Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469015
- Subject:
- XM_005265993.4
- Aligned Length:
- 1800
- Identities:
- 1394
- Gaps:
- 405
Alignment
Query 1 ATGATGGAGGAGCGTGCCAACCTGATGCACATGATGAAACTCAGCATCAAGGTGTTGCTCCAGTCGGCTCTGAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCTGGGCCGCAGCCTGGATGCGGACCATGCCCCCTTGCAGCAGTTCTTTGTAGTGATGGAGCACTGCCTCAAAC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ATGGGCTGAAAGTTAAGAAGAGTTTTATTGGCCAAAATAAATCATTCTTTGGTCCTTTGGAGCTGGTGGAGAAA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CTTTGTCCAGAAGCATCAGATATAGCGACTAGTGTCAGAAATCTTCCAGAATTAAAGACAGCTGTGGGAAGAGG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CCGAGCGTGGCTTTATCTTGCACTCATGCAAAAGAAACTGGCAGATTATCTGAAAGTGCTTATAGACAATAAAC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 ATCTCTTAAGCGAGTTCTATGAGCCTGAGGCTTTAATGATGGAGGAAGAAGGGATGGTGATTGTTGGTCTGCTG 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------------------ATGATGGAGGAAGAAGGGATGGTGATTGTTGGTCTGCTG 39
Query 445 GTGGGACTCAATGTTCTCGATGCCAATCTCTGCTTGAAAGGAGAAGACTTGGATTCTCAGGTTGGAGTAATAGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 40 GTGGGACTCAATGTTCTCGATGCCAATCTCTGCTTGAAAGGAGAAGACTTGGATTCTCAGGTTGGAGTAATAGA 113
Query 519 TTTTTCCCTCTACCTTAAGGATGTGCAGGATCTTGATGGTGGCAAGGAGCATGAAAGAATTACTGATGTCCTTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 114 TTTTTCCCTCTACCTTAAGGATGTGCAGGATCTTGATGGTGGCAAGGAGCATGAAAGAATTACTGATGTCCTTG 187
Query 593 ATCAAAAAAATTATGTGGAAGAACTTAACCGGCACTTGAGCTGCACAGTTGGGGATCTTCAAACCAAGATAGAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 188 ATCAAAAAAATTATGTGGAAGAACTTAACCGGCACTTGAGCTGCACAGTTGGGGATCTTCAAACCAAGATAGAT 261
Query 667 GGCTTGGAAAAGACTAACTCAAAGCTTCAAGAAGAGCTTTCAGCTGCAACAGACCGAATTTGCTCACTTCAAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 262 GGCTTGGAAAAGACTAACTCAAAGCTTCAAGAAGAGCTTTCAGCTGCAACAGACCGAATTTGCTCACTTCAAGA 335
Query 741 AGAACAGCAGCAGTTAAGAGAACAAAATGAATTAATTCGAGAAAGAAGTGAAAAGAGTGTAGAGATAACAAAAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 336 AGAACAGCAGCAGTTAAGAGAACAAAATGAATTAATTCGAGAAAGAAGTGAAAAGAGTGTAGAGATAACAAAAC 409
Query 815 AGGATACCAAAGTTGAGCTGGAGACTTACAAGCAAACTCGGCAAGGTCTGGATGAAATGTACAGTGATGTGTGG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 410 AGGATACCAAAGTTGAGCTGGAGACTTACAAGCAAACTCGGCAAGGTCTGGATGAAATGTACAGTGATGTGTGG 483
Query 889 AAGCAGCTAAAAGAGGAGAAGAAAGTCCGGTTGGAACTGGAAAAAGAACTGGAGTTACAAATTGGAATGAAAAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 484 AAGCAGCTAAAAGAGGAGAAGAAAGTCCGGTTGGAACTGGAAAAAGAACTGGAGTTACAAATTGGAATGAAAAC 557
Query 963 CGAAATGGAAATTGCAATGAAGTTACTGGAAAAGGACACCCACGAGAAGCAGGACACACTAGTTGCCCTCCGCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 558 CGAAATGGAAATTGCAATGAAGTTACTGGAAAAGGACACCCACGAGAAGCAGGACACACTAGTTGCCCTCCGCC 631
Query 1037 AGCAGCTGGAAGAAGTCAAAGCGATTAATTTACAGATGTTTCACAAAGCTCAGAATGCAGAGAGCAGTTTGCAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 632 AGCAGCTGGAAGAAGTCAAAGCGATTAATTTACAGATGTTTCACAAAGCTCAGAATGCAGAGAGCAGTTTGCAG 705
Query 1111 CAGAAGAATGAAGCCATCACATCCTTTGAAGGAAAAACCAACCAAGTTATGTCCAGCATGAAACAAATGGAAGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 706 CAGAAGAATGAAGCCATCACATCCTTTGAAGGAAAAACCAACCAAGTTATGTCCAGCATGAAACAAATGGAAGA 779
Query 1185 AAGGTTGCAGCACTCGGAGCGGGCGAGGCAGGGAGCTGAGGAGCGGAGCCACAAGCTGCAGCAGGAGCTGGGCG 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 AAGGTTGCAGCACTCGGAGCGGGCGAGGCAGGGGGCTGAGGAGCGGAGCCACAAGCTGCAGCAGGAGCTGGGCG 853
Query 1259 GGAGGATCGGCGCCCTGCAGCTGCAGCTCTCCCAGCTGCACGAGCAATGCTCAAGCCTGGAGAAAGAATTGAAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 854 GGAGGATCGGCGCCCTGCAGCTGCAGCTCTCCCAGCTGCACGAGCAATGCTCAAGCCTGGAGAAAGAATTGAAA 927
Query 1333 TCAGAAAAAGAGCAAAGACAGGCTCTTCAGCGCGAATTACAGCACGAGAAAGACACTTCCTCTCTACTCAGGAT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 928 TCAGAAAAAGAGCAAAGACAGGCTCTTCAGCGCGAATTACAGCACGAGAAAGACACTTCCTCTCTACTCAGGAT 1001
Query 1407 GGAGCTGCAACAAGTGGAAGGACTGAAAAAGGAGTTGCGGGAGCTTCAGGACGAGAAGGCAGAGCTGCAGAAGA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002 GGAGCTGCAACAAGTGGAAGGACTGAAAAAGGAGTTGCGGGAGCTTCAGGACGAGAAGGCAGAGCTGCAGAAGA 1075
Query 1481 TCTGCGAGGAGCAGGAACAAGCCCTCCAGGAAATGGGCCTGCACCTCAGCCAGTCCAAGCTGAAGATGGAAGAT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1076 TCTGCGAGGAGCAGGAACAAGCCCTCCAGGAAATGGGCCTGCACCTCAGCCAGTCCAAGCTGAAGATGGAAGAT 1149
Query 1555 ATAAAAGAAGTGAACCAGGCACTGAAGGGCCACGCCTGGCTGAAAGATGACGAAGCGACACACTGTAGGCAGTG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1150 ATAAAAGAAGTGAACCAGGCACTGAAGGGCCACGCCTGGCTGAAAGATGACGAAGCGACACACTGTAGGCAGTG 1223
Query 1629 TGAGAAGGAGTTCTCCATTTCCCGGAGAAAGCACCACTGCCGGAACTGTGGCCACATCTTCTGCAACACCTGCT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1224 TGAGAAGGAGTTCTCCATTTCCCGGAGAAAGCACCACTGCCGGAACTGTGGCCACATCTTCTGCAACACCTGCT 1297
Query 1703 CCAGCAACGAGCTGGCCCTGCCCTCCTACCCCAAGCCGGTGCGAGTGTGCGACAGCTGCCACACCCTGCTCCTG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1298 CCAGCAACGAGCTGGCCCTGCCCTCCTACCCCAAGCCGGTGCGAGTGTGCGACAGCTGCCACACCCTGCTCCTG 1371
Query 1777 CAGCGCTGCTCCTCCACGGCCTCC 1800
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1372 CAGCGCTGCTCCTCCACGGCCTCC 1395
