Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468836
- Subject:
- NM_001324306.1
- Aligned Length:
- 1942
- Identities:
- 1419
- Gaps:
- 521
Alignment
Query 1 ATGGCGCCGCCGGGTTCAAGCACTGTCTTCCTGTTGGCCCTGACAATCATAGCCAGCACCTGGGCTCTGACGCC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CACTCACTACCTCACCAAGCATGACGTGGAGAGACTAAAAGCCTCGCTGGATCGCCCTTTCACAAATTTGGAAT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CTGCCTTCTACTCCATCGTGGGACTCAGCAGCCTTGGTGCTCAGGTGCCAGATGCAAAGAAAGCATGTACCTAC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ATCAGATCTAACCTTGATCCCAGCAATGTGGATTCCCTCTTCTACGCTGCCCAGGCCAGCCAGGCCCTCTCAGG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 ATGTGAGATCTCTATTTCAAATGAGACCAAAGATCTGCTTCTGGCAGCTGTCAGTGAGGACTCATCTGTTACCC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AGATCTACCATGCAGTTGCAGCTCTAAGTGGCTTTGGCCTTCCCTTGGCATCCCAAGAAGCACTCAGTGCCCTT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 ACTGCTCGTCTCA-GCAAGGAGGAGACTGTGCTGGCAACAGTCCAGGCTCTGCAGACAGCATCCCACCTGTCCC 517
| ||||.| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ------------ATGCAAAG----------------AACAGTCCAGGCTCTGCAGACAGCATCCCACCTGTCCC 46
Query 518 AGCAGGCTGACCTGAGGAGCATCGTGGAGGAGATTGAGGACCTTGTTGCTCGCCTGGATGAACTCGGGGGCGTG 591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 47 AGCAGGCTGACCTGAGGAGCATCGTGGAGGAGATTGAGGACCTTGTTGCTCGCCTGGATGAACTCGGGGGCGTG 120
Query 592 TATCTCCAGTTTGAAGAAGGACTGGAAACAACAGCGTTATTTGTGGCTGCCACCTACAAGCTCATGGATCATGT 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TATCTCCAGTTTGAAGAAGGACTGGAAACAACAGCGTTATTTGTGGCTGCCACCTACAAGCTCATGGATCATGT 194
Query 666 GGGGACTGAGCCATCCATTAAGGAGGATCAGGTCATCCAGCTGATGAACGCGATCTTCAGCAAGAAGAACTTTG 739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 195 GGGGACTGAGCCATCCATTAAGGAGGATCAGGTCATCCAGCTGATGAACGCGATCTTCAGCAAGAAGAACTTTG 268
Query 740 AGTCCCTCTCCGAAGCCTTCAGCGTGGCCTCTGCAGCTGCTGTGCTCTCGCATAATCGCTACCACGTGCCAGTT 813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 269 AGTCCCTCTCCGAAGCCTTCAGCGTGGCCTCTGCAGCTGCTGTGCTCTCGCATAATCGCTACCACGTGCCAGTT 342
Query 814 GTGGTTGTGCCTGAGGGCTCTGCTTCCGACACTCATGAACAGGCTATCTTGCGGTTGCAAGTCACCAATGTTCT 887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 343 GTGGTTGTGCCTGAGGGCTCTGCTTCCGACACTCATGAACAGGCTATCTTGCGGTTGCAAGTCACCAATGTTCT 416
Query 888 GTCTCAGCCTCTGACTCAGGCCACTGTTAAACTAGAACATGCTAAATCTGTTGCTTCCAGAGCCACTGTCCTCC 961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 417 GTCTCAGCCTCTGACTCAGGCCACTGTTAAACTAGAACATGCTAAATCTGTTGCTTCCAGAGCCACTGTCCTCC 490
Query 962 AGAAGACATCCTTCACCCCTGTAGGGGATGTTTTTGAACTAAATTTCATGAACGTCAAATTTTCCAGTGGTTAT 1035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 491 AGAAGACATCCTTCACCCCTGTAGGGGATGTTTTTGAACTAAATTTCATGAACGTCAAATTTTCCAGTGGTTAT 564
Query 1036 TATGACTTCCTTGTCGAAGTTGAAGGTGACAACCGGTATATTGCAAATACCGTAGAGCTCAGAGTCAAGATCTC 1109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 565 TATGACTTCCTTGTCGAAGTTGAAGGTGACAACCGGTATATTGCAAATACCGTAGAGCTCAGAGTCAAGATCTC 638
Query 1110 CACTGAAGTTGGCATCACAAATGTTGATCTTTCCACCGTGGATAAGGATCAGAGCATTGCACCCAAAACTACCC 1183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 639 CACTGAAGTTGGCATCACAAATGTTGATCTTTCCACCGTGGATAAGGATCAGAGCATTGCACCCAAAACTACCC 712
Query 1184 GGGTGACATACCCAGCCAAAGCCAAGGGCACATTCATCGCAGACAGCCACCAGAACTTCGCCTTGTTCTTCCAG 1257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 713 GGGTGACATACCCAGCCAAAGCCAAGGGCACATTCATCGCAGACAGCCACCAGAACTTCGCCTTGTTCTTCCAG 786
Query 1258 CTGGTAGATGTGAACACTGGTGCTGAACTCACTCCTCACCAGACATTTGTCCGACTCCATAACCAGAAGACTGG 1331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 787 CTGGTAGATGTGAACACTGGTGCTGAACTCACTCCTCACCAGACATTTGTCCGACTCCATAACCAGAAGACTGG 860
Query 1332 CCAGGAAGTGGTGTTTGTTGCCGAGCCAGACAACAAGAACGTGTACAAGTTTGAACTGGATACCTCTGAAAGAA 1405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 861 CCAGGAAGTGGTGTTTGTTGCCGAGCCAGACAACAAGAACGTGTACAAGTTTGAACTGGATACCTCTGAAAGAA 934
Query 1406 AGATTGAATTTGACTCTGCCTCTGGCACCTACACTCTCTACTTAATCATTGGAGATGCCACTTTGAAGAACCCA 1479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 935 AGATTGAATTTGACTCTGCCTCTGGCACCTACACTCTCTACTTAATCATTGGAGATGCCACTTTGAAGAACCCA 1008
Query 1480 ATCCTCTGGAATGTGGCTGATGTGGTCATCAAGTTCCCTGAGGAAGAAGCTCCCTCGACTGTCTTGTCCCAGAA 1553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009 ATCCTCTGGAATGTGGCTGATGTGGTCATCAAGTTCCCTGAGGAAGAAGCTCCCTCGACTGTCTTGTCCCAGAA 1082
Query 1554 CCTTTTCACTCCAAAACAGGAAATTCAGCACCTGTTCCGCGAGCCTGAGAAGAGGCCCCCCACCGTGGTGTCCA 1627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083 CCTTTTCACTCCAAAACAGGAAATTCAGCACCTGTTCCGCGAGCCTGAGAAGAGGCCCCCCACCGTGGTGTCCA 1156
Query 1628 ATACATTCACTGCCCTGATCCTCTCGCCGTTGCTTCTGCTCTTCGCTCTGTGGATCCGGATTGGTGCCAATGTC 1701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157 ATACATTCACTGCCCTGATCCTCTCGCCGTTGCTTCTGCTCTTCGCTCTGTGGATCCGGATTGGTGCCAATGTC 1230
Query 1702 TCCAACTTCACTTTTGCTCCTAGCACGATTATATTTCACCTGGGACATGCTGCTATGCTGGGACTCATGTATGT 1775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231 TCCAACTTCACTTTTGCTCCTAGCACGATTATATTTCACCTGGGACATGCTGCTATGCTGGGACTCATGTATGT 1304
Query 1776 CTACTGGACTCAGCTCAACATGTTCCAGACCTTGAAGTACCTGGCCATCTTGGGCAGTGTGACGTTTCTGGCTG 1849
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305 CTACTGGACTCAGCTCAACATGTTCCAGACCTTGAAGTACCTGGCCATCCTGGGCAGTGTGACGTTTCTGGCTG 1378
Query 1850 GCAATCGGATGCTGGCCCAGCAGGCAGTCAAGA----------------------------------------- 1882
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379 GCAATCGGATGCTGGCCCAGCAGGCAGTCAAGAGGATCGCTGCAGAGCAGAGCAGTAGATTGGCAAAATATAGG 1452
Query 1883 -------GAACAGCACAT 1893
|||||||||||
Sbjct 1453 ACACTACGAACAGCACAT 1470