Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000468772
Subject:
NM_006584.4
Aligned Length:
1590
Identities:
1586
Gaps:
1

Alignment

Query    1  ATGGCTGCGAT-AAGGCCGTCAACTCCAAGGCTGAGGTGGCGCGGGCCCAGGCAGCTTTGGCTGTCAATATATG  73
            ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGCGATAAAGGCCGTCAACTCCAAGGCTGAGGTGGCGCGGGCCCGGGCAGCTTTGGCTGTCAATATATG  74

Query   74  CGCCGCCCGAGGGCTGCAGGATGTGCTGCGGACCAACTTGGGTCCTAAAGGCACCATGAAAATGCTTGCTTCTG  147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct   75  CGCCGCCCGAGGGCTGCAGGATGTGCTGCGGACCAACTTGGGTCCTAAAGGCACCATGAAAATGCTTGTTTCTG  148

Query  148  GTGCAGGTGACATCAAACTCACCAAAGATGGCAATGTACTGCTCGATGAGATGCAAATTCAACATCCAACAGCT  221
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTGCAGGTGACATCAAACTCACCAAAGATGGCAATGTGCTGCTCGATGAGATGCAAATTCAACATCCAACAGCT  222

Query  222  TCCTTGATAGCAAAAGTAGCAACAGCTCAGGATGACGTCACAGGAGATGGTACTACTTCAAATGTTCTAATTAT  295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCTTGATAGCAAAAGTAGCAACAGCTCAGGATGACGTCACAGGAGATGGTACTACTTCAAATGTTCTAATTAT  296

Query  296  TGGAGAGTTATTAAAACAAGCTGACCTGTACATTTCTGAGGGCCTGCACCCTAGAATAATAGCTGAAGGATTTG  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGAGAGTTATTAAAACAAGCTGACCTGTACATTTCTGAGGGCCTGCACCCTAGAATAATAGCTGAAGGATTTG  370

Query  370  AAGCTGCAAAGATAAAAGCACTTGAAGTTTTGGAGGAAGTTAAAGTGACAAAGGAGATGAAAAGAAAAATCCTC  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGCTGCAAAGATAAAAGCACTTGAAGTTTTGGAGGAAGTTAAAGTGACAAAGGAGATGAAAAGAAAAATCCTC  444

Query  444  TTAGATGTAGCTAGAACATCATTACAAACTAAAGTTCATGCTGAACTGGCTGATGTCTTAACAGAGGTTGTGGT  517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTAGATGTAGCTAGAACATCATTACAAACTAAAGTTCATGCTGAACTGGCTGATGTCTTAACAGAGGTTGTGGT  518

Query  518  GGATTCTGTTTTGGCTGTTAGAAGACCAGGTTACCCTATTGATCTCTTCATGGTAGAAATAATGGAGATGAAGC  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGATTCTGTTTTGGCTGTTAGAAGACCAGGTTACCCTATTGATCTCTTCATGGTAGAAATAATGGAGATGAAGC  592

Query  592  ATAAATTAGGAACAGATACAAAGTTGATCCAAGGATTAGTTTTGGATCATGGTGCCCGTCATCCAGATATGAAG  665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATAAATTAGGAACAGATACAAAGTTGATCCAAGGATTAGTTTTGGATCATGGTGCCCGTCATCCAGATATGAAG  666

Query  666  AAGCGAGTAGAAGATGCATTTATCCTTATTTGCAACGTTTCACTGGAATATGAAAAAACAGAGGTGAACTCTGG  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGCGAGTAGAAGATGCATTTATCCTTATTTGCAACGTTTCACTGGAATATGAAAAAACAGAGGTGAACTCTGG  740

Query  740  TTTCTTTTATAAGACTGCAGAAGAGAAAGAGAAATTGGTAAAAGCTGAAAGAAAATTTATTGAAGATAGAGTAC  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTTCTTTTATAAGACTGCAGAAGAGAAAGAGAAATTGGTAAAAGCTGAAAGAAAATTTATTGAAGATAGAGTAC  814

Query  814  AAAAAATAATAGACCTGAAGGACAAAGTCTGTGCTCAGTCAAATAAAGGATTTGTCGTCATTAATCAAAAGGGA  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAAAAATAATAGACCTGAAGGACAAAGTCTGTGCTCAGTCAAATAAAGGATTTGTCGTCATTAATCAAAAGGGA  888

Query  888  ATTGATCCATTTTCCTTAGATTCTCTTGCAAAACATGGAATAGTAGCTCTTCGCAGAGCAAAAAGAAGAAATAT  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTGATCCATTTTCCTTAGATTCTCTTGCAAAACATGGAATAGTAGCTCTTCGCAGAGCAAAAAGAAGAAATAT  962

Query  962  GGAAAGACTCTCTCTTGCTTGTGGTGGAATGGCCGTGAATTCTTTTGAAGATCTCACTGTAGATTGCTTGGGAC  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAAAGACTCTCTCTTGCTTGTGGTGGAATGGCCGTGAATTCTTTTGAAGATCTCACTGTAGATTGCTTGGGAC  1036

Query 1036  ATGCTGGTCTTGTGTATGAGTATACATTAGGTGAAGAAAAGTTCACTTTTATTGAGGAGTGTGTTAACCCTTGC  1109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGCTGGTCTTGTGTATGAGTATACATTAGGTGAAGAAAAGTTCACTTTTATTGAGGAGTGTGTTAACCCTTGC  1110

Query 1110  TCTGTTACCTTGTTGGTTAAAGGACCAAATAAGCATACTCTCACACAAGTCAAGGATGCCATAAGAGATGGACT  1183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCTGTTACCTTGTTGGTTAAAGGACCAAATAAGCATACTCTCACACAAGTCAAGGATGCCATAAGAGATGGACT  1184

Query 1184  TCGTGCTATCAAAAATGCCATTGAAGATGGTTGTATGGTTCCTGGAGCTGGTGCAATTGAAGTGGCAATGGCTG  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCGTGCTATCAAAAATGCCATTGAAGATGGTTGTATGGTTCCTGGAGCTGGTGCAATTGAAGTGGCAATGGCTG  1258

Query 1258  AAGCTCTTGTTACATATAAGAACAGTATAAAAGGAAGAGCTCGTCTTGGAGTCCAAGCTTTTGCTGATGCCTTA  1331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAGCTCTTGTTACATATAAGAACAGTATAAAAGGAAGAGCTCGTCTTGGAGTCCAAGCTTTTGCTGATGCCTTA  1332

Query 1332  CTCATTATTCCCAAGGTTCTTGCTCAGAATGCTGGTTATGACCCACAGGAAACATTAGTAAAAGTTCAGGCTGA  1405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTCATTATTCCCAAGGTTCTTGCTCAGAATGCTGGTTATGACCCACAGGAAACATTAGTAAAAGTTCAGGCTGA  1406

Query 1406  GCATGTCGAGTCAAAACAACTTGTGGGCGTAGATTTGAATACAGGTGAGCCAATGGTAGCAGCAGATGCAGGAG  1479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCATGTCGAGTCAAAACAACTTGTGGGCGTAGATTTGAATACAGGTGAGCCAATGGTAGCAGCAGATGCAGGAG  1480

Query 1480  TTTGGGATAATTATTGTGTAAAAAAACAACTTCTTCACTCTTGCACAGTGATTGCCACCAACATTCTCCTGGTT  1553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTTGGGATAATTATTGTGTAAAAAAACAACTTCTTCACTCTTGCACAGTGATTGCCACCAACATTCTCCTGGTT  1554

Query 1554  GATGAAATTATGCGAGCTGGGATGTCTTCTCTCAAA  1589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GATGAAATTATGCGAGCTGGGATGTCTTCTCTCAAA  1590