Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468882
- Subject:
- XM_006718266.3
- Aligned Length:
- 1791
- Identities:
- 1511
- Gaps:
- 279
Alignment
Query 1 ATGTTTCCCCGCGAGAAGACGTGGAACATCTCGTTCGCGGGCTGCGGCTTCCTCGGCGTCTACTACGTCGGCGT 74
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Sbjct 1 ATGTTTCCCCGCGAGAAGACGTGGAACATCTCGTTCGCGGGCTGCGGCTTCCTCGGCGTCTACTACGTCGGCGT 74
Query 75 GGCCTCCTGCCTCCGCGAGCACGCGCCCTTCCTGGTGGCCAACGCCACGCACATCTACGGCGCCTCGGCCGGGG 148
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Sbjct 75 GGCCTCCTGCCTCCGCGAGCACGCGCCCTTCCTGGTGGCCAACGCCACGCACATCTACGGCGCCTCGGCCGGGG 148
Query 149 CGCTCACGGCCACGGCGCTGGTCACCGGGGTCTGCCTGGGTGAGGCTGGTGCCAAGTTCATTGAGGTATCTAAA 222
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Sbjct 149 CGCTCACGGCCACGGCGCTGGTCACCGGGGTCTGCCTGGGTGAGGCTGGTGCCAAGTTCATTGAGGTATCTAAA 222
Query 223 GAGGCCCGGAAGCGGTTCCTGGGCCCCCTGCACCCCTCCTTCAACCTGGTAAAGATCATCCGCAGTTTCCTGCT 296
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Sbjct 223 GAGGCCCGGAAGCGGTTCCTGGGCCCCCTGCACCCCTCCTTCAACCTGGTAAAGATCATCCGCAGTTTCCTGCT 296
Query 297 GAAGGTCCTGCCTGCTGATAGCCATGAGCATGCCAGTGGGCGCCTGGGCATCTCCCTGACCCGCGTGTCAGACG 370
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Sbjct 297 GAAGGTCCTGCCTGCTGATAGCCATGAGCATGCCAGTGGGCGCCTGGGCATCTCCCTGACCCGCGTGTCAGACG 370
Query 371 GCGAGAATGTCATTATATCCCACTTCAACTCCAAGGACGAGCTCATCCAGGCCAATGTCTGCAGCGGTTTCATC 444
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Sbjct 371 GCGAGAATGTCATTATATCCCACTTCAACTCCAAGGACGAGCTCATCCAGGCCAATGTCTGCAGCGGTTTCATC 444
Query 445 CCCGTGTACTGTGGGCTCATCCCTCCCTCCCTCCAGGGGGTGCGCTACGTGGATGGTGGCATTTCAGACAACCT 518
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Sbjct 445 CCCGTGTACTGTGGGCTCATCCCTCCCTCCCTCCAGGGGGTGCGCTACGTGGATGGTGGCATTTCAGACAACCT 518
Query 519 GCCACTCTATGAGCTTAAGAACACCATCACAGTGTCCCCCTTCTCGGGCGAGAGTGACATCTGTCCGCAGGACA 592
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Sbjct 519 GCCACTCTATGAGCTTAAGAACACCATCACAGTGTCCCCCTTCTCGGGCGAGAGTGACATCTGTCCGCAGGACA 592
Query 593 GCTCCACCAACATCCACGAGCTGCGGGTCACCAACACCAGCATCCAGTTCAACCTGCGCAACCTCTACCGCCTC 666
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Sbjct 593 GCTCCACCAACATCCACGAGCTGCGGGTCACCAACACCAGCATCCAGTTCAACCTGCGCAACCTCTACCGCCTC 666
Query 667 TCCAAGGCCCTCTTCCCGCCGGAGCCCCTGGTGCTGCGAGAGATGTGCAAGCAGGGATACCGGGATGGCCTGCG 740
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Sbjct 667 TCCAAGGCCCTCTTCCCGCCGGAGCCCCTGGTGCTGCGAGAGATGTGCAAGCAGGGATACCGGGATGGCCTGCG 740
Query 741 CTTTCTGCAGCGGAACGGCCTCCTGAACCGGCCCAACCCCTTGCTGGCGTTGCCCCCCGCCCGCCCCCACGGCC 814
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Sbjct 741 CTTTCTGCAGCGGAACGGCCTCCTGAACCGGCCCAACCCCTTGCTGGCGTTGCCCCCCGCCCGCCCCCACGGCC 814
Query 815 CAGAGGACAAGGACCAGGCAGTGGAGAGCGCCCAAGCGGAGGATTACTCGCAGCTGCCGGGAGAAGATCACATC 888
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Sbjct 815 CAGAGGACAAGGACCAGGCAGTGGAGAGCGCCCAAGCGGAGGATTACTCGCAGCTGCCCGGAGAAGATCACATC 888
Query 889 CTGGAGCACCTGCCCGCCCGGCTCAATGAG-------------------------------------------- 918
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Sbjct 889 CTGGAGCACCTGCCCGCCCGGCTCAATGAGGGTGCGCACCTGGGGGACGGGAGGGGAGGAGGGGAGGCAGGAGG 962
Query 919 -------------------------------------------------------------------------- 918
Sbjct 963 GAAAGAGAGAGAGGAGAGGACGGTGAGCAGGGGAGGGAAGCCGAGCGGGTCCTGGGCCCCGCTGCCTCCACTGG 1036
Query 919 ------------------------GCCCTGCTGGAGGCCTGCGTGGAGCCCACGGACCTGCTGACCACCCTCTC 968
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Sbjct 1037 CCGCCGACCTCCCGCCCACCCGCAGCCCTGCTGGAGGCCTGCGTGGAGCCCACGGACCTGCTGACCACCCTCTC 1110
Query 969 CAACATGCTGCCTGTGCGTCTGGCCACGGCCATGATGGTGCCCTACACGCTGCCGCTGGAGAGCGCTCTGTCCT 1042
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Sbjct 1111 CAACATGCTGCCTGTGCGTCTGGCCACGGCCATGATGGTGCCCTACACGCTGCCGCTGGAGAGCGCTCTGTCCT 1184
Query 1043 TCACCATCCGCTTGCTGGAGTGGCTGCCCGACGTTCCCGAGGACATCCGGTGGATGAAGGAGCAGACGGGCAGC 1116
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Sbjct 1185 TCACCATCCGCTTGCTGGAGTGGCTGCCCGACGTTCCCGAGGACATCCGGTGGATGAAGGAGCAGACGGGCAGC 1258
Query 1117 ATCTGCCAGTACCTGGTGATGCGCGCCAAGAGGAAGCTGGGCAGGCACCTGCCCTCCAGGCTGCCGGAGCAGGT 1190
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Sbjct 1259 ATCTGCCAGTACCTGGTGATGCGCGCCAAGAGGAAGCTGGGCAGGCACCTGCCCTCCAGGCTGCCGGAGCAGGT 1332
Query 1191 GGAGCTGCGCCGCGTCCAGTCGCTGCCGTCCGTGCCGCTGTCCTGCGCCGCCTACAGAGAGGCACTGCCCGGCT 1264
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Sbjct 1333 GGAGCTGCGCCGCGTCCAGTCGCTGCCGTCCGTGCCGCTGTCCTGCGCCGCCTACAGAGAGGCACTGCCCGGCT 1406
Query 1265 GGATGCGCAACAACCTCTCGCTGGGGGACGCGCTGGCCAAGTGGGAGGAGTGCCAGCGCCAGCTGCTGCTCGGC 1338
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Sbjct 1407 GGATGCGCAACAACCTCTCGCTGGGGGACGCGCTGGCCAAGTGGGAGGAGTGCCAGCGCCAGCTGCTGCTCGGC 1480
Query 1339 CTCTTCTGCACCAACGTGGCCTTCCCGCCCGAAGCTCTGCGCATGCGCGCACCCGCCGACCCGGCTCCCGCCCC 1412
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Sbjct 1481 CTCTTCTGCACCAACGTGGCCTTCCCGCCCGAAGCTCTGCGCATGCGCGCACCCGCCGACCCGGCTCCCGCCCC 1554
Query 1413 CGCGGACCCAGCATCCCCGCAGCACCAGCTGGCCGGGCCTGCCCCCTTGCTGAGCACCCCTGCTCCCGAGGCCC 1486
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Sbjct 1555 CGCGGACCCAGCATCCCCGCAGCACCAGCTGGCCGGGCCTGCCCCCTTGCTGAGCACCCCTGCTCCCGAGGCCC 1628
Query 1487 GGCCCGTGATCGGGGCCCTGGGGCTG------------------------------------------------ 1512
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Sbjct 1629 GGCCCGTGATCGGGGCCCTGGGGCTGTGAGACCCCGACCCTCTCGAGGAACCCTGCCTGAGACGCCTCCATTAC 1702
Query 1513 -------------------------------------------------------------------------- 1512
Sbjct 1703 CACTGCGCAGTGAGATGAGGGGACTCACAGTTGCCAAGAGGGGTCTTTGCCGTGGGCCCCCTCGCCAGCCACTC 1776
Query 1513 --------------- 1512
Sbjct 1777 ACCAGCTGCATGCAC 1791
