Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468757
• Subject: NM_001362837.2
• Aligned Length: 3453
• Identities: 3055
• Gaps: 396

Alignment

Query    1  ATGTCCCGGCGAAAGCAAAAGGAACCCCGGCAGATCAAACGGCCGCTTGAAGATGCCATTGAAGATGAGGAAGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGAATGTCCATCAGAGGAAACAGACATCATCTCCAAAGGAGACTTTCCATTGGAGGAAAGCTTTTCCACAGAAT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTGGGCCTGAAAATCTGAGCTGCGAAGAAGTGGAATACTTTTGTAACAAAGGTGATGATGAAGGAATCCAGGAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ACAGCAGAATCAGATGGGGACACACAGTCAGAGAAACCGGGGCAACCTGGAGTTGAGACAGACGACTGGGATGG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  ACCAGGAGAGCTGGAGGTGTTTCAGAAAGATGGGGAACGAAAAATTCAGAGTCGACAGCAACTTCCAGTGGGAA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CAACCTGGGGGCCGTTTCCTGGGAAGATGGACTTGAATAATAATTCTTTGAAGACAAAGGCTCAGGTCCCAATG  444
                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------ATGGACTTGAATAATAATTCTTTGAAGACAAAGGCTCAGGTCCCAATG  48

Query  445  GTGCTGACTGCTGGTCCCAAGTGGTTGCTGGATGTGACTTGGCAAGGAGTGGAAGACAACAAAAACAACTGCAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   49  GTGCTGACTGCTGGTCCCAAGTGGTTGCTGGATGTGACTTGGCAAGGAGTGGAAGACAACAAAAACAACTGCAT  122

Query  519  TGTGTACAGCAAAGGGGGTCAGCTTTGGTGTACAACTACGAAGGCCATCTCTGAGGGTGAAGAGCTAATTGCCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  123  TGTGTACAGCAAAGGGGGTCAGCTTTGGTGTACAACTACGAAGGCCATCTCTGAGGGTGAAGAGCTAATTGCCT  196

Query  593  TTGTGGTGGATTTTGACTCAAGGCTACAAGCTGCCAGTCAGATGACTCTCACAGAAGGGATGTACCCTGCACGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  197  TTGTGGTGGATTTTGACTCAAGGCTACAAGCTGCCAGTCAGATGACTCTCACAGAAGGGATGTACCCTGCACGC  270

Query  667  CTGCTGGACTCAATTCAGCTGCTTCCTCAGCAAGCTGCCATGGCTTCTATTTTGCCCACAGCTATTGTCAATAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  271  CTGCTGGACTCAATTCAGCTGCTTCCTCAGCAAGCTGCCATGGCTTCTATTTTGCCCACAGCTATTGTCAATAA  344

Query  741  GGATATATTCCCTTGCAAGTCCTGTGGCATCTGGTATCGGAGTGAGCGGAATCTGCAGGCCCATTTGATGTACT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  345  GGATATATTCCCTTGCAAGTCCTGTGGCATCTGGTATCGGAGTGAGCGGAATCTGCAGGCCCATTTGATGTACT  418

Query  815  ACTGCAGTGGGAGGCAAAGAGAAGCTGCTCCGGTGTCAGAGGAAAATGAAGACAGTGCCCATCAGATTTCCAGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  419  ACTGCAGTGGGAGGCAAAGAGAAGCTGCTCCGGTGTCAGAGGAAAATGAAGACAGTGCCCATCAGATTTCCAGC  492

Query  889  CTGTGCCCCTTCCCACAGTGCACCAAGAGCTTTTCAAATGCTCGAGCTCTAGAAATGCACCTGAATTCACACAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  493  CTGTGCCCCTTCCCACAGTGCACCAAGAGCTTTTCAAATGCTCGAGCTCTAGAAATGCACCTGAATTCACACAG  566

Query  963  TGGAGTGAAAATGGAAGAATTCCTGCCCCCTGGTGCTAGTCTAAAATGCACCGTCTGTAGCTACACTGCTGATT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  567  TGGAGTGAAAATGGAAGAATTCCTGCCCCCTGGTGCTAGTCTAAAATGCACCGTCTGTAGCTACACTGCTGATT  640

Query 1037  CCGTGATCAACTTTCACCAACACCTGTTCTCCCATCTCACTCAAGCTGCCTTCCGATGTAATCACTGCCATTTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  641  CCGTGATCAACTTTCACCAACACCTGTTCTCCCATCTCACTCAAGCTGCCTTCCGATGTAATCACTGCCATTTC  714

Query 1111  GGCTTCCAGACTCAGAGGGAGTTATTGCAGCACCAGGAGCTCCATGTCCCTAGCGGCAAACTTCCCAGAGAAAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  715  GGCTTCCAGACTCAGAGGGAGTTATTGCAGCACCAGGAGCTCCATGTCCCTAGCGGCAAACTTCCCAGAGAAAG  788

Query 1185  TGACATGGAACACTCTCCAAGTGCAACTGAAGACAGCTTACAGCCAGCCACAGACTTATTGACCAGAAGCGAAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  789  TGACATGGAACACTCTCCAAGTGCAACTGAAGACAGCTTACAGCCAGCCACAGACTTATTGACCAGAAGCGAAC  862

Query 1259  TTCCCCAGAGCCAAAAGGCCATGCAGACTAAAGATGCGAGCTCTGACACAGAGCTGGACAAGTGTGAGAAAAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  863  TTCCCCAGAGCCAAAAGGCCATGCAGACTAAAGATGCGAGCTCTGACACAGAGCTGGACAAGTGTGAGAAAAAG  936

Query 1333  ACTCAGCTCTTTCTCACGAACCAGAGACCAGAGATACAGCCTACAACAAATAAACAAAGCTTTTCTTACACAAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  937  ACTCAGCTCTTTCTCACGAACCAGAGACCAGAGATACAGCCTACAACAAATAAACAAAGCTTTTCTTACACAAA  1010

Query 1407  AATAAAGTCTGAGCCCTCTAGCCCAAGACTTGCCTCATCTCCAGTTCAGCCTAATATTGGGCCTTCTTTCCCTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011  AATAAAGTCTGAGCCCTCTAGCCCAAGACTTGCCTCATCTCCAGTTCAGCCTAATATTGGGCCTTCTTTCCCTG  1084

Query 1481  TGGGCCCTTTCCTATCTCAGTTTTCTTTCCCCCAAGATATCACCATGGTCCCTCAAGCTTCAGAGATCTTAGCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1085  TGGGCCCTTTCCTATCTCAGTTTTCTTTCCCCCAAGATATCACCATGGTCCCTCAAGCTTCAGAGATCTTAGCT  1158

Query 1555  AAGATGTCTGAACTGGTGCATCGGCGACTGAGGCATGGCAGTAGTAGCTACCCTCCCGTCATTTACAGCCCTTT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1159  AAGATGTCTGAACTGGTGCATCGGCGACTGAGGCATGGCAGTAGTAGCTACCCTCCCGTCATTTACAGCCCTTT  1232

Query 1629  GATGCCCAAGGGGGCTACTTGTTTTGAGTGTAACATAACATTCAATAATTTGGATAATTATCTAGTGCACAAAA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1233  GATGCCCAAGGGGGCTACTTGTTTTGAGTGTAACATAACATTCAATAATTTGGATAATTATCTAGTGCACAAAA  1306

Query 1703  AGCATTATTGCAGCAGCCGATGGCAGCAGATGGCTAAGTCCCCAGAGTTCCCTAGTGTGTCAGAAAAGATGCCT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1307  AGCATTATTGCAGCAGCCGATGGCAGCAGATGGCTAAGTCCCCAGAGTTCCCTAGTGTGTCAGAAAAGATGCCT  1380

Query 1777  GAAGCTTTGAGTCCCAACACTGGCCAAACCTCCATAAACCTTCTCAACCCAGCTGCTCATTCTGCTGATCCTGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381  GAAGCTTTGAGTCCCAACACTGGCCAAACCTCCATAAACCTTCTCAACCCAGCTGCTCATTCTGCTGATCCTGA  1454

Query 1851  GAATCCACTTCTTCAAACATCTTGCATCAATTCTTCCACTGTCTTAGATTTAATTGGGCCAAATGGGAAGGGCC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1455  GAATCCACTTCTTCAAACATCTTGCATCAATTCTTCCACTGTCTTAGATTTAATTGGGCCAAATGGGAAGGGCC  1528

Query 1925  ATGACAAGGACTTTTCCACTCAAACTAAGAAGCTCTCCACCTCCAGTAACAATGATGACAAAATTAATGGAAAA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1529  ATGACAAGGACTTTTCCACTCAAACTAAGAAGCTCTCCACCTCCAGTAACAATGATGACAAAATTAATGGAAAA  1602

Query 1999  CCTGTTGATGTGAAAAATCCCAGTGTCCCCTTAGTGGATGGGGAAAGTGACCCAAATAAGACTACCTGTGAAGC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1603  CCTGTTGATGTGAAAAATCCCAGTGTCCCCTTAGTGGATGGGGAAAGTGACCCAAATAAGACTACCTGTGAAGC  1676

Query 2073  TTGCAACATTACCTTCAGCCGGCACGAAACATACATGGTCCACAAACAGTATTACTGTGCTACACGCCACGACC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1677  TTGCAACATTACCTTCAGCCGGCACGAAACATACATGGTCCACAAACAGTATTACTGTGCTACACGCCACGACC  1750

Query 2147  CTCCACTGAAGAGGTCTGCTTCCAACAAAGTGCCTGCCATGCAGAGAACCATGCGCACACGCAAGCGCAGAAAG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1751  CTCCACTGAAGAGGTCTGCTTCCAACAAAGTGCCTGCCATGCAGAGAACCATGCGCACACGCAAGCGCAGAAAG  1824

Query 2221  ATGTATGAGATGTGCCTACCTGAGCAGGAACAAAGGCCTCCACTGGTTCAGCAGAGATTTCTTGACGTAGCCAA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1825  ATGTATGAGATGTGCCTACCTGAGCAGGAACAAAGGCCTCCACTGGTTCAGCAGAGATTTCTTGACGTAGCCAA  1898

Query 2295  CCTCAATAATCCTTGTACCTCCACTCAAGAACCCACAGAAGGGCTAGGAGAGTGCTACCACCCAAGATGTGATA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1899  CCTCAATAATCCTTGTACCTCCACTCAAGAACCCACAGAAGGGCTAGGAGAGTGCTACCACCCAAGATGTGATA  1972

Query 2369  TCTTTCCAGGAATTGTCTCTAAACACTTGGAAACTTCTCTGACGATCAACAAGTGTGTTCCAGTTTCCAAATGT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1973  TCTTTCCAGGAATTGTCTCTAAACACTTGGAAACTTCTCTGACGATCAACAAGTGTGTTCCAGTTTCCAAATGT  2046

Query 2443  GATACTACTCATTCCAGTGTTTCCTGCCTAGAGATGGACGTGCCCATAGATCTCAGCAAAAAGTGTTTATCTCA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2047  GATACTACTCATTCCAGTGTTTCCTGCCTAGAGATGGACGTGCCCATAGATCTCAGCAAAAAGTGTTTATCTCA  2120

Query 2517  GTCTGAGCGGACGACCACGTCTCCCAAAAGGCTGCTGGACTATCACGAGTGCACTGTGTGCAAGATCAGTTTCA  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2121  GTCTGAGCGGACGACCACGTCTCCCAAAAGGCTGCTGGACTATCACGAGTGCACTGTGTGCAAGATCAGTTTCA  2194

Query 2591  ATAAGGTAGAAAACTATCTGGCCCACAAGCAGAATTTCTGCCCGGTTACTGCACATCAGCGTAATGACCTGGGT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2195  ATAAGGTAGAAAACTATCTGGCCCACAAGCAGAATTTCTGCCCGGTTACTGCACATCAGCGTAATGACCTGGGT  2268

Query 2665  CAACTGGACGGCAAAGTGTTTCCGAATCCAGAAAGCGAACGAAACAGCCCTGATGTCAGCTACGAAAGAAGCAT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2269  CAACTGGACGGCAAAGTGTTTCCGAATCCAGAAAGCGAACGAAACAGCCCTGATGTCAGCTACGAAAGAAGCAT  2342

Query 2739  AATAAAATGTGAGAAAAATGGGAATTTGAAGCAGCCTTCCCCCAATGGAAACTTATTTTCATCCCACCTAGCAA  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2343  AATAAAATGTGAGAAAAATGGGAATTTGAAGCAGCCTTCCCCCAATGGAAACTTATTTTCATCCCACCTAGCAA  2416

Query 2813  CCCTGCAAGGCTTGAAGGTCTTTAGTGAAGCTGCTCAGCTCATTGCTACAAAAGAAGAAAACAGACATTTGTTT  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2417  CCCTGCAAGGCTTGAAGGTCTTTAGTGAAGCTGCTCAGCTCATTGCTACAAAAGAAGAAAACAGACATTTGTTT  2490

Query 2887  CTTCCACAATGCCTTTACCCTGGAGCAATAGCGAAAGCAAAAGGAGCCGACCAGCTTTCTCCATATTATGGAAT  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2491  CTTCCACAATGCCTTTACCCTGGAGCAATAAAGAAAGCAAAAGGAGCCGACCAGCTTTCTCCATATTATGGAAT  2564

Query 2961  CAAGCCAAGTGATTATATTTCTGGTTCTCTTGTCATCCATAACACTGACATCGAGCAAAGCAGAAATGCAGAAA  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2565  CAAGCCAAGTGATTATATTTCTGGTTCTCTTGTCATCCATAACACTGACATCGAGCAAAGCAGAAATGCAGAAA  2638

Query 3035  ATGAATCTCCTAAAGGCCAGGCTTCCTCAAATGGGTGTGCTGCGCTGAAGAAAGATTCTCTGCCATTGTTGCCC  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2639  ATGAATCTCCTAAAGGCCAGGCTTCCTCAAATGGGTGTGCTGCGCTGAAGAAAGATTCTCTGCCATTGTTGCCC  2712

Query 3109  AAAAATCGAGGAATGGTAATAGTGAATGGTGGACTGAAACAAGATGAGAGACCTGCTGCCAACCCACAGCAAGA  3182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2713  AAAAATCGAGGAATGGTAATAGTGAATGGTGGACTGAAACAAGATGAGAGACCTGCTGCCAACCCACAGCAAGA  2786

Query 3183  GAACATTTCCCAGAATCCTCAGCACGAAGACGACCACAAATCTCCCTCGTGGATCTCTGAGAACCCATTAGCTG  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2787  GAACATTTCCCAGAATCCTCAGCACGAAGACGACCACAAATCTCCCTCGTGGATCTCTGAGAACCCATTAGCTG  2860

Query 3257  CCAATGAGAATGTCTCACCAGGAATTCCCTCAGCAGAGGAACAGTTGTCTAGTATAGCAAAAGGTGTGAATGGT  3330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2861  CCAATGAGAATGTCTCACCAGGAATTCCCTCAGCAGAGGAACAGTTGTCTAGTATAGCAAAAGGTGTGAATGGT  2934

Query 3331  TCCAGCCAGGCTCCAACCAGTGGGAAATATTGCCGGCTATGTGATATCCAGTTCAACAACCTTTCAAACTTTAT  3404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2935  TCCAGCCAGGCTCCAACCAGTGGGAAATATTGCCGGCTATGTGATATCCAGTTCAACAACCTTTCAAACTTTAT  3008

Query 3405  AACTCACAAGAAGTTTTATTGCTCATCACATGCAGCAGAACATGTCAAA  3453
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3009  AACTCACAAGAAGTTTTATTGCTCATCACATGCAGCAGAACATGTCAAA  3057