Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468757
• Subject: XM_011516947.3
• Aligned Length: 3456
• Identities: 3417
• Gaps: 36

Alignment

Query    1  ---ATGTCCCGGCGAAAGCAAAAGGAACCCCGGCAGATCAAACGGCCGCTTGAAGATGCCATTGAAGATGAGGA  71
               .|||                |||                 |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGT----------------GGA-----------------GGCCGCTTGAAGATGCCATTGAAGATGAGGA  41

Query   72  AGAAGAATGTCCATCAGAGGAAACAGACATCATCTCCAAAGGAGACTTTCCATTGGAGGAAAGCTTTTCCACAG  145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   42  AGAAGAATGTCCATCAGAGGAAACAGACATCATCTCCAAAGGAGACTTTCCATTGGAGGAAAGCTTTTCCACAG  115

Query  146  AATTTGGGCCTGAAAATCTGAGCTGCGAAGAAGTGGAATACTTTTGTAACAAAGGTGATGATGAAGGAATCCAG  219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  116  AATTTGGGCCTGAAAATCTGAGCTGCGAAGAAGTGGAATACTTTTGTAACAAAGGTGATGATGAAGGAATCCAG  189

Query  220  GAGACAGCAGAATCAGATGGGGACACACAGTCAGAGAAACCGGGGCAACCTGGAGTTGAGACAGACGACTGGGA  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  190  GAGACAGCAGAATCAGATGGGGACACACAGTCAGAGAAACCGGGGCAACCTGGAGTTGAGACAGACGACTGGGA  263

Query  294  TGGACCAGGAGAGCTGGAGGTGTTTCAGAAAGATGGGGAACGAAAAATTCAGAGTCGACAGCAACTTCCAGTGG  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  264  TGGACCAGGAGAGCTGGAGGTGTTTCAGAAAGATGGGGAACGAAAAATTCAGAGTCGACAGCAACTTCCAGTGG  337

Query  368  GAACAACCTGGGGGCCGTTTCCTGGGAAGATGGACTTGAATAATAATTCTTTGAAGACAAAGGCTCAGGTCCCA  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  338  GAACAACCTGGGGGCCGTTTCCTGGGAAGATGGACTTGAATAATAATTCTTTGAAGACAAAGGCTCAGGTCCCA  411

Query  442  ATGGTGCTGACTGCTGGTCCCAAGTGGTTGCTGGATGTGACTTGGCAAGGAGTGGAAGACAACAAAAACAACTG  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  412  ATGGTGCTGACTGCTGGTCCCAAGTGGTTGCTGGATGTGACTTGGCAAGGAGTGGAAGACAACAAAAACAACTG  485

Query  516  CATTGTGTACAGCAAAGGGGGTCAGCTTTGGTGTACAACTACGAAGGCCATCTCTGAGGGTGAAGAGCTAATTG  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  486  CATTGTGTACAGCAAAGGGGGTCAGCTTTGGTGTACAACTACGAAGGCCATCTCTGAGGGTGAAGAGCTAATTG  559

Query  590  CCTTTGTGGTGGATTTTGACTCAAGGCTACAAGCTGCCAGTCAGATGACTCTCACAGAAGGGATGTACCCTGCA  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  560  CCTTTGTGGTGGATTTTGACTCAAGGCTACAAGCTGCCAGTCAGATGACTCTCACAGAAGGGATGTACCCTGCA  633

Query  664  CGCCTGCTGGACTCAATTCAGCTGCTTCCTCAGCAAGCTGCCATGGCTTCTATTTTGCCCACAGCTATTGTCAA  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  634  CGCCTGCTGGACTCAATTCAGCTGCTTCCTCAGCAAGCTGCCATGGCTTCTATTTTGCCCACAGCTATTGTCAA  707

Query  738  TAAGGATATATTCCCTTGCAAGTCCTGTGGCATCTGGTATCGGAGTGAGCGGAATCTGCAGGCCCATTTGATGT  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  708  TAAGGATATATTCCCTTGCAAGTCCTGTGGCATCTGGTATCGGAGTGAGCGGAATCTGCAGGCCCATTTGATGT  781

Query  812  ACTACTGCAGTGGGAGGCAAAGAGAAGCTGCTCCGGTGTCAGAGGAAAATGAAGACAGTGCCCATCAGATTTCC  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  782  ACTACTGCAGTGGGAGGCAAAGAGAAGCTGCTCCGGTGTCAGAGGAAAATGAAGACAGTGCCCATCAGATTTCC  855

Query  886  AGCCTGTGCCCCTTCCCACAGTGCACCAAGAGCTTTTCAAATGCTCGAGCTCTAGAAATGCACCTGAATTCACA  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  856  AGCCTGTGCCCCTTCCCACAGTGCACCAAGAGCTTTTCAAATGCTCGAGCTCTAGAAATGCACCTGAATTCACA  929

Query  960  CAGTGGAGTGAAAATGGAAGAATTCCTGCCCCCTGGTGCTAGTCTAAAATGCACCGTCTGTAGCTACACTGCTG  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  930  CAGTGGAGTGAAAATGGAAGAATTCCTGCCCCCTGGTGCTAGTCTAAAATGCACCGTCTGTAGCTACACTGCTG  1003

Query 1034  ATTCCGTGATCAACTTTCACCAACACCTGTTCTCCCATCTCACTCAAGCTGCCTTCCGATGTAATCACTGCCAT  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1004  ATTCCGTGATCAACTTTCACCAACACCTGTTCTCCCATCTCACTCAAGCTGCCTTCCGATGTAATCACTGCCAT  1077

Query 1108  TTCGGCTTCCAGACTCAGAGGGAGTTATTGCAGCACCAGGAGCTCCATGTCCCTAGCGGCAAACTTCCCAGAGA  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078  TTCGGCTTCCAGACTCAGAGGGAGTTATTGCAGCACCAGGAGCTCCATGTCCCTAGCGGCAAACTTCCCAGAGA  1151

Query 1182  AAGTGACATGGAACACTCTCCAAGTGCAACTGAAGACAGCTTACAGCCAGCCACAGACTTATTGACCAGAAGCG  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1152  AAGTGACATGGAACACTCTCCAAGTGCAACTGAAGACAGCTTACAGCCAGCCACAGACTTATTGACCAGAAGCG  1225

Query 1256  AACTTCCCCAGAGCCAAAAGGCCATGCAGACTAAAGATGCGAGCTCTGACACAGAGCTGGACAAGTGTGAGAAA  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1226  AACTTCCCCAGAGCCAAAAGGCCATGCAGACTAAAGATGCGAGCTCTGACACAGAGCTGGACAAGTGTGAGAAA  1299

Query 1330  AAGACTCAGCTCTTTCTCACGAACCAGAGACCAGAGATACAGCCTACAACAAATAAACAAAGCTTTTCTTACAC  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1300  AAGACTCAGCTCTTTCTCACGAACCAGAGACCAGAGATACAGCCTACAACAAATAAACAAAGCTTTTCTTACAC  1373

Query 1404  AAAAATAAAGTCTGAGCCCTCTAGCCCAAGACTTGCCTCATCTCCAGTTCAGCCTAATATTGGGCCTTCTTTCC  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1374  AAAAATAAAGTCTGAGCCCTCTAGCCCAAGACTTGCCTCATCTCCAGTTCAGCCTAATATTGGGCCTTCTTTCC  1447

Query 1478  CTGTGGGCCCTTTCCTATCTCAGTTTTCTTTCCCCCAAGATATCACCATGGTCCCTCAAGCTTCAGAGATCTTA  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1448  CTGTGGGCCCTTTCCTATCTCAGTTTTCTTTCCCCCAAGATATCACCATGGTCCCTCAAGCTTCAGAGATCTTA  1521

Query 1552  GCTAAGATGTCTGAACTGGTGCATCGGCGACTGAGGCATGGCAGTAGTAGCTACCCTCCCGTCATTTACAGCCC  1625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1522  GCTAAGATGTCTGAACTGGTGCATCGGCGACTGAGGCATGGCAGTAGTAGCTACCCTCCCGTCATTTACAGCCC  1595

Query 1626  TTTGATGCCCAAGGGGGCTACTTGTTTTGAGTGTAACATAACATTCAATAATTTGGATAATTATCTAGTGCACA  1699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1596  TTTGATGCCCAAGGGGGCTACTTGTTTTGAGTGTAACATAACATTCAATAATTTGGATAATTATCTAGTGCACA  1669

Query 1700  AAAAGCATTATTGCAGCAGCCGATGGCAGCAGATGGCTAAGTCCCCAGAGTTCCCTAGTGTGTCAGAAAAGATG  1773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1670  AAAAGCATTATTGCAGCAGCCGATGGCAGCAGATGGCTAAGTCCCCAGAGTTCCCTAGTGTGTCAGAAAAGATG  1743

Query 1774  CCTGAAGCTTTGAGTCCCAACACTGGCCAAACCTCCATAAACCTTCTCAACCCAGCTGCTCATTCTGCTGATCC  1847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1744  CCTGAAGCTTTGAGTCCCAACACTGGCCAAACCTCCATAAACCTTCTCAACCCAGCTGCTCATTCTGCTGATCC  1817

Query 1848  TGAGAATCCACTTCTTCAAACATCTTGCATCAATTCTTCCACTGTCTTAGATTTAATTGGGCCAAATGGGAAGG  1921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1818  TGAGAATCCACTTCTTCAAACATCTTGCATCAATTCTTCCACTGTCTTAGATTTAATTGGGCCAAATGGGAAGG  1891

Query 1922  GCCATGACAAGGACTTTTCCACTCAAACTAAGAAGCTCTCCACCTCCAGTAACAATGATGACAAAATTAATGGA  1995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1892  GCCATGACAAGGACTTTTCCACTCAAACTAAGAAGCTCTCCACCTCCAGTAACAATGATGACAAAATTAATGGA  1965

Query 1996  AAACCTGTTGATGTGAAAAATCCCAGTGTCCCCTTAGTGGATGGGGAAAGTGACCCAAATAAGACTACCTGTGA  2069
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1966  AAACCTGTTGATGTGAAAAATCCCAGTGTCCCCTTAGTGGATGGGGAAAGTGACCCAAATAAGACTACCTGTGA  2039

Query 2070  AGCTTGCAACATTACCTTCAGCCGGCACGAAACATACATGGTCCACAAACAGTATTACTGTGCTACACGCCACG  2143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2040  AGCTTGCAACATTACCTTCAGCCGGCACGAAACATACATGGTCCACAAACAGTATTACTGTGCTACACGCCACG  2113

Query 2144  ACCCTCCACTGAAGAGGTCTGCTTCCAACAAAGTGCCTGCCATGCAGAGAACCATGCGCACACGCAAGCGCAGA  2217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2114  ACCCTCCACTGAAGAGGTCTGCTTCCAACAAAGTGCCTGCCATGCAGAGAACCATGCGCACACGCAAGCGCAGA  2187

Query 2218  AAGATGTATGAGATGTGCCTACCTGAGCAGGAACAAAGGCCTCCACTGGTTCAGCAGAGATTTCTTGACGTAGC  2291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2188  AAGATGTATGAGATGTGCCTACCTGAGCAGGAACAAAGGCCTCCACTGGTTCAGCAGAGATTTCTTGACGTAGC  2261

Query 2292  CAACCTCAATAATCCTTGTACCTCCACTCAAGAACCCACAGAAGGGCTAGGAGAGTGCTACCACCCAAGATGTG  2365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2262  CAACCTCAATAATCCTTGTACCTCCACTCAAGAACCCACAGAAGGGCTAGGAGAGTGCTACCACCCAAGATGTG  2335

Query 2366  ATATCTTTCCAGGAATTGTCTCTAAACACTTGGAAACTTCTCTGACGATCAACAAGTGTGTTCCAGTTTCCAAA  2439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2336  ATATCTTTCCAGGAATTGTCTCTAAACACTTGGAAACTTCTCTGACGATCAACAAGTGTGTTCCAGTTTCCAAA  2409

Query 2440  TGTGATACTACTCATTCCAGTGTTTCCTGCCTAGAGATGGACGTGCCCATAGATCTCAGCAAAAAGTGTTTATC  2513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2410  TGTGATACTACTCATTCCAGTGTTTCCTGCCTAGAGATGGACGTGCCCATAGATCTCAGCAAAAAGTGTTTATC  2483

Query 2514  TCAGTCTGAGCGGACGACCACGTCTCCCAAAAGGCTGCTGGACTATCACGAGTGCACTGTGTGCAAGATCAGTT  2587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2484  TCAGTCTGAGCGGACGACCACGTCTCCCAAAAGGCTGCTGGACTATCACGAGTGCACTGTGTGCAAGATCAGTT  2557

Query 2588  TCAATAAGGTAGAAAACTATCTGGCCCACAAGCAGAATTTCTGCCCGGTTACTGCACATCAGCGTAATGACCTG  2661
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2558  TCAATAAGGTAGAAAACTATCTGGCCCACAAGCAGAATTTCTGCCCGGTTACTGCACATCAGCGTAATGACCTG  2631

Query 2662  GGTCAACTGGACGGCAAAGTGTTTCCGAATCCAGAAAGCGAACGAAACAGCCCTGATGTCAGCTACGAAAGAAG  2735
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2632  GGTCAACTGGACGGCAAAGTGTTTCCGAATCCAGAAAGCGAACGAAACAGCCCTGATGTCAGCTACGAAAGAAG  2705

Query 2736  CATAATAAAATGTGAGAAAAATGGGAATTTGAAGCAGCCTTCCCCCAATGGAAACTTATTTTCATCCCACCTAG  2809
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2706  CATAATAAAATGTGAGAAAAATGGGAATTTGAAGCAGCCTTCCCCCAATGGAAACTTATTTTCATCCCACCTAG  2779

Query 2810  CAACCCTGCAAGGCTTGAAGGTCTTTAGTGAAGCTGCTCAGCTCATTGCTACAAAAGAAGAAAACAGACATTTG  2883
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2780  CAACCCTGCAAGGCTTGAAGGTCTTTAGTGAAGCTGCTCAGCTCATTGCTACAAAAGAAGAAAACAGACATTTG  2853

Query 2884  TTTCTTCCACAATGCCTTTACCCTGGAGCAATAGCGAAAGCAAAAGGAGCCGACCAGCTTTCTCCATATTATGG  2957
            |||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2854  TTTCTTCCACAATGCCTTTACCCTGGAGCAATAAAGAAAGCAAAAGGAGCCGACCAGCTTTCTCCATATTATGG  2927

Query 2958  AATCAAGCCAAGTGATTATATTTCTGGTTCTCTTGTCATCCATAACACTGACATCGAGCAAAGCAGAAATGCAG  3031
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2928  AATCAAGCCAAGTGATTATATTTCTGGTTCTCTTGTCATCCATAACACTGACATCGAGCAAAGCAGAAATGCAG  3001

Query 3032  AAAATGAATCTCCTAAAGGCCAGGCTTCCTCAAATGGGTGTGCTGCGCTGAAGAAAGATTCTCTGCCATTGTTG  3105
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3002  AAAATGAATCTCCTAAAGGCCAGGCTTCCTCAAATGGGTGTGCTGCGCTGAAGAAAGATTCTCTGCCATTGTTG  3075

Query 3106  CCCAAAAATCGAGGAATGGTAATAGTGAATGGTGGACTGAAACAAGATGAGAGACCTGCTGCCAACCCACAGCA  3179
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3076  CCCAAAAATCGAGGAATGGTAATAGTGAATGGTGGACTGAAACAAGATGAGAGACCTGCTGCCAACCCACAGCA  3149

Query 3180  AGAGAACATTTCCCAGAATCCTCAGCACGAAGACGACCACAAATCTCCCTCGTGGATCTCTGAGAACCCATTAG  3253
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3150  AGAGAACATTTCCCAGAATCCTCAGCACGAAGACGACCACAAATCTCCCTCGTGGATCTCTGAGAACCCATTAG  3223

Query 3254  CTGCCAATGAGAATGTCTCACCAGGAATTCCCTCAGCAGAGGAACAGTTGTCTAGTATAGCAAAAGGTGTGAAT  3327
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3224  CTGCCAATGAGAATGTCTCACCAGGAATTCCCTCAGCAGAGGAACAGTTGTCTAGTATAGCAAAAGGTGTGAAT  3297

Query 3328  GGTTCCAGCCAGGCTCCAACCAGTGGGAAATATTGCCGGCTATGTGATATCCAGTTCAACAACCTTTCAAACTT  3401
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3298  GGTTCCAGCCAGGCTCCAACCAGTGGGAAATATTGCCGGCTATGTGATATCCAGTTCAACAACCTTTCAAACTT  3371

Query 3402  TATAACTCACAAGAAGTTTTATTGCTCATCACATGCAGCAGAACATGTCAAA  3453
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3372  TATAACTCACAAGAAGTTTTATTGCTCATCACATGCAGCAGAACATGTCAAA  3423