Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468699
- Subject:
- XM_006510394.3
- Aligned Length:
- 1272
- Identities:
- 1131
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGATCAACCTAGTGGAAGAAGTTTCATGCAAGTATTATGTGAAAAATATAGTCCTGAAAATTTTCCTTATCG 74
|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 1 ATGGACCAGCCTAGTGGGAGAAGTTTCATGCAAGTATTGTGTGAAAAATACAGTCCTGAAAACTTCCCTTACCG 74
Query 75 CCGTGGCCCGGGGATGGGAGTCCATGTCCCAGCCACACCTCAGGGCTCTCCTATGAAAGATCGCCTCAACCTCC 148
|||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCGTGGCCCTGGGGTGGGAGTCCATGTCCCAGCCACTCCCCAGGGCTCGCCTATGAAAGATCGCCTCAACCTCC 148
Query 149 CAAGTGTACTAGTGTTGAACAGCTGTGGAATAACCTGTGCAGGAGATGAAAAAGAAATTGCTGCTTTCTGCGCT 222
|.||.||.||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||.||||||.||.||.|||||.|||
Sbjct 149 CGAGCGTGCTCGTGTTGAACAGCTGCGGCATTACCTGCGCGGGAGATGAAAGAGAAATCGCAGCCTTCTGTGCT 222
Query 223 CATGTGTCGGAACTAGATCTTTCTGACAACAAACTCGAAGACTGGCATGAGGTCAGTAAAATTGTGTCAAATGT 296
||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 223 CACGTGTCAGAACTCGATCTTTCTGACAACAAGCTCCAAGACTGGCATGAGGTCAGTAAGATTGTGTCAAATGT 296
Query 297 TCCTCAGTTGGAGTTTCTAAACCTGAGTTCCAACCCTCTGAATTTGTCGGTTTTAGAAAGAACATGTGCTGGGT 370
|||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.||||.|||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCCTCAGCTGGAGTTTCTAAACCTGAGTTCCAATCCTCTGAGTCTGTCAGTTCTAGAAAGAACATGTGCTGGGT 370
Query 371 CCTTCTCTGGGGTTCGCAAACTTGTCCTCAACAACAGCAAAGCTTCTTGGGAGACGGTCCACATGATACTACAG 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||..|||||.|||
Sbjct 371 CCTTCTCTGGGGTTCGCAAACTTGTCCTCAACAACAGCAAAGCATCATGGGAAACAGTGCACACCATACTGCAG 444
Query 445 GAGTTACCAGATTTGGAGGAGCTCTTCCTGTGCCTTAATGACTATGAAACAGTGTCTTGTCCTTCTATTTGCTG 518
|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||
Sbjct 445 GAGTTGCCAGAGTTGGAGGAGCTCTTCCTGTGCCTTAATGACTATGAAACAGTGTCTTGTCCTTCTGTCTGCTG 518
Query 519 TCATTCTCTTAAGCTACTACATATAACAGACAATAACCTCCAAGACTGGACTGAAATACGAAAGTTAGGAGTTA 592
||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.|.||.||.|
Sbjct 519 TCATTCCCTCAAGCTCCTACACATCACAGACAACAACCTCCAAGACTGGACTGAAATCCGAAAGCTGGGTGTAA 592
Query 593 TGTTTCCTTCACTGGATACCCTCGTCCTGGCCAACAATCATTTGAATGCTATTGAGGAGCCTGATGATTCATTG 666
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||.|||.||..||
Sbjct 593 TGTTTCCTTCACTGGATACCCTGGTCCTGGCCAACAATCACTTGAATGCAATCGAGGAGCCTGCTGACTCCCTG 666
Query 667 GCCAGGTTGTTTCCTAATCTTCGATCCATCAGCCTCCACAAGTCAGGTTTGCAGTCCTGGGAAGACATTGATAA 740
||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 667 GCTAGGTTGTTCCCTAATCTGCGGTCCATCAGCCTCCACAAGTCAGGTTTGCAGTCCTGGGAAGACATTGACAA 740
Query 741 ACTAAATTCATTTCCCAAACTGGAAGAAGTGAGATTGTTAGGAATTCCTCTTCTGCAGCCATATACCACCGAGG 814
||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 741 ACTAAATTCATTCCCCAAGCTTGAAGAAGTGAGATTGCTAGGAATTCCTCTTCTACAGCCGTATACCACCGAGG 814
Query 815 AGCGAAGGAAATTGGTAATAGCCAGATTGCCATCAGTTTCCAAACTTAATGGCAGCGTTGTTACTGATGGTGAA 888
|.||.|||||||||||..|.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.
Sbjct 815 AACGCAGGAAATTGGTGGTGGCCAGATTGCCCTCCGTTTCCAAACTCAATGGCAGTGTTGTGACGGATGGTGAG 888
Query 889 CGAGAAGATTCTGAGAGATTTTTTATTCGTTACTATGTGGATGTTCCACAGGAAGAAGTGCCATTCAGGTATCA 962
|||||.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CGAGAGGATTCCGAGAGGTTTTTCATCCGGTACTACGTGGATGTTCCTCAGGAGGAAGTGCCATTCAGGTATCA 962
Query 963 TGAACTGATCACTAAATATGGGAAGTTGGAGCCTTTGGCAGAAGTGGACCTAAGACCCCAGAGCAGTGCAAAAG 1036
|||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 963 TGAGCTCATTACAAAATATGGGAAATTGGAGCCTTTGGCAGAAGTGGACCTAAGACCCCAGAGCAGTGCGAAAG 1036
Query 1037 TAGAAGTCCACTTTAACGATCAGGTGGAAGAAATGAGCATTCGTCTGGACCAAACAGTGGCAGAACTAAAGAAA 1110
|||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1037 TAGAAGTTCACTTCAATGACCAAGTGGAGGAAATGAGCATCCGCCTGGACCAGACAGTAGCCGAACTGAAGAAA 1110
Query 1111 CAGTTAAAAACTCTAGTACAATTACCCACAAGCAACATGCTTCTCTACTATTTTGACCATGAAGCACCCTTTGG 1184
|||.||||.||.||.||.||.||.|||||.||||.|||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||
Sbjct 1111 CAGCTAAAGACCCTGGTGCAGTTGCCCACCAGCAGCATGCTTCTCTACTACTTTGACCACGAGGCCCCGTTTGG 1184
Query 1185 CCCAGAGGAAATGAAGTACAGCTCTCGGGCATTGCATTCCTTTGGCATTAGGGATGGAGATAAAATTTACGTGG 1258
|||||||||.||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 1185 CCCAGAGGAGATGAAGTACAGCTCCCGGGCACTGCACTCCTTTGGCATTAGGGATGGAGATAAAATTTTTGTGG 1258
Query 1259 AATCCAAAACAAAA 1272
||||.|||||||||
Sbjct 1259 AATCAAAAACAAAA 1272