Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468698
- Subject:
- XM_011512091.1
- Aligned Length:
- 1871
- Identities:
- 1355
- Gaps:
- 505
Alignment
Query 1 ATGACAGGGCTCGTGTCCCTGTCATATTTTCCACTCTCCACGAGGTCCTGCGCGCTTCAATCCT----GCAGCC 70
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1 ATGACAGGGCTCGTGTCCCTGTCATATTTTCCACTCTCCACGAGGTCCTGCGCGCTTCAATCCTGCAGGCAGCC 74
Query 71 CGGTTTGGGGATGTGGTCCTTGCTGCTCTGCGGGTTGTCCATCGCCCTTCCACTGTCTGTCACAGC-------- 136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGGTTTGGGGATGTGGTCCTTGCTGCTCTGCGGGTTGTCCATCGCCCTTCCACTGTCTGTCACAGCAGATGGAT 148
Query 137 -------------------------------------------------------------------------- 136
Sbjct 149 GCAAGGACATTTTTATGAAAAATGAGATACTTTCAGCAAGCCAGCCTTTTGCTTTTAATTGTACATTCCCTCCC 222
Query 137 -------------------------------------------------------------------------- 136
Sbjct 223 ATAACATCTGGGGAAGTCAGTGTAACATGGTATAAAAATTCTAGCAAAATCCCAGTGTCCAAAATCATACAGTC 296
Query 137 -------------------------------------------------------------------------- 136
Sbjct 297 TAGAATTCACCAGGACGAGACTTGGATTTTGTTTCTCCCCATGGAATGGGGGGACTCAGGAGTCTACCAATGTG 370
Query 137 -------------------------------------------------------------------------- 136
Sbjct 371 TTATAAAGGGTAGAGACAGCTGTCATAGAATACATGTAAACCTAACTGTTTTTGAAAAACATTGGTGTGACACT 444
Query 137 -------------------------------------------------------------------------- 136
Sbjct 445 TCCATAGGTGGTTTACCAAATTTATCAGATGAGTACAAGCAAATATTACATCTTGGAAAAGATGATAGTCTCAC 518
Query 137 -----------------------------------------------------AGGACTGTAACGAGATTAAAG 157
|||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ATGTCATCTGCACTTCCCGAAGAGTTGTGTTTTGGGTCCAATAAAGTGGTATAAGGACTGTAACGAGATTAAAG 592
Query 158 GGGAGCGGTTCACTGTTTTGGAAACCAGGCTTTTGGTGAGCAATGTCTCGGCAGAGGACAGAGGGAACTACGCG 231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GGGAGCGGTTCACTGTTTTGGAAACCAGGCTTTTGGTGAGCAATGTCTCGGCAGAGGACAGAGGGAACTACGCG 666
Query 232 TGTCAAGCCATACTGACACACTCAGGGAAGCAGTACGAGGTTTTAAATGGCATCACTGTGAGCATTAAAAGAGC 305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TGTCAAGCCATACTGACACACTCAGGGAAGCAGTACGAGGTTTTAAATGGCATCACTGTGAGCATTAAAAGAGC 740
Query 306 TGGATATGGAGGAAGTGTCCCTAAAATCATTTATCCAAAAAATCATTCAATTGAAGTACAGCTTGGTACCACTC 379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGGATATGGAGGAAGTGTCCCTAAAATCATTTATCCAAAAAATCATTCAATTGAAGTACAGCTTGGTACCACTC 814
Query 380 TGATTGTGGACTGCAATGTAACAGACACCAAGGATAATACAAATCTACGATGCTGGAGAGTCAATAACACTTTG 453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGATTGTGGACTGCAATGTAACAGACACCAAGGATAATACAAATCTACGATGCTGGAGAGTCAATAACACTTTG 888
Query 454 GTGGATGATTACTATGATGAATCCAAACGAATCAGAGAAGGGGTGGAAACCCATGTCTCTTTTCGGGAACATAA 527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTGGATGATTACTATGATGAATCCAAACGAATCAGAGAAGGGGTGGAAACCCATGTCTCTTTTCGGGAACATAA 962
Query 528 TTTGTACACAGTAAACATCACCTTCTTGGAAGTGAAAATGGAAGATTATGGCCTTCCTTTCATGTGCCACGCTG 601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TTTGTACACAGTAAACATCACCTTCTTGGAAGTGAAAATGGAAGATTATGGCCTTCCTTTCATGTGCCACGCTG 1036
Query 602 GAGTGTCCACAGCATACATTATATTACAGCTCCCAGCTCCGGATTTTCGAGCTTACTTGATAGGAGGGCTTATC 675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GAGTGTCCACAGCATACATTATATTACAGCTCCCAGCTCCGGATTTTCGAGCTTACTTGATAGGAGGGCTTATC 1110
Query 676 GCCTTGGTGGCTGTGGCTGTGTCTGTTGTGTACATATACAACATTTTTAAGATCGACATTGTTCTTTGGTATCG 749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCCTTGGTGGCTGTGGCTGTGTCTGTTGTGTACATATACAACATTTTTAAGATCGACATTGTTCTTTGGTATCG 1184
Query 750 AAGTGCCTTCCATTCTACAGAGACCATAGTAGATGGGAAGCTGTATGACGCCTATGTCTTATACCCCAAGCCCC 823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AAGTGCCTTCCATTCTACAGAGACCATAGTAGATGGGAAGCTGTATGACGCCTATGTCTTATACCCCAAGCCCC 1258
Query 824 ACAAGGAAAGCCAGAGGCATGCCGTGGATGCCCTGGTGTTGAATATCCTGCCCGAGGTGTTGGAGAGACAATGT 897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ACAAGGAAAGCCAGAGGCATGCCGTGGATGCCCTGGTGTTGAATATCCTGCCCGAGGTGTTGGAGAGACAATGT 1332
Query 898 GGATATAAGTTGTTTATATTCGGCAGAGATGAATTCCCTGGACAAGCCGTGGCCAATGTCATCGATGAAAACGT 971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GGATATAAGTTGTTTATATTCGGCAGAGATGAATTCCCTGGACAAGCCGTGGCCAATGTCATCGATGAAAACGT 1406
Query 972 TAAGCTGTGCAGGAGGCTGATTGTCATTGTGGTCCCCGAATCGCTGGGCTTTGGCCTGTTGAAGAACCTGTCAG 1045
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TAAGCTGTGCAGGAGGCTGATTGTCATTGTGGTCCCCGAATCGCTGGGCTTTGGCCTGTTGAAGAACCTGTCAG 1480
Query 1046 AAGAACAAATCGCGGTCTACAGTGCCCTGATCCAGGACGGGATGAAGGTTATTCTCATTGAGCTGGAGAAAATC 1119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AAGAACAAATCGCGGTCTACAGTGCCCTGATCCAGGACGGGATGAAGGTTATTCTCATTGAGCTGGAGAAAATC 1554
Query 1120 GAGGACTACACAGTCATGCCAGAGTCAATTCAGTACATCAAACAGAAGCATGGTGCCATCCGGTGGCATGGGGA 1193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GAGGACTACACAGTCATGCCAGAGTCAATTCAGTACATCAAACAGAAGCATGGTGCCATCCGGTGGCATGGGGA 1628
Query 1194 CTTCACGGAGCAGTCACAGTGTATGAAGACCAAGTTTTGGAAGACAGTGAGATACCACATGCCGCCCAGAAGGT 1267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CTTCACGGAGCAGTCACAGTGTATGAAGACCAAGTTTTGGAAGACAGTGAGATACCACATGCCGCCCAGAAGGT 1702
Query 1268 GTCGGCCGTTTCCTCCGGTCCAGCTGCTGCAGCACACACCTTGCTACCGCACCGCAGGCCCAGA---------- 1331
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| .||
Sbjct 1703 GTCGGCCGTTTCCTCCGGTCCAGCTGCTGCAGCACACACCTTGCTACCGCACCGCAGG---TGAGCGGGTGGGA 1773
Query 1332 ----ACTAGG---CTCAAGAA--GAAAGAAGTGTACT---------------CTCACGACTGGC---------- 1371
||.||| .|||.|.| | |.|.||.|| || |||||..||||.
Sbjct 1774 GGACACGAGGTTTGTCACGCACTG-ATGGAGGGT-CTATCATTGCGTGGTGGCTCACAGCTGGAGGAGGACACG 1845
Query 1372 --------------------- 1371
Sbjct 1846 TTTCATCGGGGCCGTCTGCTC 1866
