Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468963
• Subject: XM_017003141.1
• Aligned Length: 1425
• Identities: 1278
• Gaps: 147

Alignment

Query    1  ATGGCGGAGCTGCAGATGCTGCTGGAAGAGGAAATCCCGGGGGGCCGCCGGGCCCTCTTCGACAGCTACACAAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGAGCTGCAGATGCTGCTGGAAGAGGAAATCCCGGGGGGCCGCCGGGCCCTCTTCGACAGCTACACAAA  74

Query   75  TCTGGAACGGGTGGCCGATTACTGCGAGAACAACTACATACAGTCAGCAGATAAGCAGAGAGCCCTAGAAGAAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTGGAACGGGTGGCCGATTACTGCGAGAACAACTACATACAGTCAGCAGATAAGCAGAGAGCCCTAGAAGAAA  148

Query  149  CCAAAGCCTACACCACCCAATCCTTAGCAAGTGTTGCCTATCTGATAAACACCTTGGCCAACAATGTCCTGCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAAAGCCTACACCACCCAATCCTTAGCAAGTGTTGCCTATCTGATAAACACCTTGGCCAACAATGTCCTGCAG  222

Query  223  ATGCTGGATATCCAGGCATCCCAGCTACGAAGGATGGAATCTTCAATCAATCATATTTCACAAACAGTTGATAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATGCTGGATATCCAGGCATCCCAGCTACGAAGGATGGAATCTTCAATCAATCATATTTCACAAACAGTTGATAT  296

Query  297  TCATAAAGAGAAAGTTGCAAGAAGAGAAATTGGTATTTTGACTACCAATAAAAACACTTCAAGGACACATAAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCATAAAGAGAAAGTTGCAAGAAGAGAAATTGGTATTTTGACTACCAATAAAAACACTTCAAGGACACATAAGA  370

Query  371  TTATTGCTCCAGCCAACCTTGAACGACCAGTTCGTTATATTAGAAAACCTATTGACTATACAATTCTAGATGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTATTGCTCCAGCCAACCTTGAACGACCAGTTCGTTATATTAGAAAACCTATTGACTATACAATTCTAGATGAT  444

Query  445  ATTGGACATGGAGTAAAGGTGAGTACCCAGAACATGAAGATGGGTGGGCTGCCGCGTACAACACCTCCAACTCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTGGACATGGAGTAAAGGTGAGTACCCAGAACATGAAGATGGGTGGGCTGCCGCGTACAACACCTCCAACTCA  518

Query  519  GAAGCCCCCTAGTCCCCCTATGTCAGGGAAAGGGACACTTGGGCGGCACTCCCCCTATCGCACACTGGAGCCAG  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                 
Sbjct  519  GAAGCCCCCTAGTCCCCCTATGTCAGGGAAAGGGACACTTG---------------------------------  559

Query  593  TGCGTCCTCCAGTGGTACCAAATGATTACGTACCTAGCCCAACCCGTAATATGGCTCCCTCGCAGCAGAGCCCT  666
                                                                                      
Sbjct  560  --------------------------------------------------------------------------  559

Query  667  GTGAGGACAGCTTCTGTGAATCAAAGAAATCGAACTTACAGCAGCAGTGGGAGTAGTGGAGGGAGCCACCCAAG  740
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  560  ----------------------------------------GCAGCAGTGGGAGTAGTGGAGGGAGCCACCCAAG  593

Query  741  TAGTCGGAGCAGCAGTCGAGAGAACAGTGGAAGTGGTAGTGTGGGGGTTCCTATTGCTGTTCCTACTCCATCTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  594  TAGTCGGAGCAGCAGTCGAGAGAACAGTGGAAGTGGTAGTGTGGGGGTTCCTATTGCTGTTCCTACTCCATCTC  667

Query  815  CTCCCAGTGTCTTTCCAGGTCATCCTGTACAGTTCTACAGCATGAATAGGCCTGCCTCTCGCCATACTCCCCCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  668  CTCCCAGTGTCTTTCCAGGTCATCCTGTACAGTTCTACAGCATGAATAGGCCTGCCTCTCGCCATACTCCCCCA  741

Query  889  ACAATAGGGGGCTCGTTGCCCTATAGACGCCCTCCTTCCATTACTTCACAAACAAGCCTTCAGAATCAGATGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  742  ACAATAGGGGGCTCGTTGCCCTATAGACGCCCTCCTTCCATTACTTCACAAACAAGCCTTCAGAATCAGATGAA  815

Query  963  TGGAGGACCTTTTTATAGCCAGAATCCAGTATCTCTTGCTCCTCCTCCTCCCTCCATCCTACAGGTAACTCCTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  816  TGGAGGACCTTTTTATAGCCAGAATCCAGTATCTCTTGCTCCTCCTCCTCCCTCCATCCTACAGGTAACTCCTC  889

Query 1037  AGTTACCTTTAATGGGATTTGTGGCCAGAGTCCAAGAAAATATTTCAGATACACCACCTCCACCGCCACCTGTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  890  AGTTACCTTTAATGGGATTTGTGGCCAGAGTCCAAGAAAATATTTCAGATACACCACCTCCACCGCCACCTGTG  963

Query 1111  GAAGAACCAGTCTTTGATGAGTCTCCCCCACCTCCTCCTCCTCCAGAAGATTACGAAGAGGAGGAAGCTGCTGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  964  GAAGAACCAGTCTTTGATGAGTCTCCCCCACCTCCTCCTCCTCCAGAAGATTACGAAGAGGAGGAAGCTGCTGT  1037

Query 1185  GGTTGAGTATAGTGATCCTTATGCTGAAGAGGACCCACCGTGGGCTCCACGTTCTTACTTGGAAAAGGTTGTGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1038  GGTTGAGTATAGTGATCCTTATGCTGAAGAGGACCCACCGTGGGCTCCACGTTCTTACTTGGAAAAGGTTGTGG  1111

Query 1259  CAATTTATGACTATACAAAAGACAAGGAAGATGAGCTGTCCTTTCAGGAAGGAGCCATTATTTATGTCATCAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1112  CAATTTATGACTATACAAAAGACAAGGAAGATGAGCTGTCCTTTCAGGAAGGAGCCATTATTTATGTCATCAAG  1185

Query 1333  AAGAATGACGATGGTTGGTATGAGGGAGTTATGAATGGAGTGACTGGGCTTTTTCCTGGGAATTACGTTGAGTC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1186  AAGAATGACGATGGTTGGTATGAGGGAGTTATGAATGGAGTGACTGGGCTTTTTCCTGGGAATTACGTTGAGTC  1259

Query 1407  TATCATGCATTATTCTGAG  1425
            |||||||||||||||||||
Sbjct 1260  TATCATGCATTATTCTGAG  1278