Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468759
- Subject:
- XM_017024587.1
- Aligned Length:
- 3588
- Identities:
- 2490
- Gaps:
- 1095
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------ATGTGGCTCTTCCACACTCTGCT 23
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTGTCGCACTCGCCTCGGCTCCCACACAGCCGCCTCTGCTCCAGCAAGGATGTGGCTCTTCCACACTCTGCT 74
Query 24 CTGCATAGCCAGCCTGGCCCTGCTGGCCGCTTTCAATGTGGATGTGGCCCGGCCCTGGCTCACGCCCAAGGGAG 97
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTGCATAGCCAGCCTGGCCCTGCTGGCCGCTTTCAATGTGGATGTGGCCCGGCCCTGGCTCACGCCCAAGGGAG 148
Query 98 GTGCCCCTTTCGTGCTCAGCTCCCTTCTGCACCAAGACCCCAGCACCAACCAGACCTGGCTCCTGGTCACCAGC 171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GTGCCCCTTTCGTGCTCAGCTCCCTTCTGCACCAAGACCCCAGCACCAACCAGACCTGGCTCCTGGTCACCAGC 222
Query 172 CCCAGAACCAAGAGGACACCAGGGCCCCTCCATCGATGTTCCCTTGTCCAGGATGAAATCCTTTGCCATCCTGT 245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCCAGAACCAAGAGGACACCAGGGCCCCTCCATCGATGTTCCCTTGTCCAGGATGAAATCCTTTGCCATCCTGT 296
Query 246 AGAGCATGTCCCCATCCCCAAGGGGAGGCACCGGGGAGTGACCGTTGTCCGGAGCCACCACGGTGTTTTGATAT 319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGAGCATGTCCCCATCCCCAAGGGGAGGCACCGGGGAGTGACCGTTGTCCGGAGCCACCACGGTGTTTTGATAT 370
Query 320 GCATTCAAGTGCTGGTCCGGCGGCCTCACAGCCTCAGCTCAGAACTCACAGGCACCTGTAGCCTCCTGGGCCCT 393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCATTCAAGTGCTGGTCCGGCGGCCTCACAGCCTCAGCTCAGAACTCACAGGCACCTGTAGCCTCCTGGGCCCT 444
Query 394 GACCTCCGTCCCCAGGCTCAGGCCAACTTCTTCGACCTTGAAAATCTCCTGGATCCAGATGCACGTGTGGACAC 467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GACCTCCGTCCCCAGGCTCAGGCCAACTTCTTCGACCTTGAAAATCTCCTGGATCCAGATGCACGTGTGGACAC 518
Query 468 TGGAGACTGCTACAGCAACAAAGAAGGCGGTGGAGAAGACGATGTGAACACAGCCAGGCAGCGCCGGGCTCTGG 541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGGAGACTGCTACAGCAACAAAGAAGGCGGTGGAGAAGACGATGTGAACACAGCCAGGCAGCGCCGGGCTCTGG 592
Query 542 AGAAGGAGGAGGAGGAAGACAAGGAGGAGGAGGAAGACGAGGAGGAGGAGGAAGCTGGCACCGAGATTGCCATC 615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGAAGGAGGAGGAGGAAGACAAGGAGGAGGAGGAAGACGAGGAGGAGGAGGAAGCTGGCACCGAGATTGCCATC 666
Query 616 ATCCTGGATGGCTCAGGAAGCATTGATCCCCCAGACTTTCAGAGAGCCAAAGACTTCATCTCCAACATGATGAG 689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATCCTGGATGGCTCAGGAAGCATTGATCCCCCAGACTTTCAGAGAGCCAAAGACTTCATCTCCAACATGATGAG 740
Query 690 GAACTTCTATGAAAAGTGTTTTGAGTGCAACTTTGCCTTGGTGCAGTATGGAGGAGTGATCCAGACTGAGTTTG 763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAACTTCTATGAAAAGTGTTTTGAGTGCAACTTTGCCTTGGTGCAGTATGGAGGAGTGATCCAGACTGAGTTTG 814
Query 764 ACCTTCGGGACAGCCAGGATGTGATGGCCTCCCTCGCCAGAGTCCAGAACATCACTCAAGTGGGGAGTGTCACC 837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACCTTCGGGACAGCCAGGATGTGATGGCCTCCCTCGCCAGAGTCCAGAACATCACTCAAGTGGGGAGTGTCACC 888
Query 838 AAGACTGCCTCAGCCATGCAACACGTCTTAGACAGCATCTTCACCTCAAGCCACGGCTCCAGGAGAAAGGCATC 911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGACTGCCTCAGCCATGCAACACGTCTTAGACAGCATCTTCACCTCAAGCCACGGCTCCAGGAGAAAGGCATC 962
Query 912 CAAGGTCATGGTGGTGCTCACCGATGGTGGCATATTCGAGGACCCCCTCAACCTTACGACAGTCATCAACTCCC 985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAAGGTCATGGTGGTGCTCACCGATGGTGGCATATTCGAGGACCCCCTCAACCTTACGACAGTCATCAACTCCC 1036
Query 986 CCAAAATGCAGGGTGTTGAGCGCTTTGCCATTGGGGTGGGAGAAGAATTTAAGAGTGCTAGGACTGCGAGGGAA 1059
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCAAAATGCAGGGTGTTGAGCGCTTTGCCATTGGGGTGGGAGAAGAATTTAAGAGTGCTAGGACTGCGAGGGAA 1110
Query 1060 CTGAACCTGATCGCCTCAGACCCGGATGAGACCCATGCTTTCAAGGTGACCAACTACATGGCGCTGGATGGGCT 1133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTGAACCTGATCGCCTCAGACCCGGATGAGACCCATGCTTTCAAGGTGACCAACTACATGGCGCTGGATGGGCT 1184
Query 1134 GCTGAGCAAACTGCGGTACAACATCATCAGCATGGAAGGCACGGTTGGAGACGCCCTTCACTACCAGCTGGCAC 1207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCTGAGCAAACTGCGGTACAACATCATCAGCATGGAAGGCACGGTTGGAGACGCCCTTCACTACCAGCTGGCAC 1258
Query 1208 AGATTGGCTTCAGTGCTCAGATCCTGGATGAGCGGCAGGTGCTGCTCGGCGCCGTCGGGGCCTTTGACTGGTCC 1281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGATTGGCTTCAGTGCTCAGATCCTGGATGAGCGGCAGGTGCTGCTCGGCGCCGTCGGGGCCTTTGACTGGTCC 1332
Query 1282 GGAGGGGCGTTGCTCTACGACACACGCAGCCGCCGGGGCCGCTTCCTGAACCAGACAGCGGCGGCGGCGGCAGA 1355
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GGAGGGGCGTTGCTCTACGACACACGCAGCCGCCGGGGCCGCTTCCTGAACCAGACAGCGGCGGCGGCGGCAGA 1406
Query 1356 CGCGGAGGCTGCGCAGTACAGCTACCTGGGTTACGCTGTGGCCGTGCTGCACAAGACCTGCAGCCTCTCCTACG 1429
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1407 CGCGGAGGCTGCGCAGTACAGCTACCTGGGTTACGCTGTGGCCGTGCTGCACAAGACCTGCAGCCTCTCCTACA 1480
Query 1430 TCGCGGGGGCTCCACAGTACAAACATCATGGGGCCGTGTTTGAGCTCCAGAAGGAGGGCAGAGAGGCCAGCTTC 1503
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCGCGGGGGCTCCACGGTACAAACATCATGGGGCCGTGTTTGAGCTCCAGAAGGAGGGCAGAGAGGCCAGCTTC 1554
Query 1504 CTGCCAGTGCTGGAGGGAGAGCAGATGGGGTCCTATTTTGGCTCTGAGCTGTGCCCTGTGGACATTGACATGGA 1577
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CTGCCAGTGCTGGAGGGAGAGCAGATGGGGTCCTATTTTGGCTCTGAGCTGTGCCCTGTGGACATTGACATGGA 1628
Query 1578 TGGAAGCACGGACTTCTTGCTGGTGGCTGCTCCATTTTACCACGTTCATGGAGAAGAAGGCAGAGTCTACGTGT 1651
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGGAAGCACGGACTTCTTGCTGGTGGCTGCTCCATTTTACCACGTTCATGGAGAAGAAGGCAGAGTCTACGTGT 1702
Query 1652 ACCGTCTCAGCGAGCAGGATGGTTCTTTCTCCTTGGCACGCATACTGAGTGGGCACCCCGGGTTCACCAATGCC 1725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ACCGTCTCAGCGAGCAGGATGGTTCTTTCTCCTTGGCACGCATACTGAGTGGGCACCCCGGGTTCACCAATGCC 1776
Query 1726 CGCTTTGGCTTTGCCATGGCGGCTATGGGGGATCTCAGTCAGGATAAGCTCACAGATGTGGCCATCGGGGCCCC 1799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CGCTTTGGCTTTGCCATGGCGGCTATGGGGGATCTCAGTCAGGATAAGCTCACAGATGTGGCCATCGGGGCCCC 1850
Query 1800 CCTGGAAGGTTTTGGGGCAGATGATGGTGCCAGCTTCGGCAGTGTGTATATCTACAATGGACACTGGGACGGCC 1873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CCTGGAAGGTTTTGGGGCAGATGATGGTGCCAGCTTCGGCAGTGTGTATATCTACAATGGACACTGGGACGGCC 1924
Query 1874 TCTCCGCCAGCCCCTCGCAGCGGATCAGAGCCTCCACGGTGGCCCCAGGACTCCAGTACTTCGGCATGTCCATG 1947
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TCTCCGCCAGCCCCTCGCAGCGGATCAGAGCCTCCACGGTGGCCCCAGGACTCCAGTACTTCGGCATGTCCATG 1998
Query 1948 GCTGGTGGCTTTGATATTAGTGGCGACGGCCTTGCCGACATCACCGTGGGCACTCTGGGCCAGGCGGTTGTGTT 2021
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GCTGGTGGCTTTGATATTAGTGGCGACGGCCTTGCCGACATCACCGTGGGCACTCTGGGCCAGGCGGTTGTGTT 2072
Query 2022 CCGCTCCCGGCCTGTGGTTCGCCTGAAGGTCTCCATGGCCTTCACCCCCAGCGCACTGCCCATCGGCTTCAACG 2095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CCGCTCCCGGCCTGTGGTTCGCCTGAAGGTCTCCATGGCCTTCACCCCCAGCGCACTGCCCATCGGCTTCAACG 2146
Query 2096 GCGTCGTGAATGTCCGTTTATGTTTTGAAATCAGCTCTGTAACCACAGCCTCTGAGTCAGGCCTCCGTGAGGCA 2169
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2147 GCGTCGTGAATGTCCGTTTATGTTTTGAAATCAGCTCTGTAACCACAGCCTCTGAGTCAGGCCTCCGCGAGGCA 2220
Query 2170 CTTCTCAACTTCACGCTGGATGTGGATGTGGGGAAGCAGAGGAGACGGCTGCAGTGTTCAGACGTAAGAAGCTG 2243
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CTTCTCAACTTCACGCTGGATGTGGATGTGGGGAAGCAGAGGAGACGGCTGCAGTGTTCAGACGTAAGAAGCTG 2294
Query 2244 TCTGGGCTGCCTGAGGGAGTGGAGCAGCGGATCCCAGCTTTGTGAGGACCTCCTGCTCATGCCCACAGAGGGAG 2317
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TCTGGGCTGCCTGAGGGAGTGGAGCAGCGGATCCCAGCTTTGTGAGGACCTCCTGCTCATGCCCACAGAGGGAG 2368
Query 2318 AGCTCTGTGAGGAGGACTGCTTCTCCAATGCCAGTGTCAAAGTCAGCTACCAGCTCCAGACCCCTGAGGGACAG 2391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 AGCTCTGTGAGGAGGACTGCTTCTCCAATGCCAGTGTCAAAGTCAGCTACCAGCTCCAGACCCCTGAGGGACAG 2442
Query 2392 ACGGACCATCCCCAGCCCATCCTGGACCGCTACACTGAGCCCTTTGCCATCTTCCAGCTGCCCTATGAGAAGGC 2465
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 ACGGACCATCCCCAGCCCATCCTGGACCGCTACACTGAGCCCTTTGCCATCTTCCAG----------------- 2499
Query 2466 CTGCAAGAATAAGCTGTTTTGTGTCGCAGAATTACAGTTGGCCACCACCGTCTCTCAGCAGGAGTTGGTGGTGG 2539
|||||||||||||||||
Sbjct 2500 ---------------------------------------------------------GCAGGAGTTGGTGGTGG 2516
Query 2540 GTCTCACAAAGGAGCTGACCCTGAACATTAACCTAACTAACTCCGGGGAAGATTCCTACATGACAAGCATGGCC 2613
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GTCTCACAAAGGAGCTGACCCTGAACAT---------------------------------------------- 2544
Query 2614 TTGAATTACCCCAGAAACCTGCAGTTGAAGAGGATGCAAAAGCCTCCCTCTCCAAACATTCAGTGTGATGACCC 2687
Sbjct 2545 -------------------------------------------------------------------------- 2544
Query 2688 TCAGCCGGTTGCTTCTGTCCTGATCATGAACTGCAGGATTGGTCACCCCGTCCTCAAGAGGTCATCTGCTCATG 2761
Sbjct 2545 -------------------------------------------------------------------------- 2544
Query 2762 TTTCAGTCGTTTGGCAGCTAGAGGAGAATGCCTTTCCAAACAGGACAGCAGACATCACTGTGACTGTCACCAAT 2835
Sbjct 2545 -------------------------------------------------------------------------- 2544
Query 2836 TCCAATGAAAGACGGTCTTTGGCCAACGAGACCCACACCCTTCAATTCAGGCATGGCTTCGTTGCAGTTCTGTC 2909
Sbjct 2545 -------------------------------------------------------------------------- 2544
Query 2910 CAAACCATCCATAATGTACGTGAACACAGGCCAGGGGCTTTCTCACCACAAAGAATTCCTCTTCCATGTACATG 2983
Sbjct 2545 -------------------------------------------------------------------------- 2544
Query 2984 GGGAGAACCTCTTTGGAGCAGAATACCAGTTGCAAATTTGCGTCCCAACCAAATTACGAGGTCTCCAGGTTGCA 3057
Sbjct 2545 -------------------------------------------------------------------------- 2544
Query 3058 GCAGTGAAGAAGCTGACGAGGACTCAGGCCTCCACGGTGTGCACCTGGAGTCAGGAGCGCGCTTGTGCGTACAG 3131
Sbjct 2545 -------------------------------------------------------------------------- 2544
Query 3132 TTCGGTTCAGCATGTGGAAGAATGGCATTCAGTGAGCTGTGTCATCGCTTCAGATAAAGAAAATGTCACCGTGG 3205
Sbjct 2545 -------------------------------------------------------------------------- 2544
Query 3206 CTGCAGAGATCTCCTGGGATCACTCTGAGGAGTTACTAAAAGATGTAACTGAACTGCAGATCCTTGGTGAAATA 3279
Sbjct 2545 -------------------------------------------------------------------------- 2544
Query 3280 TCTTTCAACAAATCTCTATATGAGGGACTGAATGCAGAGAACCACAGAACTAAGATCACTGTCGTCTTCCTGAA 3353
Sbjct 2545 -------------------------------------------------------------------------- 2544
Query 3354 AGATGAGAAGTACCATTCTTTGCCTATCATCATTAAAGGCAGCGTTGGTGGACTTCTGGTGTTGATCGTGATTC 3427
Sbjct 2545 -------------------------------------------------------------------------- 2544
Query 3428 TGGTCATCCTGTTCAAGTGTGGCTTTTTTAAAAGAAAATATCAACAACTGAACTTGGAGAGCATCAGGAAGGCC 3501
Sbjct 2545 -------------------------------------------------------------------------- 2544
Query 3502 CAGCTGAAATCAGAGAATCTGCTCGAAGAAGAGAAT 3537
Sbjct 2545 ------------------------------------ 2544