Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469025
• Subject: NM_001172309.1
• Aligned Length: 1833
• Identities: 1701
• Gaps: 132

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAATGATATTTCCCAAAAGGCTGAGATTAAAGAAATGCTTGCTTCTGATGATGAGGAAGATGTATCTTCTAA  74

Query    1  ----------------------------------------------------------ATGGAGAAACAAAGAC  16
                                                                      ||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTAGAAAAGGCTTATGTTCCAAAATTAACAGGAACTGTGAAGGGTAGATTTGCTGAAATGGAGAAACAAAGAC  148

Query   17  AAGAGGAACAAAGGAAGAGAACGGAGGAGGAACGAAAACGCAGAATTGAGCAGGATATGTTAGAAAAGAGGAAA  90
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGAGGAACAAAGGAAGAGAACGGAGGAGGAACGAAAACGCAGAATTGAGCAGGATATGTTAGAAAAGAGGAAA  222

Query   91  ATACAGCGTGAATTAGCAAAAAGGGCTGAACAGATTGAGGACATAAACAATACGGGAACTGAATCAGCATCAGA  164
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATACAGCGTGAATTAGCAAAAAGGGCTGAACAGATTGAGGACATAAACAATACGGGAACTGAATCAGCATCAGA  296

Query  165  GGAAGGAGATGATTCACTACTTATAACTGTGGTACCTGTCAAATCATATAAAACATCTGGAAAAATGAAAAAGA  238
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAAGGAGATGATTCACTACTTATAACTGTGGTACCTGTCAAATCATATAAAACATCTGGAAAAATGAAAAAGA  370

Query  239  ATTTTGAGGATCTAGAAAAAGAACGTGAAGAGAAAGAAAGGATCAAGTACGAGGAAGATAAAAGAATAAGATAT  312
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTTTGAGGATCTAGAAAAAGAACGTGAAGAGAAAGAAAGGATCAAGTACGAGGAAGATAAAAGAATAAGATAT  444

Query  313  GAAGAACAACGACCATCTCTCAAGGAAGCAAAGTGTCTTTCATTAGTTATGGATGATGAAATAGAAAGTGAAGC  386
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAGAACAACGACCATCTCTCAAGGAAGCAAAGTGTCTTTCATTAGTTATGGATGATGAAATAGAAAGTGAAGC  518

Query  387  AAAAAAAGAATCACTTTCTCCCGGAAAATTGAAACTAACTTTTGAAGAACTGGAGCGACAAAGACAAGAAAACC  460
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAAAAAAGAATCACTTTCTCCCGGAAAATTGAAACTAACTTTTGAAGAACTGGAGCGACAAAGACAAGAAAACC  592

Query  461  GAAAGAAGCAAGCTGAAGAGGAAGCAAGAAAACGTTTAGAAGAAGAGAAGCGTGCTTTTGAAGAAGCAAGGCGG  534
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAAAGAAGCAAGCTGAAGAGGAAGCAAGAAAACGTTTAGAAGAAGAGAAGCGTGCTTTTGAAGAAGCAAGGCGG  666

Query  535  CAAATGGTAAATGAAGATGAGGAAAACCAAGACACAGCAAAAATTTTTAAAGGGTACCGCCCTGGTAAACTCAA  608
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAAATGGTAAATGAAGATGAGGAAAACCAAGACACAGCAAAAATTTTTAAAGGGTACCGCCCTGGTAAACTCAA  740

Query  609  ACTCAGTTTTGAAGAAATGGAAAGGCAAAGAAGAGAAGATGAAAAAAGGAAAGCAGAAGAAGAAGCCAGAAGGA  682
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACTCAGTTTTGAAGAAATGGAAAGGCAAAGAAGAGAAGATGAAAAAAGGAAAGCAGAAGAAGAAGCCAGAAGGA  814

Query  683  GAATAGAGGAAGAAAAGAAGGCGTTTGCTGAAGCAAGGAGAAATATGGTAGTAGATGATGACTCCCCAGAGATG  756
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAATAGAGGAAGAAAAGAAGGCGTTTGCTGAAGCAAGGAGAAATATGGTAGTAGATGATGACTCCCCAGAGATG  888

Query  757  TATAAGACAATCTCTCAAGAATTTCTTACACCGGGAAAACTGGAAATTAATTTTGAAGAATTATTAAAACAAAA  830
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TATAAGACAATCTCTCAAGAATTTCTTACACCGGGAAAACTGGAAATTAATTTTGAAGAATTATTAAAACAAAA  962

Query  831  AATGGAAGAAGAAAAACGACGAACAGAGGAGGAACGGAAGCATAAGCTAGAAATGGAGAAACAAGAATTTGAAC  904
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AATGGAAGAAGAAAAACGACGAACAGAGGAGGAACGGAAGCATAAGCTAGAAATGGAGAAACAAGAATTTGAAC  1036

Query  905  AACTGAGACAGGAAATGGGAGAGGAAGAGGAAGAAAATGAAACCTTTGGATTGAGCAGAGAATATGAAGAACTG  978
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AACTGAGACAGGAAATGGGAGAGGAAGAGGAAGAAAATGAAACCTTTGGATTGAGCAGAGAATATGAAGAACTG  1110

Query  979  ATCAAATTAAAAAGGAGTGGCTCTATTCAAGCTAAAAACCTAAAAAGCAAGTTTGAAAAAATTGGACAGTTGTC  1052
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATCAAATTAAAAAGGAGTGGCTCTATTCAAGCTAAAAACCTAAAAAGCAAGTTTGAAAAAATTGGACAGTTGTC  1184

Query 1053  TGAAAAAGAAATACAGAAAAAAATAGAAGAAGAGCGAGCAAGAAGGAGAGCAATTGACCTTGAAATTAAAGAGC  1126
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGAAAAAGAAATACAGAAAAAAATAGAAGAAGAGCGAGCAAGAAGGAGAGCAATTGACCTTGAAATTAAAGAGC  1258

Query 1127  GAGAAGCTGAAAATTTTCATGAGGAAGATGATGTTGATGTTAGGCCTGCAAGAAAAAGCGAGGCTCCATTTACT  1200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GAGAAGCTGAAAATTTTCATGAGGAAGATGATGTTGATGTTAGGCCTGCAAGAAAAAGCGAGGCTCCATTTACT  1332

Query 1201  CACAAAGTGAATATGAAAGCTAGATTTGAACAAATGGCTAAGGCAAGAGAAGAAGAAGAACAAAGAAGAATTGA  1274
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CACAAAGTGAATATGAAAGCTAGATTTGAACAAATGGCTAAGGCAAGAGAAGAAGAAGAACAAAGAAGAATTGA  1406

Query 1275  AGAACAAAAGTTACTACGCATGCAGTTTGAACAAAGGGAAATTGATGCAGCACTACAAAAGAAAAGAGAAGAGG  1348
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGAACAAAAGTTACTACGCATGCAGTTTGAACAAAGGGAAATTGATGCAGCACTACAAAAGAAAAGAGAAGAGG  1480

Query 1349  AGGAGGAGGAAGAAGGTAGCATCATGAATGGCTCCACTGCTGAAGATGAAGAGCAAACCAGATCAGGAGCTCCA  1422
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGAGGAGGAAGAAGGTAGCATCATGAATGGCTCCACTGCTGAAGATGAAGAGCAAACCAGATCAGGAGCTCCA  1554

Query 1423  TGGTTCAAGAAGCCTCTTAAAAACACATCAGTTGTAGACAGTGAGCCAGTCAGATTTACGGTTAAAGTAACAGG  1496
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGGTTCAAGAAGCCTCTTAAAAACACATCAGTTGTAGACAGTGAGCCAGTCAGATTTACGGTTAAAGTAACAGG  1628

Query 1497  AGAACCCAAACCAGAAATTACATGGTGGTTTGAAGGAGAAATACTGCAGGATGGAGAAGACTATCAATATATTG  1570
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGAACCCAAACCAGAAATTACATGGTGGTTTGAAGGAGAAATACTGCAGGATGGAGAAGACTATCAATATATTG  1702

Query 1571  AAAGGGGAGAAACTTACTGCCTTTACTTACCAGAAACTTTCCCAGAAGATGGAGGAGAGTATATGTGTAAAGCA  1644
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AAAGGGGAGAAACTTACTGCCTTTACTTACCAGAAACTTTCCCAGAAGATGGAGGAGAGTATATGTGTAAAGCA  1776

Query 1645  GTCAACAATAAAGGATCTGCAGCTAGTACCTGTATTCTTACCATTGAAAGTAAGAAT  1701
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTCAACAATAAAGGATCTGCAGCTAGTACCTGTATTCTTACCATTGAAAGTAAGAAT  1833