Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469035
• Subject: NM_001346550.1
• Aligned Length: 2265
• Identities: 2263
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGACTGAATCTGCCTCTAGCACAAGTGGTCAAGAGTTTGATGTGTTCAGTGTTATGGACTGGAAAGATGGAGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACTGAATCTGCCTCTAGCACAAGTGGTCAAGAGTTTGATGTGTTCAGTGTTATGGACTGGAAAGATGGAGT  74

Query   75  GGGCACGTTACCAGGAAGTGACTTAAAGTTTCGGGTAAATGAGTTTGGAGCCCTGGAAGTTATTACAGATGAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGCACGTTACCAGGAAGTGACTTAAAGTTTCGGGTAAATGAGTTTGGAGCCCTGGAAGTTATTACAGATGAGA  148

Query  149  ATGAGATGGAAAATGTTAAAAAAGCAACTGCTACCACCACTTGGATGGTACCAACTGCTCAAGAAGTCTTTTCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGAGATGGAAAATGTTAAAAAAGCAACTGCTACCACCACTTGGATGGTACCAACTGCTCAAGAAGTCTTTTCA  222

Query  223  GAGAAGACTGGGATGCCTTTCAGGTTGAAGGATCCAGTGAAAGTAGAAGGGCTTCAGTTCTGTGAGAACTGTTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGAAGACTGGGATGCCTTTCAGGTTGAAGGATCCAGTGAAAGTAGAAGGGCTTCAGTTCTGTGAGAACTGTTG  296

Query  297  TCAGTATGGCAACGTAGATGAGTGTCTTTCTGGAGGAAACTATTGCAGCCAGAATTGTGCTCGGCACATCAAAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCAGTATGGCAACGTAGATGAGTGTCTTTCTGGAGGAAACTATTGCAGCCAGAATTGTGCTCGGCACATCAAAG  370

Query  371  ATAAAGATCAGAAGGAAGAAAGGGACGTAGAAGAAGACAATGAGGAAGAAGATCCTAAGTGTAGTCGGAAGAAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATAAAGATCAGAAGGAAGAAAGGGACGTAGAAGAAGACAATGAGGAAGAAGATCCTAAGTGTAGTCGGAAGAAA  444

Query  445  AAACCAAAATTATCTCTGAAAGCTGACAACAAGGAGGATGGAGAAGAGAGAGATGATGAAATGGAGAACAAACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAACCAAAATTATCTCTGAAAGCTGACACCAAGGAGGATGGAGAAGAGAGAGATGATGAAATGGAGAACAAACA  518

Query  519  AGATGTAAGAATCCTGAGGGGTTCGCAGAGAGCACGGAGGAAAAGACGAGGGGATTCGGCTGTACTAAAGCAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGATGTAAGAATCCTGAGGGGTTCGCAGAGAGCACGGAGGAAAAGACGAGGGGATTCGGCTGTACTAAAGCAGG  592

Query  593  GTTTGCCTCCTAAAGGAAAGAAAGCGTGGTGCTGGGCATCCTACCTGGAAGAGGAGAAAGCGGTGGCAGTGCCG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTTTGCCTCCTAAAGGAAAGAAAGCGTGGTGCTGGGCATCCTACCTGGAAGAGGAGAAAGCGGTGGCAGTGCCG  666

Query  667  GCGAAGCTGTTCAAGGAGCATCAATCCTTTCCATATAACAAAAATGGATTCAAAGTTGGCATGAAATTAGAAGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCGAAGCTGTTCAAGGAGCATCAATCCTTTCCATATAACAAAAATGGATTCAAAGTTGGCATGAAATTAGAAGG  740

Query  741  CGTGGATCCCGAGCATCAGTCTGTGTACTGTGTCCTCACCGTCGCGGAGGTTTGTGGATACCGGATAAAGCTTC  814
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGTGGATCCTGAGCATCAGTCTGTGTACTGTGTCCTCACCGTCGCGGAGGTTTGTGGATACCGGATAAAGCTTC  814

Query  815  ACTTTGATGGGTATTCTGATTGCTATGACTTCTGGGTGAATGCAGACGCTCTGGATATCCACCCAGTTGGGTGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACTTTGATGGGTATTCTGATTGCTATGACTTCTGGGTGAATGCAGACGCTCTGGATATCCACCCAGTTGGGTGG  888

Query  889  TGTGAGAAAACCGGCCACAAACTCCATCCTCCAAAAGGGTATAAAGAAGAAGAATTCAATTGGCAGACCTATCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGTGAGAAAACCGGCCACAAACTCCATCCTCCAAAAGGGTATAAAGAAGAAGAATTCAATTGGCAGACCTATCT  962

Query  963  TAAGACATGTAAAGCTCAAGCTGCTCCTAAGTCATTATTTGAAAATCAGAATATAACAGTGATCCCATCGGGCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TAAGACATGTAAAGCTCAAGCTGCTCCTAAGTCATTATTTGAAAATCAGAATATAACAGTGATCCCATCGGGCT  1036

Query 1037  TTCGAGTTGGTATGAAGCTTGAGGCAGTAGACAAAAAGAATCCCTCATTCATCTGTGTTGCTACGGTAACAGAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTCGAGTTGGTATGAAGCTTGAGGCAGTAGACAAAAAGAATCCCTCATTCATCTGTGTTGCTACGGTAACAGAT  1110

Query 1111  ATGGTGGACAATCGTTTCCTGGTACATTTTGACAACTGGGATGAGAGCTATGACTATTGGTGTGAAGCATCAAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATGGTGGACAATCGTTTCCTGGTACATTTTGACAACTGGGATGAGAGCTATGACTATTGGTGTGAAGCATCAAG  1184

Query 1185  TCCACATATTCATCCAGTTGGTTGGTGTAAGGAACATAGAAGAACCCTTATTACTCCACCAGGTTATCCAAATG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCCACATATTCATCCAGTTGGTTGGTGTAAGGAACATAGAAGAACCCTTATTACTCCACCAGGTTATCCAAATG  1258

Query 1259  TGAAACATTTTTCTTGGGATAAATACTTAGAAGAAACCAATTCTTTACCTGCTCCTGCAAGAGCTTTCAAAGTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGAAACATTTTTCTTGGGATAAATACTTAGAAGAAACCAATTCTTTACCTGCTCCTGCAAGAGCTTTCAAAGTG  1332

Query 1333  AAACCTCCTCATGGATTCCAGAAAAAAATGAAGCTTGAGGTTGTAGACAAAAGGAACCCTATGTTTATTAGAGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAACCTCCTCATGGATTCCAGAAAAAAATGAAGCTTGAGGTTGTAGACAAAAGGAACCCTATGTTTATTAGAGT  1406

Query 1407  AGCAACTGTGGCAGACACAGATGATCACCGGGTAAAAGTTCACTTTGATGGCTGGAACAATTGCTATGATTACT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGCAACTGTGGCAGACACAGATGATCACCGGGTAAAAGTTCACTTTGATGGCTGGAACAATTGCTATGATTACT  1480

Query 1481  GGATAGATGCAGATTCTCCTGATATTCACCCTGTAGGCTGGTGTTCAAAAACAGGACATCCCCTTCAGCCTCCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGATAGATGCAGATTCTCCTGATATTCACCCTGTAGGCTGGTGTTCAAAAACAGGACATCCCCTTCAGCCTCCT  1554

Query 1555  TTGAGCCCCTTAGAATTAATGGAAGCTTCAGAACATGGTGGATGCTCAACCCCGGGATGTAAAGGGATTGGCCA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTGAGCCCCTTAGAATTAATGGAAGCTTCAGAACATGGTGGATGCTCAACCCCGGGATGTAAAGGGATTGGCCA  1628

Query 1629  TTTCAAGAGAGCGAGACATCTGGGCCCTCACAGTGCTGCCAACTGTCCCTATTCAGAAATCAATTTGAATAAAG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TTTCAAGAGAGCGAGACATCTGGGCCCTCACAGTGCTGCCAACTGTCCCTATTCAGAAATCAATTTGAATAAAG  1702

Query 1703  ACCGTATTTTTCCAGACCGCTTAAGTGGTGAGATGCCTCCGGCTAGTCCGTCATTTCCAAGAAATAAAAGGACA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACCGTATTTTTCCAGACCGCTTAAGTGGTGAGATGCCTCCGGCTAGTCCGTCATTTCCAAGAAATAAAAGGACA  1776

Query 1777  GATGCAAATGAAAGCTCTTCTTCCCCTGAAATCAGAGACCAGCATGCTGATGATGTCAAAGAAGACTTTGAAGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GATGCAAATGAAAGCTCTTCTTCCCCTGAAATCAGAGACCAGCATGCTGATGATGTCAAAGAAGACTTTGAAGA  1850

Query 1851  GAGAACAGAAAGTGAAATGAGAACATCACATGAAGCCAGAGGTGCCCGGGAAGAACCCACCGTCCAGCAGGCAC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GAGAACAGAAAGTGAAATGAGAACATCACATGAAGCCAGAGGTGCCCGGGAAGAACCCACCGTCCAGCAGGCAC  1924

Query 1925  AGCGTCGGTCAGCTGTCTTTCTGTCCTTTAAGTCCCCAATTCCATGTCTGCCCTTGCGCTGGGAGCAGCAAAGC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGCGTCGGTCAGCTGTCTTTCTGTCCTTTAAGTCCCCAATTCCATGTCTGCCCTTGCGCTGGGAGCAGCAAAGC  1998

Query 1999  AAACTTCTTCCAACTGTCGCAGGAATCCCTGCCAGTAAAGTTTCCAAATGGAGCACAGACGAGGTGTCAGAATT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AAACTTCTTCCAACTGTCGCAGGAATCCCTGCCAGTAAAGTTTCCAAATGGAGCACAGACGAGGTGTCAGAATT  2072

Query 2073  TATACAGAGCTTACCTGGGTGTGAAGAACATGGAAAGGTATTTAAAGATGAACAAATTGATGGAGAAGCATTTC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TATACAGAGCTTACCTGGGTGTGAAGAACATGGAAAGGTATTTAAAGATGAACAAATTGATGGAGAAGCATTTC  2146

Query 2147  TACTTATGACTCAAACAGACATTGTTAAAATTATGAGCATTAAACTGGGCCCTGCTCTCAAAATTTTCAATTCC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TACTTATGACTCAAACAGACATTGTTAAAATTATGAGCATTAAACTGGGCCCTGCTCTCAAAATTTTCAATTCC  2220

Query 2221  ATCCTGATGTTCAAAGCTGCAGAGAAGAATTCTCACAATGAACTT  2265
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ATCCTGATGTTCAAAGCTGCAGAGAAGAATTCTCACAATGAACTT  2265