Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468758
• Subject: XM_006514237.2
• Aligned Length: 3399
• Identities: 2881
• Gaps: 174

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGACATGTAGCGGACCTCTGCATCAGCCAAGAGGAATTAAGCTTTGTCACTCCCCACTGGGACTACCTTTCTC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTGGTATGTGCGCAAGGAATTCACATGCTGCCGCTCGCCGCTGCAGCCACCAGAGCAGAGCCCCTGTGTACACT  148

Query    1  -----------------------ATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGTTGTCAAATTCTGAGGCGACTTACT  51
                                   ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  149  TTGCCAGAGAGCAGAGAGCAAGAATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGCTGTCAAATTCTAAGGCGACTTACC  222

Query   52  AAAGATGAGAGTCCCTACACTAAATCCGCCAGCCAGACAAAGCCGCCTGATGGAGCGTTGGCTGTGAGGAGACA  125
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAGATGAGAGTCCCTACACTAAATCTGCCAGCCAGACAAAGCCGCCCGATGGAGCATTGGCTGTGAGGAGACA  296

Query  126  GAGCATCCCAGAGGAATTCAAGGGCTCCACAGTCGTCGAGCTGATGAAGAAGGAAGGCACTACCCTGGGTCTGA  199
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.||.||.||.||.||.||||
Sbjct  297  GAGCATCCCAGAGGAATTCAAGGGCTCCACAGTGGTGGAGTTGATGAAGAAGGAGGGAACCACTCTTGGCCTGA  370

Query  200  CGGTATCGGGAGGAATTGATAAGGATGGCAAGCCAAGAGTATCTAATCTGCGGCAAGGAGGAATTGCTGCTAGA  273
            |||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct  371  CGGTATCGGGAGGCATTGATAAAGATGGCAAGCCAAGAGTGTCCAACCTGCGGCAGGGAGGAATCGCTGCCAGA  444

Query  274  AGTGACCAGCTGGATGTGGGTGACTACATCAAAGCAGTGAATGGAATCAACCTGGCCAAATTCCGCCATGACGA  347
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct  445  AGTGACCAGCTGGATGTGGGCGACTACATCAAGGCGGTGAATGGGATCAACCTGGCCAAGTTCCGCCACGATGA  518

Query  348  GATCATCAGCTTGCTGAAGAATGTGGGAGAAAGAGTGGTTCTTGAAGTAGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTG  421
            ||||||||||.|||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATCATCAGCCTGCTGAAAAATGTCGGGGAAAGAGTGGTCCTGGAGGTCGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTG  592

Query  422  TGCAAGGATCAAGTGTTATTTTCCGAACAGTGGAGGTCACATTACATAAAGAAGGCAATACCTTTGGTTTTGTA  495
            |.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  593  TACAAGGATCCAGTGTTATGTTCCGAACTGTGGAGGTCACGCTGCACAAAGAAGGCAACACCTTTGGTTTTGTC  666

Query  496  ATTCGAGGGGGAGCACATGATGATAGAAATAAATCTCGTCCAGTTGTGATAACATGTGTTCGTCCTGGAGGGCC  569
            ||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCCGAGGGGGAGCGCATGATGACAGGAACAAGTCCCGTCCGGTTGTGATAACCTGTGTTCGTCCTGGAGGGCC  740

Query  570  TGCTGACAGAGAGGGCACGATCAAACCCGGTGACAGGTTGCTCAGTGTGGATGGAATTCGGCTTCTTGGAACTA  643
            ||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct  741  TGCTGACAGAGAGGGCACCATCAAACCTGGAGACAGGTTGCTCAGCGTGGATGGAATTCGGCTCCTGGGAACCA  814

Query  644  CGCATGCTGAAGCCATGAGTATTCTTAAACAATGTGGACAAGAAGCAGCACTGCTGATAGAATATGATGTCTCA  717
            |.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  815  CCCATGCCGAGGCCATGAGCATCCTTAAACAGTGCGGACAAGAAGCCACGCTGCTGATAGAATACGATGTCTCT  888

Query  718  GTAATGGACTCTGTGGCAACAGCATCCGGGCCACTACTAGTCGAAGTTGCCAAAACTCCTGGTGCCAGCCTTGG  791
            ||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  889  GTGATGGATTCTGTGGCGACAGCATCCGGGCCACTACTAGTTGAAGTTGCCAAAACTCCAGGTGCCAGCCTTGG  962

Query  792  GGTTGCCCTAACTACCTCGATGTGCTGTAACAAACAAGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGTATTG  865
            ||||||||||||||||||..|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  963  GGTTGCCCTAACTACCTCCGTGTGCTGTAACAAGCAGGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGCATTG  1036

Query  866  CAGACAGATGTGGCGCATTGCATGTGGGAGATCACATCCTCTCCATCGATGGAACCAGCATGGAGTACTGTACA  939
            |.||||||||||||||..|.||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1037  CGGACAGATGTGGCGCGCTACACGTGGGAGACCACATCCTCTCCATTGACGGCACGAGTATGGAGTACTGTACC  1110

Query  940  CTTGCAGAAGCAACCCAGTTCCTGGCCAACACCACTGACCAGGTCAAGCTTGAGATCCTTCCCCATCATCAGAC  1013
            ||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1111  CTCGCAGAAGCGACCCAGTTCCTGGCCAATACCACTGACCAGGTCAAGCTGGAGATTCTCCCACACCATCAGAC  1184

Query 1014  CCGGCTGGCCCTAAAGGGGCCCGACCATGCAGCTTTGGTGTCTTCATCCTTCTCTCCTACCTCCATGAGTGCAT  1087
            |||.||||||||||||||.||.||||||||.|||.|||||.|.|||||   .||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1185  CCGCCTGGCCCTAAAGGGCCCTGACCATGCGGCTATGGTGCCCTCATC---TTCTCCTACCTCCATGAGTGCGT  1255

Query 1088  ACAGCCTGAGTTCCCTGAACATGGGGACTCTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGTGGAACCATGATG  1161
            ||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1256  ACAGTCTGAGTTCCCTGAACATGGGGACTTTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGAGGAACCATGATG  1329

Query 1162  AGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCATTGTCCTTAGCCTCCAGCACAGTAGGATTGGCTGGGCA  1235
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1330  AGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCACTGTCTTTAGCCTCCAGCACTGTGGGGTTGGCTGGCCA  1403

Query 1236  GGTTGTTCACACAGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCAGATCCTGTCACAGGATTTGGGATCCAACTGCAGG  1309
            |||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 1404  GGTCGTTCACACTGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCTGACCCTGTCACGGGCTTCGGAATCCAACTGCAGG  1477

Query 1310  GCAGTGTGTTTGCCACAGAAACTCTCTCTTCTCCACCTCTGATTTCCTATATCGAAGCTGACAGCCCAGCAGAG  1383
            ||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1478  GCAGCGTGTTTGCCACAGAGACGCTCTCCTCTCCGCCTCTGATTTCCTATATTGAAGCTGACAGCCCAGCAGAG  1551

Query 1384  AGATGTGGGGTGCTACAGATTGGAGACAGAGTGATGGCCATCAATGGAATTCCAACAGAAGACAGCACCTTCGA  1457
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552  AGATGTGGTGTGCTACAGATTGGAGACAGAGTCATGGCCATTAATGGAATCCCAACAGAAGACAGCACCTTCGA  1625

Query 1458  AGAAGCCAGTCAGCTCCTCCGAGACTCTTCAATCACGAGCAAGGTCACACTGGAAATCGAGTTTGATGTTGCAG  1531
            .|||||||.|||.|||||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  GGAAGCCAATCAACTCCTGAGAGACTCTTCCATCACGAGCAAAGTCACACTAGAAATCGAGTTTGATGTTGCAG  1699

Query 1532  AGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAGCTGCCTAAGAAGCACAATGTGGAACTTGGAATAACC  1605
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||..||||||||||||||||||
Sbjct 1700  AGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAACTGCCCAAGAAGCACAGCGTGGAACTTGGAATAACC  1773

Query 1606  ATAAGTTCACCATCCAGTAGAAAACCAGGAGACCCCCTCGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGGAGTGTGGCACA  1679
            ||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1774  ATCAGTTCGCCATCCAGTAGAAAACCGGGGGACCCCCTTGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGCAGTGTGGCACA  1847

Query 1680  CAGAACTGGGACCCTGGAACTTGGGGATAAATTGCTCGCAATAGATAATATCCGGCTGGACAACTGTTCCATGG  1753
            ||||||.||.||.||||||||.||.||.|||.||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1848  CAGAACCGGAACTCTGGAACTGGGAGACAAACTGCTTGCGATAGATAACATCCGGCTGGATAACTGTTCCATGG  1921

Query 1754  AAGATGCAGTTCAGATCCTCCAGCAATGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAATTCA  1827
            |||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1922  AAGATGCGGTCCAGATCCTCCAGCAGTGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAACTCA  1995

Query 1828  GATGAGCAAGAAAGTTCCGGAGCAATTATTTACACCGTGGAGCTTAAACGCTACGGGGGGCCCCTTGGCATCAC  1901
            ||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1996  GACGAGCAAGAGAGTTCCGGAGCGATTATTTACACGGTGGAGCTGAAGCGCTATGGGGGGCCCCTTGGCATCAC  2069

Query 1902  AATTTCAGGAACTGAAGAGCCGTTTGATCCTATAATCATTTCAAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGAA  1975
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2070  AATTTCTGGAACTGAAGAGCCGTTTGATCCTATTATCATCTCGAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGGA  2143

Query 1976  CTGGCGCAATCCACATAGGAGACCGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAAGGGAAGCCTCTGAGTGAA  2049
            ||||.||.||||||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2144  CTGGAGCGATCCACATCGGAGATAGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAGGGGAAGCCTCTGAGTGAA  2217

Query 2050  GCCATCCATTTGTTACAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCTTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAGTCAGC  2123
            ||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 2218  GCCATCCACTTGCTCCAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCCTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAATCTGC  2291

Query 2124  ATCGAGCCCCAAGAAGTTCCCTATTTCTAGCCATTTGAGTGACCTGGGGGATGTGGAGGAGGACTCCTCACCAG  2197
            |||.||.||||||||||||||.||..||.||||.|.|.|.|||||.||.||||..|||||||||.||||.|||.
Sbjct 2292  ATCAAGTCCCAAGAAGTTCCCCATCCCTGGCCACTCGGGGGACCTAGGAGATGGTGAGGAGGACCCCTCCCCAA  2365

Query 2198  CACAGAAGCCAGGCAAGCTCTCCGACATGTACCCCTCCACGGTGCCCAGTGTGGACAGTGCTGTGGATTCATGG  2271
            .||||||.||.||||||||||||||...|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 2366  TACAGAAACCTGGCAAGCTCTCCGATGCGTACCCCTCCACGGTGCCCAGCGTGGACAGTGCTGTGGACTCCTGG  2439

Query 2272  GATGGGTCTGCAATAGACACCAGCTATGGAACTGAAGGCACTAGTTTTCAGGCCTCAGGATACAATTTCAACAC  2345
            ||||||||||.||||||..||||||||||.|.|.|||||.|.|.|||||||.|.|||||||||||||.||||||
Sbjct 2440  GATGGGTCTGGAATAGATGCCAGCTATGGGAGTCAAGGCTCAACTTTTCAGACTTCAGGATACAATTACAACAC  2513

Query 2346  CTATGACTGGAGGAGTCCAAAACAGAGAGGCAGCTTGTCCCCAGTCACTAAGCCTCGAAGCCAGACTTACCCAG  2419
            ||||||.||||||||||||||.||.|||..||||.|||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2514  CTATGATTGGAGGAGTCCAAAGCAAAGAACCAGCCTGTCCCCAGTCCCCAAGCCTCGAAGCCAGACGTACCCAG  2587

Query 2420  ATGTGGGGCTGAGTTATGAAGACTGGGACCGGTCCACAGCCAGTGGTTTTGCAGGGGCTGCCGATAGTGCAGAG  2493
            |||||||.||||||.|||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.|||||||.|.||.||||||||.
Sbjct 2588  ATGTGGGCCTGAGTAATGAAGACTGGGATCGATCCACAGCCAGTGGCTTTGTAGGGGCTTCTGACAGTGCAGAT  2661

Query 2494  ACAGAACAAGAGGAGAACTTCTGGTCTCAAGCGCTGGAGGATTTGGAAACCTGCGGACAGTCAGGAATTCTGAG  2567
            .|.|||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||..||||.||||||||.|||||.||.||.|||||
Sbjct 2662  GCTGAACAAGAGGAAAACTTCTGGTCTCAAGCATTGGAGGACCTGGAGACCTGCGGCCAGTCGGGGATCCTGAG  2735

Query 2568  AGAACTGGAGGAGAAAGCTGACAGGCGTGTGTCTTTGAGAAACATGACTCTCTTGGCAACAATCATGTCGGGGA  2641
            |||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2736  AGAGCTTGAGGAGAAAGCTGACAGGCGTGTGTCATTGAGAAACATGACCCTCTTGGCAACAATCATGTCGGGGA  2809

Query 2642  GCACGATGAGTTTGAATCATGAGGCTCCAACACCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAGCGC  2715
            |.||.|||||||||||||||||||||||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 2810  GTACTATGAGTTTGAATCATGAGGCTCCAATGGCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAACGG  2883

Query 2716  AGCAGCTCGCGGCCGCACTACAGCCAAACAACTCGGAGCAACACCCTGCCTTCAGATGTGGGTAGGAAGTCAGT  2789
            |||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||
Sbjct 2884  AGCAGTTCACGGCCACACTATAGCCAAACAACTCGCAGCAACACCCTGCCCTCAGACGTGGGCAGAAAGTCTGT  2957

Query 2790  AACCCTGAGAAAAATGAAACAAGAAATAAAGGAGATCATGTCTCCAACTCCTGTGGAGCTGCACAAGGTGACCT  2863
            |||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2958  AACCCTGCGGAAAATGAAGCAAGAAATAAAGGAGATCATGTCCCCAACTCCGGTGGAGCTACACAAGGTGACCT  3031

Query 2864  TGTACAAGGACTCTGACATGGAGGACTTTGGGTTCAGTGTAGCAGATGGCTTACTGGAGAAAGGAGTGTATGTC  2937
            |.|||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 3032  TATACAAGGACTCTGGCATGGAGGACTTCGGGTTCAGTGTGGCAGATGGCCTGCTGGAGAAAGGCGTGTATGTC  3105

Query 2938  AAAAATATTCGCCCAGCTGGGCCAGGAGATCTTGGTGGCTTAAAGCCCTATGACAGGCTCTTACAGGTGAATCA  3011
            ||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 3106  AAAAATATCCGCCCAGCTGGGCCAGGTGATGTTGGGGGCTTGAAGCCCTACGACAGGCTCTTACAGGTAAATCA  3179

Query 3012  TGTCCGAACCAGAGACTTTGACTGCTGCCTTGTTGTGCCCCTCATAGCAGAATCCGGGAATAAGCTGGACCTGG  3085
            .||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 3180  CGTGCGGACGAGAGACTTTGACTGCTGCCTGGTGGTGCCTCTCATAGCTGAATCTGGCAACAAGCTGGACCTGG  3253

Query 3086  TTATTAGTAGAAACCCACTGGCTTCACAGAAGTCTATAGACCAACAGAGTCTACCAGGAGATTGGAGTGAACAG  3159
            |||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|.|..|||.||..|.||.|||||.||||||
Sbjct 3254  TTATTAGCAGAAATCCACTGGCCTCCCAGAAGTCGATAGAACAGCCGGCTCTGCCCAGCGACTGGAGCGAACAG  3327

Query 3160  AACAGTGCTTTTTTCCAGCAGCCTAGCCACGGTGGTAATTTGGAGACACGAGAACCCACTAATACATTA  3228
            |||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct 3328  AACAGCGCTTTCTTCCAGCAACCCAGCCACGGTGGTAATCTAGAGACACGAGAACCCACTAACACACTA  3396