Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000468740
Subject:
NM_001348098.2
Aligned Length:
1395
Identities:
1379
Gaps:
15

Alignment

Query    1  ATGTTCCTGGCGACCCTGTACTTCGCGCTGCCGCTCTTGGACTTGCTCCTGTCGGCCGAAGTGAGCGGCGGAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTCCTGGCGACCCTGTACTTCGCGCTGCCGCTCTTGGACTTGCTCCTGTCGGCCGAAGTGAGCGGCGGAGA  74

Query   75  CCGCCTGGATTGCGTGAAAGCCAGTGATCAGTGCCTGAAGGAGCAGAGCTGCAGCACCAAGTACCGCACGCTAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGCCTGGATTGCGTGAAAGCCAGTGATCAGTGCCTGAAGGAGCAGAGCTGCAGCACCAAGTACCGCACGCTAA  148

Query  149  GGCAGTGCGTGGCGGGCAAGGAGACCAACTTCAGCCTGGCATCCGGCCTGGAGGCCAAGGATGAGTGCCGCAGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCAGTGCGTGGCGGGCAAGGAGACCAACTTCAGCCTGGCATCCGGCCTGGAGGCCAAGGATGAGTGCCGCAGC  222

Query  223  GCCATGGAGGCCCTGAAGCAGAAGTCGCTCTACAACTGCCGCTGCAAGCGGGGTATGAAGAAGGAGAAGAACTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCATGGAGGCCCTGAAGCAGAAGTCGCTCTACAACTGCCGCTGCAAGCGGGGTATGAAGAAGGAGAAGAACTG  296

Query  297  CCTGCGCATTTACTGGAGCATGTACCAGAGCCTGCAGGGAAATGATCTGCTGGAGGATTCCCCATATGAACCAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTGCGCATTTACTGGAGCATGTACCAGAGCCTGCAGGGAAATGATCTGCTGGAGGATTCCCCATATGAACCAG  370

Query  371  TTAACAGCAGATTGTCAGATATATTCCGGGTGGTCCCATTCATATC---------------AGTGGAGCACATT  429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||
Sbjct  371  TTAACAGCAGATTGTCAGATATATTCCGGGTGGTCCCATTCATATCAGATGTTTTTCAGCAAGTGGAGCACATT  444

Query  430  CCCAAAGGGAACAACTGCCTGGATGCAGCGAAGGCCTGCAACCTCGACGACATTTGCAAGAAGTACAGGTCGGC  503
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCAAAGGGAACAACTGCCTGGATGCAGCGAAGGCCTGCAACCTCGACGACATTTGCAAGAAGTACAGGTCGGC  518

Query  504  GTACATCACCCCGTGCACCACCAGCGTGTCCAATGATGTCTGCAACCGCCGCAAGTGCCACAAGGCCCTCCGGC  577
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTACATCACCCCGTGCACCACCAGCGTGTCCAACGATGTCTGCAACCGCCGCAAGTGCCACAAGGCCCTCCGGC  592

Query  578  AGTTCTTTGACAAGGTCCCGGCCAAGCACAGCTACGGAATGCTCTTCTGCTCCTGCCGGGACATCGCCTGCACA  651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGTTCTTTGACAAGGTCCCGGCCAAGCACAGCTACGGAATGCTCTTCTGCTCCTGCCGGGACATCGCCTGCACA  666

Query  652  GAGCGGAGGCGACAGACCATCGTGCCTGTGTGCTCCTATGAAGAGAGGGAGAAGCCCAACTGTTTGAATTTGCA  725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGCGGAGGCGACAGACCATCGTGCCTGTGTGCTCCTATGAAGAGAGGGAGAAGCCCAACTGTTTGAATTTGCA  740

Query  726  GGACTCCTGCAAGACGAATTACATCTGCAGATCTCGCCTTGCGGATTTTTTTACCAACTGCCAGCCAGAGTCAA  799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGACTCCTGCAAGACGAATTACATCTGCAGATCTCGCCTTGCGGATTTTTTTACCAACTGCCAGCCAGAGTCAA  814

Query  800  GGTCTGTCAGCAGCTGTCTAAAGGAAAACTACGCTGACTGCCTCCTCGCCTACTCGGGGCTTATTGGCACAGTC  873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGTCTGTCAGCAGCTGTCTAAAGGAAAACTACGCTGACTGCCTCCTCGCCTACTCGGGGCTTATTGGCACAGTC  888

Query  874  ATGACCCCCAACTACATAGACTCCAGTAGCCTCAGTGTGGCCCCATGGTGTGACTGCAGCAACAGTGGGAACGA  947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGACCCCCAACTACATAGACTCCAGTAGCCTCAGTGTGGCCCCATGGTGTGACTGCAGCAACAGTGGGAACGA  962

Query  948  CCTAGAAGAGTGCTTGAAATTTTTGAATTTCTTCAAGGACAATACATGTCTTAAAAATGCAATTCAAGCCTTTG  1021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCTAGAAGAGTGCTTGAAATTTTTGAATTTCTTCAAGGACAATACATGTCTTAAAAATGCAATTCAAGCCTTTG  1036

Query 1022  GCAATGGCTCCGATGTGACCGTGTGGCAGCCAGCCTTCCCAGTACAGACCACCACTGCCACTACCACCACTGCC  1095
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCAATGGCTCCGATGTGACCGTGTGGCAGCCAGCCTTCCCAGTACAGACCACCACTGCCACTACCACCACTGCC  1110

Query 1096  CTCCGGGTTAAGAACAAGCCCCTGGGGCCAGCAGGGTCTGAGAATGAAATTCCCACTCATGTTTTGCCACCGTG  1169
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTCCGGGTTAAGAACAAGCCCCTGGGGCCAGCAGGGTCTGAGAATGAAATTCCCACTCATGTTTTGCCACCGTG  1184

Query 1170  TGCAAATTTACAGGCACAGAAGCTGAAATCCAATGTGTCGGGCAATACACACCTCTGTATTTCCAATGGTAATT  1243
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCAAATTTACAGGCACAGAAGCTGAAATCCAATGTGTCGGGCAATACACACCTCTGTATTTCCAATGGTAATT  1258

Query 1244  ATGAAAAAGAAGGTCTCGGTGCTTCCAGCCACATAACCACAAAATCAATGGCTGCTCCTCCAAGCTGTGGTCTG  1317
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATGAAAAAGAAGGTCTCGGTGCTTCCAGCCACATAACCACAAAATCAATGGCTGCTCCTCCAAGCTGTGGTCTG  1332

Query 1318  AGCCCACTGCTGGTCCTGGTGGTAACCGCTCTGTCCACCCTATTATCTTTAACAGAAACATCA  1380
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGCCCACTGCTGGTCCTGGTGGTAACCGCTCTGTCCACCCTATTATCTTTAACAGAAACATCA  1395