Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468758
- Subject:
- XM_006514234.2
- Aligned Length:
- 3569
- Identities:
- 2791
- Gaps:
- 436
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGACATGTAGCGGACCTCTGCATCAGCCAAGAGGAATTAAGCTTTGTCACTCCCCACTGGGACTACCTTTCTC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTGGTATGTGCGCAAGGAATTCACATGCTGCCGCTCGCCGCTGCAGCCACCAGAGCAGAGCCCCTGTGTACACT 148
Query 1 -----------------------ATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGTTGTCAAATTCTGAGGCGACTTACT 51
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 149 TTGCCAGAGAGCAGAGAGCAAGAATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGCTGTCAAATTCTAAGGCGACTTACC 222
Query 52 AAAGATGAGAGTCCCTACACTAAATCCGCCAGCCAGACAAAGCCGCCTGATGGAGCGTTGGCTGTGAGGAGACA 125
||
Sbjct 223 AA------------------------------------------------------------------------ 224
Query 126 GAGCATCCCAGAGGAATTCAAGGGCTCCACAGTCGTCGAGCTGATGAAGAAGGAAGGCACTACCCTGGGTCTGA 199
||||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.||.||.||.||.||.||||
Sbjct 225 ---------AGAGGAATTCAAGGGCTCCACAGTGGTGGAGTTGATGAAGAAGGAGGGAACCACTCTTGGCCTGA 289
Query 200 CGGTATCGGGAGGAATTGATAAGGATGGCAAGCCAAGAGTATCTAATCTGCGGCAAGGAGGAATTGCTGCTAGA 273
|||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 290 CGGTATCGGGAGGCATTGATAAAGATGGCAAGCCAAGAGTGTCCAACCTGCGGCAGGGAGGAATCGCTGCCAGA 363
Query 274 AGTGACCAGCTGGATGTGGGTGACTACATCAAAGCAGTGAATGGAATCAACCTGGCCAAATTCCGCCATGACGA 347
||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 364 AGTGACCAGCTGGATGTGGGCGACTACATCAAGGCGGTGAATGGGATCAACCTGGCCAAGTTCCGCCACGATGA 437
Query 348 GATCATCAGCTTGCTGAAGAATGTGGGAGAAAGAGTGGTTCTTGAAGTAGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTG 421
||||||||||.|||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 438 GATCATCAGCCTGCTGAAAAATGTCGGGGAAAGAGTGGTCCTGGAGGTCGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTG 511
Query 422 TGCAAGGATCAAGTGTTATTTTCCGAACAGTGGAGGTCACATTACATAAAGAAGGCAATACCTTTGGTTTTGTA 495
|.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 512 TACAAGGATCCAGTGTTATGTTCCGAACTGTGGAGGTCACGCTGCACAAAGAAGGCAACACCTTTGGTTTTGTC 585
Query 496 ATTCGAGGGGGAGCACATGATGATAGAAATAAATCTCGTCCAGTTGTGATAACATGTGTTCGTCCTGGAGGGCC 569
||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 586 ATCCGAGGGGGAGCGCATGATGACAGGAACAAGTCCCGTCCGGTTGTGATAACCTGTGTTCGTCCTGGAGGGCC 659
Query 570 TGCTGACAGAGAGGGCACGATCAAACCCGGTGACAGGTTGCTCAGTGTGGATGGAATTCGGCTTCTTGGAACTA 643
||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 660 TGCTGACAGAGAGGGCACCATCAAACCTGGAGACAGGTTGCTCAGCGTGGATGGAATTCGGCTCCTGGGAACCA 733
Query 644 CGCATGCTGAAGCCATGAGTATTCTTAAACAATGTGGACAAGAAGCAGCACTGCTGATAGAATATGATGTCTCA 717
|.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 734 CCCATGCCGAGGCCATGAGCATCCTTAAACAGTGCGGACAAGAAGCCACGCTGCTGATAGAATACGATGTCTCT 807
Query 718 GTAATGGACTCTGTGGCAACAGCATCCGGGCCACTACTAGTCGAAGTTGCCAAAACTCCTGGTGCCAGCCTTGG 791
||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 808 GTGATGGATTCTGTGGCGACAGCATCCGGGCCACTACTAGTTGAAGTTGCCAAAACTCCAGGTGCCAGCCTTGG 881
Query 792 GGTTGCCCTAACTACCTCGATGTGCTGTAACAAACAAGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGTATTG 865
||||||||||||||||||..|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 882 GGTTGCCCTAACTACCTCCGTGTGCTGTAACAAGCAGGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGCATTG 955
Query 866 CAGACAGATGTGGCGCATTGCATGTGGGAGATCACATCCTCTCCATCGATGGAACCAGCATGGAGTACTGTACA 939
|.||||||||||||||..|.||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||.
Sbjct 956 CGGACAGATGTGGCGCGCTACACGTGGGAGACCACATCCTCTCCATTGACGGCACGAGTATGGAGTACTGTACC 1029
Query 940 CTTGCAGAAGCAACCCAGTTCCTGGCCAACACCACTGACCAGGTCAAGCTTGAGATCCTTCCCCATCATCAGAC 1013
||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1030 CTCGCAGAAGCGACCCAGTTCCTGGCCAATACCACTGACCAGGTCAAGCTGGAGATTCTCCCACACCATCAGAC 1103
Query 1014 CCGGCTGGCCCTAAAGGGGCCCGACCATG--------------------------------------------- 1042
|||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1104 CCGCCTGGCCCTAAAGGGCCCTGACCATGTGAAAATTCAGAGGAGCGACAGACAACATCCCTGGGATGCCTGGG 1177
Query 1043 -------------------------------------------------------------------------- 1042
Sbjct 1178 CCAGCAACCAGTGCGGCGTTCATACCAACCATCACCATAACACGTACCACCCAGACCATTGCAGAGTGCCAGCC 1251
Query 1043 -------------------------------------CAGCTTTGGTGTCTTCATCCTTCTCTCCTACCTCCAT 1079
|.|||.|||||.|.||||| .||||||||||||||
Sbjct 1252 CTGACTTTCCCGAAAGCGCTTCCTCCAAACAGCCCTCCGGCTATGGTGCCCTCATC---TTCTCCTACCTCCAT 1322
Query 1080 GAGTGCATACAGCCTGAGTTCCCTGAACATGGGGACTCTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGTGGAA 1153
||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1323 GAGTGCGTACAGTCTGAGTTCCCTGAACATGGGGACTTTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGAGGAA 1396
Query 1154 CCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCATTGTCCTTAGCCTCCAGCACAGTAGGATTG 1227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1397 CCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCACTGTCTTTAGCCTCCAGCACTGTGGGGTTG 1470
Query 1228 GCTGGGCAGGTTGTTCACACAGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCAGATCCTGTCACAGGATTTGGGATCCA 1301
|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||
Sbjct 1471 GCTGGCCAGGTCGTTCACACTGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCTGACCCTGTCACGGGCTTCGGAATCCA 1544
Query 1302 ACTGCAGGGCAGTGTGTTTGCCACAGAAACTCTCTCTTCTCCACCTCTGATTTCCTATATCGAAGCTGACAGCC 1375
||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1545 ACTGCAGGGCAGCGTGTTTGCCACAGAGACGCTCTCCTCTCCGCCTCTGATTTCCTATATTGAAGCTGACAGCC 1618
Query 1376 CAGCAGAGAGATGTGGGGTGCTACAGATTGGAGACAGAGTGATGGCCATCAATGGAATTCCAACAGAAGACAGC 1449
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1619 CAGCAGAGAGATGTGGTGTGCTACAGATTGGAGACAGAGTCATGGCCATTAATGGAATCCCAACAGAAGACAGC 1692
Query 1450 ACCTTCGAAGAAGCCAGTCAGCTCCTCCGAGACTCTTCAATCACGAGCAAGGTCACACTGGAAATCGAGTTTGA 1523
||||||||.|||||||.|||.|||||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1693 ACCTTCGAGGAAGCCAATCAACTCCTGAGAGACTCTTCCATCACGAGCAAAGTCACACTAGAAATCGAGTTTGA 1766
Query 1524 TGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAGCTGCCTAAGAAGCACAATGTGGAACTTG 1597
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||..||||||||||
Sbjct 1767 TGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAACTGCCCAAGAAGCACAGCGTGGAACTTG 1840
Query 1598 GAATAACCATAAGTTCACCATCCAGTAGAAAACCAGGAGACCCCCTCGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGGAGT 1671
||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1841 GAATAACCATCAGTTCGCCATCCAGTAGAAAACCGGGGGACCCCCTTGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGCAGT 1914
Query 1672 GTGGCACACAGAACTGGGACCCTGGAACTTGGGGATAAATTGCTCGCAATAGATAATATCCGGCTGGACAACTG 1745
||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.|||.||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1915 GTGGCACACAGAACCGGAACTCTGGAACTGGGAGACAAACTGCTTGCGATAGATAACATCCGGCTGGATAACTG 1988
Query 1746 TTCCATGGAAGATGCAGTTCAGATCCTCCAGCAATGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAG 1819
|||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1989 TTCCATGGAAGATGCGGTCCAGATCCTCCAGCAGTGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAG 2062
Query 1820 ATAATTCAGATGAGCAAGAAAGTTCCGGAGCAATTATTTACACCGTGGAGCTTAAACGCTACGGGGGGCCCCTT 1893
||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2063 ATAACTCAGACGAGCAAGAGAGTTCCGGAGCGATTATTTACACGGTGGAGCTGAAGCGCTATGGGGGGCCCCTT 2136
Query 1894 GGCATCACAATTTCAGGAACTGAAGAGCCGTTTGATCCTATAATCATTTCAAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGC 1967
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2137 GGCATCACAATTTCTGGAACTGAAGAGCCGTTTGATCCTATTATCATCTCGAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGC 2210
Query 1968 TGAAAGAACTGGCGCAATCCACATAGGAGACCGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAAGGGAAGCCTC 2041
||||||.|||||.||.||||||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2211 TGAAAGGACTGGAGCGATCCACATCGGAGATAGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAGGGGAAGCCTC 2284
Query 2042 TGAGTGAAGCCATCCATTTGTTACAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCTTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCC 2115
||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2285 TGAGTGAAGCCATCCACTTGCTCCAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCCTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCC 2358
Query 2116 CAGTCAGCATCGAGCCCCAAGAAGTTCCCTATTTCTAGCCATTTGAGTGACCTGGGGGATGTGGAGGAGGACTC 2189
||.||.|||||.||.||||||||||||||.||..||.||||.|.|.|.|||||.||.||||..|||||||||.|
Sbjct 2359 CAATCTGCATCAAGTCCCAAGAAGTTCCCCATCCCTGGCCACTCGGGGGACCTAGGAGATGGTGAGGAGGACCC 2432
Query 2190 CTCACCAGCACAGAAGCCAGGCAAGCTCTCCGACATGTACCCCTCCACGGTGCCCAGTGTGGACAGTGCTGTGG 2263
|||.|||..||||||.||.||||||||||||||...|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2433 CTCCCCAATACAGAAACCTGGCAAGCTCTCCGATGCGTACCCCTCCACGGTGCCCAGCGTGGACAGTGCTGTGG 2506
Query 2264 ATTCATGGGATGGGTCTGCAATAGACACCAGCTATGGAACTGAAGGCACTAGTTTTCAGGCCTCAGGATACAAT 2337
|.||.|||||||||||||.||||||..||||||||||.|.|.|||||.|.|.|||||||.|.||||||||||||
Sbjct 2507 ACTCCTGGGATGGGTCTGGAATAGATGCCAGCTATGGGAGTCAAGGCTCAACTTTTCAGACTTCAGGATACAAT 2580
Query 2338 TTCAACACCTATGACTGGAGGAGTCCAAAACAGAGAGGCAGCTTGTCCCCAGTCACTAAGCCTCGAAGCCAGAC 2411
|.||||||||||||.||||||||||||||.||.|||..||||.|||||||||||.|.|||||||||||||||||
Sbjct 2581 TACAACACCTATGATTGGAGGAGTCCAAAGCAAAGAACCAGCCTGTCCCCAGTCCCCAAGCCTCGAAGCCAGAC 2654
Query 2412 TTACCCAGATGTGGGGCTGAGTTATGAAGACTGGGACCGGTCCACAGCCAGTGGTTTTGCAGGGGCTGCCGATA 2485
.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.|||||||.|.||.|
Sbjct 2655 GTACCCAGATGTGGGCCTGAGTAATGAAGACTGGGATCGATCCACAGCCAGTGGCTTTGTAGGGGCTTCTGACA 2728
Query 2486 GTGCAGAGACAGAACAAGAGGAGAACTTCTGGTCTCAAGCGCTGGAGGATTTGGAAACCTGCGGACAGTCAGGA 2559
|||||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||..||||.||||||||.|||||.||.
Sbjct 2729 GTGCAGATGCTGAACAAGAGGAAAACTTCTGGTCTCAAGCATTGGAGGACCTGGAGACCTGCGGCCAGTCGGGG 2802
Query 2560 ATTCTGAGAGAACTGGAGGAGAAAGCTGACAGGCGTGTGTCTTTGAGAAACATGACTCTCTTGGCAACAATCAT 2633
||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2803 ATCCTGAGAGAGCTTGAGGAGAAAGCTGACAGGCGTGTGTCATTGAGAAACATGACCCTCTTGGCAACAATCAT 2876
Query 2634 GTCGGGGAGCACGATGAGTTTGAATCATGAGGCTCCAACACCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCC 2707
|||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2877 GTCGGGGAGTACTATGAGTTTGAATCATGAGGCTCCAATGGCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCC 2950
Query 2708 AGGAGCGCAGCAGCTCGCGGCCGCACTACAGCCAAACAACTCGGAGCAACACCCTGCCTTCAGATGTGGGTAGG 2781
||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.
Sbjct 2951 AGGAACGGAGCAGTTCACGGCCACACTATAGCCAAACAACTCGCAGCAACACCCTGCCCTCAGACGTGGGCAGA 3024
Query 2782 AAGTCAGTAACCCTGAGAAAAATGAAACAAGAAATAAAGGAGATCATGTCTCCAACTCCTGTGGAGCTGCACAA 2855
|||||.|||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 3025 AAGTCTGTAACCCTGCGGAAAATGAAGCAAGAAATAAAGGAGATCATGTCCCCAACTCCGGTGGAGCTACACAA 3098
Query 2856 GGTGACCTTGTACAAGGACTCTGACATGGAGGACTTTGGGTTCAGTGTAGCAGATGGCTTACTGGAGAAAGGAG 2929
|||||||||.|||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.|
Sbjct 3099 GGTGACCTTATACAAGGACTCTGGCATGGAGGACTTCGGGTTCAGTGTGGCAGATGGCCTGCTGGAGAAAGGCG 3172
Query 2930 TGTATGTCAAAAATATTCGCCCAGCTGGGCCAGGAGATCTTGGTGGCTTAAAGCCCTATGACAGGCTCTTACAG 3003
||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 3173 TGTATGTCAAAAATATCCGCCCAGCTGGGCCAGGTGATGTTGGGGGCTTGAAGCCCTACGACAGGCTCTTACAG 3246
Query 3004 GTGAATCATGTCCGAACCAGAGACTTTGACTGCTGCCTTGTTGTGCCCCTCATAGCAGAATCCGGGAATAAGCT 3077
||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||
Sbjct 3247 GTAAATCACGTGCGGACGAGAGACTTTGACTGCTGCCTGGTGGTGCCTCTCATAGCTGAATCTGGCAACAAGCT 3320
Query 3078 GGACCTGGTTATTAGTAGAAACCCACTGGCTTCACAGAAGTCTATAGACCAACAGAGTCTACCAGGAGATTGGA 3151
|||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|.|..|||.||..|.||.||||
Sbjct 3321 GGACCTGGTTATTAGCAGAAATCCACTGGCCTCCCAGAAGTCGATAGAACAGCCGGCTCTGCCCAGCGACTGGA 3394
Query 3152 GTGAACAGAACAGTGCTTTTTTCCAGCAGCCTAGCCACGGTGGTAATT--TGGAGACACGAGAACCCACT-AAT 3222
|.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||| .||| |||||| .||| .||
Sbjct 3395 GCGAACAGAACAGCGCTTTCTTCCAGCAACCCAGCCACGGTGG-GATTCCTGGAGA----------TACTGTAT 3457
Query 3223 ACATTA----------- 3228
||.||.
Sbjct 3458 ACTTTTGGCAAAGCCTC 3474