Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468758
• Subject: XM_006514238.2
• Aligned Length: 3430
• Identities: 2841
• Gaps: 245

Alignment

Query    1  ATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGTTGTC----------AAAT-----TCTGAGGCGACTTACTAA------  53
                                ||||||  |.|          |.||     ||||      ||||| ||      
Sbjct    1  --------------------ATGCCG--GGCTGGAAGAAGAACATCCCCATCTG------CTTAC-AAGCGGAG  45

Query   54  -----------AGATGAGAGTCCCTACACTAAATCCGCCAGCCAGACAAAGCCGCCTGATGGAGCGTTGGCTGT  116
                       ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct   46  GAGCAGGAGAGAGATGAGAGTCCCTACACTAAATCTGCCAGCCAGACAAAGCCGCCCGATGGAGCATTGGCTGT  119

Query  117  GAGGAGACAGAGCATCCCAGAGGAATTCAAGGGCTCCACAGTCGTCGAGCTGATGAAGAAGGAAGGCACTACCC  190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.||.||.||.|
Sbjct  120  GAGGAGACAGAGCATCCCAGAGGAATTCAAGGGCTCCACAGTGGTGGAGTTGATGAAGAAGGAGGGAACCACTC  193

Query  191  TGGGTCTGACGGTATCGGGAGGAATTGATAAGGATGGCAAGCCAAGAGTATCTAATCTGCGGCAAGGAGGAATT  264
            |.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.
Sbjct  194  TTGGCCTGACGGTATCGGGAGGCATTGATAAAGATGGCAAGCCAAGAGTGTCCAACCTGCGGCAGGGAGGAATC  267

Query  265  GCTGCTAGAAGTGACCAGCTGGATGTGGGTGACTACATCAAAGCAGTGAATGGAATCAACCTGGCCAAATTCCG  338
            |||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  268  GCTGCCAGAAGTGACCAGCTGGATGTGGGCGACTACATCAAGGCGGTGAATGGGATCAACCTGGCCAAGTTCCG  341

Query  339  CCATGACGAGATCATCAGCTTGCTGAAGAATGTGGGAGAAAGAGTGGTTCTTGAAGTAGAGTACGAGCTTCCAC  412
            |||.||.||||||||||||.|||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct  342  CCACGATGAGATCATCAGCCTGCTGAAAAATGTCGGGGAAAGAGTGGTCCTGGAGGTCGAGTACGAGCTTCCAC  415

Query  413  CGGTCTCTGTGCAAGGATCAAGTGTTATTTTCCGAACAGTGGAGGTCACATTACATAAAGAAGGCAATACCTTT  486
            ||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||||
Sbjct  416  CGGTCTCTGTACAAGGATCCAGTGTTATGTTCCGAACTGTGGAGGTCACGCTGCACAAAGAAGGCAACACCTTT  489

Query  487  GGTTTTGTAATTCGAGGGGGAGCACATGATGATAGAAATAAATCTCGTCCAGTTGTGATAACATGTGTTCGTCC  560
            ||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  490  GGTTTTGTCATCCGAGGGGGAGCGCATGATGACAGGAACAAGTCCCGTCCGGTTGTGATAACCTGTGTTCGTCC  563

Query  561  TGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACGATCAAACCCGGTGACAGGTTGCTCAGTGTGGATGGAATTCGGCTTC  634
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  564  TGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACCATCAAACCTGGAGACAGGTTGCTCAGCGTGGATGGAATTCGGCTCC  637

Query  635  TTGGAACTACGCATGCTGAAGCCATGAGTATTCTTAAACAATGTGGACAAGAAGCAGCACTGCTGATAGAATAT  708
            |.|||||.||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||||||||.
Sbjct  638  TGGGAACCACCCATGCCGAGGCCATGAGCATCCTTAAACAGTGCGGACAAGAAGCCACGCTGCTGATAGAATAC  711

Query  709  GATGTCTCAGTAATGGACTCTGTGGCAACAGCATCCGGGCCACTACTAGTCGAAGTTGCCAAAACTCCTGGTGC  782
            ||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  712  GATGTCTCTGTGATGGATTCTGTGGCGACAGCATCCGGGCCACTACTAGTTGAAGTTGCCAAAACTCCAGGTGC  785

Query  783  CAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCGATGTGCTGTAACAAACAAGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTG  856
            |||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  786  CAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCCGTGTGCTGTAACAAGCAGGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTG  859

Query  857  CAAGTATTGCAGACAGATGTGGCGCATTGCATGTGGGAGATCACATCCTCTCCATCGATGGAACCAGCATGGAG  930
            ||||.|||||.||||||||||||||..|.||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||||||
Sbjct  860  CAAGCATTGCGGACAGATGTGGCGCGCTACACGTGGGAGACCACATCCTCTCCATTGACGGCACGAGTATGGAG  933

Query  931  TACTGTACACTTGCAGAAGCAACCCAGTTCCTGGCCAACACCACTGACCAGGTCAAGCTTGAGATCCTTCCCCA  1004
            ||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct  934  TACTGTACCCTCGCAGAAGCGACCCAGTTCCTGGCCAATACCACTGACCAGGTCAAGCTGGAGATTCTCCCACA  1007

Query 1005  TCATCAGACCCGGCTGGCCCTAAAGGGGCCCGACCATG------------------------------------  1042
            .|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||                                    
Sbjct 1008  CCATCAGACCCGCCTGGCCCTAAAGGGCCCTGACCATGTGAAAATTCAGAGGAGCGACAGACAACATCCCTGGG  1081

Query 1043  --------------------------------------------------------------------------  1042
                                                                                      
Sbjct 1082  ATGCCTGGGCCAGCAACCAGTGCGGCGTTCATACCAACCATCACCATAACACGTACCACCCAGACCATTGCAGA  1155

Query 1043  ----------------------------------------------CAGCTTTGGTGTCTTCATCCTTCTCTCC  1070
                                                          |.|||.|||||.|.|||||   .|||||
Sbjct 1156  GTGCCAGCCCTGACTTTCCCGAAAGCGCTTCCTCCAAACAGCCCTCCGGCTATGGTGCCCTCATC---TTCTCC  1226

Query 1071  TACCTCCATGAGTGCATACAGCCTGAGTTCCCTGAACATGGGGACTCTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCC  1144
            |||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1227  TACCTCCATGAGTGCGTACAGTCTGAGTTCCCTGAACATGGGGACTTTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCC  1300

Query 1145  CACGTGGAACCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCATTGTCCTTAGCCTCCAGCACA  1218
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.
Sbjct 1301  CACGAGGAACCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCACTGTCTTTAGCCTCCAGCACT  1374

Query 1219  GTAGGATTGGCTGGGCAGGTTGTTCACACAGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCAGATCCTGTCACAGGATT  1292
            ||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||
Sbjct 1375  GTGGGGTTGGCTGGCCAGGTCGTTCACACTGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCTGACCCTGTCACGGGCTT  1448

Query 1293  TGGGATCCAACTGCAGGGCAGTGTGTTTGCCACAGAAACTCTCTCTTCTCCACCTCTGATTTCCTATATCGAAG  1366
            .||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1449  CGGAATCCAACTGCAGGGCAGCGTGTTTGCCACAGAGACGCTCTCCTCTCCGCCTCTGATTTCCTATATTGAAG  1522

Query 1367  CTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGGGTGCTACAGATTGGAGACAGAGTGATGGCCATCAATGGAATTCCAACA  1440
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1523  CTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGTGTGCTACAGATTGGAGACAGAGTCATGGCCATTAATGGAATCCCAACA  1596

Query 1441  GAAGACAGCACCTTCGAAGAAGCCAGTCAGCTCCTCCGAGACTCTTCAATCACGAGCAAGGTCACACTGGAAAT  1514
            |||||||||||||||||.|||||||.|||.|||||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1597  GAAGACAGCACCTTCGAGGAAGCCAATCAACTCCTGAGAGACTCTTCCATCACGAGCAAAGTCACACTAGAAAT  1670

Query 1515  CGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAGCTGCCTAAGAAGCACAATG  1588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||..|
Sbjct 1671  CGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAACTGCCCAAGAAGCACAGCG  1744

Query 1589  TGGAACTTGGAATAACCATAAGTTCACCATCCAGTAGAAAACCAGGAGACCCCCTCGTCATTTCAGATATCAAG  1662
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1745  TGGAACTTGGAATAACCATCAGTTCGCCATCCAGTAGAAAACCGGGGGACCCCCTTGTCATTTCAGATATCAAG  1818

Query 1663  AAAGGGAGTGTGGCACACAGAACTGGGACCCTGGAACTTGGGGATAAATTGCTCGCAATAGATAATATCCGGCT  1736
            |||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.|||.||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 1819  AAAGGCAGTGTGGCACACAGAACCGGAACTCTGGAACTGGGAGACAAACTGCTTGCGATAGATAACATCCGGCT  1892

Query 1737  GGACAACTGTTCCATGGAAGATGCAGTTCAGATCCTCCAGCAATGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCA  1810
            |||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1893  GGATAACTGTTCCATGGAAGATGCGGTCCAGATCCTCCAGCAGTGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCA  1966

Query 1811  AAGATGAAGATAATTCAGATGAGCAAGAAAGTTCCGGAGCAATTATTTACACCGTGGAGCTTAAACGCTACGGG  1884
            |||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1967  AAGATGAAGATAACTCAGACGAGCAAGAGAGTTCCGGAGCGATTATTTACACGGTGGAGCTGAAGCGCTATGGG  2040

Query 1885  GGGCCCCTTGGCATCACAATTTCAGGAACTGAAGAGCCGTTTGATCCTATAATCATTTCAAGCCTCACTAAAGG  1958
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct 2041  GGGCCCCTTGGCATCACAATTTCTGGAACTGAAGAGCCGTTTGATCCTATTATCATCTCGAGCCTCACTAAAGG  2114

Query 1959  GGGATTAGCTGAAAGAACTGGCGCAATCCACATAGGAGACCGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAAG  2032
            |||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2115  GGGATTAGCTGAAAGGACTGGAGCGATCCACATCGGAGATAGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAGG  2188

Query 2033  GGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCATTTGTTACAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCTTGAAAATTAAGAAACAG  2106
            |||||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2189  GGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCACTTGCTCCAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCCTGAAAATTAAGAAACAG  2262

Query 2107  ACAGATGCCCAGTCAGCATCGAGCCCCAAGAAGTTCCCTATTTCTAGCCATTTGAGTGACCTGGGGGATGTGGA  2180
            |||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||..||.||||.|.|.|.|||||.||.||||..||
Sbjct 2263  ACAGATGCCCAATCTGCATCAAGTCCCAAGAAGTTCCCCATCCCTGGCCACTCGGGGGACCTAGGAGATGGTGA  2336

Query 2181  GGAGGACTCCTCACCAGCACAGAAGCCAGGCAAGCTCTCCGACATGTACCCCTCCACGGTGCCCAGTGTGGACA  2254
            |||||||.||||.|||..||||||.||.||||||||||||||...|||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2337  GGAGGACCCCTCCCCAATACAGAAACCTGGCAAGCTCTCCGATGCGTACCCCTCCACGGTGCCCAGCGTGGACA  2410

Query 2255  GTGCTGTGGATTCATGGGATGGGTCTGCAATAGACACCAGCTATGGAACTGAAGGCACTAGTTTTCAGGCCTCA  2328
            ||||||||||.||.|||||||||||||.||||||..||||||||||.|.|.|||||.|.|.|||||||.|.|||
Sbjct 2411  GTGCTGTGGACTCCTGGGATGGGTCTGGAATAGATGCCAGCTATGGGAGTCAAGGCTCAACTTTTCAGACTTCA  2484

Query 2329  GGATACAATTTCAACACCTATGACTGGAGGAGTCCAAAACAGAGAGGCAGCTTGTCCCCAGTCACTAAGCCTCG  2402
            ||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||.||.|||..||||.|||||||||||.|.||||||||
Sbjct 2485  GGATACAATTACAACACCTATGATTGGAGGAGTCCAAAGCAAAGAACCAGCCTGTCCCCAGTCCCCAAGCCTCG  2558

Query 2403  AAGCCAGACTTACCCAGATGTGGGGCTGAGTTATGAAGACTGGGACCGGTCCACAGCCAGTGGTTTTGCAGGGG  2476
            |||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct 2559  AAGCCAGACGTACCCAGATGTGGGCCTGAGTAATGAAGACTGGGATCGATCCACAGCCAGTGGCTTTGTAGGGG  2632

Query 2477  CTGCCGATAGTGCAGAGACAGAACAAGAGGAGAACTTCTGGTCTCAAGCGCTGGAGGATTTGGAAACCTGCGGA  2550
            ||.|.||.||||||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||..||||.||||||||.
Sbjct 2633  CTTCTGACAGTGCAGATGCTGAACAAGAGGAAAACTTCTGGTCTCAAGCATTGGAGGACCTGGAGACCTGCGGC  2706

Query 2551  CAGTCAGGAATTCTGAGAGAACTGGAGGAGAAAGCTGACAGGCGTGTGTCTTTGAGAAACATGACTCTCTTGGC  2624
            |||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2707  CAGTCGGGGATCCTGAGAGAGCTTGAGGAGAAAGCTGACAGGCGTGTGTCATTGAGAAACATGACCCTCTTGGC  2780

Query 2625  AACAATCATGTCGGGGAGCACGATGAGTTTGAATCATGAGGCTCCAACACCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGG  2698
            ||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||...||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2781  AACAATCATGTCGGGGAGTACTATGAGTTTGAATCATGAGGCTCCAATGGCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGG  2854

Query 2699  CCAGCTTCCAGGAGCGCAGCAGCTCGCGGCCGCACTACAGCCAAACAACTCGGAGCAACACCCTGCCTTCAGAT  2772
            |||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 2855  CCAGCTTCCAGGAACGGAGCAGTTCACGGCCACACTATAGCCAAACAACTCGCAGCAACACCCTGCCCTCAGAC  2928

Query 2773  GTGGGTAGGAAGTCAGTAACCCTGAGAAAAATGAAACAAGAAATAAAGGAGATCATGTCTCCAACTCCTGTGGA  2846
            |||||.||.|||||.|||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 2929  GTGGGCAGAAAGTCTGTAACCCTGCGGAAAATGAAGCAAGAAATAAAGGAGATCATGTCCCCAACTCCGGTGGA  3002

Query 2847  GCTGCACAAGGTGACCTTGTACAAGGACTCTGACATGGAGGACTTTGGGTTCAGTGTAGCAGATGGCTTACTGG  2920
            |||.||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.||||
Sbjct 3003  GCTACACAAGGTGACCTTATACAAGGACTCTGGCATGGAGGACTTCGGGTTCAGTGTGGCAGATGGCCTGCTGG  3076

Query 2921  AGAAAGGAGTGTATGTCAAAAATATTCGCCCAGCTGGGCCAGGAGATCTTGGTGGCTTAAAGCCCTATGACAGG  2994
            |||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 3077  AGAAAGGCGTGTATGTCAAAAATATCCGCCCAGCTGGGCCAGGTGATGTTGGGGGCTTGAAGCCCTACGACAGG  3150

Query 2995  CTCTTACAGGTGAATCATGTCCGAACCAGAGACTTTGACTGCTGCCTTGTTGTGCCCCTCATAGCAGAATCCGG  3068
            |||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 3151  CTCTTACAGGTAAATCACGTGCGGACGAGAGACTTTGACTGCTGCCTGGTGGTGCCTCTCATAGCTGAATCTGG  3224

Query 3069  GAATAAGCTGGACCTGGTTATTAGTAGAAACCCACTGGCTTCACAGAAGTCTATAGACCAACAGAGTCTACCAG  3142
            .||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|.|..|||.||..
Sbjct 3225  CAACAAGCTGGACCTGGTTATTAGCAGAAATCCACTGGCCTCCCAGAAGTCGATAGAACAGCCGGCTCTGCCCA  3298

Query 3143  GAGATTGGAGTGAACAGAACAGTGCTTTTTTCCAGCAGCCTAGCCACGGTGGTAATT--TGGAGACACGAGAAC  3214
            |.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||| .|||  ||||||         
Sbjct 3299  GCGACTGGAGCGAACAGAACAGCGCTTTCTTCCAGCAACCCAGCCACGGTGG-GATTCCTGGAGA---------  3362

Query 3215  CCACT-AATACATTA-----------  3228
             .||| .||||.||.           
Sbjct 3363  -TACTGTATACTTTTGGCAAAGCCTC  3387