Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468757
• Subject: NM_001362836.2
• Aligned Length: 3453
• Identities: 3289
• Gaps: 159

Alignment

Query    1  ATGTCCCGGCGAAAGCAAAAGGAACCCCGGCAGATCAAACGGCCGCTTGAAGATGCCATTGAAGATGAGGAAGA  74
            |||||||||||||||||||...||||||||||||||||||                                  
Sbjct    1  ATGTCCCGGCGAAAGCAAAGCAAACCCCGGCAGATCAAAC----------------------------------  40

Query   75  AGAATGTCCATCAGAGGAAACAGACATCATCTCCAAAGGAGACTTTCCATTGGAGGAAAGCTTTTCCACAGAAT  148
                                                                                      
Sbjct   41  --------------------------------------------------------------------------  40

Query  149  TTGGGCCTGAAAATCTGAGCTGCGAAGAAGTGGAATACTTTTGTAACAAAGGTGATGATGAAGGAATCCAGGAG  222
                                                               |||||||||||||||||||||||
Sbjct   41  ---------------------------------------------------GTGATGATGAAGGAATCCAGGAG  63

Query  223  ACAGCAGAATCAGATGGGGACACACAGTCAGAGAAACCGGGGCAACCTGGAGTTGAGACAGACGACTGGGATGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   64  ACAGCAGAATCAGATGGGGACACACAGTCAGAGAAACCGGGGCAACCTGGAGTTGAGACAGACGACTGGGATGG  137

Query  297  ACCAGGAGAGCTGGAGGTGTTTCAGAAAGATGGGGAACGAAAAATTCAGAGTCGACAGCAACTTCCAGTGGGAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  138  ACCAGGAGAGCTGGAGGTGTTTCAGAAAGATGGGGAACGAAAAATTCAGAGTCGACAGCAACTTCCAGTGGGAA  211

Query  371  CAACCTGGGGGCCGTTTCCTGGGAAGATGGACTTGAATAATAATTCTTTGAAGACAAAGGCTCAGGTCCCAATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  212  CAACCTGGGGGCCGTTTCCTGGGAAGATGGACTTGAATAATAATTCTTTGAAGACAAAGGCTCAGGTCCCAATG  285

Query  445  GTGCTGACTGCTGGTCCCAAGTGGTTGCTGGATGTGACTTGGCAAGGAGTGGAAGACAACAAAAACAACTGCAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  286  GTGCTGACTGCTGGTCCCAAGTGGTTGCTGGATGTGACTTGGCAAGGAGTGGAAGACAACAAAAACAACTGCAT  359

Query  519  TGTGTACAGCAAAGGGGGTCAGCTTTGGTGTACAACTACGAAGGCCATCTCTGAGGGTGAAGAGCTAATTGCCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  360  TGTGTACAGCAAAGGGGGTCAGCTTTGGTGTACAACTACGAAGGCCATCTCTGAGGGTGAAGAGCTAATTGCCT  433

Query  593  TTGTGGTGGATTTTGACTCAAGGCTACAAGCTGCCAGTCAGATGACTCTCACAGAAGGGATGTACCCTGCACGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  434  TTGTGGTGGATTTTGACTCAAGGCTACAAGCTGCCAGTCAGATGACTCTCACAGAAGGGATGTACCCTGCACGC  507

Query  667  CTGCTGGACTCAATTCAGCTGCTTCCTCAGCAAGCTGCCATGGCTTCTATTTTGCCCACAGCTATTGTCAATAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  508  CTGCTGGACTCAATTCAGCTGCTTCCTCAGCAAGCTGCCATGGCTTCTATTTTGCCCACAGCTATTGTCAATAA  581

Query  741  GGATATATTCCCTTGCAAGTCCTGTGGCATCTGGTATCGGAGTGAGCGGAATCTGCAGGCCCATTTGATGTACT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  582  GGATATATTCCCTTGCAAGTCCTGTGGCATCTGGTATCGGAGTGAGCGGAATCTGCAGGCCCATTTGATGTACT  655

Query  815  ACTGCAGTGGGAGGCAAAGAGAAGCTGCTCCGGTGTCAGAGGAAAATGAAGACAGTGCCCATCAGATTTCCAGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  656  ACTGCAGTGGGAGGCAAAGAGAAGCTGCTCCGGTGTCAGAGGAAAATGAAGACAGTGCCCATCAGATTTCCAGC  729

Query  889  CTGTGCCCCTTCCCACAGTGCACCAAGAGCTTTTCAAATGCTCGAGCTCTAGAAATGCACCTGAATTCACACAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  730  CTGTGCCCCTTCCCACAGTGCACCAAGAGCTTTTCAAATGCTCGAGCTCTAGAAATGCACCTGAATTCACACAG  803

Query  963  TGGAGTGAAAATGGAAGAATTCCTGCCCCCTGGTGCTAGTCTAAAATGCACCGTCTGTAGCTACACTGCTGATT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  804  TGGAGTGAAAATGGAAGAATTCCTGCCCCCTGGTGCTAGTCTAAAATGCACCGTCTGTAGCTACACTGCTGATT  877

Query 1037  CCGTGATCAACTTTCACCAACACCTGTTCTCCCATCTCACTCAAGCTGCCTTCCGATGTAATCACTGCCATTTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  878  CCGTGATCAACTTTCACCAACACCTGTTCTCCCATCTCACTCAAGCTGCCTTCCGATGTAATCACTGCCATTTC  951

Query 1111  GGCTTCCAGACTCAGAGGGAGTTATTGCAGCACCAGGAGCTCCATGTCCCTAGCGGCAAACTTCCCAGAGAAAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  952  GGCTTCCAGACTCAGAGGGAGTTATTGCAGCACCAGGAGCTCCATGTCCCTAGCGGCAAACTTCCCAGAGAAAG  1025

Query 1185  TGACATGGAACACTCTCCAAGTGCAACTGAAGACAGCTTACAGCCAGCCACAGACTTATTGACCAGAAGCGAAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1026  TGACATGGAACACTCTCCAAGTGCAACTGAAGACAGCTTACAGCCAGCCACAGACTTATTGACCAGAAGCGAAC  1099

Query 1259  TTCCCCAGAGCCAAAAGGCCATGCAGACTAAAGATGCGAGCTCTGACACAGAGCTGGACAAGTGTGAGAAAAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1100  TTCCCCAGAGCCAAAAGGCCATGCAGACTAAAGATGCGAGCTCTGACACAGAGCTGGACAAGTGTGAGAAAAAG  1173

Query 1333  ACTCAGCTCTTTCTCACGAACCAGAGACCAGAGATACAGCCTACAACAAATAAACAAAGCTTTTCTTACACAAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1174  ACTCAGCTCTTTCTCACGAACCAGAGACCAGAGATACAGCCTACAACAAATAAACAAAGCTTTTCTTACACAAA  1247

Query 1407  AATAAAGTCTGAGCCCTCTAGCCCAAGACTTGCCTCATCTCCAGTTCAGCCTAATATTGGGCCTTCTTTCCCTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1248  AATAAAGTCTGAGCCCTCTAGCCCAAGACTTGCCTCATCTCCAGTTCAGCCTAATATTGGGCCTTCTTTCCCTG  1321

Query 1481  TGGGCCCTTTCCTATCTCAGTTTTCTTTCCCCCAAGATATCACCATGGTCCCTCAAGCTTCAGAGATCTTAGCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322  TGGGCCCTTTCCTATCTCAGTTTTCTTTCCCCCAAGATATCACCATGGTCCCTCAAGCTTCAGAGATCTTAGCT  1395

Query 1555  AAGATGTCTGAACTGGTGCATCGGCGACTGAGGCATGGCAGTAGTAGCTACCCTCCCGTCATTTACAGCCCTTT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1396  AAGATGTCTGAACTGGTGCATCGGCGACTGAGGCATGGCAGTAGTAGCTACCCTCCCGTCATTTACAGCCCTTT  1469

Query 1629  GATGCCCAAGGGGGCTACTTGTTTTGAGTGTAACATAACATTCAATAATTTGGATAATTATCTAGTGCACAAAA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1470  GATGCCCAAGGGGGCTACTTGTTTTGAGTGTAACATAACATTCAATAATTTGGATAATTATCTAGTGCACAAAA  1543

Query 1703  AGCATTATTGCAGCAGCCGATGGCAGCAGATGGCTAAGTCCCCAGAGTTCCCTAGTGTGTCAGAAAAGATGCCT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1544  AGCATTATTGCAGCAGCCGATGGCAGCAGATGGCTAAGTCCCCAGAGTTCCCTAGTGTGTCAGAAAAGATGCCT  1617

Query 1777  GAAGCTTTGAGTCCCAACACTGGCCAAACCTCCATAAACCTTCTCAACCCAGCTGCTCATTCTGCTGATCCTGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618  GAAGCTTTGAGTCCCAACACTGGCCAAACCTCCATAAACCTTCTCAACCCAGCTGCTCATTCTGCTGATCCTGA  1691

Query 1851  GAATCCACTTCTTCAAACATCTTGCATCAATTCTTCCACTGTCTTAGATTTAATTGGGCCAAATGGGAAGGGCC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1692  GAATCCACTTCTTCAAACATCTTGCATCAATTCTTCCACTGTCTTAGATTTAATTGGGCCAAATGGGAAGGGCC  1765

Query 1925  ATGACAAGGACTTTTCCACTCAAACTAAGAAGCTCTCCACCTCCAGTAACAATGATGACAAAATTAATGGAAAA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1766  ATGACAAGGACTTTTCCACTCAAACTAAGAAGCTCTCCACCTCCAGTAACAATGATGACAAAATTAATGGAAAA  1839

Query 1999  CCTGTTGATGTGAAAAATCCCAGTGTCCCCTTAGTGGATGGGGAAAGTGACCCAAATAAGACTACCTGTGAAGC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1840  CCTGTTGATGTGAAAAATCCCAGTGTCCCCTTAGTGGATGGGGAAAGTGACCCAAATAAGACTACCTGTGAAGC  1913

Query 2073  TTGCAACATTACCTTCAGCCGGCACGAAACATACATGGTCCACAAACAGTATTACTGTGCTACACGCCACGACC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1914  TTGCAACATTACCTTCAGCCGGCACGAAACATACATGGTCCACAAACAGTATTACTGTGCTACACGCCACGACC  1987

Query 2147  CTCCACTGAAGAGGTCTGCTTCCAACAAAGTGCCTGCCATGCAGAGAACCATGCGCACACGCAAGCGCAGAAAG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1988  CTCCACTGAAGAGGTCTGCTTCCAACAAAGTGCCTGCCATGCAGAGAACCATGCGCACACGCAAGCGCAGAAAG  2061

Query 2221  ATGTATGAGATGTGCCTACCTGAGCAGGAACAAAGGCCTCCACTGGTTCAGCAGAGATTTCTTGACGTAGCCAA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2062  ATGTATGAGATGTGCCTACCTGAGCAGGAACAAAGGCCTCCACTGGTTCAGCAGAGATTTCTTGACGTAGCCAA  2135

Query 2295  CCTCAATAATCCTTGTACCTCCACTCAAGAACCCACAGAAGGGCTAGGAGAGTGCTACCACCCAAGATGTGATA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2136  CCTCAATAATCCTTGTACCTCCACTCAAGAACCCACAGAAGGGCTAGGAGAGTGCTACCACCCAAGATGTGATA  2209

Query 2369  TCTTTCCAGGAATTGTCTCTAAACACTTGGAAACTTCTCTGACGATCAACAAGTGTGTTCCAGTTTCCAAATGT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2210  TCTTTCCAGGAATTGTCTCTAAACACTTGGAAACTTCTCTGACGATCAACAAGTGTGTTCCAGTTTCCAAATGT  2283

Query 2443  GATACTACTCATTCCAGTGTTTCCTGCCTAGAGATGGACGTGCCCATAGATCTCAGCAAAAAGTGTTTATCTCA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2284  GATACTACTCATTCCAGTGTTTCCTGCCTAGAGATGGACGTGCCCATAGATCTCAGCAAAAAGTGTTTATCTCA  2357

Query 2517  GTCTGAGCGGACGACCACGTCTCCCAAAAGGCTGCTGGACTATCACGAGTGCACTGTGTGCAAGATCAGTTTCA  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2358  GTCTGAGCGGACGACCACGTCTCCCAAAAGGCTGCTGGACTATCACGAGTGCACTGTGTGCAAGATCAGTTTCA  2431

Query 2591  ATAAGGTAGAAAACTATCTGGCCCACAAGCAGAATTTCTGCCCGGTTACTGCACATCAGCGTAATGACCTGGGT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2432  ATAAGGTAGAAAACTATCTGGCCCACAAGCAGAATTTCTGCCCGGTTACTGCACATCAGCGTAATGACCTGGGT  2505

Query 2665  CAACTGGACGGCAAAGTGTTTCCGAATCCAGAAAGCGAACGAAACAGCCCTGATGTCAGCTACGAAAGAAGCAT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2506  CAACTGGACGGCAAAGTGTTTCCGAATCCAGAAAGCGAACGAAACAGCCCTGATGTCAGCTACGAAAGAAGCAT  2579

Query 2739  AATAAAATGTGAGAAAAATGGGAATTTGAAGCAGCCTTCCCCCAATGGAAACTTATTTTCATCCCACCTAGCAA  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2580  AATAAAATGTGAGAAAAATGGGAATTTGAAGCAGCCTTCCCCCAATGGAAACTTATTTTCATCCCACCTAGCAA  2653

Query 2813  CCCTGCAAGGCTTGAAGGTCTTTAGTGAAGCTGCTCAGCTCATTGCTACAAAAGAAGAAAACAGACATTTGTTT  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2654  CCCTGCAAGGCTTGAAGGTCTTTAGTGAAGCTGCTCAGCTCATTGCTACAAAAGAAGAAAACAGACATTTGTTT  2727

Query 2887  CTTCCACAATGCCTTTACCCTGGAGCAATAGCGAAAGCAAAAGGAGCCGACCAGCTTTCTCCATATTATGGAAT  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2728  CTTCCACAATGCCTTTACCCTGGAGCAATAAAGAAAGCAAAAGGAGCCGACCAGCTTTCTCCATATTATGGAAT  2801

Query 2961  CAAGCCAAGTGATTATATTTCTGGTTCTCTTGTCATCCATAACACTGACATCGAGCAAAGCAGAAATGCAGAAA  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2802  CAAGCCAAGTGATTATATTTCTGGTTCTCTTGTCATCCATAACACTGACATCGAGCAAAGCAGAAATGCAGAAA  2875

Query 3035  ATGAATCTCCTAAAGGCCAGGCTTCCTCAAATGGGTGTGCTGCGCTGAAGAAAGATTCTCTGCCATTGTTGCCC  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2876  ATGAATCTCCTAAAGGCCAGGCTTCCTCAAATGGGTGTGCTGCGCTGAAGAAAGATTCTCTGCCATTGTTGCCC  2949

Query 3109  AAAAATCGAGGAATGGTAATAGTGAATGGTGGACTGAAACAAGATGAGAGACCTGCTGCCAACCCACAGCAAGA  3182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2950  AAAAATCGAGGAATGGTAATAGTGAATGGTGGACTGAAACAAGATGAGAGACCTGCTGCCAACCCACAGCAAGA  3023

Query 3183  GAACATTTCCCAGAATCCTCAGCACGAAGACGACCACAAATCTCCCTCGTGGATCTCTGAGAACCCATTAGCTG  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3024  GAACATTTCCCAGAATCCTCAGCACGAAGACGACCACAAATCTCCCTCGTGGATCTCTGAGAACCCATTAGCTG  3097

Query 3257  CCAATGAGAATGTCTCACCAGGAATTCCCTCAGCAGAGGAACAGTTGTCTAGTATAGCAAAAGGTGTGAATGGT  3330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3098  CCAATGAGAATGTCTCACCAGGAATTCCCTCAGCAGAGGAACAGTTGTCTAGTATAGCAAAAGGTGTGAATGGT  3171

Query 3331  TCCAGCCAGGCTCCAACCAGTGGGAAATATTGCCGGCTATGTGATATCCAGTTCAACAACCTTTCAAACTTTAT  3404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3172  TCCAGCCAGGCTCCAACCAGTGGGAAATATTGCCGGCTATGTGATATCCAGTTCAACAACCTTTCAAACTTTAT  3245

Query 3405  AACTCACAAGAAGTTTTATTGCTCATCACATGCAGCAGAACATGTCAAA  3453
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3246  AACTCACAAGAAGTTTTATTGCTCATCACATGCAGCAGAACATGTCAAA  3294