Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468757
• Subject: NM_011766.5
• Aligned Length: 3453
• Identities: 3072
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTCCCGGCGAAAGCAAAAGGAACCCCGGCAGATCAAACGGCCGCTTGAAGATGCCATTGAAGATGAGGAAGA  74
            |||||||||||||||||.|...|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGTCCCGGCGAAAGCAGAGTAAACCCCGGCAGATCAAACGGCCGCTGGAAGATGCCATCGACGACGAGGAAGA  74

Query   75  AGAATGTCCATCAGAGGAAACAGACATCATCTCCAAAGGAGACTTTCCATTGGAGGAAAGCTTTTCCACAGAAT  148
            |||.|||||....||||||.|.||..|||||||.|||||.|||||||||.||||||.||||||..||.|||..|
Sbjct   75  AGAGTGTCCGGTGGAGGAAGCCGAAGTCATCTCGAAAGGCGACTTTCCACTGGAGGGAAGCTTCCCCGCAGGCT  148

Query  149  TTGGGCCTGAAAATCTGAGCTGCGAAGAAGTGGAATACTTTTGTAACAAAGGTGATGATGAAGGAATCCAGGAG  222
            |||.|||.||||||||||||||||||||.|||||.|.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  TTGAGCCCGAAAATCTGAGCTGCGAAGACGTGGAGTTCTTTTGTAACAAAGGTGATGACGAAGGAATCCAGGAG  222

Query  223  ACAGCAGAATCAGATGGGGACACACAGTCAGAGAAACCGGGGCAACCTGGAGTTGAGACAGACGACTGGGATGG  296
            .|||||||||||||||||||||..||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  CCAGCAGAATCAGATGGGGACAGCCATTCAGACAAACCAGGACAGCCTGGGGTAGAGACAGATGACTGGGATGG  296

Query  297  ACCAGGAGAGCTGGAGGTGTTTCAGAAAGATGGGGAACGAAAAATTCAGAGTCGACAGCAACTTCCAGTGGGAA  370
            ||||||||||||.||.||||||||||.||||||.|||.|.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  297  ACCAGGAGAGCTAGAAGTGTTTCAGAGAGATGGAGAAAGGAAGATTCAGAGTCGGCAGCAACTTCCGGTGGGAA  370

Query  371  CAACCTGGGGGCCGTTTCCTGGGAAGATGGACTTGAATAATAATTCTTTGAAGACAAAGGCTCAGGTCCCAATG  444
            ||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  371  CAACCTGGGGCCCTTTTGCTGGGAAGATGGACTTGAACAATAATTCCTTGAAGACGAAGGCTCAGGTCCCCATG  444

Query  445  GTGCTGACTGCTGGTCCCAAGTGGTTGCTGGATGTGACTTGGCAAGGAGTGGAAGACAACAAAAACAACTGCAT  518
            |||||||||||||||||.||.|||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  445  GTGCTGACTGCTGGTCCTAAATGGCTTCTGGATGTGACATGGCAAGGAGTGGAAGACAGCAAAAACAACTGCAT  518

Query  519  TGTGTACAGCAAAGGGGGTCAGCTTTGGTGTACAACTACGAAGGCCATCTCTGAGGGTGAAGAGCTAATTGCCT  592
            ||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||..|.||||
Sbjct  519  TGTGTACAGCAAAGGGGGCCAACTTTGGTGCACCACAACGAAGGCCATCTCAGAGGGTGAAGAGCTCGTCGCCT  592

Query  593  TTGTGGTGGATTTTGACTCAAGGCTACAAGCTGCCAGTCAGATGACTCTCACAGAAGGGATGTACCCTGCACGC  666
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  593  TTGTGGTGGACTTTGACTCAAGGCTACAAGCTGCTAGTCACATGACTCTCACCGAAGGGATGTACCCTGCCCGC  666

Query  667  CTGCTGGACTCAATTCAGCTGCTTCCTCAGCAAGCTGCCATGGCTTCTATTTTGCCCACAGCTATTGTCAATAA  740
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGCTGGACTCGATTCAGCTGCTTCCTCAGCAAGCTGCCATGGCTTCTATTTTGCCTACAGCTATTGTCAATAA  740

Query  741  GGATATATTCCCTTGCAAGTCCTGTGGCATCTGGTATCGGAGTGAGCGGAATCTGCAGGCCCATTTGATGTACT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  741  GGATATATTCCCTTGCAAGTCCTGTGGCATCTGGTACCGGAGCGAGCGGAACCTGCAAGCCCATTTGATGTACT  814

Query  815  ACTGCAGTGGGAGGCAAAGAGAAGCTGCTCCGGTGTCAGAGGAAAATGAAGACAGTGCCCATCAGATTTCCAGC  888
            ||||.||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||||...|.||||||.||||||||
Sbjct  815  ACTGTAGTGGGAGGCAACGAGAAGCTGCTCCAGTGTCAGAAGAAAATGAAGACAACTCGCATCAGGTTTCCAGC  888

Query  889  CTGTGCCCCTTCCCACAGTGCACCAAGAGCTTTTCAAATGCTCGAGCTCTAGAAATGCACCTGAATTCACACAG  962
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGTGCCCCTTCCCACAATGCACCAAGAGCTTTTCCAATGCCCGAGCTCTAGAAATGCACCTGAATTCACACAG  962

Query  963  TGGAGTGAAAATGGAAGAATTCCTGCCCCCTGGTGCTAGTCTAAAATGCACCGTCTGTAGCTACACTGCTGATT  1036
            |||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||.||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGTGTGAAAATGGAAGAGTTCCTGCCCCCTGGGGCGAGTTTAAAATGCACGGTCTGTAGCTACACTGCTGATT  1036

Query 1037  CCGTGATCAACTTTCACCAACACCTGTTCTCCCATCTCACTCAAGCTGCCTTCCGATGTAATCACTGCCATTTC  1110
            |.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct 1037  CTGTGATCAACTTCCACCAACACCTGTTCTCGCATCTCACTCAAGCCGCCTTCCGATGCAACCACTGCCATTTT  1110

Query 1111  GGCTTCCAGACTCAGAGGGAGTTATTGCAGCACCAGGAGCTCCATGTCCCTAGCGGCAAACTTCCCAGAGAAAG  1184
            |||||.|||||.|||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGCTTTCAGACCCAGAGGGAGCTACTGCAGCACCAGGAGCTCCATGTCCCCAGTGGCAAACTTCCCAGAGAAAG  1184

Query 1185  TGACATGGAACACTCTCCAAGTGCAACTGAAGACAGCTTACAGCCAGCCACAGACTTATTGACCAGAAGCGAAC  1258
            |||||||||.|||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||.|
Sbjct 1185  TGACATGGAGCACTCTCCAAGTGGAACGGAAGACAGCTTACAGCCAGCCACAGACTTGTTGGCCAGAAGTGACC  1258

Query 1259  TTCCCCAGAGCCAAAAGGCCATGCAGACTAAAGATGCGAGCTCTGACACAGAGCTGGACAAGTGTGAGAAAAAG  1332
            |..|||||||||||||||||||||.||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCTCCCAGAGCCAAAAGGCCATGCCGACTAAGGATGCAAGCTCAGACACAGAGCTGGACAAGTGTGAGAAAAAG  1332

Query 1333  ACTCAGCTCTTTCTCACGAACCAGAGACCAGAGATACAGCCTACAACAAATAAACAAAGCTTTTCTTACACAAA  1406
            |||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||.||.|.||.||.||||.|||.|||||||||||
Sbjct 1333  ACTCAACTCTTCCTCACCAATCAGAGACCAGAGATCCAGCCTGCAGCCAACAAGCAAAACTTCTCTTACACAAA  1406

Query 1407  AATAAAGTCTGAGCCCTCTAGCCCAAGACTTGCCTCATCTCCAGTTCAGCCTAATATTGGGCCTTCTTTCCCTG  1480
            ||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||||||||||
Sbjct 1407  AATAAAGTCTGAGCCCTCCAGTCCCAGACTCGCCTCATCTCCAGTGCAACCCAACATCGGGCCCTCTTTCCCTG  1480

Query 1481  TGGGCCCTTTCCTATCTCAGTTTTCTTTCCCCCAAGATATCACCATGGTCCCTCAAGCTTCAGAGATCTTAGCT  1554
            ||||.||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 1481  TGGGACCTTTCCTGTCTCAGTTTGCTTTTCCCCAAGATATCACGATGGTCCCTCAGGCTTCAGAGATCTTGGCG  1554

Query 1555  AAGATGTCTGAACTGGTGCATCGGCGACTGAGGCATGGCAGTAGTAGCTACCCTCCCGTCATTTACAGCCCTTT  1628
            ||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1555  AAGATGTCCGAGCTGGTGCACCGTCGACTGAGGCATGGGAGTAGTAGCTACCCTCCTGTGATTTACAGCCCTTT  1628

Query 1629  GATGCCCAAGGGGGCTACTTGTTTTGAGTGTAACATAACATTCAATAATTTGGATAATTATCTAGTGCACAAAA  1702
            |||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 1629  GATGCCCAAAGGGGCTACGTGCTTTGAGTGTAACATAACATTCAATAATTTGGATAACTATCTAGTTCATAAAA  1702

Query 1703  AGCATTATTGCAGCAGCCGATGGCAGCAGATGGCTAAGTCCCCAGAGTTCCCTAGTGTGTCAGAAAAGATGCCT  1776
            ||||.||.|||||||||.||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1703  AGCACTACTGCAGCAGCAGATGGCAGCAGATGGCCAAATCCCCTGAGTTTCCAAGTGTTTCTGAAAAAATGCCT  1776

Query 1777  GAAGCTTTGAGTCCCAACACTGGCCAAACCTCCATAAACCTTCTCAACCCAGCTGCTCATTCTGCTGATCCTGA  1850
            ||.|||.|||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||..|.||.||.||
Sbjct 1777  GAGGCTGTGAGTCCTAACACTGGCCAGACTTCCATAAACCTTCTTAACCCAGCCGCTCATTCATCGGACCCAGA  1850

Query 1851  GAATCCACTTCTTCAAACATCTTGCATCAATTCTTCCACTGTCTTAGATTTAATTGGGCCAAATGGGAAGGGCC  1924
            |||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1851  GAACCCACTCCTTCAAACATCCTGCATCAACTCTTCCACCGTTTTAGATTTGATTGGGCCAAACGGGAAAGGCC  1924

Query 1925  ATGACAAGGACTTTTCCACTCAAACTAAGAAGCTCTCCACCTCCAGTAACAATGATGACAAAATTAATGGAAAA  1998
            ||||.||||||||||||||||||...||.|||.|..|||||||||..|..|.|||.||||||||.||.|||||.
Sbjct 1925  ATGAGAAGGACTTTTCCACTCAAGTCAAAAAGTTGCCCACCTCCAACAGTAGTGACGACAAAATAAACGGAAAG  1998

Query 1999  CCTGTTGATGTGAAAAATCCCAGTGTCCCCTTAGTGGATGGGGAAAGTGACCCAAATAAGACTACCTGTGAAGC  2072
            |||||||||||||||||||||||.|..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CCTGTTGATGTGAAAAATCCCAGCGGTCCCTTAGTGGATGGGGAAAGTGACCCAAATAAGACTACCTGTGAAGC  2072

Query 2073  TTGCAACATTACCTTCAGCCGGCACGAAACATACATGGTCCACAAACAGTATTACTGTGCTACACGCCACGACC  2146
            |||.|||||.|||||.|||.||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 2073  TTGTAACATCACCTTTAGCAGGCATGAAACCTATATGGTCCACAAACAGTATTACTGTGCAACACGCCATGACC  2146

Query 2147  CTCCACTGAAGAGGTCTGCTTCCAACAAAGTGCCTGCCATGCAGAGAACCATGCGCACACGCAAGCGCAGAAAG  2220
            ||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2147  CTCCGCTAAAGAGGTCTGCTTCCAACAAAGTGCCGGCCATGCAGAGAACCATGCGCACACGCAAGCGAAGAAAG  2220

Query 2221  ATGTATGAGATGTGCCTACCTGAGCAGGAACAAAGGCCTCCACTGGTTCAGCAGAGATTTCTTGACGTAGCCAA  2294
            |||||.||.|||||||||||||||||||||||..||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2221  ATGTACGAAATGTGCCTACCTGAGCAGGAACAGCGGCCGCCCCTGGTCCAGCAGAGATTTCTTGATGTAGCCAA  2294

Query 2295  CCTCAATAATCCTTGTACCTCCACTCAAGAACCCACAGAAGGGCTAGGAGAGTGCTACCACCCAAGATGTGATA  2368
            |||.|..||||||||||.||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 2295  CCTAAGCAATCCTTGTAGCTCCACTCAAGAGCCCACCGAAGGGCTAGGAGAATGCTACCACCCAAGATGCGACA  2368

Query 2369  TCTTTCCAGGAATTGTCTCTAAACACTTGGAAACTTCTCTGACGATCAACAAGTGTGTTCCAGTTTCCAAATGT  2442
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||..||.|.||.|||||.||||||||.|||.||||.|||
Sbjct 2369  TCTTCCCAGGAATTGTCTCTAAGCACTTGGAAACATCATTGGCCATGAACAAATGTGTTCCGGTTCCCAAGTGT  2442

Query 2443  GATACTACTCATTCCAGTGTTTCCTGCCTAGAGATGGACGTGCCCATAGATCTCAGCAAAAAGTGTTTATCTCA  2516
            ||.||.||.|||||||.||||||||||.|.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2443  GACACGACCCATTCCAATGTTTCCTGCTTGGAGATGGATGTCCCTATAGATCTCAGCAAAAAGTGTTTATCGCA  2516

Query 2517  GTCTGAGCGGACGACCACGTCTCCCAAAAGGCTGCTGGACTATCACGAGTGCACTGTGTGCAAGATCAGTTTCA  2590
            |||||||||||||||..|.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 2517  GTCTGAGCGGACGACAGCATCTCCTAAGAGGCTACTAGACTACCACGAGTGCACAGTGTGCAAGATCAGCTTCA  2590

Query 2591  ATAAGGTAGAAAACTATCTGGCCCACAAGCAGAATTTCTGCCCGGTTACTGCACATCAGCGTAATGACCTGGGT  2664
            |||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  ATAAGGTCGAGAACTATCTGGCGCACAAGCAGAATTTCTGCCCTGTCACTGCACATCAGCGTAATGACCTGGGT  2664

Query 2665  CAACTGGACGGCAAAGTGTTTCCGAATCCAGAAAGCGAACGAAACAGCCCTGATGTCAGCTACGAAAGAAGCAT  2738
            ||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|.|||||||||.|||||||..|||||||.|||
Sbjct 2665  CAGCTTGATGGTAAAGTGTTTCCGAATCCAGAAAGTGAACGGAGCAGCCCTGAAGTCAGCTTTGAAAGAAACAT  2738

Query 2739  AATAAAATGTGAGAAAAATGGGAATTTGAAGCAGCCTTCCCCCAATGGAAACTTATTTTCATCCCACCTAGCAA  2812
            .||.|||||||||||.|||||||||...|||||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||.|.||||
Sbjct 2739  GATCAAATGTGAGAAGAATGGGAATCCAAAGCAACCATCTCCCAACGGAAATTTGTTTTCATCCCACTTGGCAA  2812

Query 2813  CCCTGCAAGGCTTGAAGGTCTTTAGTGAAGCTGCTCAGCTCATTGCTACAAAAGAAGAAAACAGACATTTGTTT  2886
            ||.||||||||.||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2813  CCTTGCAAGGCCTGAAAGTCTTCAGCGAAGCAGCTCAGCTCATTGCTACAAAAGAAGAAAACAAACATTTGTTT  2886

Query 2887  CTTCCACAATGCCTTTACCCTGGAGCAATAGCGAAAGCAAAAGGAGCCGACCAGCTTTCTCCATATTATGGAAT  2960
            |||||.||||||||||||||||||||||||..|||..||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 2887  CTTCCCCAATGCCTTTACCCTGGAGCAATAAAGAAGACAAAAGGAGCTGACCAACTTTCTCCATACTATGGGAT  2960

Query 2961  CAAGCCAAGTGATTATATTTCTGGTTCTCTTGTCATCCATAACACTGACATCGAGCAAAGCAGAAATGCAGAAA  3034
            .||||||||.||||||||..|..||||||||||||||||.|||||||||.||||.|||||||.||||.||||||
Sbjct 2961  AAAGCCAAGCGATTATATCGCCAGTTCTCTTGTCATCCACAACACTGACGTCGAACAAAGCACAAATACAGAAA  3034

Query 3035  ATGAATCTCCTAAAGGCCAGGCTTCCTCAAATGGGTGTGCTGCGCTGAAGAAAGATTCTCTGCCATTGTTGCCC  3108
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|..|..|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  ATGAATCTCCTAAAGGCCAGGCCTCCTCAAATGGGTGTGCCGTACCCAAGAAAGATTCTCTGCCATTGTTGCCC  3108

Query 3109  AAAAATCGAGGAATGGTAATAGTGAATGGTGGACTGAAACAAGATGAGAGACCTGCTGCCAACCCACAGCAAGA  3182
            |||||..||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||
Sbjct 3109  AAAAACAGAGGCATGGTCATAGTGAATGGTGGACTCAAGCAAGATGAAAGACCTACGGCCAACCCACAGCAAGA  3182

Query 3183  GAACATTTCCCAGAATCCTCAGCACGAAGACGACCACAAATCTCCCTCGTGGATCTCTGAGAACCCATTAGCTG  3256
            ||||||||||||||||.|.|||||||||||.|.|||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  GAACATTTCCCAGAATACCCAGCACGAAGATGGCCACAAATCCCCTTCGTGGATCTCTGAGAACCCATTAGCTG  3256

Query 3257  CCAATGAGAATGTCTCACCAGGAATTCCCTCAGCAGAGGAACAGTTGTCTAGTATAGCAAAAGGTGTGAATGGT  3330
            |.||||||||||||||.|||||||||||||..|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 3257  CAAATGAGAATGTCTCCCCAGGAATTCCCTGCGCAGAAGAACAGTTGTCTAGCATAGCAAAAGGTGTGAATGGC  3330

Query 3331  TCCAGCCAGGCTCCAACCAGTGGGAAATATTGCCGGCTATGTGATATCCAGTTCAACAACCTTTCAAACTTTAT  3404
            .|||||||||||||.|.||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 3331  GCCAGCCAGGCTCCCAGCAGTGGAAAATACTGCCGGCTATGCGATATTCAGTTCAATAATCTTTCGAACTTTAT  3404

Query 3405  AACTCACAAGAAGTTTTATTGCTCATCACATGCAGCAGAACATGTCAAA  3453
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405  AACTCACAAGAAGTTTTATTGCTCATCACATGCAGCAGAACATGTCAAA  3453