Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469035
• Subject: XM_011536184.2
• Aligned Length: 2340
• Identities: 2263
• Gaps: 75

Alignment

Query    1  ATGACTGAATCTGCCTCTAGCACAAGTGGTCAAGAGTTTGATGTGTTCAGTGTTATGGACTGGAAAGATGGAGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACTGAATCTGCCTCTAGCACAAGTGGTCAAGAGTTTGATGTGTTCAGTGTTATGGACTGGAAAGATGGAGT  74

Query   75  GGGCACGTTACCAGGAAGTGACTTAAAGTTTCGGGTAAATGAGTTTGGAGCCCTGGAAGTTATTACAGATGAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGCACGTTACCAGGAAGTGACTTAAAGTTTCGGGTAAATGAGTTTGGAGCCCTGGAAGTTATTACAGATGAGA  148

Query  149  ATGAGATGGAAAATGTTAAAAAAGCAACTGCTACCACCACTTGGATGGTACCAACTGCTCAAGA----------  212
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
Sbjct  149  ATGAGATGGAAAATGTTAAAAAAGCAACTGCTACCACCACTTGGATGGTACCAACTGCTCAAGAAGCCCCGACC  222

Query  213  -----------------------------------------------------------------AGTCTTTTC  221
                                                                             |||||||||
Sbjct  223  TCTCCCCCGAGCTCCAGGCCCGTATTTCCACCTGCCTACTGGACATCTCCACCTGGATGTCCCACAGTCTTTTC  296

Query  222  AGAGAAGACTGGGATGCCTTTCAGGTTGAAGGATCCAGTGAAAGTAGAAGGGCTTCAGTTCTGTGAGAACTGTT  295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGAGAAGACTGGGATGCCTTTCAGGTTGAAGGATCCAGTGAAAGTAGAAGGGCTTCAGTTCTGTGAGAACTGTT  370

Query  296  GTCAGTATGGCAACGTAGATGAGTGTCTTTCTGGAGGAAACTATTGCAGCCAGAATTGTGCTCGGCACATCAAA  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTCAGTATGGCAACGTAGATGAGTGTCTTTCTGGAGGAAACTATTGCAGCCAGAATTGTGCTCGGCACATCAAA  444

Query  370  GATAAAGATCAGAAGGAAGAAAGGGACGTAGAAGAAGACAATGAGGAAGAAGATCCTAAGTGTAGTCGGAAGAA  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATAAAGATCAGAAGGAAGAAAGGGACGTAGAAGAAGACAATGAGGAAGAAGATCCTAAGTGTAGTCGGAAGAA  518

Query  444  AAAACCAAAATTATCTCTGAAAGCTGACAACAAGGAGGATGGAGAAGAGAGAGATGATGAAATGGAGAACAAAC  517
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAAACCAAAATTATCTCTGAAAGCTGACACCAAGGAGGATGGAGAAGAGAGAGATGATGAAATGGAGAACAAAC  592

Query  518  AAGATGTAAGAATCCTGAGGGGTTCGCAGAGAGCACGGAGGAAAAGACGAGGGGATTCGGCTGTACTAAAGCAG  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGATGTAAGAATCCTGAGGGGTTCGCAGAGAGCACGGAGGAAAAGACGAGGGGATTCGGCTGTACTAAAGCAG  666

Query  592  GGTTTGCCTCCTAAAGGAAAGAAAGCGTGGTGCTGGGCATCCTACCTGGAAGAGGAGAAAGCGGTGGCAGTGCC  665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGTTTGCCTCCTAAAGGAAAGAAAGCGTGGTGCTGGGCATCCTACCTGGAAGAGGAGAAAGCGGTGGCAGTGCC  740

Query  666  GGCGAAGCTGTTCAAGGAGCATCAATCCTTTCCATATAACAAAAATGGATTCAAAGTTGGCATGAAATTAGAAG  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCGAAGCTGTTCAAGGAGCATCAATCCTTTCCATATAACAAAAATGGATTCAAAGTTGGCATGAAATTAGAAG  814

Query  740  GCGTGGATCCCGAGCATCAGTCTGTGTACTGTGTCCTCACCGTCGCGGAGGTTTGTGGATACCGGATAAAGCTT  813
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCGTGGATCCTGAGCATCAGTCTGTGTACTGTGTCCTCACCGTCGCGGAGGTTTGTGGATACCGGATAAAGCTT  888

Query  814  CACTTTGATGGGTATTCTGATTGCTATGACTTCTGGGTGAATGCAGACGCTCTGGATATCCACCCAGTTGGGTG  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CACTTTGATGGGTATTCTGATTGCTATGACTTCTGGGTGAATGCAGACGCTCTGGATATCCACCCAGTTGGGTG  962

Query  888  GTGTGAGAAAACCGGCCACAAACTCCATCCTCCAAAAGGGTATAAAGAAGAAGAATTCAATTGGCAGACCTATC  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTGTGAGAAAACCGGCCACAAACTCCATCCTCCAAAAGGGTATAAAGAAGAAGAATTCAATTGGCAGACCTATC  1036

Query  962  TTAAGACATGTAAAGCTCAAGCTGCTCCTAAGTCATTATTTGAAAATCAGAATATAACAGTGATCCCATCGGGC  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTAAGACATGTAAAGCTCAAGCTGCTCCTAAGTCATTATTTGAAAATCAGAATATAACAGTGATCCCATCGGGC  1110

Query 1036  TTTCGAGTTGGTATGAAGCTTGAGGCAGTAGACAAAAAGAATCCCTCATTCATCTGTGTTGCTACGGTAACAGA  1109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTTCGAGTTGGTATGAAGCTTGAGGCAGTAGACAAAAAGAATCCCTCATTCATCTGTGTTGCTACGGTAACAGA  1184

Query 1110  TATGGTGGACAATCGTTTCCTGGTACATTTTGACAACTGGGATGAGAGCTATGACTATTGGTGTGAAGCATCAA  1183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TATGGTGGACAATCGTTTCCTGGTACATTTTGACAACTGGGATGAGAGCTATGACTATTGGTGTGAAGCATCAA  1258

Query 1184  GTCCACATATTCATCCAGTTGGTTGGTGTAAGGAACATAGAAGAACCCTTATTACTCCACCAGGTTATCCAAAT  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTCCACATATTCATCCAGTTGGTTGGTGTAAGGAACATAGAAGAACCCTTATTACTCCACCAGGTTATCCAAAT  1332

Query 1258  GTGAAACATTTTTCTTGGGATAAATACTTAGAAGAAACCAATTCTTTACCTGCTCCTGCAAGAGCTTTCAAAGT  1331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGAAACATTTTTCTTGGGATAAATACTTAGAAGAAACCAATTCTTTACCTGCTCCTGCAAGAGCTTTCAAAGT  1406

Query 1332  GAAACCTCCTCATGGATTCCAGAAAAAAATGAAGCTTGAGGTTGTAGACAAAAGGAACCCTATGTTTATTAGAG  1405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAAACCTCCTCATGGATTCCAGAAAAAAATGAAGCTTGAGGTTGTAGACAAAAGGAACCCTATGTTTATTAGAG  1480

Query 1406  TAGCAACTGTGGCAGACACAGATGATCACCGGGTAAAAGTTCACTTTGATGGCTGGAACAATTGCTATGATTAC  1479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TAGCAACTGTGGCAGACACAGATGATCACCGGGTAAAAGTTCACTTTGATGGCTGGAACAATTGCTATGATTAC  1554

Query 1480  TGGATAGATGCAGATTCTCCTGATATTCACCCTGTAGGCTGGTGTTCAAAAACAGGACATCCCCTTCAGCCTCC  1553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGGATAGATGCAGATTCTCCTGATATTCACCCTGTAGGCTGGTGTTCAAAAACAGGACATCCCCTTCAGCCTCC  1628

Query 1554  TTTGAGCCCCTTAGAATTAATGGAAGCTTCAGAACATGGTGGATGCTCAACCCCGGGATGTAAAGGGATTGGCC  1627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TTTGAGCCCCTTAGAATTAATGGAAGCTTCAGAACATGGTGGATGCTCAACCCCGGGATGTAAAGGGATTGGCC  1702

Query 1628  ATTTCAAGAGAGCGAGACATCTGGGCCCTCACAGTGCTGCCAACTGTCCCTATTCAGAAATCAATTTGAATAAA  1701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATTTCAAGAGAGCGAGACATCTGGGCCCTCACAGTGCTGCCAACTGTCCCTATTCAGAAATCAATTTGAATAAA  1776

Query 1702  GACCGTATTTTTCCAGACCGCTTAAGTGGTGAGATGCCTCCGGCTAGTCCGTCATTTCCAAGAAATAAAAGGAC  1775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GACCGTATTTTTCCAGACCGCTTAAGTGGTGAGATGCCTCCGGCTAGTCCGTCATTTCCAAGAAATAAAAGGAC  1850

Query 1776  AGATGCAAATGAAAGCTCTTCTTCCCCTGAAATCAGAGACCAGCATGCTGATGATGTCAAAGAAGACTTTGAAG  1849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGATGCAAATGAAAGCTCTTCTTCCCCTGAAATCAGAGACCAGCATGCTGATGATGTCAAAGAAGACTTTGAAG  1924

Query 1850  AGAGAACAGAAAGTGAAATGAGAACATCACATGAAGCCAGAGGTGCCCGGGAAGAACCCACCGTCCAGCAGGCA  1923
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGAGAACAGAAAGTGAAATGAGAACATCACATGAAGCCAGAGGTGCCCGGGAAGAACCCACCGTCCAGCAGGCA  1998

Query 1924  CAGCGTCGGTCAGCTGTCTTTCTGTCCTTTAAGTCCCCAATTCCATGTCTGCCCTTGCGCTGGGAGCAGCAAAG  1997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CAGCGTCGGTCAGCTGTCTTTCTGTCCTTTAAGTCCCCAATTCCATGTCTGCCCTTGCGCTGGGAGCAGCAAAG  2072

Query 1998  CAAACTTCTTCCAACTGTCGCAGGAATCCCTGCCAGTAAAGTTTCCAAATGGAGCACAGACGAGGTGTCAGAAT  2071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CAAACTTCTTCCAACTGTCGCAGGAATCCCTGCCAGTAAAGTTTCCAAATGGAGCACAGACGAGGTGTCAGAAT  2146

Query 2072  TTATACAGAGCTTACCTGGGTGTGAAGAACATGGAAAGGTATTTAAAGATGAACAAATTGATGGAGAAGCATTT  2145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TTATACAGAGCTTACCTGGGTGTGAAGAACATGGAAAGGTATTTAAAGATGAACAAATTGATGGAGAAGCATTT  2220

Query 2146  CTACTTATGACTCAAACAGACATTGTTAAAATTATGAGCATTAAACTGGGCCCTGCTCTCAAAATTTTCAATTC  2219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTACTTATGACTCAAACAGACATTGTTAAAATTATGAGCATTAAACTGGGCCCTGCTCTCAAAATTTTCAATTC  2294

Query 2220  CATCCTGATGTTCAAAGCTGCAGAGAAGAATTCTCACAATGAACTT  2265
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CATCCTGATGTTCAAAGCTGCAGAGAAGAATTCTCACAATGAACTT  2340