Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469018
• Subject: XM_006517402.1
• Aligned Length: 1513
• Identities: 1295
• Gaps: 68

Alignment

Query    1  ATGGGTGTGATAGGTATAC------AGCTGGTTG---TTACCAT----GGT---GATGGC-CAGTGTCATGCAG  57
            |||.|   |..|||..|.|      |||.||..|   ||.||.|    |||   ||..|| |.||.|  |||||
Sbjct    1  ATGCG---GGCAGGACTTCCGGCCGAGCCGGAAGACCTTTCCCTTCGCGGTTTCGAGAGCTCCGTTT--TGCAG  69

Query   58  A-----------AGATTAT--AC-----------CTC---ACTATTCTCTTGCTCGA--------TGGCTACTC  96
            |           |||||.|  ||           |||   ||| .|||.|..|.|||        ||||     
Sbjct   70  AACCTGAAGGGGAGATTCTGGACGGTCCCGGGGACTCTAGACT-GTCTGTCCCACGACCTGTTCTTGGC-----  137

Query   97  TGTAATGGCAGTTTGAGGTGGTATCAACATCCTACAGAAGAAGAATTAAGAATTCTTGCAGGGAAACAACAAAA  170
             ||.||    |||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct  138  -GTTAT----GTTTGAGATGGTATCAACATCCTTCCGAAGAAGAATTAAGAATCCTTGCAGGGAAGCAGCAGAA  206

Query  171  AGGGAAAACCAAAAAAGATAGGAAATATAATGGTCACATTGAAAGTAAGCCATTAACCATTCCAAAGGATATTG  244
            |||.||||..||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||||.|||||||.|||||||||||||.||.||||
Sbjct  207  AGGAAAAAGTAAAAAAGACAGAAAATACAATGGCCATATTGAAAATAAGCCACTAACCATTCCAAAAGACATTG  280

Query  245  ACCTTCATCTAGAAACAAAGTCAGTTACAGAAGTGGATACTTTAGCATTGCATTACTTTCCAGAATACCAGTGG  318
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  281  ACCTTCATCTAGAAACCAAGTCTGTTACAGAAGTGGACACTTTAGCACTGCATTACTTCCCAGAATACCAGTGG  354

Query  319  CTGGTGGATTTCACAGTGGCTGCTACAGTTGTGTATCTAGTAACTGAAGTCTACTACAATTTTATGAAGCCTAC  392
            ||||||||.|||||.|||||||||||..||||.|||.||||||||||.|||||.||||..||.|||||||||||
Sbjct  355  CTGGTGGACTTCACGGTGGCTGCTACCATTGTCTATTTAGTAACTGAGGTCTATTACAGCTTCATGAAGCCTAC  428

Query  393  ACAGGAAATGAATATCAGCTTAGTCTGGTGCCTACTTGTTTTGTCTTTTGCAATCAAAGTTCTATTTTCATTAA  466
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  429  ACAGGAAATGAATATCAGCTTAGTTTGGTGCCTCCTGGTTTTGTCTTTTGCAATCAAAGTTCTATTTTCATTAA  502

Query  467  CTACACACTATTTTAAAGTAGAAGATGGTGGTGAAAGATCTGTTTGTGTCACCTTTGGATTTTTTTTCTTTGTC  540
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  503  CTACACACTATTTTAAAGTAGAAGATGGAGGTGAAAGGTCAGTTTGTGTCACCTTTGGATTTTTTTTCTTCGTT  576

Query  541  AAAGCAATGGCAGTGTTGATTGTAACAGAAAATTATCTGGAATTTGGACTTGAAACAGGGTTTACAAATTTTTC  614
            ||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  577  AAAGCAATGGCAGTTTTGATCGTAACAGAGAACTACCTGGAGTTTGGCCTTGAAACAGGGTTTACAAATTTTTC  650

Query  615  AGACAGTGCGATGCAGTTTCTTGAAAAGCAAGGTTTAGAATCTCAGAGTCCTGTTTCAAAACTTACTTTCAAAT  688
            |||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  651  AGACAGTGCAATGCAGTTTCTTGAAAAGCAGGGTTTAGAATCTCAGGGCCCTGTTTCAAAACTTACTTTCAAAT  724

Query  689  TTTTCCTGGCTATTTTCTGTTCATTCATTGGGGCTTTTTTGACATTTCCTGGATTACGACTGGCTCAAATGCAT  762
            |||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  725  TTTTCCTGGCTGTTTTCTGTTCACTCATTGGGGCTTTTTTGACATTTCCTGGATTACGGCTGGCTCAAATGCAT  798

Query  763  CTGGATGCCCTGAATTTGGCAACAGAAAAAATTACACAAACTTTACTTCATATCAACTTCTTGGCACCTTTATT  836
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  799  CTGGATGCCCTGAATATGGCAACAGAAAAAATTACACAAACATTACTTCATATCAACTTCTTGGCACCTTTATT  872

Query  837  TATGGTTTTGCTCTGGGTAAAACCAATCACCAAAGACTACATTATGAACCCACCACTGGGCAAAGAAAGTATCC  910
            |||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||..||||.|.|||.|||.|||
Sbjct  873  TATGGTTCTGCTCTGGGTGAAACCAATCACCAAAGACTATATCATGAACCCACCGTTGGGTAGAGAGAGTGTCC  946

Query  911  CTTTAATGACAGAAGCCACATTCGATACTCTGCGACTCTGGTTAATAATCCTGCTGTGTGCTTTGCGGTTGGCC  984
            ||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||
Sbjct  947  CTCTAATGACAGAAGCCACATTTGATACTCTTCGACTCTGGTTAATAATCCTGCTCTGTGTTTTGCGGTTGGCC  1020

Query  985  ATGATGCGTAGTCACCTGCAAGCTTATTTAAATTTAGCCCAAAAATGTGTGGATCAGATGAAGAAAGAAGCGGG  1058
            ||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1021  ATGATGCGAAGTCACCTGCAAGCATATTTAAATTTGGCCCAGAAATGTGTGGATCAAATGAAGAAAGAAGCTGG  1094

Query 1059  GCGAATAAGCACGGTTGAGCTACAGAAAATGGTGGCTCGAGTCTTTTATTATCTTTGTGTCATTGCACTGCAGT  1132
            .||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1095  CCGAATAAGTACAGTTGAGCTACAGAAAATGGTGGCGCGAGTCTTTTACTACCTGTGTGTCATTGCCCTGCAGT  1168

Query 1133  ATGTGGCGCCTCTGGTAATGCTGCTTCACACAACTCTGCTTTTGAAAACACTAGGTAATCATTCCTGGGGTATT  1206
            |||||||.||||||||||||||||||||.|..|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1169  ATGTGGCACCTCTGGTAATGCTGCTTCATATGACTCTGCTTCTGAAAACACTAGGTAATCATTCCTGGGGAATT  1242

Query 1207  TATCCAGAATCTATCTCTACCTTACCAGTGGATAATAGTCTACTGTCCAATTCTGTTTACTCTGAATTACCATC  1280
            |||||||||.|...||.|.||||.|||||||||||||.|||.|...||||.||.|.||||.|||||.|||||||
Sbjct 1243  TATCCAGAAGCCGCCTTTCCCTTGCCAGTGGATAATAATCTCCCCGCCAACTCGGCTTACCCTGAACTACCATC  1316

Query 1281  AGCTGAAGGGAAAATGAAGGTAACTGTTACACAAATAACAGTGGCACTGAGCAGCTTAAAAAATATTTTTACTC  1354
            |.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|
Sbjct 1317  ACCTGATGGGAAGATGAAGGTAACTGTTACACAAATCACAGTGGCCCTGAGCAGCTTAAAAAACATCTTCACGC  1390

Query 1355  CTCTTCTTTTTCGAGGACTTCTGTCTTTTCTGACCTGGTGGATTGCTGCTTGCCTCTTTTCTACAAGCCTTTTT  1428
            ||||.||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391  CTCTCCTTTTTCGAGGACTTCTGTCATTTTTGACATGGTGGATTGCAGCTTGCCTCTTTTCTACAAGCCTTTTT  1464

Query 1429  GGGCTTTTCTATCACCAGTATCTGACTGTGGCA  1461
            ||||||||||||||.||||||.||||.||||||
Sbjct 1465  GGGCTTTTCTATCATCAGTATTTGACAGTGGCA  1497