Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468758
• Subject: XM_006514233.2
• Aligned Length: 3569
• Identities: 2826
• Gaps: 400

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGACATGTAGCGGACCTCTGCATCAGCCAAGAGGAATTAAGCTTTGTCACTCCCCACTGGGACTACCTTTCTC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTGGTATGTGCGCAAGGAATTCACATGCTGCCGCTCGCCGCTGCAGCCACCAGAGCAGAGCCCCTGTGTACACT  148

Query    1  -----------------------ATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGTTGTCAAATTCTGAGGCGACTTACT  51
                                   ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  149  TTGCCAGAGAGCAGAGAGCAAGAATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGCTGTCAAATTCTAAGGCGACTTACC  222

Query   52  AAAGATGAGAGTCCCTACACTAAATCCGCCAGCCAGACAAAGCCGCCTGATGGAGCGTTGGCTGTGAGGAGACA  125
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAGATGAGAGTCCCTACACTAAATCTGCCAGCCAGACAAAGCCGCCCGATGGAGCATTGGCTGTGAGGAGACA  296

Query  126  GAGCATCCCAGAGGAATTCAAGGGCTCCACAGTCGTCGAGCTGATGAAGAAGGAAGGCACTACCCTGGGTCTGA  199
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.||.||.||.||.||.||||
Sbjct  297  GAGCATCCCAGAGGAATTCAAGGGCTCCACAGTGGTGGAGTTGATGAAGAAGGAGGGAACCACTCTTGGCCTGA  370

Query  200  CGGTATCGGGAGGAATTGATAAGGATGGCAAGCCAAGAGTATCTAATCTGCGGCAAGGAGGAATTGCTGCTAGA  273
            |||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct  371  CGGTATCGGGAGGCATTGATAAAGATGGCAAGCCAAGAGTGTCCAACCTGCGGCAGGGAGGAATCGCTGCCAGA  444

Query  274  AGTGACCAGCTGGATGTGGGTGACTACATCAAAGCAGTGAATGGAATCAACCTGGCCAAATTCCGCCATGACGA  347
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct  445  AGTGACCAGCTGGATGTGGGCGACTACATCAAGGCGGTGAATGGGATCAACCTGGCCAAGTTCCGCCACGATGA  518

Query  348  GATCATCAGCTTGCTGAAGAATGTGGGAGAAAGAGTGGTTCTTGAAGTAGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTG  421
            ||||||||||.|||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATCATCAGCCTGCTGAAAAATGTCGGGGAAAGAGTGGTCCTGGAGGTCGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTG  592

Query  422  TGCAAGGATCAAGTGTTATTTTCCGAACAGTGGAGGTCACATTACATAAAGAAGGCAATACCTTTGGTTTTGTA  495
            |.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  593  TACAAGGATCCAGTGTTATGTTCCGAACTGTGGAGGTCACGCTGCACAAAGAAGGCAACACCTTTGGTTTTGTC  666

Query  496  ATTCGAGGGGGAGCACATGATGATAGAAATAAATCTCGTCCAGTTGTGATAACATGTGTTCGTCCTGGAGGGCC  569
            ||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCCGAGGGGGAGCGCATGATGACAGGAACAAGTCCCGTCCGGTTGTGATAACCTGTGTTCGTCCTGGAGGGCC  740

Query  570  TGCTGACAGAGAGGGCACGATCAAACCCGGTGACAGGTTGCTCAGTGTGGATGGAATTCGGCTTCTTGGAACTA  643
            ||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct  741  TGCTGACAGAGAGGGCACCATCAAACCTGGAGACAGGTTGCTCAGCGTGGATGGAATTCGGCTCCTGGGAACCA  814

Query  644  CGCATGCTGAAGCCATGAGTATTCTTAAACAATGTGGACAAGAAGCAGCACTGCTGATAGAATATGATGTCTCA  717
            |.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  815  CCCATGCCGAGGCCATGAGCATCCTTAAACAGTGCGGACAAGAAGCCACGCTGCTGATAGAATACGATGTCTCT  888

Query  718  GTAATGGACTCTGTGGCAACAGCATCCGGGCCACTACTAGTCGAAGTTGCCAAAACTCCTGGTGCCAGCCTTGG  791
            ||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  889  GTGATGGATTCTGTGGCGACAGCATCCGGGCCACTACTAGTTGAAGTTGCCAAAACTCCAGGTGCCAGCCTTGG  962

Query  792  GGTTGCCCTAACTACCTCGATGTGCTGTAACAAACAAGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGTATTG  865
            ||||||||||||||||||..|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  963  GGTTGCCCTAACTACCTCCGTGTGCTGTAACAAGCAGGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGCATTG  1036

Query  866  CAGACAGATGTGGCGCATTGCATGTGGGAGATCACATCCTCTCCATCGATGGAACCAGCATGGAGTACTGTACA  939
            |.||||||||||||||..|.||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1037  CGGACAGATGTGGCGCGCTACACGTGGGAGACCACATCCTCTCCATTGACGGCACGAGTATGGAGTACTGTACC  1110

Query  940  CTTGCAGAAGCAACCCAGTTCCTGGCCAACACCACTGACCAGGTCAAGCTTGAGATCCTTCCCCATCATCAGAC  1013
            ||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1111  CTCGCAGAAGCGACCCAGTTCCTGGCCAATACCACTGACCAGGTCAAGCTGGAGATTCTCCCACACCATCAGAC  1184

Query 1014  CCGGCTGGCCCTAAAGGGGCCCGACCATG---------------------------------------------  1042
            |||.||||||||||||||.||.|||||||                                             
Sbjct 1185  CCGCCTGGCCCTAAAGGGCCCTGACCATGTGAAAATTCAGAGGAGCGACAGACAACATCCCTGGGATGCCTGGG  1258

Query 1043  --------------------------------------------------------------------------  1042
                                                                                      
Sbjct 1259  CCAGCAACCAGTGCGGCGTTCATACCAACCATCACCATAACACGTACCACCCAGACCATTGCAGAGTGCCAGCC  1332

Query 1043  -------------------------------------CAGCTTTGGTGTCTTCATCCTTCTCTCCTACCTCCAT  1079
                                                 |.|||.|||||.|.|||||   .||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGACTTTCCCGAAAGCGCTTCCTCCAAACAGCCCTCCGGCTATGGTGCCCTCATC---TTCTCCTACCTCCAT  1403

Query 1080  GAGTGCATACAGCCTGAGTTCCCTGAACATGGGGACTCTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGTGGAA  1153
            ||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1404  GAGTGCGTACAGTCTGAGTTCCCTGAACATGGGGACTTTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGAGGAA  1477

Query 1154  CCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCATTGTCCTTAGCCTCCAGCACAGTAGGATTG  1227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1478  CCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCACTGTCTTTAGCCTCCAGCACTGTGGGGTTG  1551

Query 1228  GCTGGGCAGGTTGTTCACACAGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCAGATCCTGTCACAGGATTTGGGATCCA  1301
            |||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||
Sbjct 1552  GCTGGCCAGGTCGTTCACACTGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCTGACCCTGTCACGGGCTTCGGAATCCA  1625

Query 1302  ACTGCAGGGCAGTGTGTTTGCCACAGAAACTCTCTCTTCTCCACCTCTGATTTCCTATATCGAAGCTGACAGCC  1375
            ||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1626  ACTGCAGGGCAGCGTGTTTGCCACAGAGACGCTCTCCTCTCCGCCTCTGATTTCCTATATTGAAGCTGACAGCC  1699

Query 1376  CAGCAGAGAGATGTGGGGTGCTACAGATTGGAGACAGAGTGATGGCCATCAATGGAATTCCAACAGAAGACAGC  1449
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1700  CAGCAGAGAGATGTGGTGTGCTACAGATTGGAGACAGAGTCATGGCCATTAATGGAATCCCAACAGAAGACAGC  1773

Query 1450  ACCTTCGAAGAAGCCAGTCAGCTCCTCCGAGACTCTTCAATCACGAGCAAGGTCACACTGGAAATCGAGTTTGA  1523
            ||||||||.|||||||.|||.|||||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1774  ACCTTCGAGGAAGCCAATCAACTCCTGAGAGACTCTTCCATCACGAGCAAAGTCACACTAGAAATCGAGTTTGA  1847

Query 1524  TGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAGCTGCCTAAGAAGCACAATGTGGAACTTG  1597
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||..||||||||||
Sbjct 1848  TGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAACTGCCCAAGAAGCACAGCGTGGAACTTG  1921

Query 1598  GAATAACCATAAGTTCACCATCCAGTAGAAAACCAGGAGACCCCCTCGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGGAGT  1671
            ||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1922  GAATAACCATCAGTTCGCCATCCAGTAGAAAACCGGGGGACCCCCTTGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGCAGT  1995

Query 1672  GTGGCACACAGAACTGGGACCCTGGAACTTGGGGATAAATTGCTCGCAATAGATAATATCCGGCTGGACAACTG  1745
            ||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.|||.||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1996  GTGGCACACAGAACCGGAACTCTGGAACTGGGAGACAAACTGCTTGCGATAGATAACATCCGGCTGGATAACTG  2069

Query 1746  TTCCATGGAAGATGCAGTTCAGATCCTCCAGCAATGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAG  1819
            |||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070  TTCCATGGAAGATGCGGTCCAGATCCTCCAGCAGTGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAG  2143

Query 1820  ATAATTCAGATGAGCAAGAAAGTTCCGGAGCAATTATTTACACCGTGGAGCTTAAACGCTACGGGGGGCCCCTT  1893
            ||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2144  ATAACTCAGACGAGCAAGAGAGTTCCGGAGCGATTATTTACACGGTGGAGCTGAAGCGCTATGGGGGGCCCCTT  2217

Query 1894  GGCATCACAATTTCAGGAACTGAAGAGCCGTTTGATCCTATAATCATTTCAAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGC  1967
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218  GGCATCACAATTTCTGGAACTGAAGAGCCGTTTGATCCTATTATCATCTCGAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGC  2291

Query 1968  TGAAAGAACTGGCGCAATCCACATAGGAGACCGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAAGGGAAGCCTC  2041
            ||||||.|||||.||.||||||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2292  TGAAAGGACTGGAGCGATCCACATCGGAGATAGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAGGGGAAGCCTC  2365

Query 2042  TGAGTGAAGCCATCCATTTGTTACAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCTTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCC  2115
            ||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366  TGAGTGAAGCCATCCACTTGCTCCAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCCTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCC  2439

Query 2116  CAGTCAGCATCGAGCCCCAAGAAGTTCCCTATTTCTAGCCATTTGAGTGACCTGGGGGATGTGGAGGAGGACTC  2189
            ||.||.|||||.||.||||||||||||||.||..||.||||.|.|.|.|||||.||.||||..|||||||||.|
Sbjct 2440  CAATCTGCATCAAGTCCCAAGAAGTTCCCCATCCCTGGCCACTCGGGGGACCTAGGAGATGGTGAGGAGGACCC  2513

Query 2190  CTCACCAGCACAGAAGCCAGGCAAGCTCTCCGACATGTACCCCTCCACGGTGCCCAGTGTGGACAGTGCTGTGG  2263
            |||.|||..||||||.||.||||||||||||||...|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2514  CTCCCCAATACAGAAACCTGGCAAGCTCTCCGATGCGTACCCCTCCACGGTGCCCAGCGTGGACAGTGCTGTGG  2587

Query 2264  ATTCATGGGATGGGTCTGCAATAGACACCAGCTATGGAACTGAAGGCACTAGTTTTCAGGCCTCAGGATACAAT  2337
            |.||.|||||||||||||.||||||..||||||||||.|.|.|||||.|.|.|||||||.|.||||||||||||
Sbjct 2588  ACTCCTGGGATGGGTCTGGAATAGATGCCAGCTATGGGAGTCAAGGCTCAACTTTTCAGACTTCAGGATACAAT  2661

Query 2338  TTCAACACCTATGACTGGAGGAGTCCAAAACAGAGAGGCAGCTTGTCCCCAGTCACTAAGCCTCGAAGCCAGAC  2411
            |.||||||||||||.||||||||||||||.||.|||..||||.|||||||||||.|.|||||||||||||||||
Sbjct 2662  TACAACACCTATGATTGGAGGAGTCCAAAGCAAAGAACCAGCCTGTCCCCAGTCCCCAAGCCTCGAAGCCAGAC  2735

Query 2412  TTACCCAGATGTGGGGCTGAGTTATGAAGACTGGGACCGGTCCACAGCCAGTGGTTTTGCAGGGGCTGCCGATA  2485
            .||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.|||||||.|.||.|
Sbjct 2736  GTACCCAGATGTGGGCCTGAGTAATGAAGACTGGGATCGATCCACAGCCAGTGGCTTTGTAGGGGCTTCTGACA  2809

Query 2486  GTGCAGAGACAGAACAAGAGGAGAACTTCTGGTCTCAAGCGCTGGAGGATTTGGAAACCTGCGGACAGTCAGGA  2559
            |||||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||..||||.||||||||.|||||.||.
Sbjct 2810  GTGCAGATGCTGAACAAGAGGAAAACTTCTGGTCTCAAGCATTGGAGGACCTGGAGACCTGCGGCCAGTCGGGG  2883

Query 2560  ATTCTGAGAGAACTGGAGGAGAAAGCTGACAGGCGTGTGTCTTTGAGAAACATGACTCTCTTGGCAACAATCAT  2633
            ||.||||||||.||.||                                             ||||||||||||
Sbjct 2884  ATCCTGAGAGAGCTTGA---------------------------------------------GGCAACAATCAT  2912

Query 2634  GTCGGGGAGCACGATGAGTTTGAATCATGAGGCTCCAACACCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCC  2707
            |||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2913  GTCGGGGAGTACTATGAGTTTGAATCATGAGGCTCCAATGGCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCC  2986

Query 2708  AGGAGCGCAGCAGCTCGCGGCCGCACTACAGCCAAACAACTCGGAGCAACACCCTGCCTTCAGATGTGGGTAGG  2781
            ||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.
Sbjct 2987  AGGAACGGAGCAGTTCACGGCCACACTATAGCCAAACAACTCGCAGCAACACCCTGCCCTCAGACGTGGGCAGA  3060

Query 2782  AAGTCAGTAACCCTGAGAAAAATGAAACAAGAAATAAAGGAGATCATGTCTCCAACTCCTGTGGAGCTGCACAA  2855
            |||||.|||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 3061  AAGTCTGTAACCCTGCGGAAAATGAAGCAAGAAATAAAGGAGATCATGTCCCCAACTCCGGTGGAGCTACACAA  3134

Query 2856  GGTGACCTTGTACAAGGACTCTGACATGGAGGACTTTGGGTTCAGTGTAGCAGATGGCTTACTGGAGAAAGGAG  2929
            |||||||||.|||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.|
Sbjct 3135  GGTGACCTTATACAAGGACTCTGGCATGGAGGACTTCGGGTTCAGTGTGGCAGATGGCCTGCTGGAGAAAGGCG  3208

Query 2930  TGTATGTCAAAAATATTCGCCCAGCTGGGCCAGGAGATCTTGGTGGCTTAAAGCCCTATGACAGGCTCTTACAG  3003
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 3209  TGTATGTCAAAAATATCCGCCCAGCTGGGCCAGGTGATGTTGGGGGCTTGAAGCCCTACGACAGGCTCTTACAG  3282

Query 3004  GTGAATCATGTCCGAACCAGAGACTTTGACTGCTGCCTTGTTGTGCCCCTCATAGCAGAATCCGGGAATAAGCT  3077
            ||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||
Sbjct 3283  GTAAATCACGTGCGGACGAGAGACTTTGACTGCTGCCTGGTGGTGCCTCTCATAGCTGAATCTGGCAACAAGCT  3356

Query 3078  GGACCTGGTTATTAGTAGAAACCCACTGGCTTCACAGAAGTCTATAGACCAACAGAGTCTACCAGGAGATTGGA  3151
            |||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|.|..|||.||..|.||.||||
Sbjct 3357  GGACCTGGTTATTAGCAGAAATCCACTGGCCTCCCAGAAGTCGATAGAACAGCCGGCTCTGCCCAGCGACTGGA  3430

Query 3152  GTGAACAGAACAGTGCTTTTTTCCAGCAGCCTAGCCACGGTGGTAATT--TGGAGACACGAGAACCCACT-AAT  3222
            |.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||| .|||  ||||||          .||| .||
Sbjct 3431  GCGAACAGAACAGCGCTTTCTTCCAGCAACCCAGCCACGGTGG-GATTCCTGGAGA----------TACTGTAT  3493

Query 3223  ACATTA-----------  3228
            ||.||.           
Sbjct 3494  ACTTTTGGCAAAGCCTC  3510