Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468772
• Subject: XM_017024023.2
• Aligned Length: 1589
• Identities: 1392
• Gaps: 197

Alignment

Query    1  ATGGCTGCGATAAGGCCGTCAACTCCAAGGCTGAGGTGGCGCGGGCCCAGGCAGCTTTGGCTGTCAATATATGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCCGCCCGAGGGCTGCAGGATGTGCTGCGGACCAACTTGGGTCCTAAAGGCACCATGAAAATGCTTGCTTCTGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGCAGGTGACATCAAACTCACCAAAGATGGCAATGTACTGCTCGATGAGATGCAAATTCAACATCCAACAGCTT  222
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------------ATGCAAATTCAACATCCAACAGCTT  25

Query  223  CCTTGATAGCAAAAGTAGCAACAGCTCAGGATGACGTCACAGGAGATGGTACTACTTCAAATGTTCTAATTATT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   26  CCTTGATAGCAAAAGTAGCAACAGCTCAGGATGACGTCACAGGAGATGGTACTACTTCAAATGTTCTAATTATT  99

Query  297  GGAGAGTTATTAAAACAAGCTGACCTGTACATTTCTGAGGGCCTGCACCCTAGAATAATAGCTGAAGGATTTGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  100  GGAGAGTTATTAAAACAAGCTGACCTGTACATTTCTGAGGGCCTGCACCCTAGAATAATAGCTGAAGGATTTGA  173

Query  371  AGCTGCAAAGATAAAAGCACTTGAAGTTTTGGAGGAAGTTAAAGTGACAAAGGAGATGAAAAGAAAAATCCTCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  174  AGCTGCAAAGATAAAAGCACTTGAAGTTTTGGAGGAAGTTAAAGTGACAAAGGAGATGAAAAGAAAAATCCTCT  247

Query  445  TAGATGTAGCTAGAACATCATTACAAACTAAAGTTCATGCTGAACTGGCTGATGTCTTAACAGAGGTTGTGGTG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  248  TAGATGTAGCTAGAACATCATTACAAACTAAAGTTCATGCTGAACTGGCTGATGTCTTAACAGAGGTTGTGGTG  321

Query  519  GATTCTGTTTTGGCTGTTAGAAGACCAGGTTACCCTATTGATCTCTTCATGGTAGAAATAATGGAGATGAAGCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  322  GATTCTGTTTTGGCTGTTAGAAGACCAGGTTACCCTATTGATCTCTTCATGGTAGAAATAATGGAGATGAAGCA  395

Query  593  TAAATTAGGAACAGATACAAAGTTGATCCAAGGATTAGTTTTGGATCATGGTGCCCGTCATCCAGATATGAAGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  396  TAAATTAGGAACAGATACAAAGTTGATCCAAGGATTAGTTTTGGATCATGGTGCCCGTCATCCAGATATGAAGA  469

Query  667  AGCGAGTAGAAGATGCATTTATCCTTATTTGCAACGTTTCACTGGAATATGAAAAAACAGAGGTGAACTCTGGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  470  AGCGAGTAGAAGATGCATTTATCCTTATTTGCAACGTTTCACTGGAATATGAAAAAACAGAGGTGAACTCTGGT  543

Query  741  TTCTTTTATAAGACTGCAGAAGAGAAAGAGAAATTGGTAAAAGCTGAAAGAAAATTTATTGAAGATAGAGTACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  544  TTCTTTTATAAGACTGCAGAAGAGAAAGAGAAATTGGTAAAAGCTGAAAGAAAATTTATTGAAGATAGAGTACA  617

Query  815  AAAAATAATAGACCTGAAGGACAAAGTCTGTGCTCAGTCAAATAAAGGATTTGTCGTCATTAATCAAAAGGGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  618  AAAAATAATAGACCTGAAGGACAAAGTCTGTGCTCAGTCAAATAAAGGATTTGTCGTCATTAATCAAAAGGGAA  691

Query  889  TTGATCCATTTTCCTTAGATTCTCTTGCAAAACATGGAATAGTAGCTCTTCGCAGAGCAAAAAGAAGAAATATG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  692  TTGATCCATTTTCCTTAGATTCTCTTGCAAAACATGGAATAGTAGCTCTTCGCAGAGCAAAAAGAAGAAATATG  765

Query  963  GAAAGACTCTCTCTTGCTTGTGGTGGAATGGCCGTGAATTCTTTTGAAGATCTCACTGTAGATTGCTTGGGACA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  766  GAAAGACTCTCTCTTGCTTGTGGTGGAATGGCCGTGAATTCTTTTGAAGATCTCACTGTAGATTGCTTGGGACA  839

Query 1037  TGCTGGTCTTGTGTATGAGTATACATTAGGTGAAGAAAAGTTCACTTTTATTGAGGAGTGTGTTAACCCTTGCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  840  TGCTGGTCTTGTGTATGAGTATACATTAGGTGAAGAAAAGTTCACTTTTATTGAGGAGTGTGTTAACCCTTGCT  913

Query 1111  CTGTTACCTTGTTGGTTAAAGGACCAAATAAGCATACTCTCACACAAGTCAAGGATGCCATAAGAGATGGACTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  914  CTGTTACCTTGTTGGTTAAAGGACCAAATAAGCATACTCTCACACAAGTCAAGGATGCCATAAGAGATGGACTT  987

Query 1185  CGTGCTATCAAAAATGCCATTGAAGATGGTTGTATGGTTCCTGGAGCTGGTGCAATTGAAGTGGCAATGGCTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  988  CGTGCTATCAAAAATGCCATTGAAGATGGTTGTATGGTTCCTGGAGCTGGTGCAATTGAAGTGGCAATGGCTGA  1061

Query 1259  AGCTCTTGTTACATATAAGAACAGTATAAAAGGAAGAGCTCGTCTTGGAGTCCAAGCTTTTGCTGATGCCTTAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062  AGCTCTTGTTACATATAAGAACAGTATAAAAGGAAGAGCTCGTCTTGGAGTCCAAGCTTTTGCTGATGCCTTAC  1135

Query 1333  TCATTATTCCCAAGGTTCTTGCTCAGAATGCTGGTTATGACCCACAGGAAACATTAGTAAAAGTTCAGGCTGAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1136  TCATTATTCCCAAGGTTCTTGCTCAGAATGCTGGTTATGACCCACAGGAAACATTAGTAAAAGTTCAGGCTGAG  1209

Query 1407  CATGTCGAGTCAAAACAACTTGTGGGCGTAGATTTGAATACAGGTGAGCCAATGGTAGCAGCAGATGCAGGAGT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210  CATGTCGAGTCAAAACAACTTGTGGGCGTAGATTTGAATACAGGTGAGCCAATGGTAGCAGCAGATGCAGGAGT  1283

Query 1481  TTGGGATAATTATTGTGTAAAAAAACAACTTCTTCACTCTTGCACAGTGATTGCCACCAACATTCTCCTGGTTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284  TTGGGATAATTATTGTGTAAAAAAACAACTTCTTCACTCTTGCACAGTGATTGCCACCAACATTCTCCTGGTTG  1357

Query 1555  ATGAAATTATGCGAGCTGGGATGTCTTCTCTCAAA  1589
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1358  ATGAAATTATGCGAGCTGGGATGTCTTCTCTCAAA  1392