Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468836
- Subject:
- XM_006499024.3
- Aligned Length:
- 2008
- Identities:
- 1667
- Gaps:
- 116
Alignment
Query 1 ------------------------------------------------------------------ATGGCGCC 8
| ||.|.|
Sbjct 1 ATGAAAGCTTTTGAGCATGTCACTAGACTTTCTTCGACTTCTAGGTTCCTTTTCCCTGACAGGGACA-GGAGAC 73
Query 9 GC-CGGGTTCAAGCACTGTCTTCCTGTTGGCCCTGACAATCATAGCCAGCACCTGGGCTCTGACGCCCACTCAC 81
.| |.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||..||||||..|..|||||||||.|||||.|||
Sbjct 74 TCACAGGTTCAAGCGCTGTCTTCCTGTTGGCCCTGACAATCACTGCCAGCGTCCAGGCTCTGACCCCCACCCAC 147
Query 82 TACCTCACCAAGCATGACGTGGAGAGACTAAAAGCCTCGCTGGATCGCCCTTTCACAAATTTGGAATCTGCCTT 155
||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||.|||||||.||||||||
Sbjct 148 TACCTCACCAAGCAGGATGTGGAAAGGCTGAAGGCCTCACTGGACCGCCCCTTCACAGATTTGGAGTCTGCCTT 221
Query 156 CTACTCCATCGTGGGACTCAGCAGCCTTGGTGCTCAGGTGCCAGATGCAAAGAAAGCATGTACCTACATCAGAT 229
||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||||||||||||..||||||||.|||||||.|||||..|
Sbjct 222 CTACTCCATCGTGGGACTCAGCAGCCTTGGGGTACAGGTGCCAGATGTCAAGAAAGCGTGTACCTTCATCAAGT 295
Query 230 CTAACCTTGATCCCAGCAATGTGGATTCCCTCTTCTACGCTGCCCAGGCCAGCCAGGCCCTCTCAGGATGTGAG 303
|.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||.|||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 296 CCAACCTTGATCCCAGCAACGTGGATTCTCTCTTCTATGCAGCCCAGTCCAGCCAGGTCCTCTCAGGCTGTGAG 369
Query 304 ATCTCTATTTCAAATGAGACCAAAGATCTGCTTCTGGCAGCTGTCAGTGAGGACTCATCTGTTACCCAGATCTA 377
||.|||.|||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||..|..||.||||||||||
Sbjct 370 ATATCTGTTTCAAATGAGACCAAAGAGCTCCTGCTGGCAGCAGTGAGTGAAGACTCCCCCATTGCCCAGATCTA 443
Query 378 CCATGCAGTTGCAGCTCTAAGTGGCTTTGGCCTTCCCTTGGCATCCCAAGAAGCACTCAGTGCCCTTACTGCTC 451
|||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||.|.|||||.|||.||||||||||.||||
Sbjct 444 CCATGCAGTTGCAGCACTCAGCGGGTTTGGGCTTCCCTTGGCATCCAATGAAGCCCTCGGTGCCCTTACCGCTC 517
Query 452 GTCTCAGCAAGGAGGAGACTGTGCTGGCAACAGTCCAGGCTCTGCAGACAGCATCCCACCTGTCCCAGCAGGCT 525
|.|||.|||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 518 GCCTCGGCAAGGAAGAGACTGTGCTAGCAACGGTCCAGGCTCTGCAGACAGCGTCCCACCTCTCCCAGCAGGCT 591
Query 526 GACCTGAGGAGCATCGTGGAGGAGATTGAGGACCTTGTTGCTCGCCTGGATGAACTCGGGGGCGTGTATCTCCA 599
||||||||||.|||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 592 GACCTGAGGAACATTGTAGAGGAGATTGAGGACCTTGTTGCTCGGCTGGATGAACTAGGGGGTGTGTATCTGCA 665
Query 600 GTTTGAAGAAGGACTGGAAACAACAGCGTTATTTGTGGCTGCCACCTACAAGCTCATGGATCATGTGGGGACTG 673
||||||.|||||||||||....||.|||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 666 GTTTGAGGAAGGACTGGAGCTCACGGCGCTGTTTGTTGCTGCCACCTACAAGCTCATGGACCACGTGGGGACCG 739
Query 674 AGCCATCCATTAAGGAGGATCAGGTCATCCAGCTGATGAACGCGATCTTCAGCAAGAAGAACTTTGAGTCCCTC 747
|.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 AACCGTCCATGAAGGAGGATCAGGTTATCCAGCTCATGAACACAATCTTCAGCAAGAAGAACTTTGAGTCCCTC 813
Query 748 TCCGAAGCCTTCAGCGTGGCCTCTGCAGCTGCTGTGCTCTCGCATAATCGCTACCACGTGCCAGTTGTGGTTGT 821
||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||...|.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 814 TCAGAAGCCTTCAGTGTGGCCTCTGCTGCTGCTGCATTGTCCCAGAATCGCTACCACGTACCAGTGGTGGTTGT 887
Query 822 GCCTGAGGGCTCTGCTTCCGACACTCATGAACAGGCTATCTTGCGGTTGCAAGTCACCAATGTTCTGTCTCAGC 895
|||.|||||||||.||||.||||||||.||||||||||||.||.|||||||.||||.|||||||.|||||||||
Sbjct 888 GCCCGAGGGCTCTACTTCTGACACTCAAGAACAGGCTATCCTGAGGTTGCAGGTCAGCAATGTTTTGTCTCAGC 961
Query 896 CTCTGACTCAGGCCACTGTTAAACTAGAACATGCTAAATCTGTTGCTTCCAGAGCCACTGTCCTCCAGAAGACA 969
|||||.||||.||..|.||.||.||.||.||||||||.||.|..|||.||||.||.||.|||||.||||||||.
Sbjct 962 CTCTGGCTCAAGCTGCAGTGAAGCTGGAGCATGCTAAGTCGGCGGCTACCAGGGCTACCGTCCTGCAGAAGACG 1035
Query 970 TCCTTCACCCCTGTAGGGGATGTTTTTGAACTAAATTTCATGAACGTCAAATTTTCCAGTGGTTATTATGACTT 1043
.||||..|.|.|||.|||.||||||||||.|||||.||||.|||.||.|||.||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1036 CCCTTTTCGCTTGTGGGGAATGTTTTTGAGCTAAACTTCAAGAATGTTAAACTTTCCAGTGGCTACTATGACTT 1109
Query 1044 CCTTGTCGAAGTTGAAGGTGACAACCGGTATATTGCAAATACCGTAGAGCTCAGAGTCAAGATCTCCACTGAAG 1117
|..||||..||||||||||||||.|||.||.||||||||.||.||||||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 CTCTGTCCGAGTTGAAGGTGACAGCCGTTACATTGCAAACACTGTAGAGCTTCGAGTCAAGATCTCCACTGAAG 1183
Query 1118 TTGGCATCACAAATGTTGATCTTTCCACCGTGGATAAGGATCAGAGCATTGCACCCAAAACTACCCGGGTGACA 1191
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1184 TTGGCATCACAAATGTTGATCTTTCCACTGTGGATAAGGATCAGAGCATTGCACCCAAAACTACCCGGGTGACC 1257
Query 1192 TACCCAGCCAAAGCCAAGGGCACATTCATCGCAGACAGCCACCAGAACTTCGCCTTGTTCTTCCAGCTGGTAGA 1265
||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||.||||||||||||||
Sbjct 1258 TACCCAGCCAAAGCCAAGGGTACATTCATCGCAGACAGCCATCAGAACTTTGCCCTGTTTTTCCAGCTGGTAGA 1331
Query 1266 TGTGAACACTGGTGCTGAACTCACTCCTCACCAGACATTTGTCCGACTCCATAACCAGAAGACTGGCCAGGAAG 1339
|||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 TGTGAACACCGGTGCGGAGCTCACCCCTCACCAGACGTTTGTTCGACTTCATAACCAGAAGACTGGCCAGGAAG 1405
Query 1340 TGGTGTTTGTTGCCGAGCCAGACAACAAGAACGTGTACAAGTTTGAACTGGATACCTCTGAAAGAAAGATTGAA 1413
|||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1406 TGGTGTTTGTTGCTGAGCCAGATAACAAGAATGTATATAAGTTTGAACTGGACACCTCTGAAAGGAAGATTGAA 1479
Query 1414 TTTGACTCTGCCTCTGGCACCTACACTCTCTACTTAATCATTGGAGATGCCACTTTGAAGAACCCAATCCTCTG 1487
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 TTTGACTCTGCCTCTGGCACCTACACACTCTACTTAATCATCGGGGATGCCACATTGAAGAACCCAATCCTCTG 1553
Query 1488 GAATGTGGCTGATGTGGTCATCAAGTTCCCTGAGGAAGAAGCTCCCTCGACTGTCTTGTCCCAGAACCTTTTCA 1561
|||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..|||||||||.|||.||.|
Sbjct 1554 GAACGTGGCTGACGTGGTTATCAAGTTCCCTGAGGAGGAAGCCCCCTCGACTGTGCTGTCCCAGAGCCTGTTTA 1627
Query 1562 CTCCAAAACAGGAAATTCAGCACCTGTTCCGCGAGCCTGAGAAGAGGCCCCCCACCGTGGTGTCCAATACATTC 1635
|.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1628 CCCCAAAACAGGAAATTCAGCACCTGTTCCGAGAGCCTGAGAAGAGGCCCCCCACAGTGGTGTCCAATACATTC 1701
Query 1636 ACTGCCCTGATCCTCTCGCCGTTGCTTCTGCTCTTCGCTCTGTGGATCCGGATTGGTGCCAATGTCTCCAACTT 1709
||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1702 ACGGCCCTCATCCTCTCGCCCTTGCTCCTGCTCTTTGCACTGTGGATCCGGATTGGAGCCAATGTCTCCAACTT 1775
Query 1710 CACTTTTGCTCCTAGCACGATTATATTTCACCTGGGACATGCTGCTATGCTGGGACTCATGTATGTCTACTGGA 1783
|||.||||||||||||||..||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||||
Sbjct 1776 CACATTTGCTCCTAGCACAGTTATCTTCCACCTGGGACATGCTGCGATGCTGGGCCTCATGTATATCTACTGGA 1849
Query 1784 CTCAGCTCAACATGTTCCAGACCTTGAAGTACCTGGCCATCTTGGGCAGTGTGACGTTTCTGGCTGGCAATCGG 1857
|||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||..||.||||||.|||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1850 CTCAGCTCAACATGTTCCAGACCCTCAAGTACCTGGCTGTCCTGGGCACTGTGACGTTTCTGGCTGGCAACCGA 1923
Query 1858 ATGCTGGCCCAGCAGGCAGTCAAGA------------------------------------------------G 1883
||||||||||||||.|||||.|||| |
Sbjct 1924 ATGCTGGCCCAGCATGCAGTTAAGAGGATCGCTGCAGAGCAGAGCAGTAGATTGGCAAAATATAGGACACTACG 1997
Query 1884 AACAGCACAT 1893
||||||||||
Sbjct 1998 AACAGCACAT 2007