Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468758
• Subject: NM_028736.2
• Aligned Length: 3384
• Identities: 2881
• Gaps: 159

Alignment

Query    1  ATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGTTGTCAAATTCTGAGGCGACTTACTAAAGATGAGAGTCCCTACACTAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGCTGTCAAATTCTAAGGCGACTTACCAAAGATGAGAGTCCCTACACTAA  74

Query   75  ATCCGCCAGCCAGACAAAGCCGCCTGATGGAGCGTTGGCTGTGAGGAGACAGAGCATCCCAGAGGAATTCAAGG  148
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATCTGCCAGCCAGACAAAGCCGCCCGATGGAGCATTGGCTGTGAGGAGACAGAGCATCCCAGAGGAATTCAAGG  148

Query  149  GCTCCACAGTCGTCGAGCTGATGAAGAAGGAAGGCACTACCCTGGGTCTGACGGTATCGGGAGGAATTGATAAG  222
            ||||||||||.||.|||.|||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  149  GCTCCACAGTGGTGGAGTTGATGAAGAAGGAGGGAACCACTCTTGGCCTGACGGTATCGGGAGGCATTGATAAA  222

Query  223  GATGGCAAGCCAAGAGTATCTAATCTGCGGCAAGGAGGAATTGCTGCTAGAAGTGACCAGCTGGATGTGGGTGA  296
            |||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  GATGGCAAGCCAAGAGTGTCCAACCTGCGGCAGGGAGGAATCGCTGCCAGAAGTGACCAGCTGGATGTGGGCGA  296

Query  297  CTACATCAAAGCAGTGAATGGAATCAACCTGGCCAAATTCCGCCATGACGAGATCATCAGCTTGCTGAAGAATG  370
            |||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||.||||
Sbjct  297  CTACATCAAGGCGGTGAATGGGATCAACCTGGCCAAGTTCCGCCACGATGAGATCATCAGCCTGCTGAAAAATG  370

Query  371  TGGGAGAAAGAGTGGTTCTTGAAGTAGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTGTGCAAGGATCAAGTGTTATTTTC  444
            |.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct  371  TCGGGGAAAGAGTGGTCCTGGAGGTCGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTGTACAAGGATCCAGTGTTATGTTC  444

Query  445  CGAACAGTGGAGGTCACATTACATAAAGAAGGCAATACCTTTGGTTTTGTAATTCGAGGGGGAGCACATGATGA  518
            |||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  445  CGAACTGTGGAGGTCACGCTGCACAAAGAAGGCAACACCTTTGGTTTTGTCATCCGAGGGGGAGCGCATGATGA  518

Query  519  TAGAAATAAATCTCGTCCAGTTGTGATAACATGTGTTCGTCCTGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACGATCA  592
            .||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  CAGGAACAAGTCCCGTCCGGTTGTGATAACCTGTGTTCGTCCTGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACCATCA  592

Query  593  AACCCGGTGACAGGTTGCTCAGTGTGGATGGAATTCGGCTTCTTGGAACTACGCATGCTGAAGCCATGAGTATT  666
            ||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||.
Sbjct  593  AACCTGGAGACAGGTTGCTCAGCGTGGATGGAATTCGGCTCCTGGGAACCACCCATGCCGAGGCCATGAGCATC  666

Query  667  CTTAAACAATGTGGACAAGAAGCAGCACTGCTGATAGAATATGATGTCTCAGTAATGGACTCTGTGGCAACAGC  740
            ||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct  667  CTTAAACAGTGCGGACAAGAAGCCACGCTGCTGATAGAATACGATGTCTCTGTGATGGATTCTGTGGCGACAGC  740

Query  741  ATCCGGGCCACTACTAGTCGAAGTTGCCAAAACTCCTGGTGCCAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCGATGT  814
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|||
Sbjct  741  ATCCGGGCCACTACTAGTTGAAGTTGCCAAAACTCCAGGTGCCAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCCGTGT  814

Query  815  GCTGTAACAAACAAGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGTATTGCAGACAGATGTGGCGCATTGCAT  888
            ||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..|.||.
Sbjct  815  GCTGTAACAAGCAGGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGCATTGCGGACAGATGTGGCGCGCTACAC  888

Query  889  GTGGGAGATCACATCCTCTCCATCGATGGAACCAGCATGGAGTACTGTACACTTGCAGAAGCAACCCAGTTCCT  962
            ||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  889  GTGGGAGACCACATCCTCTCCATTGACGGCACGAGTATGGAGTACTGTACCCTCGCAGAAGCGACCCAGTTCCT  962

Query  963  GGCCAACACCACTGACCAGGTCAAGCTTGAGATCCTTCCCCATCATCAGACCCGGCTGGCCCTAAAGGGGCCCG  1036
            ||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct  963  GGCCAATACCACTGACCAGGTCAAGCTGGAGATTCTCCCACACCATCAGACCCGCCTGGCCCTAAAGGGCCCTG  1036

Query 1037  ACCATG--------------------------------------------------------------------  1042
            ||||||                                                                    
Sbjct 1037  ACCATGTGAAAATTCAGAGGAGCGACAGACAACATCCCTGGGATGCCTGGGCCAGCAACCAGTGCGGCGTTCAT  1110

Query 1043  --------------------------------------------------------------------------  1042
                                                                                      
Sbjct 1111  ACCAACCATCACCATAACACGTACCACCCAGACCATTGCAGAGTGCCAGCCCTGACTTTCCCGAAAGCGCTTCC  1184

Query 1043  --------------CAGCTTTGGTGTCTTCATCCTTCTCTCCTACCTCCATGAGTGCATACAGCCTGAGTTCCC  1102
                          |.|||.|||||.|.|||||   .||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1185  TCCAAACAGCCCTCCGGCTATGGTGCCCTCATC---TTCTCCTACCTCCATGAGTGCGTACAGTCTGAGTTCCC  1255

Query 1103  TGAACATGGGGACTCTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGTGGAACCATGATGAGGAGGAGACTGAAA  1176
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  TGAACATGGGGACTTTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGAGGAACCATGATGAGGAGGAGACTGAAA  1329

Query 1177  AAGAAAGACTTCAAAAGCTCATTGTCCTTAGCCTCCAGCACAGTAGGATTGGCTGGGCAGGTTGTTCACACAGA  1250
            |||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 1330  AAGAAAGACTTCAAAAGCTCACTGTCTTTAGCCTCCAGCACTGTGGGGTTGGCTGGCCAGGTCGTTCACACTGA  1403

Query 1251  AACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCAGATCCTGTCACAGGATTTGGGATCCAACTGCAGGGCAGTGTGTTTGCCA  1324
            ||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1404  AACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCTGACCCTGTCACGGGCTTCGGAATCCAACTGCAGGGCAGCGTGTTTGCCA  1477

Query 1325  CAGAAACTCTCTCTTCTCCACCTCTGATTTCCTATATCGAAGCTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGGGTGCTA  1398
            ||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1478  CAGAGACGCTCTCCTCTCCGCCTCTGATTTCCTATATTGAAGCTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGTGTGCTA  1551

Query 1399  CAGATTGGAGACAGAGTGATGGCCATCAATGGAATTCCAACAGAAGACAGCACCTTCGAAGAAGCCAGTCAGCT  1472
            |||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.||
Sbjct 1552  CAGATTGGAGACAGAGTCATGGCCATTAATGGAATCCCAACAGAAGACAGCACCTTCGAGGAAGCCAATCAACT  1625

Query 1473  CCTCCGAGACTCTTCAATCACGAGCAAGGTCACACTGGAAATCGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAA  1546
            |||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  CCTGAGAGACTCTTCCATCACGAGCAAAGTCACACTAGAAATCGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAA  1699

Query 1547  GTAGTGGAACATTTCATGTAAAGCTGCCTAAGAAGCACAATGTGGAACTTGGAATAACCATAAGTTCACCATCC  1620
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||..||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1700  GTAGTGGAACATTTCATGTAAAACTGCCCAAGAAGCACAGCGTGGAACTTGGAATAACCATCAGTTCGCCATCC  1773

Query 1621  AGTAGAAAACCAGGAGACCCCCTCGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGGAGTGTGGCACACAGAACTGGGACCCT  1694
            |||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1774  AGTAGAAAACCGGGGGACCCCCTTGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGCAGTGTGGCACACAGAACCGGAACTCT  1847

Query 1695  GGAACTTGGGGATAAATTGCTCGCAATAGATAATATCCGGCTGGACAACTGTTCCATGGAAGATGCAGTTCAGA  1768
            ||||||.||.||.|||.||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1848  GGAACTGGGAGACAAACTGCTTGCGATAGATAACATCCGGCTGGATAACTGTTCCATGGAAGATGCGGTCCAGA  1921

Query 1769  TCCTCCAGCAATGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAATTCAGATGAGCAAGAAAGT  1842
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 1922  TCCTCCAGCAGTGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAACTCAGACGAGCAAGAGAGT  1995

Query 1843  TCCGGAGCAATTATTTACACCGTGGAGCTTAAACGCTACGGGGGGCCCCTTGGCATCACAATTTCAGGAACTGA  1916
            ||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1996  TCCGGAGCGATTATTTACACGGTGGAGCTGAAGCGCTATGGGGGGCCCCTTGGCATCACAATTTCTGGAACTGA  2069

Query 1917  AGAGCCGTTTGATCCTATAATCATTTCAAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGAACTGGCGCAATCCACA  1990
            ||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||
Sbjct 2070  AGAGCCGTTTGATCCTATTATCATCTCGAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGGACTGGAGCGATCCACA  2143

Query 1991  TAGGAGACCGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAAGGGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCATTTGTTA  2064
            |.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|.
Sbjct 2144  TCGGAGATAGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAGGGGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCACTTGCTC  2217

Query 2065  CAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCTTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAGTCAGCATCGAGCCCCAAGAA  2138
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||
Sbjct 2218  CAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCCTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAATCTGCATCAAGTCCCAAGAA  2291

Query 2139  GTTCCCTATTTCTAGCCATTTGAGTGACCTGGGGGATGTGGAGGAGGACTCCTCACCAGCACAGAAGCCAGGCA  2212
            ||||||.||..||.||||.|.|.|.|||||.||.||||..|||||||||.||||.|||..||||||.||.||||
Sbjct 2292  GTTCCCCATCCCTGGCCACTCGGGGGACCTAGGAGATGGTGAGGAGGACCCCTCCCCAATACAGAAACCTGGCA  2365

Query 2213  AGCTCTCCGACATGTACCCCTCCACGGTGCCCAGTGTGGACAGTGCTGTGGATTCATGGGATGGGTCTGCAATA  2286
            ||||||||||...|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||.||||
Sbjct 2366  AGCTCTCCGATGCGTACCCCTCCACGGTGCCCAGCGTGGACAGTGCTGTGGACTCCTGGGATGGGTCTGGAATA  2439

Query 2287  GACACCAGCTATGGAACTGAAGGCACTAGTTTTCAGGCCTCAGGATACAATTTCAACACCTATGACTGGAGGAG  2360
            ||..||||||||||.|.|.|||||.|.|.|||||||.|.|||||||||||||.||||||||||||.||||||||
Sbjct 2440  GATGCCAGCTATGGGAGTCAAGGCTCAACTTTTCAGACTTCAGGATACAATTACAACACCTATGATTGGAGGAG  2513

Query 2361  TCCAAAACAGAGAGGCAGCTTGTCCCCAGTCACTAAGCCTCGAAGCCAGACTTACCCAGATGTGGGGCTGAGTT  2434
            ||||||.||.|||..||||.|||||||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.
Sbjct 2514  TCCAAAGCAAAGAACCAGCCTGTCCCCAGTCCCCAAGCCTCGAAGCCAGACGTACCCAGATGTGGGCCTGAGTA  2587

Query 2435  ATGAAGACTGGGACCGGTCCACAGCCAGTGGTTTTGCAGGGGCTGCCGATAGTGCAGAGACAGAACAAGAGGAG  2508
            |||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.|||||||.|.||.||||||||..|.|||||||||||.
Sbjct 2588  ATGAAGACTGGGATCGATCCACAGCCAGTGGCTTTGTAGGGGCTTCTGACAGTGCAGATGCTGAACAAGAGGAA  2661

Query 2509  AACTTCTGGTCTCAAGCGCTGGAGGATTTGGAAACCTGCGGACAGTCAGGAATTCTGAGAGAACTGGAGGAGAA  2582
            |||||||||||||||||..|||||||..||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 2662  AACTTCTGGTCTCAAGCATTGGAGGACCTGGAGACCTGCGGCCAGTCGGGGATCCTGAGAGAGCTTGAGGAGAA  2735

Query 2583  AGCTGACAGGCGTGTGTCTTTGAGAAACATGACTCTCTTGGCAACAATCATGTCGGGGAGCACGATGAGTTTGA  2656
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 2736  AGCTGACAGGCGTGTGTCATTGAGAAACATGACCCTCTTGGCAACAATCATGTCGGGGAGTACTATGAGTTTGA  2809

Query 2657  ATCATGAGGCTCCAACACCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAGCGCAGCAGCTCGCGGCCG  2730
            |||||||||||||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.
Sbjct 2810  ATCATGAGGCTCCAATGGCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAACGGAGCAGTTCACGGCCA  2883

Query 2731  CACTACAGCCAAACAACTCGGAGCAACACCCTGCCTTCAGATGTGGGTAGGAAGTCAGTAACCCTGAGAAAAAT  2804
            |||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||.|.|||||
Sbjct 2884  CACTATAGCCAAACAACTCGCAGCAACACCCTGCCCTCAGACGTGGGCAGAAAGTCTGTAACCCTGCGGAAAAT  2957

Query 2805  GAAACAAGAAATAAAGGAGATCATGTCTCCAACTCCTGTGGAGCTGCACAAGGTGACCTTGTACAAGGACTCTG  2878
            |||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2958  GAAGCAAGAAATAAAGGAGATCATGTCCCCAACTCCGGTGGAGCTACACAAGGTGACCTTATACAAGGACTCTG  3031

Query 2879  ACATGGAGGACTTTGGGTTCAGTGTAGCAGATGGCTTACTGGAGAAAGGAGTGTATGTCAAAAATATTCGCCCA  2952
            .||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 3032  GCATGGAGGACTTCGGGTTCAGTGTGGCAGATGGCCTGCTGGAGAAAGGCGTGTATGTCAAAAATATCCGCCCA  3105

Query 2953  GCTGGGCCAGGAGATCTTGGTGGCTTAAAGCCCTATGACAGGCTCTTACAGGTGAATCATGTCCGAACCAGAGA  3026
            |||||||||||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||
Sbjct 3106  GCTGGGCCAGGTGATGTTGGGGGCTTGAAGCCCTACGACAGGCTCTTACAGGTAAATCACGTGCGGACGAGAGA  3179

Query 3027  CTTTGACTGCTGCCTTGTTGTGCCCCTCATAGCAGAATCCGGGAATAAGCTGGACCTGGTTATTAGTAGAAACC  3100
            |||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 3180  CTTTGACTGCTGCCTGGTGGTGCCTCTCATAGCTGAATCTGGCAACAAGCTGGACCTGGTTATTAGCAGAAATC  3253

Query 3101  CACTGGCTTCACAGAAGTCTATAGACCAACAGAGTCTACCAGGAGATTGGAGTGAACAGAACAGTGCTTTTTTC  3174
            |||||||.||.||||||||.|||||.||.|.|..|||.||..|.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 3254  CACTGGCCTCCCAGAAGTCGATAGAACAGCCGGCTCTGCCCAGCGACTGGAGCGAACAGAACAGCGCTTTCTTC  3327

Query 3175  CAGCAGCCTAGCCACGGTGGTAATTTGGAGACACGAGAACCCACTAATACATTA  3228
            |||||.||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct 3328  CAGCAACCCAGCCACGGTGGTAATCTAGAGACACGAGAACCCACTAACACACTA  3381