Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469015
- Subject:
- XM_017009893.2
- Aligned Length:
- 1802
- Identities:
- 1242
- Gaps:
- 556
Alignment
Query 1 ATGATGGAGGAGCGTGCCAACCTGATGCACATGATGAAACTCAGCATCAAGGTGTTGCTCCAGTCGGCTCTGAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCTGGGCCGCAGCCTGGATGCGGACCATGCCCCCTTGCAGCAGTTCTTTGTAGTGATGGAGCACTGCCTCAAAC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ATGGGCTGAAAGTTAAGAAGAGTTTTATTGGCCAAAATAAATCATTCTTTGGTCCTTTGGAGCTGGTGGAGAAA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CTTTGTCCAGAAGCATCAGATATAGCGACTAGTGTCAGAAATCTTCCAGAATTAAAGACAGCTGTGGGAAGAGG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CCGAGCGTGGCTTTATCTTGCACTCATGCAAAAGAAACTGGCAGATTATCTGAAAGTGCTTATAGACAATAAAC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 ATCTCTTAAGCGAGTTCTATGAGCCTGAGGCTTTAATGATGGAGGAAGAAGGGATGGTGATTGTTGGTCTGCTG 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GTGGGACTCAATGTTCTCGATGCCAATCTCTGCTTGAAAGGAGAAGACTTGGATTC--TCAGGTTGGAGTAATA 516
|.||| ||||||| |..|||||||||||||
Sbjct 1 -------------------------------------ATGGA-------TGGATTCCTTTTGGTTGGAGTAATA 30
Query 517 GATTTTTCCCTCTACCTTAAGGATGTGCAGGATCTTGATGGTGGCAAGGAGCATGAAAGAATTACTGATGTCCT 590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 31 GATTTTTCCCTCTACCTTAAGGATGTGCAGGATCTTGATGGTGGCAAGGA------------------------ 80
Query 591 TGATCAAAAAAATTATGTGGAAGAACTTAACCGGCACTTGAGCTGCACAGTTGGGGATCTTCAAACCAAGATAG 664
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 81 ------------------------------------------CTGCACAGTTGGGGATCTTCAAACCAAGATAG 112
Query 665 ATGGCTTGGAAAAGACTAACTCAAAGCTTCAAGAAGAGCTTTCAGCTGCAACAGACCGAATTTGCTCACTTCAA 738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 113 ATGGCTTGGAAAAGACTAACTCAAAGCTTCAAGAAGAGCTTTCAGCTGCAACAGACCGAATTTGCTCACTTCAA 186
Query 739 GAAGAACAGCAGCAGTTAAGAGAACAAAATGAATTAATTCGAGAAAGAAGTGAAAAGAGTGTAGAGATAACAAA 812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 187 GAAGAACAGCAGCAGTTAAGAGAACAAAATGAATTAATTCGAGAAAGAAGTGAAAAGAGTGTAGAGATAACAAA 260
Query 813 ACAGGATACCAAAGTTGAGCTGGAGACTTACAAGCAAACTCGGCAAGGTCTGGATGAAATGTACAGTGATGTGT 886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 261 ACAGGATACCAAAGTTGAGCTGGAGACTTACAAGCAAACTCGGCAAGGTCTGGATGAAATGTACAGTGATGTGT 334
Query 887 GGAAGCAGCTAAAAGAGGAGAAGAAAGTCCGGTTGGAACTGGAAAAAGAACTGGAGTTACAAATTGGAATGAAA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 335 GGAAGCAGCTAAAAGAGGAGAAGAAAGTCCGGTTGGAACTGGAAAAAGAACTGGAGTTACAAATTGGAATGAAA 408
Query 961 ACCGAAATGGAAATTGCAATGAAGTTACTGGAAAAGGACACCCACGAGAAGCAGGACACACTAGTTGCCCTCCG 1034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 409 ACCGAAATGGAAATTGCAATGAAGTTACTGGAAAAGGACACCCACGAGAAGCAGGACACACTAGTTGCCCTCCG 482
Query 1035 CCAGCAGCTGGAAGAAGTCAAAGCGATTAATTTACAGATGTTTCACAAAGCTCAGAATGCAGAGAGCAGTTTGC 1108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 483 CCAGCAGCTGGAAGAAGTCAAAGCGATTAATTTACAGATGTTTCACAAAGCTCAGAATGCAGAGAGCAGTTTGC 556
Query 1109 AGCAGAAGAATGAAGCCATCACATCCTTTGAAGGAAAAACCAACCAAGTTATGTCCAGCATGAAACAAATGGAA 1182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 557 AGCAGAAGAATGAAGCCATCACATCCTTTGAAGGAAAAACCAACCAAGTTATGTCCAGCATGAAACAAATGGAA 630
Query 1183 GAAAGGTTGCAGCACTCGGAGCGGGCGAGGCAGGGAGCTGAGGAGCGGAGCCACAAGCTGCAGCAGGAGCTGGG 1256
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 631 GAAAGGTTGCAGCACTCGGAGCGGGCGAGGCAGGGGGCTGAGGAGCGGAGCCACAAGCTGCAGCAGGAGCTGGG 704
Query 1257 CGGGAGGATCGGCGCCCTGCAGCTGCAGCTCTCCCAGCTGCACGAGCAATGCTCAAGCCTGGAGAAAGAATTGA 1330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 705 CGGGAGGATCGGCGCCCTGCAGCTGCAGCTCTCCCAGCTGCACGAGCAATGCTCAAGCCTGGAGAAAGAATTGA 778
Query 1331 AATCAGAAAAAGAGCAAAGACAGGCTCTTCAGCGCGAATTACAGCACGAGAAAGACACTTCCTCTCTACTCAGG 1404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 AATCAGAAAAAGAGCAAAGACAGGCTCTTCAGCGCGAATTACAGCACGAGAAAGACACTTCCTCTCTACTCAGG 852
Query 1405 ATGGAGCTGCAACAAGTGGAAGGACTGAAAAAGGAGTTGCGGGAGCTTCAGGACGAGAAGGCAGAGCTGCAGAA 1478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 853 ATGGAGCTGCAACAAGTGGAAGGACTGAAAAAGGAGTTGCGGGAGCTTCAGGACGAGAAGGCAGAGCTGCAGAA 926
Query 1479 GATCTGCGAGGAGCAGGAACAAGCCCTCCAGGAAATGGGCCTGCACCTCAGCCAGTCCAAGCTGAAGATGGAAG 1552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 927 GATCTGCGAGGAGCAGGAACAAGCCCTCCAGGAAATGGGCCTGCACCTCAGCCAGTCCAAGCTGAAGATGGAAG 1000
Query 1553 ATATAAAAGAAGTGAACCAGGCACTGAAGGGCCACGCCTGGCTGAAAGATGACGAAGCGACACACTGTAGGCAG 1626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001 ATATAAAAGAAGTGAACCAGGCACTGAAGGGCCACGCCTGGCTGAAAGATGACGAAGCGACACACTGTAGGCAG 1074
Query 1627 TGTGAGAAGGAGTTCTCCATTTCCCGGAGAAAGCACCACTGCCGGAACTGTGGCCACATCTTCTGCAACACCTG 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075 TGTGAGAAGGAGTTCTCCATTTCCCGGAGAAAGCACCACTGCCGGAACTGTGGCCACATCTTCTGCAACACCTG 1148
Query 1701 CTCCAGCAACGAGCTGGCCCTGCCCTCCTACCCCAAGCCGGTGCGAGTGTGCGACAGCTGCCACACCCTGCTCC 1774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1149 CTCCAGCAACGAGCTGGCCCTGCCCTCCTACCCCAAGCCGGTGCGAGTGTGCGACAGCTGCCACACCCTGCTCC 1222
Query 1775 TGCAGCGCTGCTCCTCCACGGCCTCC 1800
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1223 TGCAGCGCTGCTCCTCCACGGCCTCC 1248
