Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000468882
Subject:
XM_024448618.1
Aligned Length:
1740
Identities:
1511
Gaps:
228

Alignment

Query    1  ATGTTTCCCCGCGAGAAGACGTGGAACATCTCGTTCGCGGGCTGCGGCTTCCTCGGCGTCTACTACGTCGGCGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTTCCCCGCGAGAAGACGTGGAACATCTCGTTCGCGGGCTGCGGCTTCCTCGGCGTCTACTACGTCGGCGT  74

Query   75  GGCCTCCTGCCTCCGCGAGCACGCGCCCTTCCTGGTGGCCAACGCCACGCACATCTACGGCGCCTCGGCCGGGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCCTCCTGCCTCCGCGAGCACGCGCCCTTCCTGGTGGCCAACGCCACGCACATCTACGGCGCCTCGGCCGGGG  148

Query  149  CGCTCACGGCCACGGCGCTGGTCACCGGGGTCTGCCTGGGTGAGGCTGGTGCCAAGTTCATTGAGGTATCTAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGCTCACGGCCACGGCGCTGGTCACCGGGGTCTGCCTGGGTGAGGCTGGTGCCAAGTTCATTGAGGTATCTAAA  222

Query  223  GAGGCCCGGAAGCGGTTCCTGGGCCCCCTGCACCCCTCCTTCAACCTGGTAAAGATCATCCGCAGTTTCCTGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGGCCCGGAAGCGGTTCCTGGGCCCCCTGCACCCCTCCTTCAACCTGGTAAAGATCATCCGCAGTTTCCTGCT  296

Query  297  GAAGGTCCTGCCTGCTGATAGCCATGAGCATGCCAGTGGGCGCCTGGGCATCTCCCTGACCCGCGTGTCAGACG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAGGTCCTGCCTGCTGATAGCCATGAGCATGCCAGTGGGCGCCTGGGCATCTCCCTGACCCGCGTGTCAGACG  370

Query  371  GCGAGAATGTCATTATATCCCACTTCAACTCCAAGGACGAGCTCATCCAGGCCAATGTCTGCAGCGGTTTCATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCGAGAATGTCATTATATCCCACTTCAACTCCAAGGACGAGCTCATCCAGGCCAATGTCTGCAGCGGTTTCATC  444

Query  445  CCCGTGTACTGTGGGCTCATCCCTCCCTCCCTCCAGGGGGTGCGCTACGTGGATGGTGGCATTTCAGACAACCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCGTGTACTGTGGGCTCATCCCTCCCTCCCTCCAGGGGGTGCGCTACGTGGATGGTGGCATTTCAGACAACCT  518

Query  519  GCCACTCTATGAGCTTAAGAACACCATCACAGTGTCCCCCTTCTCGGGCGAGAGTGACATCTGTCCGCAGGACA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCCACTCTATGAGCTTAAGAACACCATCACAGTGTCCCCCTTCTCGGGCGAGAGTGACATCTGTCCGCAGGACA  592

Query  593  GCTCCACCAACATCCACGAGCTGCGGGTCACCAACACCAGCATCCAGTTCAACCTGCGCAACCTCTACCGCCTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCTCCACCAACATCCACGAGCTGCGGGTCACCAACACCAGCATCCAGTTCAACCTGCGCAACCTCTACCGCCTC  666

Query  667  TCCAAGGCCCTCTTCCCGCCGGAGCCCCTGGTGCTGCGAGAGATGTGCAAGCAGGGATACCGGGATGGCCTGCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCAAGGCCCTCTTCCCGCCGGAGCCCCTGGTGCTGCGAGAGATGTGCAAGCAGGGATACCGGGATGGCCTGCG  740

Query  741  CTTTCTGCAGCGGAACGGCCTCCTGAACCGGCCCAACCCCTTGCTGGCGTTGCCCCCCGCCCGCCCCCACGGCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTTCTGCAGCGGAACGGCCTCCTGAACCGGCCCAACCCCTTGCTGGCGTTGCCCCCCGCCCGCCCCCACGGCC  814

Query  815  CAGAGGACAAGGACCAGGCAGTGGAGAGCGCCCAAGCGGAGGATTACTCGCAGCTGCCGGGAGAAGATCACATC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  815  CAGAGGACAAGGACCAGGCAGTGGAGAGCGCCCAAGCGGAGGATTACTCGCAGCTGCCCGGAGAAGATCACATC  888

Query  889  CTGGAGCACCTGCCCGCCCGGCTCAATGAG--------------------------------------------  918
            ||||||||||||||||||||||||||||||                                            
Sbjct  889  CTGGAGCACCTGCCCGCCCGGCTCAATGAGGGTGCGCACCTGGGGGACGGGAGGGGAGGAGGGGAGGCAGGAGG  962

Query  919  --------------------------------------------------------------------------  918
                                                                                      
Sbjct  963  GAAAGAGAGAGAGGAGAGGACGGTGAGCAGGGGAGGGAAGCCGAGCGGGTCCTGGGCCCCGCTGCCTCCACTGG  1036

Query  919  ------------------------GCCCTGCTGGAGGCCTGCGTGGAGCCCACGGACCTGCTGACCACCCTCTC  968
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCGCCGACCTCCCGCCCACCCGCAGCCCTGCTGGAGGCCTGCGTGGAGCCCACGGACCTGCTGACCACCCTCTC  1110

Query  969  CAACATGCTGCCTGTGCGTCTGGCCACGGCCATGATGGTGCCCTACACGCTGCCGCTGGAGAGCGCTCTGTCCT  1042
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAACATGCTGCCTGTGCGTCTGGCCACGGCCATGATGGTGCCCTACACGCTGCCGCTGGAGAGCGCTCTGTCCT  1184

Query 1043  TCACCATCCGCTTGCTGGAGTGGCTGCCCGACGTTCCCGAGGACATCCGGTGGATGAAGGAGCAGACGGGCAGC  1116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCACCATCCGCTTGCTGGAGTGGCTGCCCGACGTTCCCGAGGACATCCGGTGGATGAAGGAGCAGACGGGCAGC  1258

Query 1117  ATCTGCCAGTACCTGGTGATGCGCGCCAAGAGGAAGCTGGGCAGGCACCTGCCCTC------------------  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct 1259  ATCTGCCAGTACCTGGTGATGCGCGCCAAGAGGAAGCTGGGCAGGCACCTGCCCTCCAGGTGAGCCGCCGACCG  1332

Query 1173  --------------------------------------------------------------------CAGGCT  1178
                                                                                ||||||
Sbjct 1333  CGCGTCCACCCGGGGCCCGCGGTGCTAGCGCCGGGAGCTGAAGCCCTCCCTGCCGCATCCCTGCCCCGCAGGCT  1406

Query 1179  GCCGGAGCAGGTGGAGCTGCGCCGCGTCCAGTCGCTGCCGTCCGTGCCGCTGTCCTGCGCCGCCTACAGAGAGG  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCCGGAGCAGGTGGAGCTGCGCCGCGTCCAGTCGCTGCCGTCCGTGCCGCTGTCCTGCGCCGCCTACAGAGAGG  1480

Query 1253  CACTGCCCGGCTGGATGCGCAACAACCTCTCGCTGGGGGACGCGCTGGCCAAGTGGGAGGAGTGCCAGCGCCAG  1326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CACTGCCCGGCTGGATGCGCAACAACCTCTCGCTGGGGGACGCGCTGGCCAAGTGGGAGGAGTGCCAGCGCCAG  1554

Query 1327  CTGCTGCTCGGCCTCTTCTGCACCAACGTGGCCTTCCCGCCCGAAGCTCTGCGCATGCGCGCACCCGCCGACCC  1400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGCTGCTCGGCCTCTTCTGCACCAACGTGGCCTTCCCGCCCGAAGCTCTGCGCATGCGCGCACCCGCCGACCC  1628

Query 1401  GGCTCCCGCCCCCGCGGACCCAGCATCCCCGCAGCACCAGCTGGCCGGGCCTGCCCCCTTGCTGAGCACCCCTG  1474
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGCTCCCGCCCCCGCGGACCCAGCATCCCCGCAGCACCAGCTGGCCGGGCCTGCCCCCTTGCTGAGCACCCCTG  1702

Query 1475  CTCCCGAGGCCCGGCCCGTGATCGGGGCCCTGGGGCTG  1512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTCCCGAGGCCCGGCCCGTGATCGGGGCCCTGGGGCTG  1740