Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468758
• Subject: XM_006514235.2
• Aligned Length: 3490
• Identities: 2846
• Gaps: 290

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGACCGCTTCCTGGGATTTGTCAAGCAGATTCGGAGATCTAGGAGAAGAAAGGGGAAAAAGTACCGGCCGGA  74

Query    1  -----------ATGATAGCT------GTCTCTTTTA-AATGCCGTTGTCAAATTCTGAGGCGACTTACTAAAGA  56
                       |.||..|||      .|.|||.||| .||||          |||.|||  .|.||.|.||  |
Sbjct   75  AGAGGACTACCAGGAGGGCTACGAGGATGTCTATTACTATGC----------TTCGGAG--CATTTTCGAA--A  134

Query   57  TGAGAGTCCCTACACTAAATCCGCCAGCCAGACAAAGCCGCCTGATGGAGCGTTGGCTGTGAGGAGACAGAGCA  130
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  135  TGAGAGTCCCTACACTAAATCTGCCAGCCAGACAAAGCCGCCCGATGGAGCATTGGCTGTGAGGAGACAGAGCA  208

Query  131  TCCCAGAGGAATTCAAGGGCTCCACAGTCGTCGAGCTGATGAAGAAGGAAGGCACTACCCTGGGTCTGACGGTA  204
            ||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||||||
Sbjct  209  TCCCAGAGGAATTCAAGGGCTCCACAGTGGTGGAGTTGATGAAGAAGGAGGGAACCACTCTTGGCCTGACGGTA  282

Query  205  TCGGGAGGAATTGATAAGGATGGCAAGCCAAGAGTATCTAATCTGCGGCAAGGAGGAATTGCTGCTAGAAGTGA  278
            ||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  283  TCGGGAGGCATTGATAAAGATGGCAAGCCAAGAGTGTCCAACCTGCGGCAGGGAGGAATCGCTGCCAGAAGTGA  356

Query  279  CCAGCTGGATGTGGGTGACTACATCAAAGCAGTGAATGGAATCAACCTGGCCAAATTCCGCCATGACGAGATCA  352
            |||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct  357  CCAGCTGGATGTGGGCGACTACATCAAGGCGGTGAATGGGATCAACCTGGCCAAGTTCCGCCACGATGAGATCA  430

Query  353  TCAGCTTGCTGAAGAATGTGGGAGAAAGAGTGGTTCTTGAAGTAGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTGTGCAA  426
            |||||.|||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  431  TCAGCCTGCTGAAAAATGTCGGGGAAAGAGTGGTCCTGGAGGTCGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTGTACAA  504

Query  427  GGATCAAGTGTTATTTTCCGAACAGTGGAGGTCACATTACATAAAGAAGGCAATACCTTTGGTTTTGTAATTCG  500
            |||||.||||||||.||||||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct  505  GGATCCAGTGTTATGTTCCGAACTGTGGAGGTCACGCTGCACAAAGAAGGCAACACCTTTGGTTTTGTCATCCG  578

Query  501  AGGGGGAGCACATGATGATAGAAATAAATCTCGTCCAGTTGTGATAACATGTGTTCGTCCTGGAGGGCCTGCTG  574
            |||||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  579  AGGGGGAGCGCATGATGACAGGAACAAGTCCCGTCCGGTTGTGATAACCTGTGTTCGTCCTGGAGGGCCTGCTG  652

Query  575  ACAGAGAGGGCACGATCAAACCCGGTGACAGGTTGCTCAGTGTGGATGGAATTCGGCTTCTTGGAACTACGCAT  648
            |||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct  653  ACAGAGAGGGCACCATCAAACCTGGAGACAGGTTGCTCAGCGTGGATGGAATTCGGCTCCTGGGAACCACCCAT  726

Query  649  GCTGAAGCCATGAGTATTCTTAAACAATGTGGACAAGAAGCAGCACTGCTGATAGAATATGATGTCTCAGTAAT  722
            ||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct  727  GCCGAGGCCATGAGCATCCTTAAACAGTGCGGACAAGAAGCCACGCTGCTGATAGAATACGATGTCTCTGTGAT  800

Query  723  GGACTCTGTGGCAACAGCATCCGGGCCACTACTAGTCGAAGTTGCCAAAACTCCTGGTGCCAGCCTTGGGGTTG  796
            |||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  801  GGATTCTGTGGCGACAGCATCCGGGCCACTACTAGTTGAAGTTGCCAAAACTCCAGGTGCCAGCCTTGGGGTTG  874

Query  797  CCCTAACTACCTCGATGTGCTGTAACAAACAAGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGTATTGCAGAC  870
            |||||||||||||..|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  875  CCCTAACTACCTCCGTGTGCTGTAACAAGCAGGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGCATTGCGGAC  948

Query  871  AGATGTGGCGCATTGCATGTGGGAGATCACATCCTCTCCATCGATGGAACCAGCATGGAGTACTGTACACTTGC  944
            |||||||||||..|.||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||.||.||
Sbjct  949  AGATGTGGCGCGCTACACGTGGGAGACCACATCCTCTCCATTGACGGCACGAGTATGGAGTACTGTACCCTCGC  1022

Query  945  AGAAGCAACCCAGTTCCTGGCCAACACCACTGACCAGGTCAAGCTTGAGATCCTTCCCCATCATCAGACCCGGC  1018
            ||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|
Sbjct 1023  AGAAGCGACCCAGTTCCTGGCCAATACCACTGACCAGGTCAAGCTGGAGATTCTCCCACACCATCAGACCCGCC  1096

Query 1019  TGGCCCTAAAGGGGCCCGACCATG--------------------------------------------------  1042
            |||||||||||||.||.|||||||                                                  
Sbjct 1097  TGGCCCTAAAGGGCCCTGACCATGTGAAAATTCAGAGGAGCGACAGACAACATCCCTGGGATGCCTGGGCCAGC  1170

Query 1043  --------------------------------------------------------------------------  1042
                                                                                      
Sbjct 1171  AACCAGTGCGGCGTTCATACCAACCATCACCATAACACGTACCACCCAGACCATTGCAGAGTGCCAGCCCTGAC  1244

Query 1043  --------------------------------CAGCTTTGGTGTCTTCATCCTTCTCTCCTACCTCCATGAGTG  1084
                                            |.|||.|||||.|.|||||   .|||||||||||||||||||
Sbjct 1245  TTTCCCGAAAGCGCTTCCTCCAAACAGCCCTCCGGCTATGGTGCCCTCATC---TTCTCCTACCTCCATGAGTG  1315

Query 1085  CATACAGCCTGAGTTCCCTGAACATGGGGACTCTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGTGGAACCATG  1158
            |.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1316  CGTACAGTCTGAGTTCCCTGAACATGGGGACTTTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGAGGAACCATG  1389

Query 1159  ATGAGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCATTGTCCTTAGCCTCCAGCACAGTAGGATTGGCTGG  1232
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1390  ATGAGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCACTGTCTTTAGCCTCCAGCACTGTGGGGTTGGCTGG  1463

Query 1233  GCAGGTTGTTCACACAGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCAGATCCTGTCACAGGATTTGGGATCCAACTGC  1306
            .|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||||||||||
Sbjct 1464  CCAGGTCGTTCACACTGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCTGACCCTGTCACGGGCTTCGGAATCCAACTGC  1537

Query 1307  AGGGCAGTGTGTTTGCCACAGAAACTCTCTCTTCTCCACCTCTGATTTCCTATATCGAAGCTGACAGCCCAGCA  1380
            |||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1538  AGGGCAGCGTGTTTGCCACAGAGACGCTCTCCTCTCCGCCTCTGATTTCCTATATTGAAGCTGACAGCCCAGCA  1611

Query 1381  GAGAGATGTGGGGTGCTACAGATTGGAGACAGAGTGATGGCCATCAATGGAATTCCAACAGAAGACAGCACCTT  1454
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1612  GAGAGATGTGGTGTGCTACAGATTGGAGACAGAGTCATGGCCATTAATGGAATCCCAACAGAAGACAGCACCTT  1685

Query 1455  CGAAGAAGCCAGTCAGCTCCTCCGAGACTCTTCAATCACGAGCAAGGTCACACTGGAAATCGAGTTTGATGTTG  1528
            |||.|||||||.|||.|||||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1686  CGAGGAAGCCAATCAACTCCTGAGAGACTCTTCCATCACGAGCAAAGTCACACTAGAAATCGAGTTTGATGTTG  1759

Query 1529  CAGAGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAGCTGCCTAAGAAGCACAATGTGGAACTTGGAATA  1602
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||..|||||||||||||||
Sbjct 1760  CAGAGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAACTGCCCAAGAAGCACAGCGTGGAACTTGGAATA  1833

Query 1603  ACCATAAGTTCACCATCCAGTAGAAAACCAGGAGACCCCCTCGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGGAGTGTGGC  1676
            |||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1834  ACCATCAGTTCGCCATCCAGTAGAAAACCGGGGGACCCCCTTGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGCAGTGTGGC  1907

Query 1677  ACACAGAACTGGGACCCTGGAACTTGGGGATAAATTGCTCGCAATAGATAATATCCGGCTGGACAACTGTTCCA  1750
            |||||||||.||.||.||||||||.||.||.|||.||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1908  ACACAGAACCGGAACTCTGGAACTGGGAGACAAACTGCTTGCGATAGATAACATCCGGCTGGATAACTGTTCCA  1981

Query 1751  TGGAAGATGCAGTTCAGATCCTCCAGCAATGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAAT  1824
            ||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1982  TGGAAGATGCGGTCCAGATCCTCCAGCAGTGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAAC  2055

Query 1825  TCAGATGAGCAAGAAAGTTCCGGAGCAATTATTTACACCGTGGAGCTTAAACGCTACGGGGGGCCCCTTGGCAT  1898
            |||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2056  TCAGACGAGCAAGAGAGTTCCGGAGCGATTATTTACACGGTGGAGCTGAAGCGCTATGGGGGGCCCCTTGGCAT  2129

Query 1899  CACAATTTCAGGAACTGAAGAGCCGTTTGATCCTATAATCATTTCAAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAA  1972
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2130  CACAATTTCTGGAACTGAAGAGCCGTTTGATCCTATTATCATCTCGAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAA  2203

Query 1973  GAACTGGCGCAATCCACATAGGAGACCGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAAGGGAAGCCTCTGAGT  2046
            |.|||||.||.||||||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2204  GGACTGGAGCGATCCACATCGGAGATAGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAGGGGAAGCCTCTGAGT  2277

Query 2047  GAAGCCATCCATTTGTTACAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCTTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAGTC  2120
            |||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2278  GAAGCCATCCACTTGCTCCAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCCTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAATC  2351

Query 2121  AGCATCGAGCCCCAAGAAGTTCCCTATTTCTAGCCATTTGAGTGACCTGGGGGATGTGGAGGAGGACTCCTCAC  2194
            .|||||.||.||||||||||||||.||..||.||||.|.|.|.|||||.||.||||..|||||||||.||||.|
Sbjct 2352  TGCATCAAGTCCCAAGAAGTTCCCCATCCCTGGCCACTCGGGGGACCTAGGAGATGGTGAGGAGGACCCCTCCC  2425

Query 2195  CAGCACAGAAGCCAGGCAAGCTCTCCGACATGTACCCCTCCACGGTGCCCAGTGTGGACAGTGCTGTGGATTCA  2268
            ||..||||||.||.||||||||||||||...|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 2426  CAATACAGAAACCTGGCAAGCTCTCCGATGCGTACCCCTCCACGGTGCCCAGCGTGGACAGTGCTGTGGACTCC  2499

Query 2269  TGGGATGGGTCTGCAATAGACACCAGCTATGGAACTGAAGGCACTAGTTTTCAGGCCTCAGGATACAATTTCAA  2342
            |||||||||||||.||||||..||||||||||.|.|.|||||.|.|.|||||||.|.|||||||||||||.|||
Sbjct 2500  TGGGATGGGTCTGGAATAGATGCCAGCTATGGGAGTCAAGGCTCAACTTTTCAGACTTCAGGATACAATTACAA  2573

Query 2343  CACCTATGACTGGAGGAGTCCAAAACAGAGAGGCAGCTTGTCCCCAGTCACTAAGCCTCGAAGCCAGACTTACC  2416
            |||||||||.||||||||||||||.||.|||..||||.|||||||||||.|.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 2574  CACCTATGATTGGAGGAGTCCAAAGCAAAGAACCAGCCTGTCCCCAGTCCCCAAGCCTCGAAGCCAGACGTACC  2647

Query 2417  CAGATGTGGGGCTGAGTTATGAAGACTGGGACCGGTCCACAGCCAGTGGTTTTGCAGGGGCTGCCGATAGTGCA  2490
            ||||||||||.||||||.|||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.|||||||.|.||.||||||
Sbjct 2648  CAGATGTGGGCCTGAGTAATGAAGACTGGGATCGATCCACAGCCAGTGGCTTTGTAGGGGCTTCTGACAGTGCA  2721

Query 2491  GAGACAGAACAAGAGGAGAACTTCTGGTCTCAAGCGCTGGAGGATTTGGAAACCTGCGGACAGTCAGGAATTCT  2564
            ||..|.|||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||..||||.||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 2722  GATGCTGAACAAGAGGAAAACTTCTGGTCTCAAGCATTGGAGGACCTGGAGACCTGCGGCCAGTCGGGGATCCT  2795

Query 2565  GAGAGAACTGGAGGAGAAAGCTGACAGGCGTGTGTCTTTGAGAAACATGACTCTCTTGGCAACAATCATGTCGG  2638
            ||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2796  GAGAGAGCTTGAGGAGAAAGCTGACAGGCGTGTGTCATTGAGAAACATGACCCTCTTGGCAACAATCATGTCGG  2869

Query 2639  GGAGCACGATGAGTTTGAATCATGAGGCTCCAACACCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAG  2712
            ||||.||.|||||||||||||||||||||||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2870  GGAGTACTATGAGTTTGAATCATGAGGCTCCAATGGCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAA  2943

Query 2713  CGCAGCAGCTCGCGGCCGCACTACAGCCAAACAACTCGGAGCAACACCCTGCCTTCAGATGTGGGTAGGAAGTC  2786
            ||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct 2944  CGGAGCAGTTCACGGCCACACTATAGCCAAACAACTCGCAGCAACACCCTGCCCTCAGACGTGGGCAGAAAGTC  3017

Query 2787  AGTAACCCTGAGAAAAATGAAACAAGAAATAAAGGAGATCATGTCTCCAACTCCTGTGGAGCTGCACAAGGTGA  2860
            .|||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 3018  TGTAACCCTGCGGAAAATGAAGCAAGAAATAAAGGAGATCATGTCCCCAACTCCGGTGGAGCTACACAAGGTGA  3091

Query 2861  CCTTGTACAAGGACTCTGACATGGAGGACTTTGGGTTCAGTGTAGCAGATGGCTTACTGGAGAAAGGAGTGTAT  2934
            ||||.|||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.||||||
Sbjct 3092  CCTTATACAAGGACTCTGGCATGGAGGACTTCGGGTTCAGTGTGGCAGATGGCCTGCTGGAGAAAGGCGTGTAT  3165

Query 2935  GTCAAAAATATTCGCCCAGCTGGGCCAGGAGATCTTGGTGGCTTAAAGCCCTATGACAGGCTCTTACAGGTGAA  3008
            |||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 3166  GTCAAAAATATCCGCCCAGCTGGGCCAGGTGATGTTGGGGGCTTGAAGCCCTACGACAGGCTCTTACAGGTAAA  3239

Query 3009  TCATGTCCGAACCAGAGACTTTGACTGCTGCCTTGTTGTGCCCCTCATAGCAGAATCCGGGAATAAGCTGGACC  3082
            |||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||
Sbjct 3240  TCACGTGCGGACGAGAGACTTTGACTGCTGCCTGGTGGTGCCTCTCATAGCTGAATCTGGCAACAAGCTGGACC  3313

Query 3083  TGGTTATTAGTAGAAACCCACTGGCTTCACAGAAGTCTATAGACCAACAGAGTCTACCAGGAGATTGGAGTGAA  3156
            ||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|.|..|||.||..|.||.|||||.|||
Sbjct 3314  TGGTTATTAGCAGAAATCCACTGGCCTCCCAGAAGTCGATAGAACAGCCGGCTCTGCCCAGCGACTGGAGCGAA  3387

Query 3157  CAGAACAGTGCTTTTTTCCAGCAGCCTAGCCACGGTGGTAATT--TGGAGACACGAGAACCCACT-AATACATT  3227
            ||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||| .|||  ||||||          .||| .||||.||
Sbjct 3388  CAGAACAGCGCTTTCTTCCAGCAACCCAGCCACGGTGG-GATTCCTGGAGA----------TACTGTATACTTT  3450

Query 3228  A-----------  3228
            .           
Sbjct 3451  TGGCAAAGCCTC  3462