Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468836
• Subject: XM_011239388.1
• Aligned Length: 1992
• Identities: 1668
• Gaps: 99

Alignment

Query    1  -------------------------------------ATGGC-----GCCGCCG---------GGTTCAAGCAC  23
                                                 |.|||     .|.||.|         |||||||||.|
Sbjct    1  ATGGCTGGCTGCATTGTGCACGTAACCCCAGCATTGGAGGGCAGAGACCAGCAGATCCCAAGAGGTTCAAGCGC  74

Query   24  TGTCTTCCTGTTGGCCCTGACAATCATAGCCAGCACCTGGGCTCTGACGCCCACTCACTACCTCACCAAGCATG  97
            ||||||||||||||||||||||||||..||||||..|..|||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct   75  TGTCTTCCTGTTGGCCCTGACAATCACTGCCAGCGTCCAGGCTCTGACCCCCACCCACTACCTCACCAAGCAGG  148

Query   98  ACGTGGAGAGACTAAAAGCCTCGCTGGATCGCCCTTTCACAAATTTGGAATCTGCCTTCTACTCCATCGTGGGA  171
            |.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGTGGAAAGGCTGAAGGCCTCACTGGACCGCCCCTTCACAGATTTGGAGTCTGCCTTCTACTCCATCGTGGGA  222

Query  172  CTCAGCAGCCTTGGTGCTCAGGTGCCAGATGCAAAGAAAGCATGTACCTACATCAGATCTAACCTTGATCCCAG  245
            ||||||||||||||.|..|||||||||||||..||||||||.|||||||.|||||..||.||||||||||||||
Sbjct  223  CTCAGCAGCCTTGGGGTACAGGTGCCAGATGTCAAGAAAGCGTGTACCTTCATCAAGTCCAACCTTGATCCCAG  296

Query  246  CAATGTGGATTCCCTCTTCTACGCTGCCCAGGCCAGCCAGGCCCTCTCAGGATGTGAGATCTCTATTTCAAATG  319
            |||.||||||||.||||||||.||.||||||.|||||||||.|||||||||.||||||||.|||.|||||||||
Sbjct  297  CAACGTGGATTCTCTCTTCTATGCAGCCCAGTCCAGCCAGGTCCTCTCAGGCTGTGAGATATCTGTTTCAAATG  370

Query  320  AGACCAAAGATCTGCTTCTGGCAGCTGTCAGTGAGGACTCATCTGTTACCCAGATCTACCATGCAGTTGCAGCT  393
            ||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||..|..||.|||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  AGACCAAAGAGCTCCTGCTGGCAGCAGTGAGTGAAGACTCCCCCATTGCCCAGATCTACCATGCAGTTGCAGCA  444

Query  394  CTAAGTGGCTTTGGCCTTCCCTTGGCATCCCAAGAAGCACTCAGTGCCCTTACTGCTCGTCTCAGCAAGGAGGA  467
            ||.||.||.|||||.|||||||||||||||.|.|||||.|||.||||||||||.|||||.|||.|||||||.||
Sbjct  445  CTCAGCGGGTTTGGGCTTCCCTTGGCATCCAATGAAGCCCTCGGTGCCCTTACCGCTCGCCTCGGCAAGGAAGA  518

Query  468  GACTGTGCTGGCAACAGTCCAGGCTCTGCAGACAGCATCCCACCTGTCCCAGCAGGCTGACCTGAGGAGCATCG  541
            |||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||.|||.|
Sbjct  519  GACTGTGCTAGCAACGGTCCAGGCTCTGCAGACAGCGTCCCACCTCTCCCAGCAGGCTGACCTGAGGAACATTG  592

Query  542  TGGAGGAGATTGAGGACCTTGTTGCTCGCCTGGATGAACTCGGGGGCGTGTATCTCCAGTTTGAAGAAGGACTG  615
            |.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  593  TAGAGGAGATTGAGGACCTTGTTGCTCGGCTGGATGAACTAGGGGGTGTGTATCTGCAGTTTGAGGAAGGACTG  666

Query  616  GAAACAACAGCGTTATTTGTGGCTGCCACCTACAAGCTCATGGATCATGTGGGGACTGAGCCATCCATTAAGGA  689
            ||....||.|||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||
Sbjct  667  GAGCTCACGGCGCTGTTTGTTGCTGCCACCTACAAGCTCATGGACCACGTGGGGACCGAACCGTCCATGAAGGA  740

Query  690  GGATCAGGTCATCCAGCTGATGAACGCGATCTTCAGCAAGAAGAACTTTGAGTCCCTCTCCGAAGCCTTCAGCG  763
            |||||||||.||||||||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  741  GGATCAGGTTATCCAGCTCATGAACACAATCTTCAGCAAGAAGAACTTTGAGTCCCTCTCAGAAGCCTTCAGTG  814

Query  764  TGGCCTCTGCAGCTGCTGTGCTCTCGCATAATCGCTACCACGTGCCAGTTGTGGTTGTGCCTGAGGGCTCTGCT  837
            ||||||||||.|||||||...|.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||.||
Sbjct  815  TGGCCTCTGCTGCTGCTGCATTGTCCCAGAATCGCTACCACGTACCAGTGGTGGTTGTGCCCGAGGGCTCTACT  888

Query  838  TCCGACACTCATGAACAGGCTATCTTGCGGTTGCAAGTCACCAATGTTCTGTCTCAGCCTCTGACTCAGGCCAC  911
            ||.||||||||.||||||||||||.||.|||||||.||||.|||||||.||||||||||||||.||||.||..|
Sbjct  889  TCTGACACTCAAGAACAGGCTATCCTGAGGTTGCAGGTCAGCAATGTTTTGTCTCAGCCTCTGGCTCAAGCTGC  962

Query  912  TGTTAAACTAGAACATGCTAAATCTGTTGCTTCCAGAGCCACTGTCCTCCAGAAGACATCCTTCACCCCTGTAG  985
            .||.||.||.||.||||||||.||.|..|||.||||.||.||.|||||.||||||||..||||..|.|.|||.|
Sbjct  963  AGTGAAGCTGGAGCATGCTAAGTCGGCGGCTACCAGGGCTACCGTCCTGCAGAAGACGCCCTTTTCGCTTGTGG  1036

Query  986  GGGATGTTTTTGAACTAAATTTCATGAACGTCAAATTTTCCAGTGGTTATTATGACTTCCTTGTCGAAGTTGAA  1059
            ||.||||||||||.|||||.||||.|||.||.|||.||||||||||.||.|||||||||..||||..|||||||
Sbjct 1037  GGAATGTTTTTGAGCTAAACTTCAAGAATGTTAAACTTTCCAGTGGCTACTATGACTTCTCTGTCCGAGTTGAA  1110

Query 1060  GGTGACAACCGGTATATTGCAAATACCGTAGAGCTCAGAGTCAAGATCTCCACTGAAGTTGGCATCACAAATGT  1133
            |||||||.|||.||.||||||||.||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGTGACAGCCGTTACATTGCAAACACTGTAGAGCTTCGAGTCAAGATCTCCACTGAAGTTGGCATCACAAATGT  1184

Query 1134  TGATCTTTCCACCGTGGATAAGGATCAGAGCATTGCACCCAAAACTACCCGGGTGACATACCCAGCCAAAGCCA  1207
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGATCTTTCCACTGTGGATAAGGATCAGAGCATTGCACCCAAAACTACCCGGGTGACCTACCCAGCCAAAGCCA  1258

Query 1208  AGGGCACATTCATCGCAGACAGCCACCAGAACTTCGCCTTGTTCTTCCAGCTGGTAGATGTGAACACTGGTGCT  1281
            ||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1259  AGGGTACATTCATCGCAGACAGCCATCAGAACTTTGCCCTGTTTTTCCAGCTGGTAGATGTGAACACCGGTGCG  1332

Query 1282  GAACTCACTCCTCACCAGACATTTGTCCGACTCCATAACCAGAAGACTGGCCAGGAAGTGGTGTTTGTTGCCGA  1355
            ||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1333  GAGCTCACCCCTCACCAGACGTTTGTTCGACTTCATAACCAGAAGACTGGCCAGGAAGTGGTGTTTGTTGCTGA  1406

Query 1356  GCCAGACAACAAGAACGTGTACAAGTTTGAACTGGATACCTCTGAAAGAAAGATTGAATTTGACTCTGCCTCTG  1429
            ||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCCAGATAACAAGAATGTATATAAGTTTGAACTGGACACCTCTGAAAGGAAGATTGAATTTGACTCTGCCTCTG  1480

Query 1430  GCACCTACACTCTCTACTTAATCATTGGAGATGCCACTTTGAAGAACCCAATCCTCTGGAATGTGGCTGATGTG  1503
            ||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1481  GCACCTACACACTCTACTTAATCATCGGGGATGCCACATTGAAGAACCCAATCCTCTGGAACGTGGCTGACGTG  1554

Query 1504  GTCATCAAGTTCCCTGAGGAAGAAGCTCCCTCGACTGTCTTGTCCCAGAACCTTTTCACTCCAAAACAGGAAAT  1577
            ||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..|||||||||.|||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1555  GTTATCAAGTTCCCTGAGGAGGAAGCCCCCTCGACTGTGCTGTCCCAGAGCCTGTTTACCCCAAAACAGGAAAT  1628

Query 1578  TCAGCACCTGTTCCGCGAGCCTGAGAAGAGGCCCCCCACCGTGGTGTCCAATACATTCACTGCCCTGATCCTCT  1651
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1629  TCAGCACCTGTTCCGAGAGCCTGAGAAGAGGCCCCCCACAGTGGTGTCCAATACATTCACGGCCCTCATCCTCT  1702

Query 1652  CGCCGTTGCTTCTGCTCTTCGCTCTGTGGATCCGGATTGGTGCCAATGTCTCCAACTTCACTTTTGCTCCTAGC  1725
            ||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1703  CGCCCTTGCTCCTGCTCTTTGCACTGTGGATCCGGATTGGAGCCAATGTCTCCAACTTCACATTTGCTCCTAGC  1776

Query 1726  ACGATTATATTTCACCTGGGACATGCTGCTATGCTGGGACTCATGTATGTCTACTGGACTCAGCTCAACATGTT  1799
            ||..||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ACAGTTATCTTCCACCTGGGACATGCTGCGATGCTGGGCCTCATGTATATCTACTGGACTCAGCTCAACATGTT  1850

Query 1800  CCAGACCTTGAAGTACCTGGCCATCTTGGGCAGTGTGACGTTTCTGGCTGGCAATCGGATGCTGGCCCAGCAGG  1873
            |||||||.|.|||||||||||..||.||||||.|||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 1851  CCAGACCCTCAAGTACCTGGCTGTCCTGGGCACTGTGACGTTTCTGGCTGGCAACCGAATGCTGGCCCAGCATG  1924

Query 1874  CAGTCAAGA------------------------------------------------GAACAGCACAT  1893
            ||||.||||                                                |||||||||||
Sbjct 1925  CAGTTAAGAGGATCGCTGCAGAGCAGAGCAGTAGATTGGCAAAATATAGGACACTACGAACAGCACAT  1992