Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468698
• Subject: XM_006712820.2
• Aligned Length: 1606
• Identities: 1329
• Gaps: 254

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGTGGGGCCCTGACAGTAGGAGAGGTGTGCAGGAAAAGACGTGGCAACAATGTGTGCCACCGCAGGCCAGG  74

Query    1  ----------------------------------------------------------------------ATGA  4
                                                                                  |.||
Sbjct   75  GATCAGGCCCCCCAGGCCGGCCCCCGACCGGCTAGGTGACCATGGGGGAGCCGACTCCGTCTCTGGGTCGAGGA  148

Query    5  CAGG-GCTCGTG---------------------TCCCTGTCATATTTTCCACTCTCCACGAGGTCCTGCGCGCT  56
            ..|| |||||.|                     ||||||.|.|..||||..||.||| ||     ||| ||.||
Sbjct  149  GTGGAGCTCGCGGCTATTTTCAGCTCCAGCGGCTCCCTGCCTTCCTTTCTCCTTTCC-CG-----CTG-GCCCT  215

Query   57  TCAATCCTG-CAGCCCGGTTTGGGGATGTGGTCCTTGCTGCTCTGCGGGTTGTCCATCGCCCTTCCACTGTCTG  129
                   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  216  -------TGCCAGCCCGGTTTGGGGATGTGGTCCTTGCTGCTCTGCGGGTTGTCCATCGCCCTTCCACTGTCTG  282

Query  130  TCACAGCAGGACTGTAACGAGATTAAAGGGGAGCGGTTCACTGTTTTGGAAACCAGGCTTTTGGTGAGCAATGT  203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  283  TCACAGCAGGACTGTAACGAGATTAAAGGGGAGCGGTTCACTGTTTTGGAAACCAGGCTTTTGGTGAGCAATGT  356

Query  204  CTCGGCAGAGGACAGAGGGAACTACGCGTGTCAAGCCATACTGACACACTCAGGGAAGCAGTACGAGGTTTTAA  277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  357  CTCGGCAGAGGACAGAGGGAACTACGCGTGTCAAGCCATACTGACACACTCAGGGAAGCAGTACGAGGTTTTAA  430

Query  278  ATGGCATCACTGTGAGCATTA---AAAGAGCTGGATATGGAGGAAGTGTCCCTAAAATCATTTATCCAAAAAAT  348
            |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  431  ATGGCATCACTGTGAGCATTACAGAAAGAGCTGGATATGGAGGAAGTGTCCCTAAAATCATTTATCCAAAAAAT  504

Query  349  CATTCAATTGAAGTACAGCTTGGTACCACTCTGATTGTGGACTGCAATGTAACAGACACCAAGGATAATACAAA  422
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  505  CATTCAATTGAAGTACAGCTTGGTACCACTCTGATTGTGGACTGCAATGTAACAGACACCAAGGATAATACAAA  578

Query  423  TCTACGATGCTGGAGAGTCAATAACACTTTGGTGGATGATTACTATGATGAATCCAAACGAATCAGAGAAGGGG  496
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  579  TCTACGATGCTGGAGAGTCAATAACACTTTGGTGGATGATTACTATGATGAATCCAAACGAATCAGAGAAGGGG  652

Query  497  TGGAAACCCATGTCTCTTTTCGGGAACATAATTTGTACACAGTAAACATCACCTTCTTGGAAGTGAAAATGGAA  570
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  653  TGGAAACCCATGTCTCTTTTCGGGAACATAATTTGTACACAGTAAACATCACCTTCTTGGAAGTGAAAATGGAA  726

Query  571  GATTATGGCCTTCCTTTCATGTGCCACGCTGGAGTGTCCACAGCATACATTATATTACAGCTCCCAGCTCCGGA  644
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  727  GATTATGGCCTTCCTTTCATGTGCCACGCTGGAGTGTCCACAGCATACATTATATTACAGCTCCCAGCTCCGGA  800

Query  645  TTTTCGAGCTTACTTGATAGGAGGGCTTATCGCCTTGGTGGCTGTGGCTGTGTCTGTTGTGTACATATACAACA  718
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  801  TTTTCGAGCTTACTTGATAGGAGGGCTTATCGCCTTGGTGGCTGTGGCTGTGTCTGTTGTGTACATATACAACA  874

Query  719  TTTTTAAGATCGACATTGTTCTTTGGTATCGAAGTGCCTTCCATTCTACAGAGACCATAGTAGATGGGAAGCTG  792
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  875  TTTTTAAGATCGACATTGTTCTTTGGTATCGAAGTGCCTTCCATTCTACAGAGACCATAGTAGATGGGAAGCTG  948

Query  793  TATGACGCCTATGTCTTATACCCCAAGCCCCACAAGGAAAGCCAGAGGCATGCCGTGGATGCCCTGGTGTTGAA  866
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  949  TATGACGCCTATGTCTTATACCCCAAGCCCCACAAGGAAAGCCAGAGGCATGCCGTGGATGCCCTGGTGTTGAA  1022

Query  867  TATCCTGCCCGAGGTGTTGGAGAGACAATGTGGATATAAGTTGTTTATATTCGGCAGAGATGAATTCCCTGGAC  940
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023  TATCCTGCCCGAGGTGTTGGAGAGACAATGTGGATATAAGTTGTTTATATTCGGCAGAGATGAATTCCCTGGAC  1096

Query  941  AAGCCGTGGCCAATGTCATCGATGAAAACGTTAAGCTGTGCAGGAGGCTGATTGTCATTGTGGTCCCCGAATCG  1014
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1097  AAGCCGTGGCCAATGTCATCGATGAAAACGTTAAGCTGTGCAGGAGGCTGATTGTCATTGTGGTCCCCGAATCG  1170

Query 1015  CTGGGCTTTGGCCTGTTGAAGAACCTGTCAGAAGAACAAATCGCGGTCTACAGTGCCCTGATCCAGGACGGGAT  1088
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1171  CTGGGCTTTGGCCTGTTGAAGAACCTGTCAGAAGAACAAATCGCGGTCTACAGTGCCCTGATCCAGGACGGGAT  1244

Query 1089  GAAGGTTATTCTCATTGAGCTGGAGAAAATCGAGGACTACACAGTCATGCCAGAGTCAATTCAGTACATCAAAC  1162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1245  GAAGGTTATTCTCATTGAGCTGGAGAAAATCGAGGACTACACAGTCATGCCAGAGTCAATTCAGTACATCAAAC  1318

Query 1163  AGAAGCATGGTGCCATCCGGTGGCATGGGGACTTCACGGAGCAGTCACAGTGTATGAAGACCAAGTTTTGGAAG  1236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319  AGAAGCATGGTGCCATCCGGTGGCATGGGGACTTCACGGAGCAGTCACAGTGTATGAAGACCAAGTTTTGGAAG  1392

Query 1237  ACAGTGAGATACCACATGCCGCCCAGAAGGTGTCGGCCGTTTCCTCCGGTCCAGCTGCTGCAGCACACACCTTG  1310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1393  ACAGTGAGATACCACATGCCGCCCAGAAGGTGTCGGCCGTTTCCTCCGGTCCAGCTGCTGCAGCACACACCTTG  1466

Query 1311  CTACCGCACCGCAGGCCCAGA--------------ACTAGG---CTCAAGAA--GAAAGAAGTGTACT------  1359
            |||||||||||||||   .||              ||.|||   .|||.|.|  | |.|.||.|| ||      
Sbjct 1467  CTACCGCACCGCAGG---TGAGCGGGTGGGAGGACACGAGGTTTGTCACGCACTG-ATGGAGGGT-CTATCATT  1535

Query 1360  ---------CTCACGACTGGC-------------------------------  1371
                     |||||..||||.                               
Sbjct 1536  GCGTGGTGGCTCACAGCTGGAGGAGGACACGTTTCATCGGGGCCGTCTGCTC  1587