC 1915
Query 1901 TGCAAAGAACACAGCCTCCCTATACCCAGCAGCCATCAGGTTCACACCTGAAGTCCTATCAGCCAGAAACAAAC 1974
|.||.|||.|||||.|||||.|..|||||||||||.||||.||||.|||||||.||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1916 TCCAGAGAGCACAGGCTCCCCACTCCCAGCAGCCACCAGGCTCACTCCTGAAGCCCTACCAGCCAGAAACCAAC 1989
Query 1975 TCTTCTTTTCAACCAAATGGTATCCATGTCCATGGATTTTATGGGCAGCTGCAGAAGTTCTGTCCCCCACACTA 2048
|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||..|||||||||||.||.||
Sbjct 1990 TCTTCTTTTCAGCCAAATGGTATCCATGTCCACGGATTTTATGGCCAGCTGCAGACATTCTGTCCCCCGCATTA 2063
Query 2049 CCCCGATTCCCAGAGAATTGTGCCGCCTGTCAGCTCCTGCAGTGTGGTGCCTTCGTTTGAGGACTGCCTAGTCC 2122
.||.||||||||.||||.||||||.||...|.|||||||||||.||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 2064 TCCTGATTCCCAAAGAACTGTGCCACCCAGCGGCTCCTGCAGTATGGTGCCTTCCTTTGAGGACTGCCTGGTCC 2137
Query 2123 CTACATCCATGGGCCAGGCCAGTTTTGATGTTTTCCACAGAGCCTTCTCGACTCACTCGGGCATTACAGTGTAT 2196
|.||.||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.
Sbjct 2138 CCACGTCCATGGGTCAAGCCGGTTTTGATGTTTTCCACAGAGCCTTCTCAACACACTCAGGCATCACAGTGTAC 2211
Query 2197 GATTTACCTTCAAGTTCCTCGAGCCTCTTTGGGGAGTCTCTCCGCAGCGGGGCTGAAGATGCTACCTTCTTGCA 2270
|||||.||||||..||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||..|||||||..|.||.||||||||
Sbjct 2212 GATTTGCCTTCAGCTTCCTCAAGCCTCTTTGGGGAATCTCTTCGCAGTGGCCCTGAAGACCCCACGTTCTTGCA 2285
Query 2271 GATCAGCACCGTGGACCGCTGTCCTAGCCAGCTCTCCTCTGTCTGCACCGAAGGC 2325
|.||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||||||||
Sbjct 2286 GCTCAGTGCTGTGGACCGCTGTCCTAGCCAGCTCTCCTCTGTGTATACCGAAGGC 2340