Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000468759
Subject:
NM_002208.5
Aligned Length:
3537
Identities:
3533
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGTGGCTCTTCCACACTCTGCTCTGCATAGCCAGCCTGGCCCTGCTGGCCGCTTTCAATGTGGATGTGGCCCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGGCTCTTCCACACTCTGCTCTGCATAGCCAGCCTGGCCCTGCTGGCCGCTTTCAATGTGGATGTGGCCCG  74

Query   75  GCCCTGGCTCACGCCCAAGGGAGGTGCCCCTTTCGTGCTCAGCTCCCTTCTGCACCAAGACCCCAGCACCAACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCCTGGCTCACGCCCAAGGGAGGTGCCCCTTTCGTGCTCAGCTCCCTTCTGCACCAAGACCCCAGCACCAACC  148

Query  149  AGACCTGGCTCCTGGTCACCAGCCCCAGAACCAAGAGGACACCAGGGCCCCTCCATCGATGTTCCCTTGTCCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGACCTGGCTCCTGGTCACCAGCCCCAGAACCAAGAGGACACCAGGGCCCCTCCATCGATGTTCCCTTGTCCAG  222

Query  223  GATGAAATCCTTTGCCATCCTGTAGAGCATGTCCCCATCCCCAAGGGGAGGCACCGGGGAGTGACCGTTGTCCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATGAAATCCTTTGCCATCCTGTAGAGCATGTCCCCATCCCCAAGGGGAGGCACCGGGGAGTGACCGTTGTCCG  296

Query  297  GAGCCACCACGGTGTTTTGATATGCATTCAAGTGCTGGTCCGGCGGCCTCACAGCCTCAGCTCAGAACTCACAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAGCCACCACGGTGTTTTGATATGCATTCAAGTGCTGGTCCGGCGGCCTCACAGCCTCAGCTCAGAACTCACAG  370

Query  371  GCACCTGTAGCCTCCTGGGCCCTGACCTCCGTCCCCAGGCTCAGGCCAACTTCTTCGACCTTGAAAATCTCCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCACCTGTAGCCTCCTGGGCCCTGACCTCCGTCCCCAGGCTCAGGCCAACTTCTTCGACCTTGAAAATCTCCTG  444

Query  445  GATCCAGATGCACGTGTGGACACTGGAGACTGCTACAGCAACAAAGAAGGCGGTGGAGAAGACGATGTGAACAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATCCAGATGCACGTGTGGACACTGGAGACTGCTACAGCAACAAAGAAGGCGGTGGAGAAGACGATGTGAACAC  518

Query  519  AGCCAGGCAGCGCCGGGCTCTGGAGAAGGAGGAGGAGGAAGACAAGGAGGAGGAGGAAGACGAGGAGGAGGAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCCAGGCAGCGCCGGGCTCTGGAGAAGGAGGAGGAGGAAGACAAGGAGGAGGAGGAAGACGAGGAGGAGGAGG  592

Query  593  AAGCTGGCACCGAGATTGCCATCATCCTGGATGGCTCAGGAAGCATTGATCCCCCAGACTTTCAGAGAGCCAAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGCTGGCACCGAGATTGCCATCATCCTGGATGGCTCAGGAAGCATTGATCCCCCAGACTTTCAGAGAGCCAAA  666

Query  667  GACTTCATCTCCAACATGATGAGGAACTTCTATGAAAAGTGTTTTGAGTGCAACTTTGCCTTGGTGCAGTATGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACTTCATCTCCAACATGATGAGGAACTTCTATGAAAAGTGTTTTGAGTGCAACTTTGCCTTGGTGCAGTATGG  740

Query  741  AGGAGTGATCCAGACTGAGTTTGACCTTCGGGACAGCCAGGATGTGATGGCCTCCCTCGCCAGAGTCCAGAACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGAGTGATCCAGACTGAGTTTGACCTTCGGGACAGCCAGGATGTGATGGCCTCCCTCGCCAGAGTCCAGAACA  814

Query  815  TCACTCAAGTGGGGAGTGTCACCAAGACTGCCTCAGCCATGCAACACGTCTTAGACAGCATCTTCACCTCAAGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCACTCAAGTGGGGAGTGTCACCAAGACTGCCTCAGCCATGCAACACGTCTTAGACAGCATCTTCACCTCAAGC  888

Query  889  CACGGCTCCAGGAGAAAGGCATCCAAGGTCATGGTGGTGCTCACCGATGGTGGCATATTCGAGGACCCCCTCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CACGGCTCCAGGAGAAAGGCATCCAAGGTCATGGTGGTGCTCACCGATGGTGGCATATTCGAGGACCCCCTCAA  962

Query  963  CCTTACGACAGTCATCAACTCCCCCAAAATGCAGGGTGTTGAGCGCTTTGCCATTGGGGTGGGAGAAGAATTTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCTTACGACAGTCATCAACTCCCCCAAAATGCAGGGTGTTGAGCGCTTTGCCATTGGGGTGGGAGAAGAATTTA  1036

Query 1037  AGAGTGCTAGGACTGCGAGGGAACTGAACCTGATCGCCTCAGACCCGGATGAGACCCATGCTTTCAAGGTGACC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAGTGCTAGGACTGCGAGGGAACTGAACCTGATCGCCTCAGACCCGGATGAGACCCATGCTTTCAAGGTGACC  1110

Query 1111  AACTACATGGCGCTGGATGGGCTGCTGAGCAAACTGCGGTACAACATCATCAGCATGGAAGGCACGGTTGGAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACTACATGGCGCTGGATGGGCTGCTGAGCAAACTGCGGTACAACATCATCAGCATGGAAGGCACGGTTGGAGA  1184

Query 1185  CGCCCTTCACTACCAGCTGGCACAGATTGGCTTCAGTGCTCAGATCCTGGATGAGCGGCAGGTGCTGCTCGGCG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGCCCTTCACTACCAGCTGGCACAGATTGGCTTCAGTGCTCAGATCCTGGATGAGCGGCAGGTGCTGCTCGGCG  1258

Query 1259  CCGTCGGGGCCTTTGACTGGTCCGGAGGGGCGTTGCTCTACGACACACGCAGCCGCCGGGGCCGCTTCCTGAAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCGTCGGGGCCTTTGACTGGTCCGGAGGGGCGTTGCTCTACGACACACGCAGCCGCCGGGGCCGCTTCCTGAAC  1332

Query 1333  CAGACAGCGGCGGCGGCGGCAGACGCGGAGGCTGCGCAGTACAGCTACCTGGGTTACGCTGTGGCCGTGCTGCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGACAGCGGCGGCGGCGGCAGACGCGGAGGCTGCGCAGTACAGCTACCTGGGTTACGCTGTGGCCGTGCTGCA  1406

Query 1407  CAAGACCTGCAGCCTCTCCTACGTCGCGGGGGCTCCACAGTACAAACATCATGGGGCCGTGTTTGAGCTCCAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAAGACCTGCAGCCTCTCCTACATCGCGGGGGCTCCACGGTACAAACATCATGGGGCCGTGTTTGAGCTCCAGA  1480

Query 1481  AGGAGGGCAGAGAGGCCAGCTTCCTGCCAGTGCTGGAGGGAGAGCAGATGGGGTCCTATTTTGGCTCTGAGCTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGAGGGCAGAGAGGCCAGCTTCCTGCCAGTGCTGGAGGGAGAGCAGATGGGGTCCTATTTTGGCTCTGAGCTG  1554

Query 1555  TGCCCTGTGGACATTGACATGGATGGAAGCACGGACTTCTTGCTGGTGGCTGCTCCATTTTACCACGTTCATGG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGCCCTGTGGACATTGACATGGATGGAAGCACGGACTTCTTGCTGGTGGCTGCTCCATTTTACCACGTTCATGG  1628

Query 1629  AGAAGAAGGCAGAGTCTACGTGTACCGTCTCAGCGAGCAGGATGGTTCTTTCTCCTTGGCACGCATACTGAGTG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGAAGAAGGCAGAGTCTACGTGTACCGTCTCAGCGAGCAGGATGGTTCTTTCTCCTTGGCACGCATACTGAGTG  1702

Query 1703  GGCACCCCGGGTTCACCAATGCCCGCTTTGGCTTTGCCATGGCGGCTATGGGGGATCTCAGTCAGGATAAGCTC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GGCACCCCGGGTTCACCAATGCCCGCTTTGGCTTTGCCATGGCGGCTATGGGGGATCTCAGTCAGGATAAGCTC  1776

Query 1777  ACAGATGTGGCCATCGGGGCCCCCCTGGAAGGTTTTGGGGCAGATGATGGTGCCAGCTTCGGCAGTGTGTATAT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ACAGATGTGGCCATCGGGGCCCCCCTGGAAGGTTTTGGGGCAGATGATGGTGCCAGCTTCGGCAGTGTGTATAT  1850

Query 1851  CTACAATGGACACTGGGACGGCCTCTCCGCCAGCCCCTCGCAGCGGATCAGAGCCTCCACGGTGGCCCCAGGAC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CTACAATGGACACTGGGACGGCCTCTCCGCCAGCCCCTCGCAGCGGATCAGAGCCTCCACGGTGGCCCCAGGAC  1924

Query 1925  TCCAGTACTTCGGCATGTCCATGGCTGGTGGCTTTGATATTAGTGGCGACGGCCTTGCCGACATCACCGTGGGC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TCCAGTACTTCGGCATGTCCATGGCTGGTGGCTTTGATATTAGTGGCGACGGCCTTGCCGACATCACCGTGGGC  1998

Query 1999  ACTCTGGGCCAGGCGGTTGTGTTCCGCTCCCGGCCTGTGGTTCGCCTGAAGGTCTCCATGGCCTTCACCCCCAG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ACTCTGGGCCAGGCGGTTGTGTTCCGCTCCCGGCCTGTGGTTCGCCTGAAGGTCTCCATGGCCTTCACCCCCAG  2072

Query 2073  CGCACTGCCCATCGGCTTCAACGGCGTCGTGAATGTCCGTTTATGTTTTGAAATCAGCTCTGTAACCACAGCCT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CGCACTGCCCATCGGCTTCAACGGCGTCGTGAATGTCCGTTTATGTTTTGAAATCAGCTCTGTAACCACAGCCT  2146

Query 2147  CTGAGTCAGGCCTCCGTGAGGCACTTCTCAACTTCACGCTGGATGTGGATGTGGGGAAGCAGAGGAGACGGCTG  2220
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CTGAGTCAGGCCTCCGCGAGGCACTTCTCAACTTCACGCTGGATGTGGATGTGGGGAAGCAGAGGAGACGGCTG  2220

Query 2221  CAGTGTTCAGACGTAAGAAGCTGTCTGGGCTGCCTGAGGGAGTGGAGCAGCGGATCCCAGCTTTGTGAGGACCT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CAGTGTTCAGACGTAAGAAGCTGTCTGGGCTGCCTGAGGGAGTGGAGCAGCGGATCCCAGCTTTGTGAGGACCT  2294

Query 2295  CCTGCTCATGCCCACAGAGGGAGAGCTCTGTGAGGAGGACTGCTTCTCCAATGCCAGTGTCAAAGTCAGCTACC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CCTGCTCATGCCCACAGAGGGAGAGCTCTGTGAGGAGGACTGCTTCTCCAATGCCAGTGTCAAAGTCAGCTACC  2368

Query 2369  AGCTCCAGACCCCTGAGGGACAGACGGACCATCCCCAGCCCATCCTGGACCGCTACACTGAGCCCTTTGCCATC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AGCTCCAGACCCCTGAGGGACAGACGGACCATCCCCAGCCCATCCTGGACCGCTACACTGAGCCCTTTGCCATC  2442

Query 2443  TTCCAGCTGCCCTATGAGAAGGCCTGCAAGAATAAGCTGTTTTGTGTCGCAGAATTACAGTTGGCCACCACCGT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  TTCCAGCTGCCCTATGAGAAGGCCTGCAAGAATAAGCTGTTTTGTGTCGCAGAATTACAGTTGGCCACCACCGT  2516

Query 2517  CTCTCAGCAGGAGTTGGTGGTGGGTCTCACAAAGGAGCTGACCCTGAACATTAACCTAACTAACTCCGGGGAAG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CTCTCAGCAGGAGTTGGTGGTGGGTCTCACAAAGGAGCTGACCCTGAACATTAACCTAACTAACTCCGGGGAAG  2590

Query 2591  ATTCCTACATGACAAGCATGGCCTTGAATTACCCCAGAAACCTGCAGTTGAAGAGGATGCAAAAGCCTCCCTCT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  ATTCCTACATGACAAGCATGGCCTTGAATTACCCCAGAAACCTGCAGTTGAAGAGGATGCAAAAGCCTCCCTCT  2664

Query 2665  CCAAACATTCAGTGTGATGACCCTCAGCCGGTTGCTTCTGTCCTGATCATGAACTGCAGGATTGGTCACCCCGT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CCAAACATTCAGTGTGATGACCCTCAGCCGGTTGCTTCTGTCCTGATCATGAACTGCAGGATTGGTCACCCCGT  2738

Query 2739  CCTCAAGAGGTCATCTGCTCATGTTTCAGTCGTTTGGCAGCTAGAGGAGAATGCCTTTCCAAACAGGACAGCAG  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CCTCAAGAGGTCATCTGCTCATGTTTCAGTCGTTTGGCAGCTAGAGGAGAATGCCTTTCCAAACAGGACAGCAG  2812

Query 2813  ACATCACTGTGACTGTCACCAATTCCAATGAAAGACGGTCTTTGGCCAACGAGACCCACACCCTTCAATTCAGG  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  ACATCACTGTGACTGTCACCAATTCCAATGAAAGACGGTCTTTGGCCAACGAGACCCACACCCTTCAATTCAGG  2886

Query 2887  CATGGCTTCGTTGCAGTTCTGTCCAAACCATCCATAATGTACGTGAACACAGGCCAGGGGCTTTCTCACCACAA  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  CATGGCTTCGTTGCAGTTCTGTCCAAACCATCCATAATGTACGTGAACACAGGCCAGGGGCTTTCTCACCACAA  2960

Query 2961  AGAATTCCTCTTCCATGTACATGGGGAGAACCTCTTTGGAGCAGAATACCAGTTGCAAATTTGCGTCCCAACCA  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  AGAATTCCTCTTCCATGTACATGGGGAGAACCTCTTTGGAGCAGAATACCAGTTGCAAATTTGCGTCCCAACCA  3034

Query 3035  AATTACGAGGTCTCCAGGTTGCAGCAGTGAAGAAGCTGACGAGGACTCAGGCCTCCACGGTGTGCACCTGGAGT  3108
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  AATTACGAGGTCTCCAGGTTGTAGCAGTGAAGAAGCTGACGAGGACTCAGGCCTCCACGGTGTGCACCTGGAGT  3108

Query 3109  CAGGAGCGCGCTTGTGCGTACAGTTCGGTTCAGCATGTGGAAGAATGGCATTCAGTGAGCTGTGTCATCGCTTC  3182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  CAGGAGCGCGCTTGTGCGTACAGTTCGGTTCAGCATGTGGAAGAATGGCATTCAGTGAGCTGTGTCATCGCTTC  3182

Query 3183  AGATAAAGAAAATGTCACCGTGGCTGCAGAGATCTCCTGGGATCACTCTGAGGAGTTACTAAAAGATGTAACTG  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  AGATAAAGAAAATGTCACCGTGGCTGCAGAGATCTCCTGGGATCACTCTGAGGAGTTACTAAAAGATGTAACTG  3256

Query 3257  AACTGCAGATCCTTGGTGAAATATCTTTCAACAAATCTCTATATGAGGGACTGAATGCAGAGAACCACAGAACT  3330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  AACTGCAGATCCTTGGTGAAATATCTTTCAACAAATCTCTATATGAGGGACTGAATGCAGAGAACCACAGAACT  3330

Query 3331  AAGATCACTGTCGTCTTCCTGAAAGATGAGAAGTACCATTCTTTGCCTATCATCATTAAAGGCAGCGTTGGTGG  3404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  AAGATCACTGTCGTCTTCCTGAAAGATGAGAAGTACCATTCTTTGCCTATCATCATTAAAGGCAGCGTTGGTGG  3404

Query 3405  ACTTCTGGTGTTGATCGTGATTCTGGTCATCCTGTTCAAGTGTGGCTTTTTTAAAAGAAAATATCAACAACTGA  3478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405  ACTTCTGGTGTTGATCGTGATTCTGGTCATCCTGTTCAAGTGTGGCTTTTTTAAAAGAAAATATCAACAACTGA  3478

Query 3479  ACTTGGAGAGCATCAGGAAGGCCCAGCTGAAATCAGAGAATCTGCTCGAAGAAGAGAAT  3537
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479  ACTTGGAGAGCATCAGGAAGGCCCAGCTGAAATCAGAGAATCTGCTCGAAGAAGAGAAT  3537