Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468740
• Subject: NM_001348099.1
• Aligned Length: 1388
• Identities: 1016
• Gaps: 364

Alignment

Query    1  ATGTTCCTGGCGACCCTGTACTTCGCGCTGCCGCTCTTGGACTTGCTCCTGTCGGCCGAAGTGAGCGGCGGAGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCGCCTGGATTGCGTGAAAGCCAGTGATCAGTGCCTGAAGGAGCAGAGCTGCAGCACCAAGTACCGCACGCTAA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGCAGTGCGTGGCGGGCAAGGAGACCAACTTCAGCCTGGCATCCGGCCTGGAGGCCAAGGATGAGTGCCGCAGC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCCATGGAGGCCCTGAAGCAGAAGTCGCTCTACAACTGCCGCTGCAAGCGGGGTATG-AAGAAGGAGAAGAACT  295
                                                                  ||| |.|||||| |||    
Sbjct    1  ------------------------------------------------------ATGCAGGAAGGA-AAG----  15

Query  296  GCCTGCGCATTTACTGGA---GCATGTACCAGAGCCTGCAGGGA----AATGATCTGCTGGAGGATTCCCCATA  362
                       |.|||||   |.|||           ||||.||    ||||      ||| |||         
Sbjct   16  -----------TTCTGGAAGGGGATG-----------GCAGAGACCGGAATG------TGG-GGA---------  51

Query  363  TGAACCAGTTAACAGCAGATTGTCAGATATATTCCGGGTGGTCCCATTCATATCAGTGGAGCACATTCCCAAAG  436
                                |||..|         |.||||    ||||    |||||||||||||||||||||
Sbjct   52  --------------------TGTGGG---------GAGTGG----ATTC----CAGTGGAGCACATTCCCAAAG  88

Query  437  GGAACAACTGCCTGGATGCAGCGAAGGCCTGCAACCTCGACGACATTTGCAAGAAGTACAGGTCGGCGTACATC  510
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   89  GGAACAACTGCCTGGATGCAGCGAAGGCCTGCAACCTCGACGACATTTGCAAGAAGTACAGGTCGGCGTACATC  162

Query  511  ACCCCGTGCACCACCAGCGTGTCCAATGATGTCTGCAACCGCCGCAAGTGCCACAAGGCCCTCCGGCAGTTCTT  584
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  163  ACCCCGTGCACCACCAGCGTGTCCAACGATGTCTGCAACCGCCGCAAGTGCCACAAGGCCCTCCGGCAGTTCTT  236

Query  585  TGACAAGGTCCCGGCCAAGCACAGCTACGGAATGCTCTTCTGCTCCTGCCGGGACATCGCCTGCACAGAGCGGA  658
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  237  TGACAAGGTCCCGGCCAAGCACAGCTACGGAATGCTCTTCTGCTCCTGCCGGGACATCGCCTGCACAGAGCGGA  310

Query  659  GGCGACAGACCATCGTGCCTGTGTGCTCCTATGAAGAGAGGGAGAAGCCCAACTGTTTGAATTTGCAGGACTCC  732
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  311  GGCGACAGACCATCGTGCCTGTGTGCTCCTATGAAGAGAGGGAGAAGCCCAACTGTTTGAATTTGCAGGACTCC  384

Query  733  TGCAAGACGAATTACATCTGCAGATCTCGCCTTGCGGATTTTTTTACCAACTGCCAGCCAGAGTCAAGGTCTGT  806
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  385  TGCAAGACGAATTACATCTGCAGATCTCGCCTTGCGGATTTTTTTACCAACTGCCAGCCAGAGTCAAGGTCTGT  458

Query  807  CAGCAGCTGTCTAAAGGAAAACTACGCTGACTGCCTCCTCGCCTACTCGGGGCTTATTGGCACAGTCATGACCC  880
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  459  CAGCAGCTGTCTAAAGGAAAACTACGCTGACTGCCTCCTCGCCTACTCGGGGCTTATTGGCACAGTCATGACCC  532

Query  881  CCAACTACATAGACTCCAGTAGCCTCAGTGTGGCCCCATGGTGTGACTGCAGCAACAGTGGGAACGACCTAGAA  954
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  533  CCAACTACATAGACTCCAGTAGCCTCAGTGTGGCCCCATGGTGTGACTGCAGCAACAGTGGGAACGACCTAGAA  606

Query  955  GAGTGCTTGAAATTTTTGAATTTCTTCAAGGACAATACATGTCTTAAAAATGCAATTCAAGCCTTTGGCAATGG  1028
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  607  GAGTGCTTGAAATTTTTGAATTTCTTCAAGGACAATACATGTCTTAAAAATGCAATTCAAGCCTTTGGCAATGG  680

Query 1029  CTCCGATGTGACCGTGTGGCAGCCAGCCTTCCCAGTACAGACCACCACTGCCACTACCACCACTGCCCTCCGGG  1102
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  681  CTCCGATGTGACCGTGTGGCAGCCAGCCTTCCCAGTACAGACCACCACTGCCACTACCACCACTGCCCTCCGGG  754

Query 1103  TTAAGAACAAGCCCCTGGGGCCAGCAGGGTCTGAGAATGAAATTCCCACTCATGTTTTGCCACCGTGTGCAAAT  1176
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  755  TTAAGAACAAGCCCCTGGGGCCAGCAGGGTCTGAGAATGAAATTCCCACTCATGTTTTGCCACCGTGTGCAAAT  828

Query 1177  TTACAGGCACAGAAGCTGAAATCCAATGTGTCGGGCAATACACACCTCTGTATTTCCAATGGTAATTATGAAAA  1250
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  829  TTACAGGCACAGAAGCTGAAATCCAATGTGTCGGGCAATACACACCTCTGTATTTCCAATGGTAATTATGAAAA  902

Query 1251  AGAAGGTCTCGGTGCTTCCAGCCACATAACCACAAAATCAATGGCTGCTCCTCCAAGCTGTGGTCTGAGCCCAC  1324
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  903  AGAAGGTCTCGGTGCTTCCAGCCACATAACCACAAAATCAATGGCTGCTCCTCCAAGCTGTGGTCTGAGCCCAC  976

Query 1325  TGCTGGTCCTGGTGGTAACCGCTCTGTCCACCCTATTATCTTTAACAGAAACATCA  1380
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  977  TGCTGGTCCTGGTGGTAACCGCTCTGTCCACCCTATTATCTTTAACAGAAACATCA  1032